RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409212.5

SH3BP4-203, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,231 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-203ENST00000409212 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.76■■■□□ 2.04
SH3BP4-203ENST00000409212 NISCHQ9Y2I1 1504 aa27.01■■□□□ 1.91
SH3BP4-203ENST00000409212 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
SH3BP4-203ENST00000409212 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BP4-203ENST00000409212 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.26■■□□□ 1.63
SH3BP4-203ENST00000409212 APLP2Q06481 763 aa25.06■■□□□ 1.6
SH3BP4-203ENST00000409212 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
SH3BP4-203ENST00000409212 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
SH3BP4-203ENST00000409212 TRIM41Q8WV44 630 aa24.51■■□□□ 1.51
SH3BP4-203ENST00000409212 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.45■■□□□ 1.5
SH3BP4-203ENST00000409212 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
SH3BP4-203ENST00000409212 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
SH3BP4-203ENST00000409212 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
SH3BP4-203ENST00000409212 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
SH3BP4-203ENST00000409212 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
SH3BP4-203ENST00000409212 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
SH3BP4-203ENST00000409212 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
SH3BP4-203ENST00000409212 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
SH3BP4-203ENST00000409212 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
SH3BP4-203ENST00000409212 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP4-203ENST00000409212 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP4-203ENST00000409212 NEFLP07196 543 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP4-203ENST00000409212 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP4-203ENST00000409212 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
SH3BP4-203ENST00000409212 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
SH3BP4-203ENST00000409212 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
SH3BP4-203ENST00000409212 ITGAEP38570 1179 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP4-203ENST00000409212 ABCC9O60706 1549 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP4-203ENST00000409212 HRCP23327 699 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP4-203ENST00000409212 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP4-203ENST00000409212 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.07■■□□□ 1.28
SH3BP4-203ENST00000409212 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BP4-203ENST00000409212 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
SH3BP4-203ENST00000409212 MYT1Q01538 1121 aa22.69■■□□□ 1.22
SH3BP4-203ENST00000409212 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
SH3BP4-203ENST00000409212 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
SH3BP4-203ENST00000409212 TRIM52Q96A61 297 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP4-203ENST00000409212 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
SH3BP4-203ENST00000409212 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
SH3BP4-203ENST00000409212 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.51■■□□□ 1.19
SH3BP4-203ENST00000409212 NEUROD1Q13562 356 aa22.5■■□□□ 1.19
SH3BP4-203ENST00000409212 FBLN2P98095 1184 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP4-203ENST00000409212 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
SH3BP4-203ENST00000409212 SCRIBQ14160 1630 aa22.33■■□□□ 1.16
SH3BP4-203ENST00000409212 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
SH3BP4-203ENST00000409212 ANP32CO43423 234 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP4-203ENST00000409212 P3H3Q8IVL6 736 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP4-203ENST00000409212 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP4-203ENST00000409212 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SH3BP4-203ENST00000409212 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SH3BP4-203ENST00000409212 ARID3CA6NKF2 412 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP4-203ENST00000409212 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP4-203ENST00000409212 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SH3BP4-203ENST00000409212 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
SH3BP4-203ENST00000409212 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP4-203ENST00000409212 BCANQ96GW7 911 aa21.96■■□□□ 1.11
SH3BP4-203ENST00000409212 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
SH3BP4-203ENST00000409212 NEFMP07197 916 aa21.94■■□□□ 1.1
SH3BP4-203ENST00000409212 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP4-203ENST00000409212 TONSLQ96HA7 1378 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP4-203ENST00000409212 CANXP27824 592 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
SH3BP4-203ENST00000409212 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP21.83■■□□□ 1.09
SH3BP4-203ENST00000409212 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
SH3BP4-203ENST00000409212 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa21.8■■□□□ 1.08
SH3BP4-203ENST00000409212 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
SH3BP4-203ENST00000409212 SLC24A1O60721 1099 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP4-203ENST00000409212 CHGAP10645 457 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
SH3BP4-203ENST00000409212 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.7■■□□□ 1.06
SH3BP4-203ENST00000409212 STAG3Q9UJ98 1225 aa21.69■■□□□ 1.06
SH3BP4-203ENST00000409212 TSPY4P0CV99 314 aa21.69■■□□□ 1.06
SH3BP4-203ENST00000409212 TSPY10P0CW01 314 aa21.69■■□□□ 1.06
SH3BP4-203ENST00000409212 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.68■■□□□ 1.06
SH3BP4-203ENST00000409212 CLIP1P30622 1438 aa21.68■■□□□ 1.06
SH3BP4-203ENST00000409212 EEA1Q15075 1411 aa21.67■■□□□ 1.06
SH3BP4-203ENST00000409212 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
SH3BP4-203ENST00000409212 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
SH3BP4-203ENST00000409212 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
SH3BP4-203ENST00000409212 NACADO15069 1562 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP4-203ENST00000409212 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP21.58■■□□□ 1.051e-6■□□□□ 11
SH3BP4-203ENST00000409212 BCL11AQ9H165 835 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP4-203ENST00000409212 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP21.56■■□□□ 1.044e-6■■□□□ 11.5
SH3BP4-203ENST00000409212 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
SH3BP4-203ENST00000409212 GOLGA3Q08378 1498 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP4-203ENST00000409212 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.51■■□□□ 1.03
SH3BP4-203ENST00000409212 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP4-203ENST00000409212 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
SH3BP4-203ENST00000409212 TMC1Q8TDI8 760 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BP4-203ENST00000409212 FKBP8Q14318 412 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BP4-203ENST00000409212 CEP162Q5TB80 1403 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP4-203ENST00000409212 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP4-203ENST00000409212 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP4-203ENST00000409212 KIF27Q86VH2 1401 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP4-203ENST00000409212 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP4-203ENST00000409212 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.38■■□□□ 1.01
SH3BP4-203ENST00000409212 PLPPR3Q6T4P5 718 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP4-203ENST00000409212 MRS2Q9HD23 443 aa21.37■■□□□ 1.01
SH3BP4-203ENST00000409212 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP21.37■■□□□ 1.01
SH3BP4-203ENST00000409212 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.36■■□□□ 1.01
SH3BP4-203ENST00000409212 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
SH3BP4-203ENST00000409212 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.6 ms