Protein–RNA interactions for Protein: Q14978

NOLC1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOLC1Q14978 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.376e-11■□□□□ 10
NOLC1Q14978 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.346e-11■□□□□ 10
NOLC1Q14978 PDCD6-204ENST00000506909 458 ntTSL 314.85□□□□□ -0.036e-11■□□□□ 10
NOLC1Q14978 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.076e-11■□□□□ 10
NOLC1Q14978 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.076e-11■□□□□ 10
NOLC1Q14978 PDCD6-210ENST00000513582 3500 ntTSL 213.64□□□□□ -0.236e-11■□□□□ 10
NOLC1Q14978 PDCD6-209ENST00000512466 3763 ntTSL 212.71□□□□□ -0.376e-11■□□□□ 10
NOLC1Q14978 PDCD6-208ENST00000511482 878 ntTSL 59.82□□□□□ -0.846e-11■□□□□ 10
NOLC1Q14978 PDCD6-205ENST00000507473 486 ntTSL 38.54□□□□□ -1.046e-11■□□□□ 10
NOLC1Q14978 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.341e-9■□□□□ 10
NOLC1Q14978 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.811e-9■□□□□ 10
NOLC1Q14978 TAF15-206ENST00000603967 656 ntTSL 318.54■□□□□ 0.561e-9■□□□□ 10
NOLC1Q14978 TAF15-210ENST00000604694 891 ntTSL 518.54■□□□□ 0.561e-9■□□□□ 10
NOLC1Q14978 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.381e-9■□□□□ 10
NOLC1Q14978 SF3B3-215ENST00000577085 529 ntTSL 416.98■□□□□ 0.312e-12■□□□□ 10
NOLC1Q14978 SEMA4C-203ENST00000449330 839 ntTSL 316■□□□□ 0.152e-12■□□□□ 10
NOLC1Q14978 SF3B3-207ENST00000566095 453 ntTSL 310.71□□□□□ -0.692e-12■□□□□ 10
NOLC1Q14978 SF3B3-210ENST00000567654 334 ntTSL 36.3□□□□□ -1.42e-12■□□□□ 10
NOLC1Q14978 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.258e-8■□□□□ 10
NOLC1Q14978 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.988e-8■□□□□ 10
NOLC1Q14978 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.148e-8■□□□□ 10
NOLC1Q14978 RTN4-206ENST00000394611 4161 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.718e-8■□□□□ 10
NOLC1Q14978 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.118e-8■□□□□ 10
NOLC1Q14978 RTN4-205ENST00000394609 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.158e-8■□□□□ 10
NOLC1Q14978 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.688e-8■□□□□ 10
NOLC1Q14978 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.768e-8■□□□□ 10
NOLC1Q14978 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.186e-7■□□□□ 10
NOLC1Q14978 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.056e-7■□□□□ 10
NOLC1Q14978 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.016e-7■□□□□ 10
NOLC1Q14978 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.778e-7■□□□□ 10
NOLC1Q14978 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.448e-7■□□□□ 10
NOLC1Q14978 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.448e-7■□□□□ 10
NOLC1Q14978 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.268e-7■□□□□ 10
NOLC1Q14978 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.248e-7■□□□□ 10
NOLC1Q14978 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.248e-7■□□□□ 10
NOLC1Q14978 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.128e-7■□□□□ 10
NOLC1Q14978 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.028e-7■□□□□ 10
NOLC1Q14978 OS9-202ENST00000315970 2691 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.188e-7■□□□□ 10
NOLC1Q14978 HBG2-203ENST00000380259 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.463e-12■□□□□ 10
NOLC1Q14978 HBG2-202ENST00000380252 694 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.573e-12■□□□□ 10
NOLC1Q14978 HBE1-201ENST00000292896 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.693e-12■□□□□ 10
NOLC1Q14978 HBE1-202ENST00000380237 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.773e-12■□□□□ 10
NOLC1Q14978 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.619e-8■□□□□ 10
NOLC1Q14978 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.339e-8■□□□□ 10
NOLC1Q14978 PTGES3-206ENST00000537473 2939 ntTSL 216.61■□□□□ 0.259e-8■□□□□ 10
NOLC1Q14978 P4HB-205ENST00000467086 785 ntTSL 525.73■■□□□ 1.712e-36■□□□□ 9.9
NOLC1Q14978 P4HB-224ENST00000576541 571 ntTSL 522.96■■□□□ 1.272e-36■□□□□ 9.9
NOLC1Q14978 P4HB-219ENST00000574914 571 ntTSL 422.96■■□□□ 1.272e-36■□□□□ 9.9
NOLC1Q14978 P4HB-222ENST00000576380 943 ntTSL 322.09■■□□□ 1.132e-36■□□□□ 9.9
NOLC1Q14978 P4HB-217ENST00000573778 688 ntTSL 521.88■■□□□ 1.092e-36■□□□□ 9.9
NOLC1Q14978 P4HB-221ENST00000576052 562 ntTSL 420.69■□□□□ 0.92e-36■□□□□ 9.9
NOLC1Q14978 P4HB-207ENST00000472244 858 ntTSL 520.53■□□□□ 0.882e-36■□□□□ 9.9
NOLC1Q14978 P4HB-211ENST00000477607 1110 ntTSL 1 (best)16.73■□□□□ 0.272e-36■□□□□ 9.9
NOLC1Q14978 P4HB-212ENST00000478034 811 ntTSL 215.64■□□□□ 0.092e-36■□□□□ 9.9
NOLC1Q14978 P4HB-218ENST00000574007 1053 ntTSL 215.29■□□□□ 0.042e-36■□□□□ 9.9
NOLC1Q14978 P4HB-214ENST00000570907 353 ntTSL 36.74□□□□□ -1.332e-36■□□□□ 9.9
NOLC1Q14978 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC18.62■□□□□ 0.574e-7■□□□□ 9.9
NOLC1Q14978 PPT1-206ENST00000526547 731 ntTSL 518.39■□□□□ 0.534e-7■□□□□ 9.9
NOLC1Q14978 PPT1-207ENST00000527311 638 ntTSL 317.55■□□□□ 0.44e-7■□□□□ 9.9
NOLC1Q14978 PPT1-212ENST00000641236 2481 nt17.23■□□□□ 0.354e-7■□□□□ 9.9
NOLC1Q14978 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC17.21■□□□□ 0.354e-7■□□□□ 9.9
NOLC1Q14978 PPT1-217ENST00000641691 2253 nt16.44■□□□□ 0.224e-7■□□□□ 9.9
NOLC1Q14978 PPT1-208ENST00000529905 1836 ntTSL 516.24■□□□□ 0.194e-7■□□□□ 9.9
NOLC1Q14978 PPT1-218ENST00000641924 550 nt16.23■□□□□ 0.194e-7■□□□□ 9.9
NOLC1Q14978 PPT1-210ENST00000530704 2340 ntTSL 1 (best)16.14■□□□□ 0.184e-7■□□□□ 9.9
NOLC1Q14978 PPT1-202ENST00000372779 588 ntTSL 516.05■□□□□ 0.164e-7■□□□□ 9.9
NOLC1Q14978 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.144e-7■□□□□ 9.9
NOLC1Q14978 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.124e-7■□□□□ 9.9
NOLC1Q14978 PPT1-204ENST00000439754 2195 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.114e-7■□□□□ 9.9
NOLC1Q14978 PPT1-211ENST00000641083 2353 nt14.31□□□□□ -0.124e-7■□□□□ 9.9
NOLC1Q14978 PPT1-219ENST00000642050 4010 ntAPPRIS P2 BASIC13.92□□□□□ -0.184e-7■□□□□ 9.9
NOLC1Q14978 FN1-219ENST00000474036 1058 ntTSL 25.9□□□□□ -1.463e-55■□□□□ 9.9
NOLC1Q14978 LAMB2-209ENST00000480640 563 ntTSL 316.34■□□□□ 0.215e-8■□□□□ 9.9
NOLC1Q14978 LAMB2-218ENST00000538659 576 ntTSL 212.82□□□□□ -0.365e-8■□□□□ 9.9
NOLC1Q14978 PEG10-204ENST00000493935 763 ntTSL 413.49□□□□□ -0.258e-12■□□□□ 9.9
NOLC1Q14978 PEG10-208ENST00000615790 6394 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.678e-12■□□□□ 9.9
NOLC1Q14978 PEG10-209ENST00000617526 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.788e-12■□□□□ 9.9
NOLC1Q14978 PEG10-206ENST00000612941 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.788e-12■□□□□ 9.9
NOLC1Q14978 PEG10-202ENST00000482108 6618 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.918e-12■□□□□ 9.9
NOLC1Q14978 PRKCSH-210ENST00000589990 567 ntTSL 213.88□□□□□ -0.194e-12■□□□□ 9.9
NOLC1Q14978 RPL23-210ENST00000584583 429 ntTSL 28.22□□□□□ -1.092e-16■□□□□ 9.9
NOLC1Q14978 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.349e-45■□□□□ 9.9
NOLC1Q14978 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.089e-8■□□□□ 9.9
NOLC1Q14978 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 19e-8■□□□□ 9.9
NOLC1Q14978 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.819e-8■□□□□ 9.9
NOLC1Q14978 HSD17B12-211ENST00000636007 563 ntTSL 419.8■□□□□ 0.769e-8■□□□□ 9.9
NOLC1Q14978 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.559e-8■□□□□ 9.9
NOLC1Q14978 HSD17B12-206ENST00000531185 611 ntTSL 418.11■□□□□ 0.499e-8■□□□□ 9.9
NOLC1Q14978 PRRC2A-206ENST00000464890 593 ntTSL 216.34■□□□□ 0.219e-8■□□□□ 9.9
NOLC1Q14978 HSD17B12-205ENST00000527433 559 ntTSL 415.64■□□□□ 0.099e-8■□□□□ 9.9
NOLC1Q14978 CRIM1-202ENST00000413985 874 ntTSL 311.76□□□□□ -0.539e-8■□□□□ 9.9
NOLC1Q14978 SLC25A3-205ENST00000547444 517 ntTSL 1 (best)9.18□□□□□ -0.945e-12■□□□□ 9.9
NOLC1Q14978 THBS1-204ENST00000484734 1291 ntTSL 58.19□□□□□ -1.19e-8■□□□□ 9.9
NOLC1Q14978 AC068205.2-201ENST00000532864 771 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.169e-8■□□□□ 9.9
NOLC1Q14978 HSD17B12-204ENST00000527213 571 ntTSL 47.58□□□□□ -1.29e-8■□□□□ 9.9
NOLC1Q14978 HSD17B12-210ENST00000534053 583 ntTSL 27.49□□□□□ -1.219e-8■□□□□ 9.9
NOLC1Q14978 HSD17B12-214ENST00000638034 546 ntTSL 56.08□□□□□ -1.449e-8■□□□□ 9.9
NOLC1Q14978 HSD17B12-209ENST00000533802 511 ntTSL 35.57□□□□□ -1.529e-8■□□□□ 9.9
NOLC1Q14978 HSD17B12-208ENST00000533090 2507 ntTSL 24.75□□□□□ -1.659e-8■□□□□ 9.9
NOLC1Q14978 RPL24-205ENST00000488288 1857 ntTSL 212.3□□□□□ -0.441e-14■□□□□ 9.9
Retrieved 100 of 7,921 protein–RNA pairs in 208.6 ms