RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409212.5

SH3BP4-203, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,231 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-203ENST00000409212 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.76■■■□□ 2.04
SH3BP4-203ENST00000409212 NISCHQ9Y2I1 1504 aa27.01■■□□□ 1.91
SH3BP4-203ENST00000409212 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
SH3BP4-203ENST00000409212 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BP4-203ENST00000409212 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.26■■□□□ 1.63
SH3BP4-203ENST00000409212 APLP2Q06481 763 aa25.06■■□□□ 1.6
SH3BP4-203ENST00000409212 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
SH3BP4-203ENST00000409212 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
SH3BP4-203ENST00000409212 TRIM41Q8WV44 630 aa24.51■■□□□ 1.51
SH3BP4-203ENST00000409212 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.45■■□□□ 1.5
SH3BP4-203ENST00000409212 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
SH3BP4-203ENST00000409212 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
SH3BP4-203ENST00000409212 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
SH3BP4-203ENST00000409212 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
SH3BP4-203ENST00000409212 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
SH3BP4-203ENST00000409212 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
SH3BP4-203ENST00000409212 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
SH3BP4-203ENST00000409212 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
SH3BP4-203ENST00000409212 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
SH3BP4-203ENST00000409212 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP4-203ENST00000409212 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP4-203ENST00000409212 NEFLP07196 543 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP4-203ENST00000409212 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP4-203ENST00000409212 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
SH3BP4-203ENST00000409212 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
SH3BP4-203ENST00000409212 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
SH3BP4-203ENST00000409212 ITGAEP38570 1179 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP4-203ENST00000409212 ABCC9O60706 1549 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP4-203ENST00000409212 HRCP23327 699 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP4-203ENST00000409212 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP4-203ENST00000409212 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.07■■□□□ 1.28
SH3BP4-203ENST00000409212 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BP4-203ENST00000409212 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
SH3BP4-203ENST00000409212 MYT1Q01538 1121 aa22.69■■□□□ 1.22
SH3BP4-203ENST00000409212 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
SH3BP4-203ENST00000409212 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
SH3BP4-203ENST00000409212 TRIM52Q96A61 297 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP4-203ENST00000409212 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
SH3BP4-203ENST00000409212 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
SH3BP4-203ENST00000409212 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.51■■□□□ 1.19
SH3BP4-203ENST00000409212 NEUROD1Q13562 356 aa22.5■■□□□ 1.19
SH3BP4-203ENST00000409212 FBLN2P98095 1184 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP4-203ENST00000409212 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
SH3BP4-203ENST00000409212 SCRIBQ14160 1630 aa22.33■■□□□ 1.16
SH3BP4-203ENST00000409212 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
SH3BP4-203ENST00000409212 ANP32CO43423 234 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP4-203ENST00000409212 P3H3Q8IVL6 736 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP4-203ENST00000409212 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP4-203ENST00000409212 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SH3BP4-203ENST00000409212 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SH3BP4-203ENST00000409212 ARID3CA6NKF2 412 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP4-203ENST00000409212 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP4-203ENST00000409212 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SH3BP4-203ENST00000409212 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
SH3BP4-203ENST00000409212 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP4-203ENST00000409212 BCANQ96GW7 911 aa21.96■■□□□ 1.11
SH3BP4-203ENST00000409212 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
SH3BP4-203ENST00000409212 NEFMP07197 916 aa21.94■■□□□ 1.1
SH3BP4-203ENST00000409212 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP4-203ENST00000409212 TONSLQ96HA7 1378 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP4-203ENST00000409212 CANXP27824 592 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
SH3BP4-203ENST00000409212 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP21.83■■□□□ 1.09
SH3BP4-203ENST00000409212 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
SH3BP4-203ENST00000409212 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa21.8■■□□□ 1.08
SH3BP4-203ENST00000409212 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
SH3BP4-203ENST00000409212 SLC24A1O60721 1099 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP4-203ENST00000409212 CHGAP10645 457 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
SH3BP4-203ENST00000409212 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.7■■□□□ 1.06
SH3BP4-203ENST00000409212 STAG3Q9UJ98 1225 aa21.69■■□□□ 1.06
SH3BP4-203ENST00000409212 TSPY4P0CV99 314 aa21.69■■□□□ 1.06
SH3BP4-203ENST00000409212 TSPY10P0CW01 314 aa21.69■■□□□ 1.06
SH3BP4-203ENST00000409212 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.68■■□□□ 1.06
SH3BP4-203ENST00000409212 CLIP1P30622 1438 aa21.68■■□□□ 1.06
SH3BP4-203ENST00000409212 EEA1Q15075 1411 aa21.67■■□□□ 1.06
SH3BP4-203ENST00000409212 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
SH3BP4-203ENST00000409212 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
SH3BP4-203ENST00000409212 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
SH3BP4-203ENST00000409212 NACADO15069 1562 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP4-203ENST00000409212 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP21.58■■□□□ 1.051e-6■□□□□ 11
SH3BP4-203ENST00000409212 BCL11AQ9H165 835 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP4-203ENST00000409212 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP21.56■■□□□ 1.044e-6■■□□□ 11.5
SH3BP4-203ENST00000409212 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
SH3BP4-203ENST00000409212 GOLGA3Q08378 1498 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP4-203ENST00000409212 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.51■■□□□ 1.03
SH3BP4-203ENST00000409212 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP4-203ENST00000409212 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
SH3BP4-203ENST00000409212 TMC1Q8TDI8 760 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BP4-203ENST00000409212 FKBP8Q14318 412 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BP4-203ENST00000409212 CEP162Q5TB80 1403 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP4-203ENST00000409212 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP4-203ENST00000409212 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP4-203ENST00000409212 KIF27Q86VH2 1401 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP4-203ENST00000409212 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP4-203ENST00000409212 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.38■■□□□ 1.01
SH3BP4-203ENST00000409212 PLPPR3Q6T4P5 718 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP4-203ENST00000409212 MRS2Q9HD23 443 aa21.37■■□□□ 1.01
SH3BP4-203ENST00000409212 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP21.37■■□□□ 1.01
SH3BP4-203ENST00000409212 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.36■■□□□ 1.01
SH3BP4-203ENST00000409212 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
SH3BP4-203ENST00000409212 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
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