RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219302.7

NME3-201, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NME3, Length 1,069 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-201ENST00000219302 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.76■■■■□ 3.96
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NME3-201ENST00000219302 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.64■■■■□ 3.3
NME3-201ENST00000219302 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.02■■■■□ 3.04
NME3-201ENST00000219302 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.87■■■■□ 3.01
NME3-201ENST00000219302 NACADO15069 1562 aa33.79■■■■□ 3
NME3-201ENST00000219302 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.63■■■□□ 2.97
NME3-201ENST00000219302 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.41■■■□□ 2.94
NME3-201ENST00000219302 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.32■■■□□ 2.92
NME3-201ENST00000219302 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.22■■■□□ 2.91
NME3-201ENST00000219302 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.09■■■□□ 2.89
NME3-201ENST00000219302 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.91■■■□□ 2.86
NME3-201ENST00000219302 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.84■■■□□ 2.85
NME3-201ENST00000219302 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.6■■■□□ 2.81
NME3-201ENST00000219302 SCRIBQ14160 1630 aa32.47■■■□□ 2.79
NME3-201ENST00000219302 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.35■■■□□ 2.77
NME3-201ENST00000219302 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.3■■■□□ 2.76
NME3-201ENST00000219302 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.25■■■□□ 2.75
NME3-201ENST00000219302 NCAPD3P42695 1498 aa31.26■■■□□ 2.59
NME3-201ENST00000219302 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.17■■■□□ 2.58
NME3-201ENST00000219302 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.13■■■□□ 2.57
NME3-201ENST00000219302 SMARCA4P51532 1647 aa30.99■■■□□ 2.55
NME3-201ENST00000219302 SMARCA2P51531 1590 aa30.96■■■□□ 2.55
NME3-201ENST00000219302 HMGXB3Q12766 1538 aa30.93■■■□□ 2.54
NME3-201ENST00000219302 CUX2O14529 1486 aa30.93■■■□□ 2.54
NME3-201ENST00000219302 ERCC6Q03468 1493 aa30.9■■■□□ 2.54
NME3-201ENST00000219302 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.83■■■□□ 2.53
NME3-201ENST00000219302 NESP48681 1621 aa30.77■■■□□ 2.52
NME3-201ENST00000219302 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.76■■■□□ 2.51
NME3-201ENST00000219302 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.73■■■□□ 2.51
NME3-201ENST00000219302 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.64■■■□□ 2.5
NME3-201ENST00000219302 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.49■■■□□ 2.47
NME3-201ENST00000219302 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.42■■■□□ 2.46
NME3-201ENST00000219302 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.36■■■□□ 2.45
NME3-201ENST00000219302 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.3■■■□□ 2.44
NME3-201ENST00000219302 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.27■■■□□ 2.44
NME3-201ENST00000219302 WIZO95785 1651 aa30.22■■■□□ 2.43
NME3-201ENST00000219302 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.07■■■□□ 2.4
NME3-201ENST00000219302 WDR62O43379 1518 aa30.01■■■□□ 2.39
NME3-201ENST00000219302 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
NME3-201ENST00000219302 CFTRP13569 1480 aa29.92■■■□□ 2.38
NME3-201ENST00000219302 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.92■■■□□ 2.38
NME3-201ENST00000219302 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.91■■■□□ 2.38
NME3-201ENST00000219302 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
NME3-201ENST00000219302 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
NME3-201ENST00000219302 TRIM41Q8WV44 630 aa29.66■■■□□ 2.34
NME3-201ENST00000219302 OSCARQ8IYS5 282 aa29.57■■■□□ 2.32
NME3-201ENST00000219302 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.55■■■□□ 2.32
NME3-201ENST00000219302 PRDM2Q13029 1718 aa29.45■■■□□ 2.3
NME3-201ENST00000219302 IFT140Q96RY7 1462 aa29.36■■■□□ 2.29
NME3-201ENST00000219302 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
NME3-201ENST00000219302 TOPBP1Q92547 1522 aa29.33■■■□□ 2.29
NME3-201ENST00000219302 ABCC8Q09428 1581 aa29.26■■■□□ 2.27
NME3-201ENST00000219302 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.18■■■□□ 2.26
NME3-201ENST00000219302 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.1■■■□□ 2.25
NME3-201ENST00000219302 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.1■■■□□ 2.25
NME3-201ENST00000219302 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.1■■■□□ 2.25
NME3-201ENST00000219302 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
NME3-201ENST00000219302 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.08■■■□□ 2.253e-11■■■□□ 16.1
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NME3-201ENST00000219302 ARHGEF11O15085 1522 aa29.03■■■□□ 2.24
NME3-201ENST00000219302 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
NME3-201ENST00000219302 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.94■■■□□ 2.22
NME3-201ENST00000219302 SOGA1O94964 1423 aa28.92■■■□□ 2.22
NME3-201ENST00000219302 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
NME3-201ENST00000219302 FBLN2P98095 1184 aa28.89■■■□□ 2.22
NME3-201ENST00000219302 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.88■■■□□ 2.21
NME3-201ENST00000219302 CHD1O14646 1710 aa28.88■■■□□ 2.21
NME3-201ENST00000219302 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.81■■■□□ 2.2
NME3-201ENST00000219302 CUX1P39880 1505 aa28.78■■■□□ 2.2
NME3-201ENST00000219302 ARAP1Q96P48 1450 aa28.74■■■□□ 2.19
NME3-201ENST00000219302 WDR97A6NE52 1622 aa28.72■■■□□ 2.19
NME3-201ENST00000219302 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.72■■■□□ 2.19
NME3-201ENST00000219302 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
NME3-201ENST00000219302 GRIN2BQ13224 1484 aa28.65■■■□□ 2.18
NME3-201ENST00000219302 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
NME3-201ENST00000219302 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.62■■■□□ 2.17
NME3-201ENST00000219302 SYNJ2O15056 1496 aa28.57■■■□□ 2.16
NME3-201ENST00000219302 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
NME3-201ENST00000219302 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
NME3-201ENST00000219302 SYNJ1O43426 1573 aa28.54■■■□□ 2.16
NME3-201ENST00000219302 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.53■■■□□ 2.16
NME3-201ENST00000219302 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.49■■■□□ 2.15
NME3-201ENST00000219302 PBRM1Q86U86 1689 aa28.43■■■□□ 2.14
NME3-201ENST00000219302 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.42■■■□□ 2.14
NME3-201ENST00000219302 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.35■■■□□ 2.13
NME3-201ENST00000219302 GRIN2AQ12879 1464 aa28.27■■■□□ 2.12
NME3-201ENST00000219302 TOP2BQ02880 1626 aa28.25■■■□□ 2.11
NME3-201ENST00000219302 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.24■■■□□ 2.11
NME3-201ENST00000219302 NUP160Q12769 1436 aa28.22■■■□□ 2.11
NME3-201ENST00000219302 ADAMTS12P58397 1594 aa28.2■■■□□ 2.1
NME3-201ENST00000219302 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.18■■■□□ 2.1
NME3-201ENST00000219302 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.18■■■□□ 2.1
NME3-201ENST00000219302 CEP170Q5SW79 1584 aa28.16■■■□□ 2.1
NME3-201ENST00000219302 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.12■■■□□ 2.09
NME3-201ENST00000219302 SHROOM2Q13796 1616 aa28.06■■■□□ 2.08
NME3-201ENST00000219302 JPH4Q96JJ6 628 aa27.98■■■□□ 2.07
NME3-201ENST00000219302 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.07
NME3-201ENST00000219302 IGF1RP08069 1367 aa27.83■■■□□ 2.05
NME3-201ENST00000219302 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.79■■■□□ 2.04
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