RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460905.5

PDE9A-214, Transcript of phosphodiesterase 9A, humanhuman

TSL 5

Gene PDE9A, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE9A-214ENST00000460905 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.96■■■■■ 6.71
PDE9A-214ENST00000460905 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.24■■■■■ 5.79
PDE9A-214ENST00000460905 ABCC9O60706 1549 aa50.86■■■■■ 5.73
PDE9A-214ENST00000460905 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.64■■■■■ 5.38
PDE9A-214ENST00000460905 NACADO15069 1562 aa48.34■■■■■ 5.33
PDE9A-214ENST00000460905 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.78■■■■■ 5.24
PDE9A-214ENST00000460905 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.74■■■■■ 5.23
PDE9A-214ENST00000460905 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.55■■■■■ 5.2
PDE9A-214ENST00000460905 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.47■■■■■ 5.19
PDE9A-214ENST00000460905 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.28■■■■■ 5.16
PDE9A-214ENST00000460905 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.24■■■■■ 5.15
PDE9A-214ENST00000460905 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.18■■■■■ 5.14
PDE9A-214ENST00000460905 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.15■■■■■ 5.14
PDE9A-214ENST00000460905 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.73■■■■■ 5.07
PDE9A-214ENST00000460905 SCRIBQ14160 1630 aa46.51■■■■■ 5.04
PDE9A-214ENST00000460905 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.06■■■■■ 4.96
PDE9A-214ENST00000460905 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.01■■■■■ 4.96
PDE9A-214ENST00000460905 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.87■■■■■ 4.93
PDE9A-214ENST00000460905 NCAPD3P42695 1498 aa44.56■■■■■ 4.72
PDE9A-214ENST00000460905 SMARCA4P51532 1647 aa44.46■■■■■ 4.71
PDE9A-214ENST00000460905 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.4■■■■■ 4.7
PDE9A-214ENST00000460905 SMARCA2P51531 1590 aa44.39■■■■■ 4.7
PDE9A-214ENST00000460905 HMGXB3Q12766 1538 aa44.33■■■■■ 4.69
PDE9A-214ENST00000460905 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.27■■■■■ 4.68
PDE9A-214ENST00000460905 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.09■■■■■ 4.65
PDE9A-214ENST00000460905 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.01■■■■■ 4.64
PDE9A-214ENST00000460905 ERCC6Q03468 1493 aa43.97■■■■■ 4.63
PDE9A-214ENST00000460905 CUX2O14529 1486 aa43.96■■■■■ 4.63
PDE9A-214ENST00000460905 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.84■■■■■ 4.61
PDE9A-214ENST00000460905 NESP48681 1621 aa43.72■■■■■ 4.59
PDE9A-214ENST00000460905 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.63■■■■■ 4.57
PDE9A-214ENST00000460905 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.61■■■■■ 4.57
PDE9A-214ENST00000460905 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.41■■■■■ 4.54
PDE9A-214ENST00000460905 WIZO95785 1651 aa43.34■■■■■ 4.53
PDE9A-214ENST00000460905 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.29■■■■■ 4.52
PDE9A-214ENST00000460905 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.28■■■■■ 4.52
PDE9A-214ENST00000460905 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.16■■■■■ 4.5
PDE9A-214ENST00000460905 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.96■■■■■ 4.47
PDE9A-214ENST00000460905 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.92■■■■■ 4.46
PDE9A-214ENST00000460905 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.88■■■■■ 4.46
PDE9A-214ENST00000460905 WDR62O43379 1518 aa42.85■■■■■ 4.45
PDE9A-214ENST00000460905 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.77■■■■■ 4.44
PDE9A-214ENST00000460905 CFTRP13569 1480 aa42.74■■■■■ 4.43
PDE9A-214ENST00000460905 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.69■■■■■ 4.42
PDE9A-214ENST00000460905 PRDM2Q13029 1718 aa42.5■■■■■ 4.39
PDE9A-214ENST00000460905 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.32■■■■■ 4.37
PDE9A-214ENST00000460905 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.28■■■■■ 4.36
PDE9A-214ENST00000460905 TOPBP1Q92547 1522 aa41.91■■■■■ 4.3
PDE9A-214ENST00000460905 IFT140Q96RY7 1462 aa41.91■■■■■ 4.3
PDE9A-214ENST00000460905 ABCC8Q09428 1581 aa41.9■■■■■ 4.3
PDE9A-214ENST00000460905 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.82■■■■■ 4.29
PDE9A-214ENST00000460905 OSCARQ8IYS5 282 aa41.79■■■■■ 4.28
PDE9A-214ENST00000460905 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.74■■■■■ 4.27
PDE9A-214ENST00000460905 TRIM41Q8WV44 630 aa41.65■■■■■ 4.26
PDE9A-214ENST00000460905 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.64■■■■■ 4.26
PDE9A-214ENST00000460905 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.56■■■■■ 4.24
PDE9A-214ENST00000460905 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.48■■■■■ 4.23
PDE9A-214ENST00000460905 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.47■■■■■ 4.23
PDE9A-214ENST00000460905 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.35■■■■■ 4.21
PDE9A-214ENST00000460905 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.35■■■■■ 4.21
PDE9A-214ENST00000460905 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.35■■■■■ 4.21
PDE9A-214ENST00000460905 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.34■■■■■ 4.21
PDE9A-214ENST00000460905 CHD1O14646 1710 aa41.31■■■■■ 4.2
PDE9A-214ENST00000460905 WDR97A6NE52 1622 aa41.3■■■■■ 4.2
PDE9A-214ENST00000460905 SOGA1O94964 1423 aa41.24■■■■■ 4.19
PDE9A-214ENST00000460905 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.23■■■■■ 4.19
PDE9A-214ENST00000460905 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.23■■■■■ 4.19
PDE9A-214ENST00000460905 ARHGEF11O15085 1522 aa41.23■■■■■ 4.19
PDE9A-214ENST00000460905 CUX1P39880 1505 aa41.21■■■■■ 4.19
PDE9A-214ENST00000460905 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.08■■■■■ 4.17
PDE9A-214ENST00000460905 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41■■■■■ 4.15
PDE9A-214ENST00000460905 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.98■■■■■ 4.15
PDE9A-214ENST00000460905 FBLN2P98095 1184 aa40.96■■■■■ 4.15
PDE9A-214ENST00000460905 GRIN2BQ13224 1484 aa40.94■■■■■ 4.14
PDE9A-214ENST00000460905 PBRM1Q86U86 1689 aa40.87■■■■■ 4.13
PDE9A-214ENST00000460905 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.84■■■■■ 4.13
PDE9A-214ENST00000460905 SYNJ1O43426 1573 aa40.84■■■■■ 4.13
PDE9A-214ENST00000460905 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.82■■■■■ 4.12
PDE9A-214ENST00000460905 SYNJ2O15056 1496 aa40.81■■■■■ 4.12
PDE9A-214ENST00000460905 ARAP1Q96P48 1450 aa40.81■■■■■ 4.12
PDE9A-214ENST00000460905 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.79■■■■■ 4.12
PDE9A-214ENST00000460905 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.78■■■■■ 4.12
PDE9A-214ENST00000460905 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.75■■■■■ 4.11
PDE9A-214ENST00000460905 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.74■■■■■ 4.11
PDE9A-214ENST00000460905 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.68■■■■■ 4.1
PDE9A-214ENST00000460905 TOP2BQ02880 1626 aa40.65■■■■■ 4.1
PDE9A-214ENST00000460905 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.63■■■■■ 4.09
PDE9A-214ENST00000460905 ADAMTS12P58397 1594 aa40.47■■■■■ 4.07
PDE9A-214ENST00000460905 GRIN2AQ12879 1464 aa40.42■■■■■ 4.06
PDE9A-214ENST00000460905 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.34■■■■■ 4.05
PDE9A-214ENST00000460905 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.29■■■■■ 4.04
PDE9A-214ENST00000460905 NUP160Q12769 1436 aa40.29■■■■■ 4.04
PDE9A-214ENST00000460905 CEP170Q5SW79 1584 aa40.27■■■■■ 4.04
PDE9A-214ENST00000460905 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.25■■■■■ 4.03
PDE9A-214ENST00000460905 SHROOM2Q13796 1616 aa40.16■■■■■ 4.02
PDE9A-214ENST00000460905 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.09■■■■■ 4.01
PDE9A-214ENST00000460905 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.91■■■■□ 3.98
PDE9A-214ENST00000460905 CUL7Q14999 1698 aa39.83■■■■□ 3.97
PDE9A-214ENST00000460905 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.81■■■■□ 3.96
PDE9A-214ENST00000460905 KIF27Q86VH2 1401 aa39.8■■■■□ 3.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.5 ms