Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 BUB1-212ENST00000535254 3576 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.042e-10■■■■□ 19.4
ILF3Q12906 BUB1-202ENST00000409311 3287 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.332e-10■■■■□ 19.4
ILF3Q12906 BUB1-207ENST00000466333 2501 ntTSL 1 (best)6.05□□□□□ -1.442e-10■■■■□ 19.4
ILF3Q12906 PHACTR4-205ENST00000632202 918 ntTSL 514.83□□□□□ -0.047e-7■■■■□ 19.4
ILF3Q12906 PHACTR4-209ENST00000633371 597 ntTSL 313.83□□□□□ -0.27e-7■■■■□ 19.4
ILF3Q12906 PHACTR4-203ENST00000463428 1421 ntTSL 1 (best)13.6□□□□□ -0.237e-7■■■■□ 19.4
ILF3Q12906 PHACTR4-206ENST00000632421 3375 ntTSL 211.5□□□□□ -0.577e-7■■■■□ 19.4
ILF3Q12906 PHACTR4-204ENST00000493669 3078 ntTSL 1 (best)10.23□□□□□ -0.777e-7■■■■□ 19.4
ILF3Q12906 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.667e-7■■■■□ 19.4
ILF3Q12906 ARID4B-204ENST00000418304 1759 ntTSL 516.98■□□□□ 0.317e-7■■■■□ 19.4
ILF3Q12906 ARID4B-208ENST00000466653 2315 ntTSL 216.12■□□□□ 0.177e-7■■■■□ 19.4
ILF3Q12906 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.037e-7■■■■□ 19.4
ILF3Q12906 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.277e-7■■■■□ 19.4
ILF3Q12906 ARID4B-205ENST00000421364 5151 ntTSL 1 (best)12.35□□□□□ -0.437e-7■■■■□ 19.4
ILF3Q12906 ARID4B-212ENST00000491632 3823 ntTSL 1 (best)10.65□□□□□ -0.717e-7■■■■□ 19.4
ILF3Q12906 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.711e-10■■■■□ 19.4
ILF3Q12906 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.142e-7■■■■□ 19.4
ILF3Q12906 ECHDC1-216ENST00000479525 1368 ntTSL 517.3■□□□□ 0.362e-7■■■■□ 19.4
ILF3Q12906 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.332e-7■■■■□ 19.4
ILF3Q12906 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.162e-7■■■■□ 19.4
ILF3Q12906 ECHDC1-209ENST00000454591 1515 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.562e-7■■■■□ 19.4
ILF3Q12906 ECHDC1-207ENST00000430841 1009 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.142e-7■■■■□ 19.4
ILF3Q12906 ECHDC1-210ENST00000454859 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.352e-7■■■■□ 19.4
ILF3Q12906 ECHDC1-208ENST00000436638 766 ntAPPRIS ALT2 TSL 36.02□□□□□ -1.452e-7■■■■□ 19.4
ILF3Q12906 ECHDC1-202ENST00000368289 909 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.472e-7■■■■□ 19.4
ILF3Q12906 ECHDC1-215ENST00000475319 1543 ntTSL 25.84□□□□□ -1.482e-7■■■■□ 19.4
ILF3Q12906 ECHDC1-206ENST00000417628 767 ntTSL 55.11□□□□□ -1.592e-7■■■■□ 19.4
ILF3Q12906 ECHDC1-204ENST00000368292 854 ntTSL 54.6□□□□□ -1.672e-7■■■■□ 19.4
ILF3Q12906 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.692e-7■■■■□ 19.4
ILF3Q12906 ECHDC1-211ENST00000460558 301 ntTSL 53.96□□□□□ -1.782e-7■■■■□ 19.4
ILF3Q12906 ECHDC1-205ENST00000368295 1966 ntTSL 53.13□□□□□ -1.912e-7■■■■□ 19.4
ILF3Q12906 ANKRD17-208ENST00000559367 539 ntTSL 57.32□□□□□ -1.244e-7■■■■□ 19.4
ILF3Q12906 UBE2D2-208ENST00000511725 656 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.771e-6■■■■□ 19.4
ILF3Q12906 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.582e-6■■■■□ 19.4
ILF3Q12906 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.121e-6■■■■□ 19.4
ILF3Q12906 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.291e-6■■■■□ 19.4
ILF3Q12906 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.461e-6■■■■□ 19.4
ILF3Q12906 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.385e-6■■■■□ 19.4
ILF3Q12906 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.185e-6■■■■□ 19.4
ILF3Q12906 MTDH-202ENST00000519293 629 ntTSL 35.72□□□□□ -1.495e-6■■■■□ 19.4
ILF3Q12906 MTDH-204ENST00000521933 565 ntTSL 55.54□□□□□ -1.525e-6■■■■□ 19.4
ILF3Q12906 MTDH-205ENST00000522104 486 ntTSL 24.35□□□□□ -1.715e-6■■■■□ 19.4
ILF3Q12906 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.125e-7■■■■□ 19.4
ILF3Q12906 WDR33-205ENST00000436787 822 ntTSL 513.82□□□□□ -0.25e-7■■■■□ 19.4
ILF3Q12906 WDR33-202ENST00000393006 3574 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.815e-7■■■■□ 19.4
ILF3Q12906 GMDS-AS1-203ENST00000524770 565 ntTSL 319.82■□□□□ 0.763e-6■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 GMDS-AS1-209ENST00000532124 629 ntTSL 419.82■□□□□ 0.763e-6■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 GMDS-AS1-206ENST00000530346 594 ntTSL 418.01■□□□□ 0.473e-6■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.263e-6■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 GMDS-AS1-208ENST00000531092 744 ntTSL 313.09□□□□□ -0.313e-6■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 GMDS-AS1-214ENST00000534468 724 ntTSL 311.87□□□□□ -0.513e-6■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 GMDS-AS1-213ENST00000534441 738 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.783e-6■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 UBE2H-208ENST00000490974 572 ntTSL 522.61■■□□□ 1.212e-6■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 TIA1-219ENST00000496452 853 ntTSL 216.33■□□□□ 0.29e-9■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 TIA1-213ENST00000481650 549 ntTSL 413.93□□□□□ -0.189e-9■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 TIA1-211ENST00000477044 904 ntTSL 57.51□□□□□ -1.219e-9■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.815e-6■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 PDXDC1-207ENST00000562119 884 ntTSL 520.1■□□□□ 0.815e-6■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.195e-6■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 PDXDC1-218ENST00000627450 2683 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.325e-6■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 PDXDC1-217ENST00000570001 4828 ntTSL 211.19□□□□□ -0.625e-6■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 PDXDC1-202ENST00000396410 4521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.665e-6■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 PDXDC1-216ENST00000569715 3775 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.735e-6■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 PDXDC1-210ENST00000563679 2963 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.935e-6■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 PDXDC1-203ENST00000450288 4171 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.125e-6■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 PDXDC1-215ENST00000567306 980 ntTSL 57.23□□□□□ -1.255e-6■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 PDXDC1-201ENST00000325823 1113 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.285e-6■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 PDXDC1-206ENST00000561930 568 ntTSL 44.37□□□□□ -1.715e-6■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.434e-8■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 LAMA5-209ENST00000481120 386 ntTSL 222.71■■□□□ 1.233e-11■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 LIN54-208ENST00000509748 729 ntTSL 521.1■□□□□ 0.974e-6■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.961e-5■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.861e-5■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 AC087633.2-203ENST00000618377 489 ntTSL 519.99■□□□□ 0.791e-5■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 PTBP3-201ENST00000210227 734 ntTSL 219.49■□□□□ 0.711e-5■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.531e-6■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 TOP2A-205ENST00000581055 579 ntTSL 417.97■□□□□ 0.471e-5■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.393e-6■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 GGNBP2-216ENST00000618837 2346 ntTSL 217.36■□□□□ 0.371e-6■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.291e-6■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 NSUN4-206ENST00000486270 922 ntTSL 316.42■□□□□ 0.223e-7■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.191e-5■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.171e-5■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 FNBP4-213ENST00000534003 2515 ntTSL 515.99■□□□□ 0.151e-6■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.141e-6■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.121e-5■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.123e-6■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 TPT1-AS1-220ENST00000524062 2285 ntTSL 215.15■□□□□ 0.026e-6■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 ODF2-214ENST00000469582 1054 ntTSL 314.93□□□□□ -0.021e-5■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.071e-5■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.071e-5■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.191e-5■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.191e-5■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.211e-5■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 ZEB2-237ENST00000636732 5073 ntTSL 513.71□□□□□ -0.211e-5■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 ODF2-212ENST00000446274 822 ntTSL 213.37□□□□□ -0.271e-5■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 TPT1-AS1-217ENST00000522859 769 ntTSL 213.29□□□□□ -0.281e-5■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.281e-6■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 GGNBP2-215ENST00000617860 3497 ntTSL 213.14□□□□□ -0.311e-6■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 LIN54-201ENST00000340417 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.333e-6■■■■□ 19.3
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