RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479263.5

PRKCZ-215, Transcript of protein kinase C zeta, humanhuman

TSL 2

Gene PRKCZ, Length 1,747 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZ-215ENST00000479263 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.38■■■■■ 5.49
PRKCZ-215ENST00000479263 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.09■■■■■ 4.49
PRKCZ-215ENST00000479263 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.45■■■■■ 4.23
PRKCZ-215ENST00000479263 ABCC9O60706 1549 aa40.93■■■■■ 4.14
PRKCZ-215ENST00000479263 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.84■■■■■ 4.13
PRKCZ-215ENST00000479263 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.77■■■■■ 4.12
PRKCZ-215ENST00000479263 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.32■■■■■ 4.04
PRKCZ-215ENST00000479263 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.26■■■■■ 4.04
PRKCZ-215ENST00000479263 NACADO15069 1562 aa40.15■■■■■ 4.02
PRKCZ-215ENST00000479263 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.85■■■■□ 3.97
PRKCZ-215ENST00000479263 SCRIBQ14160 1630 aa39.68■■■■□ 3.94
PRKCZ-215ENST00000479263 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.16■■■■□ 3.86
PRKCZ-215ENST00000479263 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.72■■■■□ 3.79
PRKCZ-215ENST00000479263 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.63■■■■□ 3.78
PRKCZ-215ENST00000479263 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.58■■■■□ 3.77
PRKCZ-215ENST00000479263 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.42■■■■□ 3.74
PRKCZ-215ENST00000479263 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.26■■■■□ 3.72
PRKCZ-215ENST00000479263 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.18■■■■□ 3.7
PRKCZ-215ENST00000479263 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.11■■■■□ 3.69
PRKCZ-215ENST00000479263 SMARCA4P51532 1647 aa38■■■■□ 3.67
PRKCZ-215ENST00000479263 WIZO95785 1651 aa37.89■■■■□ 3.66
PRKCZ-215ENST00000479263 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.53■■■■□ 3.6
PRKCZ-215ENST00000479263 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.5■■■■□ 3.59
PRKCZ-215ENST00000479263 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.43■■■■□ 3.58
PRKCZ-215ENST00000479263 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.39■■■■□ 3.58
PRKCZ-215ENST00000479263 SMARCA2P51531 1590 aa37.34■■■■□ 3.57
PRKCZ-215ENST00000479263 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.17■■■■□ 3.54
PRKCZ-215ENST00000479263 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.06■■■■□ 3.52
PRKCZ-215ENST00000479263 NCAPD3P42695 1498 aa37.06■■■■□ 3.52
PRKCZ-215ENST00000479263 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.03■■■■□ 3.52
PRKCZ-215ENST00000479263 HMGXB3Q12766 1538 aa37.01■■■■□ 3.52
PRKCZ-215ENST00000479263 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.9■■■■□ 3.5
PRKCZ-215ENST00000479263 ABCC8Q09428 1581 aa36.29■■■■□ 3.4
PRKCZ-215ENST00000479263 TRIM41Q8WV44 630 aa36.28■■■■□ 3.4
PRKCZ-215ENST00000479263 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.24■■■■□ 3.39
PRKCZ-215ENST00000479263 CFTRP13569 1480 aa36.22■■■■□ 3.39
PRKCZ-215ENST00000479263 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.11■■■■□ 3.37
PRKCZ-215ENST00000479263 PRDM2Q13029 1718 aa36.07■■■■□ 3.36
PRKCZ-215ENST00000479263 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36■■■■□ 3.35
PRKCZ-215ENST00000479263 NESP48681 1621 aa35.92■■■■□ 3.34
PRKCZ-215ENST00000479263 SYNJ1O43426 1573 aa35.92■■■■□ 3.34
PRKCZ-215ENST00000479263 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.83■■■■□ 3.33
PRKCZ-215ENST00000479263 TOP2BQ02880 1626 aa35.74■■■■□ 3.31
PRKCZ-215ENST00000479263 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.73■■■■□ 3.31
PRKCZ-215ENST00000479263 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.72■■■■□ 3.31
PRKCZ-215ENST00000479263 CUX1P39880 1505 aa35.71■■■■□ 3.31
PRKCZ-215ENST00000479263 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.69■■■■□ 3.3
PRKCZ-215ENST00000479263 SOGA1O94964 1423 aa35.56■■■■□ 3.28
PRKCZ-215ENST00000479263 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.53■■■■□ 3.28
PRKCZ-215ENST00000479263 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa35.53■■■■□ 3.28
PRKCZ-215ENST00000479263 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.51■■■■□ 3.28
PRKCZ-215ENST00000479263 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.5■■■■□ 3.27
PRKCZ-215ENST00000479263 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.46■■■■□ 3.27
PRKCZ-215ENST00000479263 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.39■■■■□ 3.26
PRKCZ-215ENST00000479263 EEA1Q15075 1411 aa35.35■■■■□ 3.25
PRKCZ-215ENST00000479263 TOPBP1Q92547 1522 aa35.35■■■■□ 3.25
PRKCZ-215ENST00000479263 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.33■■■■□ 3.25
PRKCZ-215ENST00000479263 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.32■■■■□ 3.24
PRKCZ-215ENST00000479263 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35.24■■■■□ 3.23
PRKCZ-215ENST00000479263 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.22■■■■□ 3.23
PRKCZ-215ENST00000479263 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.17■■■■□ 3.22
PRKCZ-215ENST00000479263 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.12■■■■□ 3.21
PRKCZ-215ENST00000479263 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.08■■■■□ 3.21
PRKCZ-215ENST00000479263 KIF27Q86VH2 1401 aa35.08■■■■□ 3.21
PRKCZ-215ENST00000479263 ERCC6Q03468 1493 aa35.06■■■■□ 3.2
PRKCZ-215ENST00000479263 CUX2O14529 1486 aa35.06■■■■□ 3.2
PRKCZ-215ENST00000479263 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.98■■■■□ 3.19
PRKCZ-215ENST00000479263 KIF21BO75037 1637 aa34.97■■■■□ 3.19
PRKCZ-215ENST00000479263 WDR62O43379 1518 aa34.95■■■■□ 3.19
PRKCZ-215ENST00000479263 WDR97A6NE52 1622 aa34.93■■■■□ 3.18
PRKCZ-215ENST00000479263 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.91■■■■□ 3.18
PRKCZ-215ENST00000479263 GOLGA3Q08378 1498 aa34.91■■■■□ 3.18
PRKCZ-215ENST00000479263 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.85■■■■□ 3.17
PRKCZ-215ENST00000479263 PRXQ9BXM0 1461 aa34.83■■■■□ 3.17
PRKCZ-215ENST00000479263 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.83■■■■□ 3.17
PRKCZ-215ENST00000479263 IGF1RP08069 1367 aa34.81■■■■□ 3.16
PRKCZ-215ENST00000479263 TNIKQ9UKE5 1360 aa34.77■■■■□ 3.16
PRKCZ-215ENST00000479263 UBTFP17480 764 aaKnown RBP34.77■■■■□ 3.16
PRKCZ-215ENST00000479263 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.74■■■■□ 3.15
PRKCZ-215ENST00000479263 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.74■■■■□ 3.15
PRKCZ-215ENST00000479263 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.73■■■■□ 3.15
PRKCZ-215ENST00000479263 IFT140Q96RY7 1462 aa34.65■■■■□ 3.14
PRKCZ-215ENST00000479263 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.65■■■■□ 3.14
PRKCZ-215ENST00000479263 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.63■■■■□ 3.13
PRKCZ-215ENST00000479263 CEP162Q5TB80 1403 aa34.61■■■■□ 3.13
PRKCZ-215ENST00000479263 CUL7Q14999 1698 aa34.55■■■■□ 3.12
PRKCZ-215ENST00000479263 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.54■■■■□ 3.12
PRKCZ-215ENST00000479263 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.54■■■■□ 3.125e-7■■■■□ 23.1
PRKCZ-215ENST00000479263 PBRM1Q86U86 1689 aa34.51■■■■□ 3.12
PRKCZ-215ENST00000479263 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.41■■■■□ 3.1
PRKCZ-215ENST00000479263 GRIN2BQ13224 1484 aa34.38■■■■□ 3.09
PRKCZ-215ENST00000479263 CLIP1P30622 1438 aa34.36■■■■□ 3.09
PRKCZ-215ENST00000479263 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP34.32■■■■□ 3.08
PRKCZ-215ENST00000479263 ADAMTS12P58397 1594 aa34.29■■■■□ 3.08
PRKCZ-215ENST00000479263 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.25■■■■□ 3.07
PRKCZ-215ENST00000479263 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.21■■■■□ 3.07
PRKCZ-215ENST00000479263 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa34.19■■■■□ 3.06
PRKCZ-215ENST00000479263 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.09■■■■□ 3.05
PRKCZ-215ENST00000479263 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa34.09■■■■□ 3.05
PRKCZ-215ENST00000479263 ARAP1Q96P48 1450 aa34.08■■■■□ 3.05
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