RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561637.5

NME3-202, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 2

Gene NME3, Length 1,014 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-202ENST00000561637 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.78■■■■■ 7.64
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NME3-202ENST00000561637 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.21■■■■■ 6.27
NME3-202ENST00000561637 NACADO15069 1562 aa53.66■■■■■ 6.18
NME3-202ENST00000561637 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.3■■■■■ 6.12
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NME3-202ENST00000561637 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53.17■■■■■ 6.1
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NME3-202ENST00000561637 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.65■■■■■ 6.02
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NME3-202ENST00000561637 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.75■■■■■ 5.88
NME3-202ENST00000561637 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.67■■■■■ 5.86
NME3-202ENST00000561637 SCRIBQ14160 1630 aa51.6■■■■■ 5.85
NME3-202ENST00000561637 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP51.47■■■■■ 5.83
NME3-202ENST00000561637 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa50.41■■■■■ 5.66
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NME3-202ENST00000561637 NCAPD3P42695 1498 aa49.56■■■■■ 5.52
NME3-202ENST00000561637 ERCC6Q03468 1493 aa49.47■■■■■ 5.51
NME3-202ENST00000561637 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.34■■■■■ 5.49
NME3-202ENST00000561637 SMARCA4P51532 1647 aa49.14■■■■■ 5.46
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NME3-202ENST00000561637 SMARCA2P51531 1590 aa49.11■■■■■ 5.45
NME3-202ENST00000561637 NESP48681 1621 aa49.1■■■■■ 5.45
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NME3-202ENST00000561637 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.56■■■■■ 5.36
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NME3-202ENST00000561637 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.42■■■■■ 5.34
NME3-202ENST00000561637 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.24■■■■■ 5.31
NME3-202ENST00000561637 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.01■■■■■ 5.28
NME3-202ENST00000561637 TRIM41Q8WV44 630 aa47.95■■■■■ 5.27
NME3-202ENST00000561637 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.91■■■■■ 5.26
NME3-202ENST00000561637 WIZO95785 1651 aa47.84■■■■■ 5.25
NME3-202ENST00000561637 WDR62O43379 1518 aa47.84■■■■■ 5.25
NME3-202ENST00000561637 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.59■■■■■ 5.21
NME3-202ENST00000561637 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.56■■■■■ 5.2
NME3-202ENST00000561637 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.49■■■■■ 5.19
NME3-202ENST00000561637 CFTRP13569 1480 aa47.33■■■■■ 5.17
NME3-202ENST00000561637 OSCARQ8IYS5 282 aa47.24■■■■■ 5.15
NME3-202ENST00000561637 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.2■■■■■ 5.15
NME3-202ENST00000561637 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.2■■■■■ 5.15
NME3-202ENST00000561637 PRDM2Q13029 1718 aa46.89■■■■■ 5.1
NME3-202ENST00000561637 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa46.8■■■■■ 5.08
NME3-202ENST00000561637 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa46.8■■■■■ 5.08
NME3-202ENST00000561637 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa46.8■■■■■ 5.08
NME3-202ENST00000561637 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.74■■■■■ 5.07
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NME3-202ENST00000561637 IFT140Q96RY7 1462 aa46.64■■■■■ 5.06
NME3-202ENST00000561637 ARHGEF11O15085 1522 aa46.54■■■■■ 5.04
NME3-202ENST00000561637 TOPBP1Q92547 1522 aa46.54■■■■■ 5.04
NME3-202ENST00000561637 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.43■■■■■ 5.02
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NME3-202ENST00000561637 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.02■■■■■ 4.96
NME3-202ENST00000561637 FBLN2P98095 1184 aa46.01■■■■■ 4.96
NME3-202ENST00000561637 TRHP20396 242 aaPredicted RBP45.92■■■■■ 4.94
NME3-202ENST00000561637 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.91■■■■■ 4.94
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NME3-202ENST00000561637 CLASP1Q7Z460 1538 aa45.66■■■■■ 4.9
NME3-202ENST00000561637 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.64■■■■■ 4.9
NME3-202ENST00000561637 WDR97A6NE52 1622 aa45.57■■■■■ 4.89
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NME3-202ENST00000561637 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.52■■■■■ 4.88
NME3-202ENST00000561637 SYNJ1O43426 1573 aa45.51■■■■■ 4.88
NME3-202ENST00000561637 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.49■■■■■ 4.87
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NME3-202ENST00000561637 SYNJ2O15056 1496 aa45.36■■■■■ 4.85
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NME3-202ENST00000561637 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.81■■■■■ 4.76
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NME3-202ENST00000561637 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.77■■■■■ 4.76
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NME3-202ENST00000561637 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.58■■■■■ 4.73
NME3-202ENST00000561637 KIF13AQ9H1H9 1805 aa44.54■■■■■ 4.72
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NME3-202ENST00000561637 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP44.38■■■■■ 4.69
NME3-202ENST00000561637 JPH4Q96JJ6 628 aa44.29■■■■■ 4.68
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