RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567271.1

NME3-210, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 2

Gene NME3, Length 752 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-210ENST00000567271 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.5■■■■■ 5.99
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NME3-210ENST00000567271 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.88■■■■■ 4.61
NME3-210ENST00000567271 NACADO15069 1562 aa43.84■■■■■ 4.61
NME3-210ENST00000567271 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.72■■■■■ 4.59
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NME3-210ENST00000567271 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.43■■■■■ 4.54
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NME3-210ENST00000567271 SCRIBQ14160 1630 aa42.54■■■■■ 4.4
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NME3-210ENST00000567271 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.91■■■■■ 4.3
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NME3-210ENST00000567271 CECR2Q9BXF3 1484 aa41■■■■■ 4.15
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NME3-210ENST00000567271 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.67■■■■■ 4.1
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NME3-210ENST00000567271 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.46■■■■■ 4.07
NME3-210ENST00000567271 SMARCA2P51531 1590 aa40.43■■■■■ 4.06
NME3-210ENST00000567271 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.32■■■■■ 4.05
NME3-210ENST00000567271 HMGXB3Q12766 1538 aa40.25■■■■■ 4.03
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NME3-210ENST00000567271 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.16■■■■□ 3.86
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NME3-210ENST00000567271 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.04■■■■□ 3.84
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NME3-210ENST00000567271 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.77■■■■□ 3.8
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NME3-210ENST00000567271 TOPBP1Q92547 1522 aa38.22■■■■□ 3.71
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NME3-210ENST00000567271 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.28■■■■□ 3.56
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NME3-210ENST00000567271 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.38■■■■□ 3.41
NME3-210ENST00000567271 SHROOM2Q13796 1616 aa36.36■■■■□ 3.41
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