RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481120.1

LAMA5-209, Transcript of laminin subunit alpha 5, humanhuman

TSL 2

Gene LAMA5, Length 386 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5-209ENST00000481120 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.67■■■■■ 6.5
LAMA5-209ENST00000481120 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.61■■■■■ 5.53
LAMA5-209ENST00000481120 ABCC9O60706 1549 aa48.86■■■■■ 5.41
LAMA5-209ENST00000481120 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.94■■■■■ 5.11
LAMA5-209ENST00000481120 NACADO15069 1562 aa46.84■■■■■ 5.09
LAMA5-209ENST00000481120 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.77■■■■■ 5.08
LAMA5-209ENST00000481120 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.5■■■■■ 5.03
LAMA5-209ENST00000481120 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.24■■■■■ 4.99
LAMA5-209ENST00000481120 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.13■■■■■ 4.97
LAMA5-209ENST00000481120 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.66■■■■■ 4.9
LAMA5-209ENST00000481120 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.64■■■■■ 4.9
LAMA5-209ENST00000481120 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.39■■■■■ 4.86
LAMA5-209ENST00000481120 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.21■■■■■ 4.83
LAMA5-209ENST00000481120 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.13■■■■■ 4.82
LAMA5-209ENST00000481120 SCRIBQ14160 1630 aa45.12■■■■■ 4.81
LAMA5-209ENST00000481120 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.29■■■■■ 4.68
LAMA5-209ENST00000481120 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.18■■■■■ 4.66
LAMA5-209ENST00000481120 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.02■■■■■ 4.64
LAMA5-209ENST00000481120 NCAPD3P42695 1498 aa43.25■■■■■ 4.51
LAMA5-209ENST00000481120 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.2■■■■■ 4.51
LAMA5-209ENST00000481120 SMARCA4P51532 1647 aa43.19■■■■■ 4.51
LAMA5-209ENST00000481120 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.14■■■■■ 4.5
LAMA5-209ENST00000481120 SMARCA2P51531 1590 aa43.12■■■■■ 4.49
LAMA5-209ENST00000481120 HMGXB3Q12766 1538 aa42.92■■■■■ 4.46
LAMA5-209ENST00000481120 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.86■■■■■ 4.45
LAMA5-209ENST00000481120 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.81■■■■■ 4.44
LAMA5-209ENST00000481120 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.77■■■■■ 4.44
LAMA5-209ENST00000481120 WIZO95785 1651 aa42.28■■■■■ 4.36
LAMA5-209ENST00000481120 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.28■■■■■ 4.36
LAMA5-209ENST00000481120 ERCC6Q03468 1493 aa42.24■■■■■ 4.35
LAMA5-209ENST00000481120 NESP48681 1621 aa42.13■■■■■ 4.33
LAMA5-209ENST00000481120 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.11■■■■■ 4.33
LAMA5-209ENST00000481120 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.99■■■■■ 4.31
LAMA5-209ENST00000481120 CUX2O14529 1486 aa41.98■■■■■ 4.31
LAMA5-209ENST00000481120 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.95■■■■■ 4.31
LAMA5-209ENST00000481120 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.9■■■■■ 4.3
LAMA5-209ENST00000481120 CFTRP13569 1480 aa41.6■■■■■ 4.25
LAMA5-209ENST00000481120 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.56■■■■■ 4.24
LAMA5-209ENST00000481120 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.54■■■■■ 4.24
LAMA5-209ENST00000481120 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.44■■■■■ 4.22
LAMA5-209ENST00000481120 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.41■■■■■ 4.22
LAMA5-209ENST00000481120 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.41■■■■■ 4.22
LAMA5-209ENST00000481120 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.41■■■■■ 4.22
LAMA5-209ENST00000481120 WDR62O43379 1518 aa41.24■■■■■ 4.19
LAMA5-209ENST00000481120 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.2■■■■■ 4.19
LAMA5-209ENST00000481120 PRDM2Q13029 1718 aa41.1■■■■■ 4.17
LAMA5-209ENST00000481120 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.96■■■■■ 4.15
LAMA5-209ENST00000481120 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.95■■■■■ 4.15
LAMA5-209ENST00000481120 ABCC8Q09428 1581 aa40.86■■■■■ 4.13
LAMA5-209ENST00000481120 TOPBP1Q92547 1522 aa40.67■■■■■ 4.1
LAMA5-209ENST00000481120 IFT140Q96RY7 1462 aa40.6■■■■■ 4.09
LAMA5-209ENST00000481120 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.6■■■■■ 4.09
LAMA5-209ENST00000481120 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.31■■■■■ 4.04
LAMA5-209ENST00000481120 OSCARQ8IYS5 282 aa40.3■■■■■ 4.04
LAMA5-209ENST00000481120 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.3■■■■■ 4.04
LAMA5-209ENST00000481120 SOGA1O94964 1423 aa40.25■■■■■ 4.03
LAMA5-209ENST00000481120 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.22■■■■■ 4.03
LAMA5-209ENST00000481120 CUX1P39880 1505 aa40.18■■■■■ 4.02
LAMA5-209ENST00000481120 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.13■■■■■ 4.02
LAMA5-209ENST00000481120 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.11■■■■■ 4.014e-10■■■■■ 37.7
LAMA5-209ENST00000481120 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.1■■■■■ 4.01
LAMA5-209ENST00000481120 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.09■■■■■ 4.01
LAMA5-209ENST00000481120 WDR97A6NE52 1622 aa40.02■■■■■ 4
LAMA5-209ENST00000481120 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40■■■■□ 3.99
LAMA5-209ENST00000481120 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.9■■■■□ 3.98
LAMA5-209ENST00000481120 FBLN2P98095 1184 aa39.8■■■■□ 3.96
LAMA5-209ENST00000481120 GRIN2BQ13224 1484 aa39.8■■■■□ 3.96
LAMA5-209ENST00000481120 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.8■■■■□ 3.96
LAMA5-209ENST00000481120 TOP2BQ02880 1626 aa39.79■■■■□ 3.96
LAMA5-209ENST00000481120 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.74■■■■□ 3.95
LAMA5-209ENST00000481120 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.73■■■■□ 3.95
LAMA5-209ENST00000481120 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.73■■■■□ 3.95
LAMA5-209ENST00000481120 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.7■■■■□ 3.95
LAMA5-209ENST00000481120 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.68■■■■□ 3.94
LAMA5-209ENST00000481120 SYNJ1O43426 1573 aa39.65■■■■□ 3.94
LAMA5-209ENST00000481120 CHD1O14646 1710 aa39.62■■■■□ 3.93
LAMA5-209ENST00000481120 SYNJ2O15056 1496 aa39.56■■■■□ 3.92
LAMA5-209ENST00000481120 TRIM41Q8WV44 630 aa39.56■■■■□ 3.92
LAMA5-209ENST00000481120 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.55■■■■□ 3.92
LAMA5-209ENST00000481120 PBRM1Q86U86 1689 aa39.49■■■■□ 3.91
LAMA5-209ENST00000481120 ARHGEF11O15085 1522 aa39.41■■■■□ 3.9
LAMA5-209ENST00000481120 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.4■■■■□ 3.9
LAMA5-209ENST00000481120 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.4■■■■□ 3.9
LAMA5-209ENST00000481120 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.4■■■■□ 3.9
LAMA5-209ENST00000481120 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.34■■■■□ 3.89
LAMA5-209ENST00000481120 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.3■■■■□ 3.88
LAMA5-209ENST00000481120 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.27■■■■□ 3.88
LAMA5-209ENST00000481120 GRIN2AQ12879 1464 aa39.23■■■■□ 3.87
LAMA5-209ENST00000481120 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.21■■■■□ 3.87
LAMA5-209ENST00000481120 ADAMTS12P58397 1594 aa39.2■■■■□ 3.87
LAMA5-209ENST00000481120 KIF27Q86VH2 1401 aa39.16■■■■□ 3.86
LAMA5-209ENST00000481120 NUP160Q12769 1436 aa39.08■■■■□ 3.85
LAMA5-209ENST00000481120 IGF1RP08069 1367 aa39.04■■■■□ 3.84
LAMA5-209ENST00000481120 ARAP1Q96P48 1450 aa39.04■■■■□ 3.84
LAMA5-209ENST00000481120 CEP170Q5SW79 1584 aa38.95■■■■□ 3.83
LAMA5-209ENST00000481120 CUL7Q14999 1698 aa38.85■■■■□ 3.81
LAMA5-209ENST00000481120 JPH4Q96JJ6 628 aa38.82■■■■□ 3.8
LAMA5-209ENST00000481120 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.81■■■■□ 3.8
LAMA5-209ENST00000481120 SHROOM2Q13796 1616 aa38.75■■■■□ 3.79
LAMA5-209ENST00000481120 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa38.68■■■■□ 3.78
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