Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 SPTBN1-203ENST00000389980 2164 ntTSL 1 (best)15.04■□□□□ -01e-12■■□□□ 13.2
G3BP1Q13283 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.286e-9■■□□□ 13.1
G3BP1Q13283 PRKAR1A-217ENST00000589228 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.066e-9■■□□□ 13.1
G3BP1Q13283 PRKAR1A-201ENST00000358598 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.276e-9■■□□□ 13.1
G3BP1Q13283 PRKAR1A-211ENST00000586397 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.676e-9■■□□□ 13.1
G3BP1Q13283 PRKAR1A-214ENST00000588188 1209 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.76e-9■■□□□ 13.1
G3BP1Q13283 PRKAR1A-202ENST00000392710 3551 ntTSL 28.67□□□□□ -1.026e-9■■□□□ 13.1
G3BP1Q13283 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.076e-9■■□□□ 13.1
G3BP1Q13283 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.731e-6■■□□□ 13.1
G3BP1Q13283 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.431e-6■■□□□ 13.1
G3BP1Q13283 FLII-218ENST00000577485 555 ntTSL 515.46■□□□□ 0.071e-6■■□□□ 13.1
G3BP1Q13283 FLII-220ENST00000578101 4148 ntTSL 213.44□□□□□ -0.261e-6■■□□□ 13.1
G3BP1Q13283 FLII-222ENST00000579294 3936 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.31e-6■■□□□ 13.1
G3BP1Q13283 FLII-215ENST00000545457 3975 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.461e-6■■□□□ 13.1
G3BP1Q13283 MARS-230ENST00000552914 734 ntTSL 37.67□□□□□ -1.181e-6■■□□□ 13.1
G3BP1Q13283 CNN3-206ENST00000487539 739 ntTSL 25□□□□□ -1.615e-7■■□□□ 13.1
G3BP1Q13283 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.658e-8■■□□□ 13.1
G3BP1Q13283 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.438e-8■■□□□ 13.1
G3BP1Q13283 ACADVL-201ENST00000322910 2352 ntTSL 223.06■■□□□ 1.288e-8■■□□□ 13.1
G3BP1Q13283 ACADVL-237ENST00000583858 1015 ntTSL 523.02■■□□□ 1.288e-8■■□□□ 13.1
G3BP1Q13283 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.168e-8■■□□□ 13.1
G3BP1Q13283 ACTN4-208ENST00000497637 877 ntTSL 224.14■■□□□ 1.457e-13■■□□□ 13.1
G3BP1Q13283 SDHA-217ENST00000514233 558 ntTSL 411.05□□□□□ -0.646e-8■■□□□ 13.1
G3BP1Q13283 PDXDC1-207ENST00000562119 884 ntTSL 524.61■■□□□ 1.531e-7■■□□□ 13.1
G3BP1Q13283 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.022e-6■■□□□ 13.1
G3BP1Q13283 UBE2O-202ENST00000586409 3579 ntTSL 218.16■□□□□ 0.52e-6■■□□□ 13.1
G3BP1Q13283 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.144e-8■■□□□ 13.1
G3BP1Q13283 CAPRIN1-206ENST00000528948 585 ntTSL 210.16□□□□□ -0.783e-9■■□□□ 13.1
G3BP1Q13283 BSDC1-208ENST00000474414 978 ntTSL 526.61■■□□□ 1.856e-9■■□□□ 13.1
G3BP1Q13283 BSDC1-213ENST00000530753 571 ntTSL 421.62■■□□□ 1.056e-9■■□□□ 13.1
G3BP1Q13283 BSDC1-214ENST00000530876 570 ntTSL 220.99■□□□□ 0.956e-9■■□□□ 13.1
G3BP1Q13283 BSDC1-202ENST00000373520 1630 ntTSL 220.02■□□□□ 0.796e-9■■□□□ 13.1
G3BP1Q13283 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.496e-9■■□□□ 13.1
G3BP1Q13283 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.456e-9■■□□□ 13.1
G3BP1Q13283 BSDC1-210ENST00000527163 567 ntTSL 517.77■□□□□ 0.446e-9■■□□□ 13.1
G3BP1Q13283 BSDC1-211ENST00000527513 576 ntTSL 517.77■□□□□ 0.446e-9■■□□□ 13.1
G3BP1Q13283 BSDC1-201ENST00000341071 4599 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.126e-9■■□□□ 13.1
G3BP1Q13283 BSDC1-212ENST00000530485 482 ntTSL 515.8■□□□□ 0.126e-9■■□□□ 13.1
G3BP1Q13283 BSDC1-209ENST00000526031 1361 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.116e-9■■□□□ 13.1
G3BP1Q13283 BSDC1-206ENST00000455895 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.046e-9■■□□□ 13.1
G3BP1Q13283 BSDC1-204ENST00000444377 2925 ntTSL 1 (best)12.4□□□□□ -0.426e-9■■□□□ 13.1
G3BP1Q13283 ACACA-244ENST00000619245 635 ntTSL 37□□□□□ -1.296e-9■■□□□ 13.1
G3BP1Q13283 TMEM214-206ENST00000435172 1480 ntTSL 519.29■□□□□ 0.688e-7■■□□□ 13.1
G3BP1Q13283 SUCLG1-206ENST00000487809 762 ntTSL 27.46□□□□□ -1.223e-6■■□□□ 13.1
G3BP1Q13283 SUCLG1-208ENST00000491123 1073 ntTSL 32.83□□□□□ -1.963e-6■■□□□ 13.1
G3BP1Q13283 NPEPPS-216ENST00000530514 2092 ntTSL 210.75□□□□□ -0.696e-7■■□□□ 13.1
G3BP1Q13283 NPEPPS-215ENST00000530173 2864 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.826e-7■■□□□ 13.1
G3BP1Q13283 EIF4A1-220ENST00000581808 205 ntTSL 34.75□□□□□ -1.651e-12■■□□□ 13.1
G3BP1Q13283 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.153e-10■■□□□ 13.1
G3BP1Q13283 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.353e-10■■□□□ 13.1
G3BP1Q13283 DDX3X-206ENST00000542215 1592 ntTSL 222.38■■□□□ 1.174e-7■■□□□ 13.1
G3BP1Q13283 MYLK-211ENST00000506361 1250 ntTSL 516.02■□□□□ 0.161e-6■■□□□ 13.1
G3BP1Q13283 MPHOSPH10-201ENST00000244230 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.094e-7■■□□□ 13.1
G3BP1Q13283 DYNC1H1-207ENST00000555800 474 ntTSL 212.05□□□□□ -0.482e-12■■□□□ 13.1
G3BP1Q13283 MYLK-213ENST00000510571 567 ntTSL 410.75□□□□□ -0.691e-6■■□□□ 13.1
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G3BP1Q13283 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.033e-6■■□□□ 13.1
G3BP1Q13283 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.693e-10■■□□□ 13.1
G3BP1Q13283 HERPUD1-219ENST00000570273 1425 ntTSL 1 (best)19.09■□□□□ 0.653e-10■■□□□ 13.1
G3BP1Q13283 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.393e-10■■□□□ 13.1
G3BP1Q13283 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.213e-10■■□□□ 13.1
G3BP1Q13283 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.23e-10■■□□□ 13.1
G3BP1Q13283 HERPUD1-209ENST00000564678 2199 ntTSL 1 (best)8.79□□□□□ -13e-10■■□□□ 13.1
G3BP1Q13283 HERPUD1-208ENST00000563911 844 ntTSL 36.73□□□□□ -1.333e-10■■□□□ 13.1
G3BP1Q13283 HERPUD1-213ENST00000568358 751 ntTSL 55.76□□□□□ -1.493e-10■■□□□ 13.1
G3BP1Q13283 PKM-217ENST00000566809 560 ntTSL 425.1■■□□□ 1.611e-16■■□□□ 13.1
G3BP1Q13283 GFPT1-204ENST00000494201 625 ntTSL 58.49□□□□□ -1.052e-6■■□□□ 13.1
G3BP1Q13283 KDM3B-204ENST00000507996 3034 ntTSL 26.99□□□□□ -1.295e-9■■□□□ 13.1
G3BP1Q13283 HIF1A-207ENST00000555014 739 ntTSL 35.02□□□□□ -1.613e-6■■□□□ 13.1
G3BP1Q13283 KRT18-205ENST00000548496 695 ntTSL 215.04■□□□□ -06e-10■■□□□ 13.1
G3BP1Q13283 BZW1-206ENST00000447069 557 ntTSL 413.01□□□□□ -0.332e-7■■□□□ 13
G3BP1Q13283 BZW1-212ENST00000464483 530 ntTSL 212.28□□□□□ -0.442e-7■■□□□ 13
G3BP1Q13283 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.973e-6■■□□□ 13
G3BP1Q13283 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.83e-6■■□□□ 13
G3BP1Q13283 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.713e-6■■□□□ 13
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G3BP1Q13283 G3BP1-209ENST00000520578 530 ntTSL 319.05■□□□□ 0.642e-8■■□□□ 13
G3BP1Q13283 G3BP1-213ENST00000523519 535 ntTSL 418.56■□□□□ 0.562e-8■■□□□ 13
G3BP1Q13283 G3BP1-204ENST00000517947 558 ntTSL 414.38□□□□□ -0.112e-8■■□□□ 13
G3BP1Q13283 G3BP1-210ENST00000522367 580 ntTSL 314.38□□□□□ -0.112e-8■■□□□ 13
G3BP1Q13283 G3BP1-203ENST00000507878 577 ntTSL 414.38□□□□□ -0.112e-8■■□□□ 13
G3BP1Q13283 G3BP1-206ENST00000519832 1173 ntTSL 1 (best)12.53□□□□□ -0.42e-8■■□□□ 13
G3BP1Q13283 CCAR2-211ENST00000522599 1107 ntTSL 516.92■□□□□ 0.38e-7■■□□□ 13
G3BP1Q13283 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.639e-8■■□□□ 13
G3BP1Q13283 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.979e-8■■□□□ 13
G3BP1Q13283 TRIM28-207ENST00000597136 1552 ntTSL 218.55■□□□□ 0.566e-9■■□□□ 13
G3BP1Q13283 HMGCS1-201ENST00000325110 3506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.072e-8■■□□□ 13
G3BP1Q13283 HMGCS1-202ENST00000433297 3466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.262e-8■■□□□ 13
G3BP1Q13283 U2SURP-211ENST00000488497 3557 ntTSL 1 (best)7.9□□□□□ -1.142e-7■■□□□ 13
G3BP1Q13283 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.552e-7■■□□□ 13
G3BP1Q13283 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.582e-7■■□□□ 13
G3BP1Q13283 U2SURP-203ENST00000463563 4364 ntTSL 23.17□□□□□ -1.92e-7■■□□□ 13
G3BP1Q13283 VARS2-209ENST00000477288 6054 ntTSL 222.66■■□□□ 1.221e-6■■□□□ 13
G3BP1Q13283 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.731e-6■■□□□ 13
G3BP1Q13283 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.541e-6■■□□□ 13
G3BP1Q13283 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.491e-6■■□□□ 13
G3BP1Q13283 VARS2-213ENST00000625423 3362 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.251e-6■■□□□ 13
G3BP1Q13283 RALGAPB-201ENST00000262879 8663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.016e-6■■□□□ 13
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