RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482458.1

STK40-208, Transcript of serine/threonine kinase 40, humanhuman

TSL 3

Gene STK40, Length 900 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STK40-208ENST00000482458 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.78■■■■■ 7.8
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STK40-208ENST00000482458 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.78■■■■■ 6.36
STK40-208ENST00000482458 DNAJC5BQ9UF47 199 aa54.49■■■■■ 6.31
STK40-208ENST00000482458 NACADO15069 1562 aa54.32■■■■■ 6.29
STK40-208ENST00000482458 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.05■■■■■ 6.24
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STK40-208ENST00000482458 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53.46■■■■■ 6.15
STK40-208ENST00000482458 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.45■■■■■ 6.15
STK40-208ENST00000482458 BICRAQ9NZM4 1560 aa53.19■■■■■ 6.11
STK40-208ENST00000482458 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.79■■■■■ 6.04
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STK40-208ENST00000482458 SCRIBQ14160 1630 aa52.28■■■■■ 5.96
STK40-208ENST00000482458 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa52.11■■■■■ 5.93
STK40-208ENST00000482458 CECR2Q9BXF3 1484 aa52.05■■■■■ 5.92
STK40-208ENST00000482458 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP51.92■■■■■ 5.9
STK40-208ENST00000482458 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa50.28■■■■■ 5.64
STK40-208ENST00000482458 NCAPD3P42695 1498 aa50.17■■■■■ 5.62
STK40-208ENST00000482458 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.98■■■■■ 5.59
STK40-208ENST00000482458 ERCC6Q03468 1493 aa49.89■■■■■ 5.58
STK40-208ENST00000482458 CUX2O14529 1486 aa49.88■■■■■ 5.58
STK40-208ENST00000482458 SMARCA4P51532 1647 aa49.82■■■■■ 5.57
STK40-208ENST00000482458 SMARCA2P51531 1590 aa49.8■■■■■ 5.56
STK40-208ENST00000482458 HMGXB3Q12766 1538 aa49.75■■■■■ 5.55
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STK40-208ENST00000482458 NESP48681 1621 aa49.5■■■■■ 5.51
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STK40-208ENST00000482458 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.15■■■■■ 5.46
STK40-208ENST00000482458 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.07■■■■■ 5.45
STK40-208ENST00000482458 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP49.03■■■■■ 5.44
STK40-208ENST00000482458 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.84■■■■■ 5.41
STK40-208ENST00000482458 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.79■■■■■ 5.4
STK40-208ENST00000482458 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.64■■■■■ 5.38
STK40-208ENST00000482458 WIZO95785 1651 aa48.52■■■■■ 5.36
STK40-208ENST00000482458 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.43■■■■■ 5.34
STK40-208ENST00000482458 WDR62O43379 1518 aa48.3■■■■■ 5.32
STK40-208ENST00000482458 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.17■■■■■ 5.3
STK40-208ENST00000482458 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.1■■■■■ 5.29
STK40-208ENST00000482458 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.02■■■■■ 5.28
STK40-208ENST00000482458 CFTRP13569 1480 aa48■■■■■ 5.27
STK40-208ENST00000482458 TRIM41Q8WV44 630 aa47.96■■■■■ 5.27
STK40-208ENST00000482458 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.91■■■■■ 5.26
STK40-208ENST00000482458 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.71■■■■■ 5.23
STK40-208ENST00000482458 OSCARQ8IYS5 282 aa47.59■■■■■ 5.21
STK40-208ENST00000482458 PRDM2Q13029 1718 aa47.4■■■■■ 5.18
STK40-208ENST00000482458 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.39■■■■■ 5.18
STK40-208ENST00000482458 IFT140Q96RY7 1462 aa47.23■■■■■ 5.15
STK40-208ENST00000482458 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.2■■■■■ 5.15
STK40-208ENST00000482458 TOPBP1Q92547 1522 aa47.14■■■■■ 5.14
STK40-208ENST00000482458 ABCC8Q09428 1581 aa47■■■■■ 5.11
STK40-208ENST00000482458 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa46.97■■■■■ 5.11
STK40-208ENST00000482458 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa46.97■■■■■ 5.11
STK40-208ENST00000482458 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa46.97■■■■■ 5.11
STK40-208ENST00000482458 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.92■■■■■ 5.1
STK40-208ENST00000482458 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.88■■■■■ 5.1
STK40-208ENST00000482458 ARHGEF11O15085 1522 aa46.79■■■■■ 5.08
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STK40-208ENST00000482458 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.63■■■■■ 5.06
STK40-208ENST00000482458 CHD1O14646 1710 aa46.57■■■■■ 5.04
STK40-208ENST00000482458 FBLN2P98095 1184 aa46.52■■■■■ 5.04
STK40-208ENST00000482458 CYB5RLQ6IPT4 315 aa46.52■■■■■ 5.04
STK40-208ENST00000482458 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.49■■■■■ 5.03
STK40-208ENST00000482458 SOGA1O94964 1423 aa46.44■■■■■ 5.02
STK40-208ENST00000482458 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.4■■■■■ 5.02
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STK40-208ENST00000482458 WDR97A6NE52 1622 aa46.21■■■■■ 4.99
STK40-208ENST00000482458 CUX1P39880 1505 aa46.2■■■■■ 4.99
STK40-208ENST00000482458 TRHP20396 242 aaPredicted RBP46.12■■■■■ 4.97
STK40-208ENST00000482458 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP46.11■■■■■ 4.97
STK40-208ENST00000482458 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP46.09■■■■■ 4.97
STK40-208ENST00000482458 CLASP1Q7Z460 1538 aa46.07■■■■■ 4.97
STK40-208ENST00000482458 GRIN2BQ13224 1484 aa46.06■■■■■ 4.96
STK40-208ENST00000482458 SYNJ1O43426 1573 aa46.01■■■■■ 4.96
STK40-208ENST00000482458 SYNJ2O15056 1496 aa45.94■■■■■ 4.95
STK40-208ENST00000482458 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.86■■■■■ 4.93
STK40-208ENST00000482458 PBRM1Q86U86 1689 aa45.79■■■■■ 4.92
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STK40-208ENST00000482458 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.52■■■■■ 4.88
STK40-208ENST00000482458 GRIN2AQ12879 1464 aa45.47■■■■■ 4.87
STK40-208ENST00000482458 ADAMTS12P58397 1594 aa45.38■■■■■ 4.86
STK40-208ENST00000482458 TOP2BQ02880 1626 aa45.34■■■■■ 4.85
STK40-208ENST00000482458 ERCC6L2Q5T890 1561 aa45.34■■■■■ 4.85
STK40-208ENST00000482458 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.34■■■■■ 4.85
STK40-208ENST00000482458 NUP160Q12769 1436 aa45.33■■■■■ 4.85
STK40-208ENST00000482458 CEP170Q5SW79 1584 aa45.31■■■■■ 4.84
STK40-208ENST00000482458 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.27■■■■■ 4.84
STK40-208ENST00000482458 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.16■■■■■ 4.82
STK40-208ENST00000482458 SHROOM2Q13796 1616 aa45.12■■■■■ 4.81
STK40-208ENST00000482458 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP45.02■■■■■ 4.8
STK40-208ENST00000482458 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP44.93■■■■■ 4.78
STK40-208ENST00000482458 JPH4Q96JJ6 628 aa44.89■■■■■ 4.78
STK40-208ENST00000482458 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.75■■■■■ 4.75
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