RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293683.9

PDE4A-201, Transcript of phosphodiesterase 4A, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4A, Length 2,583 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4A-201ENST00000293683 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.11■■■■□ 3.21
PDE4A-201ENST00000293683 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.42■■■□□ 2.46
PDE4A-201ENST00000293683 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
PDE4A-201ENST00000293683 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.35
PDE4A-201ENST00000293683 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.58■■■□□ 2.33
PDE4A-201ENST00000293683 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.24■■■□□ 2.27
PDE4A-201ENST00000293683 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.23■■■□□ 2.27
PDE4A-201ENST00000293683 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.16■■■□□ 2.26
PDE4A-201ENST00000293683 HRCP23327 699 aa28.77■■■□□ 2.2
PDE4A-201ENST00000293683 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.66■■■□□ 2.18
PDE4A-201ENST00000293683 PCGF6Q9BYE7 350 aa28.65■■■□□ 2.18
PDE4A-201ENST00000293683 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.42■■■□□ 2.14
PDE4A-201ENST00000293683 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
PDE4A-201ENST00000293683 ABCC9O60706 1549 aa28.15■■■□□ 2.1
PDE4A-201ENST00000293683 SCRIBQ14160 1630 aa28■■■□□ 2.07
PDE4A-201ENST00000293683 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
PDE4A-201ENST00000293683 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.05
PDE4A-201ENST00000293683 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.78■■■□□ 2.04
PDE4A-201ENST00000293683 TRIM41Q8WV44 630 aa27.75■■■□□ 2.03
PDE4A-201ENST00000293683 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.69■■■□□ 2.02
PDE4A-201ENST00000293683 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.56■■■□□ 2
PDE4A-201ENST00000293683 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.49■■□□□ 1.99
PDE4A-201ENST00000293683 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.39■■□□□ 1.98
PDE4A-201ENST00000293683 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
PDE4A-201ENST00000293683 NACADO15069 1562 aa27.29■■□□□ 1.96
PDE4A-201ENST00000293683 WIZO95785 1651 aa27.27■■□□□ 1.96
PDE4A-201ENST00000293683 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
PDE4A-201ENST00000293683 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
PDE4A-201ENST00000293683 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
PDE4A-201ENST00000293683 ABCC8Q09428 1581 aa26.83■■□□□ 1.89
PDE4A-201ENST00000293683 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
PDE4A-201ENST00000293683 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.77■■□□□ 1.88
PDE4A-201ENST00000293683 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
PDE4A-201ENST00000293683 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
PDE4A-201ENST00000293683 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
PDE4A-201ENST00000293683 SMARCA4P51532 1647 aa26.68■■□□□ 1.86
PDE4A-201ENST00000293683 SMARCA2P51531 1590 aa26.66■■□□□ 1.86
PDE4A-201ENST00000293683 SOGA1O94964 1423 aa26.63■■□□□ 1.85
PDE4A-201ENST00000293683 CEP162Q5TB80 1403 aa26.6■■□□□ 1.85
PDE4A-201ENST00000293683 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.55■■□□□ 1.84
PDE4A-201ENST00000293683 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.54■■□□□ 1.84
PDE4A-201ENST00000293683 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.52■■□□□ 1.84
PDE4A-201ENST00000293683 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.46■■□□□ 1.83
PDE4A-201ENST00000293683 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.42■■□□□ 1.82
PDE4A-201ENST00000293683 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
PDE4A-201ENST00000293683 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
PDE4A-201ENST00000293683 NEUROD1Q13562 356 aa26.37■■□□□ 1.81
PDE4A-201ENST00000293683 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.35■■□□□ 1.81
PDE4A-201ENST00000293683 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
PDE4A-201ENST00000293683 EEA1Q15075 1411 aa26.32■■□□□ 1.8
PDE4A-201ENST00000293683 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
PDE4A-201ENST00000293683 GOLGA3Q08378 1498 aa26.26■■□□□ 1.79
PDE4A-201ENST00000293683 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.19■■□□□ 1.78
PDE4A-201ENST00000293683 SYNJ1O43426 1573 aa26.15■■□□□ 1.78
PDE4A-201ENST00000293683 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa26.11■■□□□ 1.77
PDE4A-201ENST00000293683 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
PDE4A-201ENST00000293683 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.07■■□□□ 1.76
PDE4A-201ENST00000293683 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.07■■□□□ 1.76
PDE4A-201ENST00000293683 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
PDE4A-201ENST00000293683 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
PDE4A-201ENST00000293683 CLIP1P30622 1438 aa26.02■■□□□ 1.76
PDE4A-201ENST00000293683 KIF21BO75037 1637 aa26.01■■□□□ 1.75
PDE4A-201ENST00000293683 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
PDE4A-201ENST00000293683 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.94■■□□□ 1.74
PDE4A-201ENST00000293683 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.93■■□□□ 1.74
PDE4A-201ENST00000293683 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.92■■□□□ 1.74
PDE4A-201ENST00000293683 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
PDE4A-201ENST00000293683 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.73
PDE4A-201ENST00000293683 MIER1Q8N108 512 aa25.81■■□□□ 1.72
PDE4A-201ENST00000293683 APLP2Q06481 763 aa25.8■■□□□ 1.72
PDE4A-201ENST00000293683 TOP2BQ02880 1626 aa25.71■■□□□ 1.71
PDE4A-201ENST00000293683 ARAP1Q96P48 1450 aa25.59■■□□□ 1.69
PDE4A-201ENST00000293683 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.58■■□□□ 1.69
PDE4A-201ENST00000293683 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
PDE4A-201ENST00000293683 PRXQ9BXM0 1461 aa25.56■■□□□ 1.68
PDE4A-201ENST00000293683 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
PDE4A-201ENST00000293683 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.52■■□□□ 1.68
PDE4A-201ENST00000293683 CUX1P39880 1505 aa25.46■■□□□ 1.67
PDE4A-201ENST00000293683 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.39■■□□□ 1.65
PDE4A-201ENST00000293683 KIF27Q86VH2 1401 aa25.35■■□□□ 1.65
PDE4A-201ENST00000293683 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
PDE4A-201ENST00000293683 NCAPD3P42695 1498 aa25.31■■□□□ 1.64
PDE4A-201ENST00000293683 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.31■■□□□ 1.64
PDE4A-201ENST00000293683 HMGXB3Q12766 1538 aa25.3■■□□□ 1.64
PDE4A-201ENST00000293683 ITGAEP38570 1179 aa25.3■■□□□ 1.64
PDE4A-201ENST00000293683 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.26■■□□□ 1.63
PDE4A-201ENST00000293683 CFTRP13569 1480 aa25.23■■□□□ 1.63
PDE4A-201ENST00000293683 CUX2O14529 1486 aa25.21■■□□□ 1.63
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PDE4A-201ENST00000293683 IGF1RP08069 1367 aa25.1■■□□□ 1.61
PDE4A-201ENST00000293683 MAPKBP1O60336 1514 aa25.07■■□□□ 1.6
PDE4A-201ENST00000293683 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
PDE4A-201ENST00000293683 TIAM1Q13009 1591 aa25.05■■□□□ 1.6
PDE4A-201ENST00000293683 KCNH8Q96L42 1107 aa25.03■■□□□ 1.6
PDE4A-201ENST00000293683 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25■■□□□ 1.59
PDE4A-201ENST00000293683 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.99■■□□□ 1.59
PDE4A-201ENST00000293683 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.97■■□□□ 1.59
PDE4A-201ENST00000293683 PRDM2Q13029 1718 aa24.96■■□□□ 1.59
PDE4A-201ENST00000293683 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.96■■□□□ 1.59
PDE4A-201ENST00000293683 P3H3Q8IVL6 736 aa24.95■■□□□ 1.58
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