RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566600.1

NME3-209, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 2

Gene NME3, Length 913 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-209ENST00000566600 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.88■■■■■ 7.66
NME3-209ENST00000566600 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa55.82■■■■■ 6.53
NME3-209ENST00000566600 ABCC9O60706 1549 aa54.28■■■■■ 6.28
NME3-209ENST00000566600 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.43■■■■■ 5.98
NME3-209ENST00000566600 NACADO15069 1562 aa52.42■■■■■ 5.98
NME3-209ENST00000566600 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.42■■■■■ 5.98
NME3-209ENST00000566600 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.41■■■■■ 5.98
NME3-209ENST00000566600 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.22■■■■■ 5.95
NME3-209ENST00000566600 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.09■■■■■ 5.93
NME3-209ENST00000566600 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.13■■■■■ 5.78
NME3-209ENST00000566600 SCRIBQ14160 1630 aa50.88■■■■■ 5.74
NME3-209ENST00000566600 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP50.75■■■■■ 5.71
NME3-209ENST00000566600 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.73■■■■■ 5.71
NME3-209ENST00000566600 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.36■■■■■ 5.65
NME3-209ENST00000566600 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.51■■■■■ 5.52
NME3-209ENST00000566600 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.41■■■■■ 5.5
NME3-209ENST00000566600 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.12■■■■■ 5.45
NME3-209ENST00000566600 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.89■■■■■ 5.42
NME3-209ENST00000566600 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48.75■■■■■ 5.39
NME3-209ENST00000566600 SMARCA4P51532 1647 aa48.72■■■■■ 5.39
NME3-209ENST00000566600 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.43■■■■■ 5.34
NME3-209ENST00000566600 SMARCA2P51531 1590 aa48.4■■■■■ 5.34
NME3-209ENST00000566600 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.39■■■■■ 5.34
NME3-209ENST00000566600 NCAPD3P42695 1498 aa48.35■■■■■ 5.33
NME3-209ENST00000566600 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.27■■■■■ 5.32
NME3-209ENST00000566600 HMGXB3Q12766 1538 aa48.15■■■■■ 5.3
NME3-209ENST00000566600 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.04■■■■■ 5.28
NME3-209ENST00000566600 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.99■■■■■ 5.27
NME3-209ENST00000566600 WIZO95785 1651 aa47.92■■■■■ 5.26
NME3-209ENST00000566600 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.47■■■■■ 5.19
NME3-209ENST00000566600 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.04■■■■■ 5.12
NME3-209ENST00000566600 NESP48681 1621 aa47.02■■■■■ 5.12
NME3-209ENST00000566600 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.99■■■■■ 5.11
NME3-209ENST00000566600 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.96■■■■■ 5.11
NME3-209ENST00000566600 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.89■■■■■ 5.1
NME3-209ENST00000566600 ERCC6Q03468 1493 aa46.82■■■■■ 5.09
NME3-209ENST00000566600 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.74■■■■■ 5.07
NME3-209ENST00000566600 CFTRP13569 1480 aa46.73■■■■■ 5.07
NME3-209ENST00000566600 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.5■■■■■ 5.03
NME3-209ENST00000566600 PRDM2Q13029 1718 aa46.4■■■■■ 5.02
NME3-209ENST00000566600 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.4■■■■■ 5.02
NME3-209ENST00000566600 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.34■■■■■ 5.01
NME3-209ENST00000566600 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.28■■■■■ 5
NME3-209ENST00000566600 CUX2O14529 1486 aa46.24■■■■■ 4.99
NME3-209ENST00000566600 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.21■■■■■ 4.99
NME3-209ENST00000566600 WDR62O43379 1518 aa46.03■■■■■ 4.96
NME3-209ENST00000566600 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.88■■■■■ 4.94
NME3-209ENST00000566600 ABCC8Q09428 1581 aa45.79■■■■■ 4.92
NME3-209ENST00000566600 TOPBP1Q92547 1522 aa45.68■■■■■ 4.9
NME3-209ENST00000566600 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.68■■■■■ 4.9
NME3-209ENST00000566600 CUX1P39880 1505 aa45.42■■■■■ 4.86
NME3-209ENST00000566600 IFT140Q96RY7 1462 aa45.36■■■■■ 4.85
NME3-209ENST00000566600 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.31■■■■■ 4.84
NME3-209ENST00000566600 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.28■■■■■ 4.84
NME3-209ENST00000566600 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.24■■■■■ 4.83
NME3-209ENST00000566600 SOGA1O94964 1423 aa45.16■■■■■ 4.82
NME3-209ENST00000566600 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.15■■■■■ 4.82
NME3-209ENST00000566600 TOP2BQ02880 1626 aa45.15■■■■■ 4.82
NME3-209ENST00000566600 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.13■■■■■ 4.82
NME3-209ENST00000566600 SYNJ1O43426 1573 aa45.1■■■■■ 4.81
NME3-209ENST00000566600 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.08■■■■■ 4.81
NME3-209ENST00000566600 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.06■■■■■ 4.8
NME3-209ENST00000566600 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.93■■■■■ 4.78
NME3-209ENST00000566600 WDR97A6NE52 1622 aa44.9■■■■■ 4.78
NME3-209ENST00000566600 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.86■■■■■ 4.773e-11■■■□□ 16.1
NME3-209ENST00000566600 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.85■■■■■ 4.77
NME3-209ENST00000566600 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.83■■■■■ 4.77
NME3-209ENST00000566600 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.65■■■■■ 4.74
NME3-209ENST00000566600 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.61■■■■■ 4.73
NME3-209ENST00000566600 GRIN2BQ13224 1484 aa44.61■■■■■ 4.73
NME3-209ENST00000566600 PBRM1Q86U86 1689 aa44.5■■■■■ 4.71
NME3-209ENST00000566600 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.47■■■■■ 4.71
NME3-209ENST00000566600 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.47■■■■■ 4.71
NME3-209ENST00000566600 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.47■■■■■ 4.71
NME3-209ENST00000566600 TRIM41Q8WV44 630 aa44.43■■■■■ 4.7
NME3-209ENST00000566600 OSCARQ8IYS5 282 aa44.39■■■■■ 4.7
NME3-209ENST00000566600 KIF27Q86VH2 1401 aa44.34■■■■■ 4.69
NME3-209ENST00000566600 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.33■■■■■ 4.69
NME3-209ENST00000566600 FBLN2P98095 1184 aa44.31■■■■■ 4.68
NME3-209ENST00000566600 CHD1O14646 1710 aa44.3■■■■■ 4.68
NME3-209ENST00000566600 SYNJ2O15056 1496 aa44.28■■■■■ 4.68
NME3-209ENST00000566600 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.26■■■■■ 4.68
NME3-209ENST00000566600 ADAMTS12P58397 1594 aa44.18■■■■■ 4.66
NME3-209ENST00000566600 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.15■■■■■ 4.66
NME3-209ENST00000566600 IGF1RP08069 1367 aa44.08■■■■■ 4.65
NME3-209ENST00000566600 CHIC1Q5VXU3 224 aa44.02■■■■■ 4.64
NME3-209ENST00000566600 GRIN2AQ12879 1464 aa44.02■■■■■ 4.64
NME3-209ENST00000566600 CUL7Q14999 1698 aa43.99■■■■■ 4.63
NME3-209ENST00000566600 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.91■■■■■ 4.62
NME3-209ENST00000566600 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa43.84■■■■■ 4.61
NME3-209ENST00000566600 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.83■■■■■ 4.61
NME3-209ENST00000566600 NUP160Q12769 1436 aa43.81■■■■■ 4.6
NME3-209ENST00000566600 CEP170Q5SW79 1584 aa43.75■■■■■ 4.59
NME3-209ENST00000566600 EEA1Q15075 1411 aa43.71■■■■■ 4.59
NME3-209ENST00000566600 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa43.63■■■■■ 4.57
NME3-209ENST00000566600 ARHGEF11O15085 1522 aa43.61■■■■■ 4.57
NME3-209ENST00000566600 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.57■■■■■ 4.57
NME3-209ENST00000566600 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.57■■■■■ 4.57
NME3-209ENST00000566600 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.57■■■■■ 4.57
NME3-209ENST00000566600 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.57■■■■■ 4.57
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