Protein–RNA interactions for Protein: Q14978

NOLC1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOLC1Q14978 TRRAP-203ENST00000417523 550 ntTSL 417.95■□□□□ 0.464e-133■■■■■ 616.9
NOLC1Q14978 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.14e-133■■■■■ 616.9
NOLC1Q14978 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.134e-133■■■■■ 616.9
NOLC1Q14978 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.144e-133■■■■■ 616.9
NOLC1Q14978 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.324e-133■■■■■ 616.9
NOLC1Q14978 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.6□□□□□ -1.991e-323■■■■■ 610.9
NOLC1Q14978 SCARNA9-201ENST00000530422 353 ntBASIC8.26□□□□□ -1.095e-291■■■■■ 608.2
NOLC1Q14978 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.45e-291■■■■■ 608.2
NOLC1Q14978 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.595e-291■■■■■ 608.2
NOLC1Q14978 CEP295-203ENST00000530425 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 43.87□□□□□ -1.795e-291■■■■■ 608.2
NOLC1Q14978 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC3.56□□□□□ -1.845e-132■■■■■ 383.5
NOLC1Q14978 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.79□□□□□ -2.125e-170■■■■■ 310.9
NOLC1Q14978 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.113e-10■■■■■ 289.9
NOLC1Q14978 THAP9-AS1-207ENST00000507660 550 ntTSL 311.17□□□□□ -0.628e-139■■■■■ 280.8
NOLC1Q14978 THAP9-AS1-212ENST00000513581 683 ntTSL 210.85□□□□□ -0.678e-139■■■■■ 280.8
NOLC1Q14978 THAP9-AS1-206ENST00000505028 552 ntTSL 47.58□□□□□ -1.28e-139■■■■■ 280.8
NOLC1Q14978 THAP9-AS1-203ENST00000504718 573 ntTSL 47.25□□□□□ -1.258e-139■■■■■ 280.8
NOLC1Q14978 RPL23A-209ENST00000582736 595 ntTSL 1 (best)15.85■□□□□ 0.131e-323■■■■■ 269.4
NOLC1Q14978 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC0.79□□□□□ -2.281e-323■■■■■ 269.4
NOLC1Q14978 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC2.28□□□□□ -2.043e-42■■■■■ 220.2
NOLC1Q14978 THAP9-AS1-202ENST00000504520 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.142e-18■■■■■ 210.2
NOLC1Q14978 SEC31A-218ENST00000506495 541 ntTSL 410.85□□□□□ -0.672e-18■■■■■ 210.2
NOLC1Q14978 THAP9-AS1-208ENST00000508772 566 ntTSL 410.85□□□□□ -0.672e-18■■■■■ 210.2
NOLC1Q14978 THAP9-AS1-204ENST00000504792 2577 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.772e-18■■■■■ 210.2
NOLC1Q14978 SEC31A-220ENST00000507051 458 ntTSL 410.17□□□□□ -0.782e-18■■■■■ 210.2
NOLC1Q14978 THAP9-AS1-210ENST00000511271 516 ntTSL 29.38□□□□□ -0.912e-18■■■■■ 210.2
NOLC1Q14978 THAP9-AS1-211ENST00000512932 971 ntTSL 29.16□□□□□ -0.942e-18■■■■■ 210.2
NOLC1Q14978 SEC31A-222ENST00000507676 551 ntTSL 48.18□□□□□ -1.12e-18■■■■■ 210.2
NOLC1Q14978 SEC31A-211ENST00000503210 553 ntTSL 47.76□□□□□ -1.172e-18■■■■■ 210.2
NOLC1Q14978 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.362e-18■■■■■ 210.2
NOLC1Q14978 RPL37-202ENST00000504562 505 ntTSL 212.41□□□□□ -0.421e-323■■■■■ 207.7
NOLC1Q14978 RPL37-205ENST00000509877 637 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.021e-323■■■■■ 207.7
NOLC1Q14978 RPL37-203ENST00000507642 425 ntTSL 38.5□□□□□ -1.051e-323■■■■■ 207.7
NOLC1Q14978 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.171e-323■■■■■ 207.7
NOLC1Q14978 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC2.38□□□□□ -2.031e-323■■■■■ 207.7
NOLC1Q14978 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.273e-34■■■■■ 207.4
NOLC1Q14978 EIF1AX-202ENST00000379607 4427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.613e-34■■■■■ 207.4
NOLC1Q14978 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.521e-323■■■■■ 201.4
NOLC1Q14978 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.135e-125■■■■■ 194
NOLC1Q14978 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.125e-125■■■■■ 194
NOLC1Q14978 RC3H2-210ENST00000498479 5746 ntTSL 214.13□□□□□ -0.155e-125■■■■■ 194
NOLC1Q14978 RC3H2-202ENST00000357244 3991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.365e-125■■■■■ 194
NOLC1Q14978 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.655e-125■■■■■ 194
NOLC1Q14978 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC1.09□□□□□ -2.235e-125■■■■■ 194
NOLC1Q14978 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC2.79□□□□□ -1.963e-67■■■■■ 184.6
NOLC1Q14978 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC1.14□□□□□ -2.231e-13■■■■■ 183
NOLC1Q14978 SNHG16-208ENST00000591956 556 ntTSL 212.44□□□□□ -0.423e-75■■■■■ 172.5
NOLC1Q14978 SNHG16-201ENST00000448136 3607 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.443e-75■■■■■ 172.5
NOLC1Q14978 SNHG16-204ENST00000586942 568 ntTSL 4 BASIC11.16□□□□□ -0.623e-75■■■■■ 172.5
NOLC1Q14978 SNHG16-207ENST00000590435 1947 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.723e-75■■■■■ 172.5
NOLC1Q14978 SNHG16-202ENST00000493536 2424 ntTSL 1 (best)9.69□□□□□ -0.863e-75■■■■■ 172.5
NOLC1Q14978 SNHG16-206ENST00000587838 884 ntTSL 36.17□□□□□ -1.423e-75■■■■■ 172.5
NOLC1Q14978 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.741e-259■■■■■ 172.5
NOLC1Q14978 NCAPD2-202ENST00000382457 2844 ntTSL 512.93□□□□□ -0.341e-259■■■■■ 172.5
NOLC1Q14978 NCAPD2-207ENST00000539084 4290 ntTSL 211.79□□□□□ -0.521e-259■■■■■ 172.5
NOLC1Q14978 NCAPD2-208ENST00000539714 533 ntTSL 37.53□□□□□ -1.21e-259■■■■■ 172.5
NOLC1Q14978 NCAPD2-210ENST00000541399 584 ntTSL 57.35□□□□□ -1.231e-259■■■■■ 172.5
NOLC1Q14978 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC5.17□□□□□ -1.581e-259■■■■■ 172.5
NOLC1Q14978 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.421e-22■■■■■ 152.3
NOLC1Q14978 NOP58-208ENST00000488403 871 ntTSL 216.07■□□□□ 0.161e-323■■■■■ 149.9
NOLC1Q14978 NOP58-202ENST00000426814 655 ntTSL 215.79■□□□□ 0.121e-323■■■■■ 149.9
NOLC1Q14978 NOP58-204ENST00000467734 638 ntTSL 512.35□□□□□ -0.431e-323■■■■■ 149.9
NOLC1Q14978 NOP58-205ENST00000472050 582 ntTSL 312.3□□□□□ -0.441e-323■■■■■ 149.9
NOLC1Q14978 NOP58-209ENST00000492688 571 ntTSL 45.83□□□□□ -1.481e-323■■■■■ 149.9
NOLC1Q14978 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC1.34□□□□□ -2.191e-53■■■■■ 144.6
NOLC1Q14978 RPL23A-205ENST00000472628 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.476e-40■■■■■ 143.2
NOLC1Q14978 HSPA9-207ENST00000507097 1796 ntTSL 216.24■□□□□ 0.192e-54■■■■■ 142.4
NOLC1Q14978 HSPA9-212ENST00000523929 780 ntTSL 415.45■□□□□ 0.062e-54■■■■■ 142.4
NOLC1Q14978 HSPA9-201ENST00000297185 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.512e-54■■■■■ 142.4
NOLC1Q14978 HSPA9-202ENST00000501917 275 ntTSL 33.69□□□□□ -1.822e-54■■■■■ 142.4
NOLC1Q14978 HSPA9-210ENST00000508003 582 ntTSL 212.31□□□□□ -0.441e-323■■■■■ 142
NOLC1Q14978 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC3.49□□□□□ -1.851e-323■■■■■ 142
NOLC1Q14978 UBAP2-206ENST00000412543 1349 ntTSL 57.62□□□□□ -1.196e-153■■■■■ 142
NOLC1Q14978 UBAP2-207ENST00000421278 833 ntTSL 56.44□□□□□ -1.386e-153■■■■■ 142
NOLC1Q14978 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC1.73□□□□□ -2.131e-323■■■■■ 138.7
NOLC1Q14978 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.021e-323■■■■■ 136.5
NOLC1Q14978 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.951e-323■■■■■ 136.5
NOLC1Q14978 RPS20-203ENST00000519369 824 ntTSL 214.67□□□□□ -0.061e-323■■■■■ 136.5
NOLC1Q14978 RPS20-208ENST00000521262 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.21e-323■■■■■ 136.5
NOLC1Q14978 RPS20-209ENST00000521289 737 ntTSL 511.99□□□□□ -0.491e-323■■■■■ 136.5
NOLC1Q14978 RPS20-212ENST00000618656 627 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.751e-323■■■■■ 136.5
NOLC1Q14978 RPS20-207ENST00000520627 423 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.771e-323■■■■■ 136.5
NOLC1Q14978 RPS20-201ENST00000009589 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.911e-323■■■■■ 136.5
NOLC1Q14978 RPS20-204ENST00000519606 424 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.911e-323■■■■■ 136.5
NOLC1Q14978 RPS20-206ENST00000520490 402 ntTSL 38.86□□□□□ -0.991e-323■■■■■ 136.5
NOLC1Q14978 RPS20-205ENST00000519807 1826 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.081e-323■■■■■ 136.5
NOLC1Q14978 RPS20-202ENST00000518875 671 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.151e-323■■■■■ 136.5
NOLC1Q14978 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.631e-323■■■■■ 136.5
NOLC1Q14978 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.216e-40■■■■■ 136.2
NOLC1Q14978 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.026e-40■■■■■ 136.2
NOLC1Q14978 RPL23A-202ENST00000394935 580 ntTSL 310.73□□□□□ -0.696e-40■■■■■ 136.2
NOLC1Q14978 RPL23A-203ENST00000394938 688 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.056e-40■■■■■ 136.2
NOLC1Q14978 RPL23A-201ENST00000355731 587 ntTSL 57.26□□□□□ -1.256e-40■■■■■ 136.2
NOLC1Q14978 RPL7A-208ENST00000492798 374 ntTSL 1 (best)6.79□□□□□ -1.321e-323■■■■■ 135.2
NOLC1Q14978 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC5.33□□□□□ -1.561e-260■■■■■ 134.4
NOLC1Q14978 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC2.18□□□□□ -2.061e-323■■■■■ 132.1
NOLC1Q14978 RPL23A-208ENST00000580755 412 ntTSL 217.41■□□□□ 0.387e-261■■■■■ 127.7
NOLC1Q14978 CCAR1-218ENST00000630771 4540 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.941e-323■■■■■ 127
NOLC1Q14978 CCAR1-207ENST00000536012 2447 ntTSL 1 (best)8.91□□□□□ -0.981e-323■■■■■ 127
NOLC1Q14978 CCAR1-214ENST00000543225 2407 ntTSL 1 (best)8.26□□□□□ -1.091e-323■■■■■ 127
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