RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530346.5

GMDS-AS1-206, humanhuman

TSL 4

Gene GMDS-AS1, Length 594 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-206ENST00000530346 NISCHQ9Y2I1 1504 aa44.28■■■■■ 4.68
GMDS-AS1-206ENST00000530346 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa39.4■■■■□ 3.9
GMDS-AS1-206ENST00000530346 ABCC9O60706 1549 aa38.79■■■■□ 3.8
GMDS-AS1-206ENST00000530346 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.24■■■■□ 3.55
GMDS-AS1-206ENST00000530346 NACADO15069 1562 aa37.18■■■■□ 3.54
GMDS-AS1-206ENST00000530346 DCAF8L2P0C7V8 631 aa37.1■■■■□ 3.53
GMDS-AS1-206ENST00000530346 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.94■■■■□ 3.5
GMDS-AS1-206ENST00000530346 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP36.82■■■■□ 3.49
GMDS-AS1-206ENST00000530346 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa36.67■■■■□ 3.46
GMDS-AS1-206ENST00000530346 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.25■■■■□ 3.39
GMDS-AS1-206ENST00000530346 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.22■■■■□ 3.39
GMDS-AS1-206ENST00000530346 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.08■■■■□ 3.37
GMDS-AS1-206ENST00000530346 SCRIBQ14160 1630 aa35.88■■■■□ 3.33
GMDS-AS1-206ENST00000530346 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.85■■■■□ 3.33
GMDS-AS1-206ENST00000530346 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.8■■■■□ 3.32
GMDS-AS1-206ENST00000530346 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.16■■■■□ 3.22
GMDS-AS1-206ENST00000530346 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.05■■■■□ 3.2
GMDS-AS1-206ENST00000530346 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.91■■■■□ 3.18
GMDS-AS1-206ENST00000530346 NCAPD3P42695 1498 aa34.35■■■■□ 3.09
GMDS-AS1-206ENST00000530346 SMARCA4P51532 1647 aa34.34■■■■□ 3.09
GMDS-AS1-206ENST00000530346 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP34.32■■■■□ 3.09
GMDS-AS1-206ENST00000530346 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.29■■■■□ 3.08
GMDS-AS1-206ENST00000530346 SMARCA2P51531 1590 aa34.23■■■■□ 3.07
GMDS-AS1-206ENST00000530346 HMGXB3Q12766 1538 aa34.09■■■■□ 3.05
GMDS-AS1-206ENST00000530346 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.08■■■■□ 3.05
GMDS-AS1-206ENST00000530346 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.07■■■■□ 3.05
GMDS-AS1-206ENST00000530346 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.97■■■■□ 3.03
GMDS-AS1-206ENST00000530346 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.67■■■□□ 2.98
GMDS-AS1-206ENST00000530346 WIZO95785 1651 aa33.64■■■□□ 2.98
GMDS-AS1-206ENST00000530346 NESP48681 1621 aa33.47■■■□□ 2.95
GMDS-AS1-206ENST00000530346 ERCC6Q03468 1493 aa33.47■■■□□ 2.95
GMDS-AS1-206ENST00000530346 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.41■■■□□ 2.94
GMDS-AS1-206ENST00000530346 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33.34■■■□□ 2.93
GMDS-AS1-206ENST00000530346 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.33■■■□□ 2.93
GMDS-AS1-206ENST00000530346 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.26■■■□□ 2.91
GMDS-AS1-206ENST00000530346 CUX2O14529 1486 aa33.24■■■□□ 2.91
GMDS-AS1-206ENST00000530346 CFTRP13569 1480 aa33.06■■■□□ 2.88
GMDS-AS1-206ENST00000530346 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33■■■□□ 2.87
GMDS-AS1-206ENST00000530346 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33■■■□□ 2.87
GMDS-AS1-206ENST00000530346 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.98■■■□□ 2.87
GMDS-AS1-206ENST00000530346 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.9■■■□□ 2.86
GMDS-AS1-206ENST00000530346 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.87■■■□□ 2.85
GMDS-AS1-206ENST00000530346 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.87■■■□□ 2.85
GMDS-AS1-206ENST00000530346 WDR62O43379 1518 aa32.76■■■□□ 2.83
GMDS-AS1-206ENST00000530346 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.63■■■□□ 2.81
GMDS-AS1-206ENST00000530346 PRDM2Q13029 1718 aa32.62■■■□□ 2.81
GMDS-AS1-206ENST00000530346 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.55■■■□□ 2.8
GMDS-AS1-206ENST00000530346 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.53■■■□□ 2.8
GMDS-AS1-206ENST00000530346 ABCC8Q09428 1581 aa32.4■■■□□ 2.78
GMDS-AS1-206ENST00000530346 TOPBP1Q92547 1522 aa32.33■■■□□ 2.77
GMDS-AS1-206ENST00000530346 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.26■■■□□ 2.75
GMDS-AS1-206ENST00000530346 IFT140Q96RY7 1462 aa32.23■■■□□ 2.75
GMDS-AS1-206ENST00000530346 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.04■■■□□ 2.72
GMDS-AS1-206ENST00000530346 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.04■■■□□ 2.72
GMDS-AS1-206ENST00000530346 CUX1P39880 1505 aa31.98■■■□□ 2.71
GMDS-AS1-206ENST00000530346 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.97■■■□□ 2.71
GMDS-AS1-206ENST00000530346 SOGA1O94964 1423 aa31.96■■■□□ 2.71
GMDS-AS1-206ENST00000530346 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.92■■■□□ 2.7
GMDS-AS1-206ENST00000530346 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.89■■■□□ 2.7
GMDS-AS1-206ENST00000530346 OSCARQ8IYS5 282 aa31.88■■■□□ 2.69
GMDS-AS1-206ENST00000530346 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.85■■■□□ 2.69
GMDS-AS1-206ENST00000530346 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.85■■■□□ 2.69
GMDS-AS1-206ENST00000530346 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.78■■■□□ 2.68
GMDS-AS1-206ENST00000530346 WDR97A6NE52 1622 aa31.75■■■□□ 2.67
GMDS-AS1-206ENST00000530346 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.75■■■□□ 2.67
GMDS-AS1-206ENST00000530346 TOP2BQ02880 1626 aa31.65■■■□□ 2.66
GMDS-AS1-206ENST00000530346 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.64■■■□□ 2.66
GMDS-AS1-206ENST00000530346 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.62■■■□□ 2.65
GMDS-AS1-206ENST00000530346 GRIN2BQ13224 1484 aa31.6■■■□□ 2.65
GMDS-AS1-206ENST00000530346 SYNJ1O43426 1573 aa31.59■■■□□ 2.65
GMDS-AS1-206ENST00000530346 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.56■■■□□ 2.64
GMDS-AS1-206ENST00000530346 FBLN2P98095 1184 aa31.54■■■□□ 2.64
GMDS-AS1-206ENST00000530346 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.53■■■□□ 2.64
GMDS-AS1-206ENST00000530346 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.53■■■□□ 2.64
GMDS-AS1-206ENST00000530346 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.46■■■□□ 2.63
GMDS-AS1-206ENST00000530346 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.46■■■□□ 2.63
GMDS-AS1-206ENST00000530346 CHD1O14646 1710 aa31.44■■■□□ 2.62
GMDS-AS1-206ENST00000530346 SYNJ2O15056 1496 aa31.41■■■□□ 2.62
GMDS-AS1-206ENST00000530346 PBRM1Q86U86 1689 aa31.37■■■□□ 2.61
GMDS-AS1-206ENST00000530346 TRIM41Q8WV44 630 aa31.29■■■□□ 2.6
GMDS-AS1-206ENST00000530346 ARHGEF11O15085 1522 aa31.25■■■□□ 2.59
GMDS-AS1-206ENST00000530346 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.25■■■□□ 2.59
GMDS-AS1-206ENST00000530346 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.24■■■□□ 2.59
GMDS-AS1-206ENST00000530346 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.24■■■□□ 2.59
GMDS-AS1-206ENST00000530346 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.24■■■□□ 2.59
GMDS-AS1-206ENST00000530346 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.22■■■□□ 2.59
GMDS-AS1-206ENST00000530346 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.19■■■□□ 2.58
GMDS-AS1-206ENST00000530346 ADAMTS12P58397 1594 aa31.17■■■□□ 2.58
GMDS-AS1-206ENST00000530346 GRIN2AQ12879 1464 aa31.16■■■□□ 2.58
GMDS-AS1-206ENST00000530346 KIF27Q86VH2 1401 aa31.13■■■□□ 2.57
GMDS-AS1-206ENST00000530346 NUP160Q12769 1436 aa31.07■■■□□ 2.56
GMDS-AS1-206ENST00000530346 CYB5RLQ6IPT4 315 aa31.05■■■□□ 2.56
GMDS-AS1-206ENST00000530346 IGF1RP08069 1367 aa31.05■■■□□ 2.56
GMDS-AS1-206ENST00000530346 ARAP1Q96P48 1450 aa30.98■■■□□ 2.55
GMDS-AS1-206ENST00000530346 CEP170Q5SW79 1584 aa30.96■■■□□ 2.55
GMDS-AS1-206ENST00000530346 CUL7Q14999 1698 aa30.87■■■□□ 2.53
GMDS-AS1-206ENST00000530346 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.85■■■□□ 2.53
GMDS-AS1-206ENST00000530346 JPH4Q96JJ6 628 aa30.79■■■□□ 2.52
GMDS-AS1-206ENST00000530346 SHROOM2Q13796 1616 aa30.79■■■□□ 2.52
GMDS-AS1-206ENST00000530346 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.73■■■□□ 2.51
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