RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567271.1

NME3-210, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 2

Gene NME3, Length 752 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-210ENST00000567271 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.5■■■■■ 5.99
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NME3-210ENST00000567271 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.88■■■■■ 4.62
NME3-210ENST00000567271 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.88■■■■■ 4.61
NME3-210ENST00000567271 NACADO15069 1562 aa43.84■■■■■ 4.61
NME3-210ENST00000567271 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.72■■■■■ 4.59
NME3-210ENST00000567271 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.61■■■■■ 4.57
NME3-210ENST00000567271 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.43■■■■■ 4.54
NME3-210ENST00000567271 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.85■■■■■ 4.45
NME3-210ENST00000567271 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.68■■■■■ 4.42
NME3-210ENST00000567271 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.56■■■■■ 4.4
NME3-210ENST00000567271 SCRIBQ14160 1630 aa42.54■■■■■ 4.4
NME3-210ENST00000567271 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.11■■■■■ 4.33
NME3-210ENST00000567271 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.91■■■■■ 4.3
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NME3-210ENST00000567271 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.26■■■■■ 4.19
NME3-210ENST00000567271 CECR2Q9BXF3 1484 aa41■■■■■ 4.15
NME3-210ENST00000567271 SMARCA4P51532 1647 aa40.7■■■■■ 4.11
NME3-210ENST00000567271 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.67■■■■■ 4.1
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NME3-210ENST00000567271 NCAPD3P42695 1498 aa40.49■■■■■ 4.07
NME3-210ENST00000567271 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.46■■■■■ 4.07
NME3-210ENST00000567271 SMARCA2P51531 1590 aa40.43■■■■■ 4.06
NME3-210ENST00000567271 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.32■■■■■ 4.05
NME3-210ENST00000567271 HMGXB3Q12766 1538 aa40.25■■■■■ 4.03
NME3-210ENST00000567271 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.15■■■■■ 4.02
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NME3-210ENST00000567271 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.32■■■■□ 3.88
NME3-210ENST00000567271 ERCC6Q03468 1493 aa39.3■■■■□ 3.88
NME3-210ENST00000567271 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.16■■■■□ 3.86
NME3-210ENST00000567271 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.14■■■■□ 3.86
NME3-210ENST00000567271 CFTRP13569 1480 aa39.08■■■■□ 3.85
NME3-210ENST00000567271 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.04■■■■□ 3.84
NME3-210ENST00000567271 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.97■■■■□ 3.83
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NME3-210ENST00000567271 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.77■■■■□ 3.8
NME3-210ENST00000567271 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.72■■■■□ 3.79
NME3-210ENST00000567271 PRDM2Q13029 1718 aa38.69■■■■□ 3.78
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NME3-210ENST00000567271 TOPBP1Q92547 1522 aa38.22■■■■□ 3.71
NME3-210ENST00000567271 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.16■■■■□ 3.7
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NME3-210ENST00000567271 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.72■■■■□ 3.63
NME3-210ENST00000567271 TOP2BQ02880 1626 aa37.62■■■■□ 3.61
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NME3-210ENST00000567271 SYNJ1O43426 1573 aa37.61■■■■□ 3.61
NME3-210ENST00000567271 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.6■■■■□ 3.61
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NME3-210ENST00000567271 GRIN2BQ13224 1484 aa37.31■■■■□ 3.56
NME3-210ENST00000567271 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.28■■■■□ 3.56
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NME3-210ENST00000567271 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.2■■■■□ 3.54
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NME3-210ENST00000567271 FBLN2P98095 1184 aa37.16■■■■□ 3.54
NME3-210ENST00000567271 CHD1O14646 1710 aa37.13■■■■□ 3.53
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NME3-210ENST00000567271 ADAMTS12P58397 1594 aa36.91■■■■□ 3.5
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NME3-210ENST00000567271 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.48■■■■□ 3.43
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NME3-210ENST00000567271 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.38■■■■□ 3.41
NME3-210ENST00000567271 SHROOM2Q13796 1616 aa36.36■■■■□ 3.41
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