Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.538e-8■■■■□ 23.1
PABPC4Q13310 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.878e-8■■■■□ 23.1
PABPC4Q13310 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.288e-8■■■■□ 23.1
PABPC4Q13310 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.381e-10■■■■□ 23.1
PABPC4Q13310 VAMP8-201ENST00000263864 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.291e-10■■■■□ 23.1
PABPC4Q13310 VAMP8-202ENST00000409760 805 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.571e-10■■■■□ 23.1
PABPC4Q13310 ERGIC3-217ENST00000488935 389 ntTSL 219.39■□□□□ 0.695e-7■■■■□ 23.1
PABPC4Q13310 SRRM2-216ENST00000573583 543 ntTSL 411.26□□□□□ -0.612e-22■■■■□ 23.1
PABPC4Q13310 TATDN1-218ENST00000523631 2016 ntTSL 212.84□□□□□ -0.351e-10■■■■□ 23.1
PABPC4Q13310 TATDN1-217ENST00000523214 1134 ntTSL 1 (best)8.16□□□□□ -1.11e-10■■■■□ 23.1
PABPC4Q13310 TATDN1-215ENST00000522927 782 ntTSL 36.28□□□□□ -1.41e-10■■■■□ 23.1
PABPC4Q13310 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.411e-10■■■■□ 23.1
PABPC4Q13310 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.511e-10■■■■□ 23.1
PABPC4Q13310 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.591e-10■■■■□ 23.1
PABPC4Q13310 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.794e-7■■■■□ 23.1
PABPC4Q13310 HADHB-209ENST00000545822 1870 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.094e-7■■■■□ 23.1
PABPC4Q13310 HADHB-201ENST00000317799 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.184e-7■■■■□ 23.1
PABPC4Q13310 HADHB-207ENST00000494615 2883 ntTSL 28.04□□□□□ -1.124e-7■■■■□ 23.1
PABPC4Q13310 B4GALT2-208ENST00000498543 360 ntTSL 321.24■□□□□ 0.996e-7■■■■□ 23.1
PABPC4Q13310 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.876e-6■■■■□ 23.1
PABPC4Q13310 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.856e-6■■■■□ 23.1
PABPC4Q13310 SEC11C-206ENST00000591406 462 ntTSL 26.83□□□□□ -1.322e-7■■■■□ 23.1
PABPC4Q13310 USF2-213ENST00000600341 1392 ntTSL 221.24■□□□□ 0.992e-8■■■■□ 23.1
PABPC4Q13310 USF2-206ENST00000594264 2742 ntTSL 216.29■□□□□ 0.22e-8■■■■□ 23.1
PABPC4Q13310 C19orf70-202ENST00000585605 586 ntTSL 319.01■□□□□ 0.631e-12■■■■□ 23.1
PABPC4Q13310 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.531e-12■■■■□ 23.1
PABPC4Q13310 MTFP1-204ENST00000412752 759 ntTSL 325.15■■□□□ 1.625e-8■■■■□ 23.1
PABPC4Q13310 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.451e-9■■■■□ 23.1
PABPC4Q13310 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.441e-9■■■■□ 23.1
PABPC4Q13310 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.951e-9■■■■□ 23.1
PABPC4Q13310 NARF-203ENST00000374611 1722 ntTSL 519.64■□□□□ 0.731e-9■■■■□ 23.1
PABPC4Q13310 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.71e-9■■■■□ 23.1
PABPC4Q13310 NARF-201ENST00000309794 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.21e-9■■■■□ 23.1
PABPC4Q13310 NARF-211ENST00000578820 625 ntTSL 313.21□□□□□ -0.291e-9■■■■□ 23.1
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PABPC4Q13310 NARF-227ENST00000584965 300 ntTSL 310.7□□□□□ -0.71e-9■■■■□ 23.1
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PABPC4Q13310 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.183e-6■■■■□ 23.1
PABPC4Q13310 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.093e-6■■■■□ 23.1
PABPC4Q13310 UBE2F-218ENST00000454786 1292 ntTSL 521.16■□□□□ 0.983e-6■■■■□ 23.1
PABPC4Q13310 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.813e-6■■■■□ 23.1
PABPC4Q13310 UBE2F-216ENST00000445676 831 ntTSL 318.35■□□□□ 0.533e-6■■■■□ 23.1
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PABPC4Q13310 UBE2F-SCLY-202ENST00000449891 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 214.52□□□□□ -0.083e-6■■■■□ 23.1
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PABPC4Q13310 UBE2F-SCLY-201ENST00000449191 951 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.463e-6■■■■□ 23.1
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PABPC4Q13310 TMEM63B-203ENST00000371893 2921 ntTSL 1 (best)16.98■□□□□ 0.314e-7■■■■□ 23.1
PABPC4Q13310 TMEM63B-209ENST00000533121 2465 ntTSL 1 (best)16.87■□□□□ 0.294e-7■■■■□ 23.1
PABPC4Q13310 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.044e-7■■■■□ 23.1
PABPC4Q13310 TMEM63B-201ENST00000259746 3318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.314e-7■■■■□ 23.1
PABPC4Q13310 AC092073.1-201ENST00000592740 625 ntAPPRIS P1 TSL 320.59■□□□□ 0.899e-9■■■■□ 23.1
PABPC4Q13310 ARL6IP4-209ENST00000442210 716 ntTSL 327.11■■□□□ 1.938e-7■■■■□ 23.1
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PABPC4Q13310 DCAF10-201ENST00000242323 7393 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.113e-6■■■■□ 23.1
PABPC4Q13310 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.193e-6■■■■□ 23.1
PABPC4Q13310 NUP37-204ENST00000547269 798 ntTSL 25.46□□□□□ -1.543e-6■■■■□ 23.1
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PABPC4Q13310 TRAPPC4-214ENST00000533632 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.078e-8■■■■□ 23
PABPC4Q13310 TRAPPC4-213ENST00000533149 1340 ntTSL 214.03□□□□□ -0.168e-8■■■■□ 23
PABPC4Q13310 TRAPPC4-204ENST00000524797 1924 ntTSL 213.48□□□□□ -0.258e-8■■■■□ 23
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PABPC4Q13310 TRAPPC4-201ENST00000359005 849 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.488e-8■■■■□ 23
PABPC4Q13310 TRAPPC4-206ENST00000525303 654 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.528e-8■■■■□ 23
PABPC4Q13310 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.626e-7■■■■□ 23
PABPC4Q13310 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.398e-9■■■■□ 23
PABPC4Q13310 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.118e-9■■■■□ 23
PABPC4Q13310 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.078e-9■■■■□ 23
PABPC4Q13310 LSM7-202ENST00000585395 621 ntTSL 327.56■■■□□ 28e-9■■■■□ 23
PABPC4Q13310 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.441e-6■■■■□ 23
PABPC4Q13310 CHID1-205ENST00000454838 3255 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.21e-6■■■■□ 23
PABPC4Q13310 CHID1-204ENST00000449825 3537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.381e-6■■■■□ 23
PABPC4Q13310 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.962e-6■■■■□ 23
PABPC4Q13310 ZNRF1-204ENST00000566244 3980 nt11.3□□□□□ -0.62e-6■■■■□ 23
PABPC4Q13310 NME3-209ENST00000566600 913 ntTSL 230.98■■■□□ 2.553e-7■■■■□ 23
PABPC4Q13310 NME3-202ENST00000561637 1014 ntTSL 230.51■■■□□ 2.473e-7■■■■□ 23
PABPC4Q13310 NME3-210ENST00000567271 752 ntTSL 225.76■■□□□ 1.713e-7■■■■□ 23
PABPC4Q13310 NME3-207ENST00000564628 811 ntTSL 523.04■■□□□ 1.283e-7■■■■□ 23
PABPC4Q13310 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.283e-7■■■■□ 23
PABPC4Q13310 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.693e-7■■■■□ 23
PABPC4Q13310 NME3-211ENST00000568561 813 ntTSL 1 (best)19.03■□□□□ 0.643e-7■■■■□ 23
PABPC4Q13310 TXNL4A-207ENST00000586825 586 ntTSL 332.26■■■□□ 2.751e-10■■■■□ 23
PABPC4Q13310 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.621e-10■■■■□ 23
PABPC4Q13310 TXNL4A-205ENST00000586295 706 ntTSL 331.42■■■□□ 2.621e-10■■■■□ 23
PABPC4Q13310 CCNB1-204ENST00000506572 1331 ntTSL 1 (best)18.27■□□□□ 0.524e-8■■■■□ 23
PABPC4Q13310 CCNB1-203ENST00000505500 1190 ntTSL 1 (best)9.04□□□□□ -0.964e-8■■■■□ 23
PABPC4Q13310 RPL13-205ENST00000467736 528 ntTSL 320.22■□□□□ 0.832e-46■■■■□ 23
PABPC4Q13310 GRK2-207ENST00000529738 500 ntTSL 225.09■■□□□ 1.612e-9■■■■□ 23
PABPC4Q13310 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.024e-11■■■■□ 23
PABPC4Q13310 HDLBP-241ENST00000487169 4339 ntTSL 214.78□□□□□ -0.046e-8■■■■□ 23
PABPC4Q13310 HDLBP-204ENST00000391976 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.066e-8■■■■□ 23
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