Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWH9

SLTM, SAFB-like transcription modulator, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,034 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLTMQ9NWH9 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.192e-9■■■■■ 32.4
SLTMQ9NWH9 PRKCZ-215ENST00000479263 1747 ntTSL 222.55■■□□□ 1.23e-7■■■■■ 32.4
SLTMQ9NWH9 PRKCZ-226ENST00000505322 1859 ntTSL 220.01■□□□□ 0.793e-7■■■■■ 32.4
SLTMQ9NWH9 PRKCZ-214ENST00000478770 1542 ntTSL 215.29■□□□□ 0.043e-7■■■■■ 32.4
SLTMQ9NWH9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.083e-8■■■■■ 32.3
SLTMQ9NWH9 UBE2I-215ENST00000567074 884 ntTSL 1 (best)19.66■□□□□ 0.743e-8■■■■■ 32.3
SLTMQ9NWH9 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.616e-8■■■■■ 32.3
SLTMQ9NWH9 UBE2I-214ENST00000566775 396 ntTSL 38.58□□□□□ -1.043e-8■■■■■ 32.3
SLTMQ9NWH9 CERS4-207ENST00000558877 758 ntTSL 313.81□□□□□ -0.21e-6■■■■■ 32.3
SLTMQ9NWH9 CHST15-201ENST00000346248 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.218e-8■■■■■ 32.2
SLTMQ9NWH9 AC092135.1-201ENST00000623398 2059 ntBASIC12.86□□□□□ -0.358e-8■■■■■ 32.2
SLTMQ9NWH9 CHST15-205ENST00000628426 3553 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.458e-8■■■■■ 32.2
SLTMQ9NWH9 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.819e-8■■■■■ 32.2
SLTMQ9NWH9 SLCO4A1-208ENST00000497209 3092 ntTSL 1 (best)16.09■□□□□ 0.179e-8■■■■■ 32.2
SLTMQ9NWH9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.957e-7■■■■■ 32.1
SLTMQ9NWH9 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.177e-7■■■■■ 32.1
SLTMQ9NWH9 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.137e-7■■■■■ 32.1
SLTMQ9NWH9 TMCO3-205ENST00000465556 314 ntTSL 312.45□□□□□ -0.427e-7■■■■■ 32.1
SLTMQ9NWH9 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.616e-7■■■■■ 32.1
SLTMQ9NWH9 ACSF3-213ENST00000542688 2024 ntTSL 518.57■□□□□ 0.566e-7■■■■■ 32.1
SLTMQ9NWH9 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.476e-7■■■■■ 32.1
SLTMQ9NWH9 ACSF3-201ENST00000317447 3664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.216e-7■■■■■ 32.1
SLTMQ9NWH9 ACSF3-218ENST00000614302 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.36e-7■■■■■ 32.1
SLTMQ9NWH9 PCSK6-205ENST00000558433 543 ntTSL 413.37□□□□□ -0.271e-7■■■■■ 32.1
SLTMQ9NWH9 PCSK6-212ENST00000560785 507 ntTSL 412.67□□□□□ -0.381e-7■■■■■ 32.1
SLTMQ9NWH9 PCSK6-206ENST00000558864 3868 ntTSL 27.08□□□□□ -1.281e-7■■■■■ 32.1
SLTMQ9NWH9 TPGS1-202ENST00000588278 2873 nt16.49■□□□□ 0.238e-8■■■■■ 32.1
SLTMQ9NWH9 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.019e-8■■■■■ 32.1
SLTMQ9NWH9 SH3PXD2A-201ENST00000315994 5504 ntTSL 1 (best)13.81□□□□□ -0.29e-8■■■■■ 32.1
SLTMQ9NWH9 SH3PXD2A-202ENST00000355946 11245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.839e-8■■■■■ 32.1
SLTMQ9NWH9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.185e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.935e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 CDYL-207ENST00000472453 1764 ntTSL 1 (best)26.84■■□□□ 1.892e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.865e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.855e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 STK40-208ENST00000482458 900 ntTSL 325.99■■□□□ 1.755e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 PANK2-202ENST00000336066 1843 ntTSL 1 (best)25.9■■□□□ 1.745e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.532e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.515e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.515e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.515e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 PDE9A-214ENST00000460905 715 ntTSL 523.86■■□□□ 1.415e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 SLC35D2-204ENST00000482643 754 ntTSL 523.29■■□□□ 1.325e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 SRPK2-211ENST00000482862 329 ntTSL 522.43■■□□□ 1.185e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.135e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 SRPK2-212ENST00000482897 715 ntTSL 522.08■■□□□ 1.135e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.095e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.035e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.035e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 SFSWAP-203ENST00000535236 5593 ntTSL 1 (best)20.78■□□□□ 0.922e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.95e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 PDE9A-225ENST00000490803 1865 ntTSL 1 (best)20.42■□□□□ 0.865e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.33■□□□□ 0.845e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.821e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 SFSWAP-207ENST00000538548 2636 ntTSL 520.11■□□□□ 0.812e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 STK40-205ENST00000460017 511 ntTSL 520.05■□□□□ 0.85e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.795e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 CDK11A-223ENST00000509982 2306 ntTSL 519.95■□□□□ 0.781e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 PDE9A-227ENST00000495521 1565 ntTSL 1 (best)19.8■□□□□ 0.765e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 PCMT1-209ENST00000494411 600 ntTSL 419.8■□□□□ 0.765e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 PANK2-205ENST00000495692 967 ntTSL 319.8■□□□□ 0.765e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 PDE9A-221ENST00000470987 1954 ntTSL 1 (best)19.75■□□□□ 0.755e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.745e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.685e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 PDE9A-216ENST00000462571 1784 ntTSL 1 (best)19.32■□□□□ 0.685e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.685e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.661e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.661e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.661e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.661e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 PDE9A-215ENST00000460989 1521 ntTSL 1 (best)19.11■□□□□ 0.655e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.595e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 CDK11A-202ENST00000356937 2275 ntTSL 1 (best)18.64■□□□□ 0.571e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 PCMT1-207ENST00000484601 1095 ntTSL 518.6■□□□□ 0.575e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.565e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.561e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 CDK11A-209ENST00000460465 2333 ntTSL 1 (best)18.22■□□□□ 0.511e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 PDE9A-220ENST00000468805 1721 ntTSL 1 (best)18.15■□□□□ 0.55e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.55e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.55e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.425e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.45e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 PDE9A-228ENST00000497805 1908 ntTSL 1 (best)17.5■□□□□ 0.395e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.365e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 PCMT1-204ENST00000460828 582 ntTSL 517.28■□□□□ 0.365e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.255e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.255e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 PDE9A-219ENST00000467403 1661 ntTSL 1 (best)16.57■□□□□ 0.245e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 PACSIN2-210ENST00000453643 818 ntTSL 516.49■□□□□ 0.235e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.225e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.175e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.132e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.125e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 PCMT1-210ENST00000495487 548 ntTSL 315.68■□□□□ 0.15e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.15e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 PECR-207ENST00000487318 742 ntTSL 515.64■□□□□ 0.095e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.062e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.035e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 PECR-208ENST00000497889 824 ntTSL 515.14■□□□□ 0.015e-6■■■■■ 31.8
SLTMQ9NWH9 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -02e-6■■■■■ 31.8
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