RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392011.6

SH3BP4-202, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,194 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-202ENST00000392011 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.29■■■□□ 2.44
SH3BP4-202ENST00000392011 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.3■■■□□ 2.28
SH3BP4-202ENST00000392011 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
SH3BP4-202ENST00000392011 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.5■■■□□ 2.15
SH3BP4-202ENST00000392011 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.92■■■□□ 2.06
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
SH3BP4-202ENST00000392011 APLP2Q06481 763 aa27.04■■□□□ 1.92
SH3BP4-202ENST00000392011 PCGF6Q9BYE7 350 aa27.01■■□□□ 1.91
SH3BP4-202ENST00000392011 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
SH3BP4-202ENST00000392011 TRIM41Q8WV44 630 aa26.72■■□□□ 1.87
SH3BP4-202ENST00000392011 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
SH3BP4-202ENST00000392011 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
SH3BP4-202ENST00000392011 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
SH3BP4-202ENST00000392011 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
SH3BP4-202ENST00000392011 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
SH3BP4-202ENST00000392011 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
SH3BP4-202ENST00000392011 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
SH3BP4-202ENST00000392011 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
SH3BP4-202ENST00000392011 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3BP4-202ENST00000392011 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.85■■□□□ 1.73
SH3BP4-202ENST00000392011 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
SH3BP4-202ENST00000392011 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
SH3BP4-202ENST00000392011 HRCP23327 699 aa25.59■■□□□ 1.69
SH3BP4-202ENST00000392011 ITGAEP38570 1179 aa25.53■■□□□ 1.68
SH3BP4-202ENST00000392011 ERICH6Q7L0X2 663 aa25.45■■□□□ 1.66
SH3BP4-202ENST00000392011 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
SH3BP4-202ENST00000392011 NEFLP07196 543 aa25.4■■□□□ 1.66
SH3BP4-202ENST00000392011 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
SH3BP4-202ENST00000392011 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.19■■□□□ 1.62
SH3BP4-202ENST00000392011 ABCC9O60706 1549 aa25.18■■□□□ 1.62
SH3BP4-202ENST00000392011 POLR3GLQ9BT43 218 aa25.1■■□□□ 1.61
SH3BP4-202ENST00000392011 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.04■■□□□ 1.6
SH3BP4-202ENST00000392011 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
SH3BP4-202ENST00000392011 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
SH3BP4-202ENST00000392011 NEUROD1Q13562 356 aa24.64■■□□□ 1.54
SH3BP4-202ENST00000392011 TRIM52Q96A61 297 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BP4-202ENST00000392011 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP4-202ENST00000392011 MYT1Q01538 1121 aa24.51■■□□□ 1.51
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
SH3BP4-202ENST00000392011 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
SH3BP4-202ENST00000392011 P3H3Q8IVL6 736 aa24.43■■□□□ 1.5
SH3BP4-202ENST00000392011 FBLN2P98095 1184 aa24.41■■□□□ 1.5
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
SH3BP4-202ENST00000392011 ARID3CA6NKF2 412 aa24.31■■□□□ 1.48
SH3BP4-202ENST00000392011 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa24.31■■□□□ 1.48
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
SH3BP4-202ENST00000392011 BCANQ96GW7 911 aa24.27■■□□□ 1.48
SH3BP4-202ENST00000392011 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
SH3BP4-202ENST00000392011 ANP32CO43423 234 aa24.24■■□□□ 1.47
SH3BP4-202ENST00000392011 SCRIBQ14160 1630 aa24.21■■□□□ 1.47
SH3BP4-202ENST00000392011 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
SH3BP4-202ENST00000392011 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
SH3BP4-202ENST00000392011 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
SH3BP4-202ENST00000392011 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.91■■□□□ 1.42
SH3BP4-202ENST00000392011 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
SH3BP4-202ENST00000392011 TONSLQ96HA7 1378 aa23.76■■□□□ 1.39
SH3BP4-202ENST00000392011 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
SH3BP4-202ENST00000392011 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.74■■□□□ 1.39
SH3BP4-202ENST00000392011 BCL11AQ9H165 835 aa23.68■■□□□ 1.38
SH3BP4-202ENST00000392011 CANXP27824 592 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
SH3BP4-202ENST00000392011 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BP4-202ENST00000392011 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa23.65■■□□□ 1.38
SH3BP4-202ENST00000392011 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
SH3BP4-202ENST00000392011 FKBP8Q14318 412 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP4-202ENST00000392011 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.61■■□□□ 1.372e-6■■□□□ 12
SH3BP4-202ENST00000392011 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
SH3BP4-202ENST00000392011 CLIP1P30622 1438 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC24A1O60721 1099 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM9BQ8IZU0 186 aa23.57■■□□□ 1.36
SH3BP4-202ENST00000392011 CHGAP10645 457 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
SH3BP4-202ENST00000392011 NEFMP07197 916 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BP4-202ENST00000392011 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
SH3BP4-202ENST00000392011 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP4-202ENST00000392011 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.51■■□□□ 1.351e-6■□□□□ 11
SH3BP4-202ENST00000392011 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
SH3BP4-202ENST00000392011 MIER1Q8N108 512 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP4-202ENST00000392011 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
SH3BP4-202ENST00000392011 TSPY4P0CV99 314 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP4-202ENST00000392011 TSPY10P0CW01 314 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP4-202ENST00000392011 CEP162Q5TB80 1403 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP4-202ENST00000392011 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP4-202ENST00000392011 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
SH3BP4-202ENST00000392011 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
SH3BP4-202ENST00000392011 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP4-202ENST00000392011 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.39■■□□□ 1.34
SH3BP4-202ENST00000392011 TMC1Q8TDI8 760 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP4-202ENST00000392011 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
SH3BP4-202ENST00000392011 STAG3Q9UJ98 1225 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP4-202ENST00000392011 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.35■■□□□ 1.33
SH3BP4-202ENST00000392011 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP4-202ENST00000392011 MRS2Q9HD23 443 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP4-202ENST00000392011 GOLGA3Q08378 1498 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP4-202ENST00000392011 EEA1Q15075 1411 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP4-202ENST00000392011 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP4-202ENST00000392011 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
SH3BP4-202ENST00000392011 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.24■■□□□ 1.31
SH3BP4-202ENST00000392011 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.23■■□□□ 1.31
SH3BP4-202ENST00000392011 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
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