RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614328.4

PTGES3-207, Transcript of prostaglandin E synthase 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene PTGES3, Length 2,077 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGES3-207ENST00000614328 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.61■■■□□ 2.65
PTGES3-207ENST00000614328 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.21■■□□□ 1.95
PTGES3-207ENST00000614328 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
PTGES3-207ENST00000614328 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.4■■□□□ 1.82
PTGES3-207ENST00000614328 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.08■■□□□ 1.77
PTGES3-207ENST00000614328 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.92■■□□□ 1.74
PTGES3-207ENST00000614328 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
PTGES3-207ENST00000614328 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.47■■□□□ 1.67
PTGES3-207ENST00000614328 SCRIBQ14160 1630 aa25.21■■□□□ 1.63
PTGES3-207ENST00000614328 ABCC9O60706 1549 aa25.16■■□□□ 1.62
PTGES3-207ENST00000614328 NACADO15069 1562 aa25.14■■□□□ 1.61
PTGES3-207ENST00000614328 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.01■■□□□ 1.59
PTGES3-207ENST00000614328 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
PTGES3-207ENST00000614328 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.77■■□□□ 1.56
PTGES3-207ENST00000614328 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.57■■□□□ 1.52
PTGES3-207ENST00000614328 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.5■■□□□ 1.51
PTGES3-207ENST00000614328 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.45■■□□□ 1.5
PTGES3-207ENST00000614328 WIZO95785 1651 aa24.37■■□□□ 1.49
PTGES3-207ENST00000614328 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
PTGES3-207ENST00000614328 SMARCA4P51532 1647 aa24.17■■□□□ 1.46
PTGES3-207ENST00000614328 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.13■■□□□ 1.45
PTGES3-207ENST00000614328 TRIM41Q8WV44 630 aa24.09■■□□□ 1.45
PTGES3-207ENST00000614328 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.09■■□□□ 1.45
PTGES3-207ENST00000614328 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
PTGES3-207ENST00000614328 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
PTGES3-207ENST00000614328 SMARCA2P51531 1590 aa23.9■■□□□ 1.42
PTGES3-207ENST00000614328 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.87■■□□□ 1.41
PTGES3-207ENST00000614328 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.85■■□□□ 1.41
PTGES3-207ENST00000614328 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.81■■□□□ 1.4
PTGES3-207ENST00000614328 PCGF6Q9BYE7 350 aa23.79■■□□□ 1.4
PTGES3-207ENST00000614328 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
PTGES3-207ENST00000614328 HRCP23327 699 aa23.69■■□□□ 1.38
PTGES3-207ENST00000614328 ABCC8Q09428 1581 aa23.65■■□□□ 1.38
PTGES3-207ENST00000614328 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.57■■□□□ 1.36
PTGES3-207ENST00000614328 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
PTGES3-207ENST00000614328 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
PTGES3-207ENST00000614328 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.44■■□□□ 1.34
PTGES3-207ENST00000614328 SOGA1O94964 1423 aa23.33■■□□□ 1.32
PTGES3-207ENST00000614328 EEA1Q15075 1411 aa23.33■■□□□ 1.32
PTGES3-207ENST00000614328 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.32■■□□□ 1.32
PTGES3-207ENST00000614328 SYNJ1O43426 1573 aa23.26■■□□□ 1.31
PTGES3-207ENST00000614328 HMGXB3Q12766 1538 aa23.24■■□□□ 1.31
PTGES3-207ENST00000614328 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.23■■□□□ 1.31
PTGES3-207ENST00000614328 NCAPD3P42695 1498 aa23.21■■□□□ 1.31
PTGES3-207ENST00000614328 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.17■■□□□ 1.3
PTGES3-207ENST00000614328 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.15■■□□□ 1.3
PTGES3-207ENST00000614328 CEP162Q5TB80 1403 aa23.12■■□□□ 1.29
PTGES3-207ENST00000614328 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
PTGES3-207ENST00000614328 GOLGA3Q08378 1498 aa23.08■■□□□ 1.29
PTGES3-207ENST00000614328 TOP2BQ02880 1626 aa23.07■■□□□ 1.28
PTGES3-207ENST00000614328 KIF21BO75037 1637 aa23.05■■□□□ 1.28
PTGES3-207ENST00000614328 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.05■■□□□ 1.28
PTGES3-207ENST00000614328 CEP164Q9UPV0 1460 aa23■■□□□ 1.27
PTGES3-207ENST00000614328 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
PTGES3-207ENST00000614328 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PTGES3-207ENST00000614328 CFTRP13569 1480 aa22.91■■□□□ 1.26
PTGES3-207ENST00000614328 PRDM2Q13029 1718 aa22.91■■□□□ 1.26
PTGES3-207ENST00000614328 CUX1P39880 1505 aa22.86■■□□□ 1.25
PTGES3-207ENST00000614328 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.81■■□□□ 1.24
PTGES3-207ENST00000614328 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.76■■□□□ 1.23
PTGES3-207ENST00000614328 CLIP1P30622 1438 aa22.76■■□□□ 1.23
PTGES3-207ENST00000614328 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.74■■□□□ 1.23
PTGES3-207ENST00000614328 PRXQ9BXM0 1461 aa22.71■■□□□ 1.23
PTGES3-207ENST00000614328 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.67■■□□□ 1.22
PTGES3-207ENST00000614328 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.66■■□□□ 1.22
PTGES3-207ENST00000614328 KIF27Q86VH2 1401 aa22.65■■□□□ 1.22
PTGES3-207ENST00000614328 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
PTGES3-207ENST00000614328 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
PTGES3-207ENST00000614328 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
PTGES3-207ENST00000614328 ARAP1Q96P48 1450 aa22.48■■□□□ 1.19
PTGES3-207ENST00000614328 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.47■■□□□ 1.19
PTGES3-207ENST00000614328 CUX2O14529 1486 aa22.46■■□□□ 1.19
PTGES3-207ENST00000614328 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.45■■□□□ 1.18
PTGES3-207ENST00000614328 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
PTGES3-207ENST00000614328 APLP2Q06481 763 aa22.41■■□□□ 1.18
PTGES3-207ENST00000614328 IGF1RP08069 1367 aa22.4■■□□□ 1.18
PTGES3-207ENST00000614328 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.38■■□□□ 1.17
PTGES3-207ENST00000614328 NESP48681 1621 aa22.33■■□□□ 1.16
PTGES3-207ENST00000614328 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.32■■□□□ 1.16
PTGES3-207ENST00000614328 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.3■■□□□ 1.16
PTGES3-207ENST00000614328 TOPBP1Q92547 1522 aa22.3■■□□□ 1.16
PTGES3-207ENST00000614328 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.29■■□□□ 1.16
PTGES3-207ENST00000614328 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.26■■□□□ 1.15
PTGES3-207ENST00000614328 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
PTGES3-207ENST00000614328 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PTGES3-207ENST00000614328 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.22■■□□□ 1.15
PTGES3-207ENST00000614328 WDR97A6NE52 1622 aa22.18■■□□□ 1.14
PTGES3-207ENST00000614328 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PTGES3-207ENST00000614328 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PTGES3-207ENST00000614328 CUL7Q14999 1698 aa22.16■■□□□ 1.14
PTGES3-207ENST00000614328 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PTGES3-207ENST00000614328 MAP3K1Q13233 1512 aa22.11■■□□□ 1.13
PTGES3-207ENST00000614328 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.08■■□□□ 1.13
PTGES3-207ENST00000614328 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.08■■□□□ 1.13
PTGES3-207ENST00000614328 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.08■■□□□ 1.12
PTGES3-207ENST00000614328 TIAM1Q13009 1591 aa22.08■■□□□ 1.12
PTGES3-207ENST00000614328 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.06■■□□□ 1.12
PTGES3-207ENST00000614328 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.03■■□□□ 1.12
PTGES3-207ENST00000614328 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.01■■□□□ 1.11
PTGES3-207ENST00000614328 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.3 ms