RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574007.5

P4HB-218, Transcript of prolyl 4-hydroxylase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene P4HB, Length 1,053 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4HB-218ENST00000574007 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.43■■■■□ 3.1
P4HB-218ENST00000574007 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.76■■■□□ 2.51
P4HB-218ENST00000574007 ABCC9O60706 1549 aa30.41■■■□□ 2.46
P4HB-218ENST00000574007 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.09■■■□□ 2.25
P4HB-218ENST00000574007 NACADO15069 1562 aa28.97■■■□□ 2.23
P4HB-218ENST00000574007 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.93■■■□□ 2.22
P4HB-218ENST00000574007 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.67■■■□□ 2.18
P4HB-218ENST00000574007 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
P4HB-218ENST00000574007 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.47■■■□□ 2.15
P4HB-218ENST00000574007 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.44■■■□□ 2.14
P4HB-218ENST00000574007 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.36■■■□□ 2.13
P4HB-218ENST00000574007 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.23■■■□□ 2.11
P4HB-218ENST00000574007 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.17■■■□□ 2.1
P4HB-218ENST00000574007 SCRIBQ14160 1630 aa28.07■■■□□ 2.08
P4HB-218ENST00000574007 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.86■■■□□ 2.05
P4HB-218ENST00000574007 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
P4HB-218ENST00000574007 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.48■■□□□ 1.99
P4HB-218ENST00000574007 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.34■■□□□ 1.97
P4HB-218ENST00000574007 SMARCA4P51532 1647 aa26.79■■□□□ 1.88
P4HB-218ENST00000574007 NCAPD3P42695 1498 aa26.73■■□□□ 1.87
P4HB-218ENST00000574007 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.71■■□□□ 1.87
P4HB-218ENST00000574007 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
P4HB-218ENST00000574007 SMARCA2P51531 1590 aa26.67■■□□□ 1.86
P4HB-218ENST00000574007 HMGXB3Q12766 1538 aa26.58■■□□□ 1.85
P4HB-218ENST00000574007 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.54■■□□□ 1.84
P4HB-218ENST00000574007 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.5■■□□□ 1.83
P4HB-218ENST00000574007 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
P4HB-218ENST00000574007 WIZO95785 1651 aa26.25■■□□□ 1.79
P4HB-218ENST00000574007 ERCC6Q03468 1493 aa26.23■■□□□ 1.79
P4HB-218ENST00000574007 NESP48681 1621 aa26.22■■□□□ 1.79
P4HB-218ENST00000574007 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
P4HB-218ENST00000574007 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.09■■□□□ 1.77
P4HB-218ENST00000574007 CUX2O14529 1486 aa26.04■■□□□ 1.76
P4HB-218ENST00000574007 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
P4HB-218ENST00000574007 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.94■■□□□ 1.74
P4HB-218ENST00000574007 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.92■■□□□ 1.74
P4HB-218ENST00000574007 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.91■■□□□ 1.74
P4HB-218ENST00000574007 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
P4HB-218ENST00000574007 CFTRP13569 1480 aa25.72■■□□□ 1.71
P4HB-218ENST00000574007 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.68■■□□□ 1.7
P4HB-218ENST00000574007 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.66■■□□□ 1.7
P4HB-218ENST00000574007 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.66■■□□□ 1.7
P4HB-218ENST00000574007 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.64■■□□□ 1.69
P4HB-218ENST00000574007 WDR62O43379 1518 aa25.6■■□□□ 1.69
P4HB-218ENST00000574007 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.59■■□□□ 1.69
P4HB-218ENST00000574007 PRDM2Q13029 1718 aa25.55■■□□□ 1.68
P4HB-218ENST00000574007 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
P4HB-218ENST00000574007 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
P4HB-218ENST00000574007 TOPBP1Q92547 1522 aa25.22■■□□□ 1.63
P4HB-218ENST00000574007 ABCC8Q09428 1581 aa25.18■■□□□ 1.62
P4HB-218ENST00000574007 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.17■■□□□ 1.62
P4HB-218ENST00000574007 IFT140Q96RY7 1462 aa25.13■■□□□ 1.61
P4HB-218ENST00000574007 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
P4HB-218ENST00000574007 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
P4HB-218ENST00000574007 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
P4HB-218ENST00000574007 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
P4HB-218ENST00000574007 CUX1P39880 1505 aa24.92■■□□□ 1.58
P4HB-218ENST00000574007 OSCARQ8IYS5 282 aa24.9■■□□□ 1.58
P4HB-218ENST00000574007 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.89■■□□□ 1.57
P4HB-218ENST00000574007 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.88■■□□□ 1.571e-13■■■■■ 34.3
P4HB-218ENST00000574007 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.88■■□□□ 1.57
P4HB-218ENST00000574007 SOGA1O94964 1423 aa24.87■■□□□ 1.57
P4HB-218ENST00000574007 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
P4HB-218ENST00000574007 WDR97A6NE52 1622 aa24.73■■□□□ 1.55
P4HB-218ENST00000574007 CHD1O14646 1710 aa24.72■■□□□ 1.55
P4HB-218ENST00000574007 TRIM41Q8WV44 630 aa24.66■■□□□ 1.54
P4HB-218ENST00000574007 FBLN2P98095 1184 aa24.65■■□□□ 1.54
P4HB-218ENST00000574007 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.64■■□□□ 1.54
P4HB-218ENST00000574007 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.63■■□□□ 1.53
P4HB-218ENST00000574007 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.63■■□□□ 1.53
P4HB-218ENST00000574007 TOP2BQ02880 1626 aa24.62■■□□□ 1.53
P4HB-218ENST00000574007 GRIN2BQ13224 1484 aa24.62■■□□□ 1.53
P4HB-218ENST00000574007 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.61■■□□□ 1.53
P4HB-218ENST00000574007 SYNJ1O43426 1573 aa24.61■■□□□ 1.53
P4HB-218ENST00000574007 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.58■■□□□ 1.53
P4HB-218ENST00000574007 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
P4HB-218ENST00000574007 PBRM1Q86U86 1689 aa24.58■■□□□ 1.53
P4HB-218ENST00000574007 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.57■■□□□ 1.52
P4HB-218ENST00000574007 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.57■■□□□ 1.52
P4HB-218ENST00000574007 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.57■■□□□ 1.52
P4HB-218ENST00000574007 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.56■■□□□ 1.52
P4HB-218ENST00000574007 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
P4HB-218ENST00000574007 ARHGEF11O15085 1522 aa24.51■■□□□ 1.51
P4HB-218ENST00000574007 SYNJ2O15056 1496 aa24.49■■□□□ 1.51
P4HB-218ENST00000574007 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.4■■□□□ 1.5
P4HB-218ENST00000574007 ADAMTS12P58397 1594 aa24.34■■□□□ 1.49
P4HB-218ENST00000574007 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.31■■□□□ 1.48
P4HB-218ENST00000574007 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.31■■□□□ 1.48
P4HB-218ENST00000574007 GRIN2AQ12879 1464 aa24.3■■□□□ 1.48
P4HB-218ENST00000574007 ARAP1Q96P48 1450 aa24.3■■□□□ 1.48
P4HB-218ENST00000574007 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.28■■□□□ 1.48
P4HB-218ENST00000574007 CEP170Q5SW79 1584 aa24.2■■□□□ 1.47
P4HB-218ENST00000574007 NUP160Q12769 1436 aa24.19■■□□□ 1.46
P4HB-218ENST00000574007 KIF27Q86VH2 1401 aa24.14■■□□□ 1.45
P4HB-218ENST00000574007 IGF1RP08069 1367 aa24.08■■□□□ 1.45
P4HB-218ENST00000574007 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.07■■□□□ 1.44
P4HB-218ENST00000574007 SHROOM2Q13796 1616 aa24.06■■□□□ 1.44
P4HB-218ENST00000574007 CUL7Q14999 1698 aa24.05■■□□□ 1.44
P4HB-218ENST00000574007 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24■■□□□ 1.43
P4HB-218ENST00000574007 JPH4Q96JJ6 628 aa23.95■■□□□ 1.42
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