RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262033.10

PTGES3-201, Transcript of prostaglandin E synthase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTGES3, Length 1,920 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGES3-201ENST00000262033 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.91■■■■□ 3.66
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PTGES3-201ENST00000262033 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.33■■■□□ 2.61
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PTGES3-201ENST00000262033 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.39■■■□□ 2.46
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PTGES3-201ENST00000262033 SMARCA2P51531 1590 aa28.58■■■□□ 2.17
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PTGES3-201ENST00000262033 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.13■■■□□ 2.09
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PTGES3-201ENST00000262033 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.65■■■□□ 2.02
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PTGES3-201ENST00000262033 TOP2BQ02880 1626 aa27.46■■□□□ 1.99
PTGES3-201ENST00000262033 SOGA1O94964 1423 aa27.43■■□□□ 1.98
PTGES3-201ENST00000262033 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.41■■□□□ 1.98
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PTGES3-201ENST00000262033 CUX1P39880 1505 aa27.37■■□□□ 1.97
PTGES3-201ENST00000262033 NESP48681 1621 aa27.35■■□□□ 1.97
PTGES3-201ENST00000262033 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.34■■□□□ 1.97
PTGES3-201ENST00000262033 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.33■■□□□ 1.97
PTGES3-201ENST00000262033 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.32■■□□□ 1.96
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PTGES3-201ENST00000262033 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.99■■□□□ 1.91
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PTGES3-201ENST00000262033 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.95■■□□□ 1.9
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PTGES3-201ENST00000262033 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
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PTGES3-201ENST00000262033 PRXQ9BXM0 1461 aa26.87■■□□□ 1.89
PTGES3-201ENST00000262033 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.85■■□□□ 1.89
PTGES3-201ENST00000262033 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.84■■□□□ 1.89
PTGES3-201ENST00000262033 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.84■■□□□ 1.89
PTGES3-201ENST00000262033 IGF1RP08069 1367 aa26.82■■□□□ 1.88
PTGES3-201ENST00000262033 CEP162Q5TB80 1403 aa26.81■■□□□ 1.88
PTGES3-201ENST00000262033 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.8■■□□□ 1.88
PTGES3-201ENST00000262033 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.78■■□□□ 1.88
PTGES3-201ENST00000262033 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.67■■□□□ 1.86
PTGES3-201ENST00000262033 WDR97A6NE52 1622 aa26.66■■□□□ 1.86
PTGES3-201ENST00000262033 ERCC6Q03468 1493 aa26.64■■□□□ 1.86
PTGES3-201ENST00000262033 WDR62O43379 1518 aa26.62■■□□□ 1.85
PTGES3-201ENST00000262033 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
PTGES3-201ENST00000262033 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
PTGES3-201ENST00000262033 CLIP1P30622 1438 aa26.58■■□□□ 1.85
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PTGES3-201ENST00000262033 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
PTGES3-201ENST00000262033 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.4■■□□□ 1.825e-7■■■■□ 25
PTGES3-201ENST00000262033 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.37■■□□□ 1.81
PTGES3-201ENST00000262033 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
PTGES3-201ENST00000262033 GRIN2BQ13224 1484 aa26.32■■□□□ 1.8
PTGES3-201ENST00000262033 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
PTGES3-201ENST00000262033 PBRM1Q86U86 1689 aa26.3■■□□□ 1.8
PTGES3-201ENST00000262033 ARAP1Q96P48 1450 aa26.3■■□□□ 1.8
PTGES3-201ENST00000262033 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.28■■□□□ 1.8
PTGES3-201ENST00000262033 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.28■■□□□ 1.8
PTGES3-201ENST00000262033 ADAMTS12P58397 1594 aa26.2■■□□□ 1.78
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