RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.8■■■□□ 2.2
SH3BP4-201ENST00000344528 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.14■■■□□ 2.09
SH3BP4-201ENST00000344528 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
SH3BP4-201ENST00000344528 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.8■■□□□ 1.88
SH3BP4-201ENST00000344528 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.02■■□□□ 1.76
SH3BP4-201ENST00000344528 APLP2Q06481 763 aa25.83■■□□□ 1.73
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
SH3BP4-201ENST00000344528 TRIM41Q8WV44 630 aa25.31■■□□□ 1.64
SH3BP4-201ENST00000344528 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
SH3BP4-201ENST00000344528 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
SH3BP4-201ENST00000344528 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
SH3BP4-201ENST00000344528 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.03■■□□□ 1.6
SH3BP4-201ENST00000344528 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
SH3BP4-201ENST00000344528 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
SH3BP4-201ENST00000344528 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
SH3BP4-201ENST00000344528 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
SH3BP4-201ENST00000344528 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
SH3BP4-201ENST00000344528 ABCC9O60706 1549 aa24.28■■□□□ 1.48
SH3BP4-201ENST00000344528 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
SH3BP4-201ENST00000344528 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.21■■□□□ 1.47
SH3BP4-201ENST00000344528 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
SH3BP4-201ENST00000344528 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
SH3BP4-201ENST00000344528 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
SH3BP4-201ENST00000344528 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.08■■□□□ 1.44
SH3BP4-201ENST00000344528 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.03■■□□□ 1.44
SH3BP4-201ENST00000344528 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.02■■□□□ 1.44
SH3BP4-201ENST00000344528 ITGAEP38570 1179 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP4-201ENST00000344528 NEFLP07196 543 aa23.97■■□□□ 1.43
SH3BP4-201ENST00000344528 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.9■■□□□ 1.42
SH3BP4-201ENST00000344528 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
SH3BP4-201ENST00000344528 HRCP23327 699 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BP4-201ENST00000344528 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.65■■□□□ 1.38
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
SH3BP4-201ENST00000344528 FBLN2P98095 1184 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP4-201ENST00000344528 TRIM52Q96A61 297 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP4-201ENST00000344528 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
SH3BP4-201ENST00000344528 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP4-201ENST00000344528 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
SH3BP4-201ENST00000344528 SCRIBQ14160 1630 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
SH3BP4-201ENST00000344528 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
SH3BP4-201ENST00000344528 NEUROD1Q13562 356 aa23.15■■□□□ 1.3
SH3BP4-201ENST00000344528 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
SH3BP4-201ENST00000344528 P3H3Q8IVL6 736 aa23.09■■□□□ 1.29
SH3BP4-201ENST00000344528 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa23.09■■□□□ 1.29
SH3BP4-201ENST00000344528 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
SH3BP4-201ENST00000344528 ARID3CA6NKF2 412 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BP4-201ENST00000344528 ANP32CO43423 234 aa22.88■■□□□ 1.25
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
SH3BP4-201ENST00000344528 MYT1Q01538 1121 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP4-201ENST00000344528 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.81■■□□□ 1.24
SH3BP4-201ENST00000344528 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
SH3BP4-201ENST00000344528 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.72■■□□□ 1.23
SH3BP4-201ENST00000344528 BCANQ96GW7 911 aa22.69■■□□□ 1.22
SH3BP4-201ENST00000344528 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
SH3BP4-201ENST00000344528 NEFMP07197 916 aa22.61■■□□□ 1.21
SH3BP4-201ENST00000344528 NACADO15069 1562 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP4-201ENST00000344528 TONSLQ96HA7 1378 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP4-201ENST00000344528 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
SH3BP4-201ENST00000344528 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
SH3BP4-201ENST00000344528 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP4-201ENST00000344528 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
SH3BP4-201ENST00000344528 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
SH3BP4-201ENST00000344528 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP4-201ENST00000344528 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP4-201ENST00000344528 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
SH3BP4-201ENST00000344528 TSPY4P0CV99 314 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP4-201ENST00000344528 TSPY10P0CW01 314 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP4-201ENST00000344528 EEA1Q15075 1411 aa22.45■■□□□ 1.19
SH3BP4-201ENST00000344528 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
SH3BP4-201ENST00000344528 CLIP1P30622 1438 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC24A1O60721 1099 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP4-201ENST00000344528 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
SH3BP4-201ENST00000344528 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP4-201ENST00000344528 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP4-201ENST00000344528 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.34■■□□□ 1.17
SH3BP4-201ENST00000344528 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.33■■□□□ 1.171e-6■□□□□ 11
SH3BP4-201ENST00000344528 GOLGA3Q08378 1498 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP4-201ENST00000344528 KIF27Q86VH2 1401 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP4-201ENST00000344528 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP4-201ENST00000344528 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SH3BP4-201ENST00000344528 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP4-201ENST00000344528 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SH3BP4-201ENST00000344528 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SH3BP4-201ENST00000344528 CEP162Q5TB80 1403 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP4-201ENST00000344528 BCL11AQ9H165 835 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP4-201ENST00000344528 KCNH8Q96L42 1107 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP4-201ENST00000344528 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP4-201ENST00000344528 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP4-201ENST00000344528 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.134e-6■■□□□ 11.5
SH3BP4-201ENST00000344528 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP4-201ENST00000344528 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP4-201ENST00000344528 TMC1Q8TDI8 760 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.08■■□□□ 1.12
SH3BP4-201ENST00000344528 ERCC6Q03468 1493 aa22.05■■□□□ 1.12
SH3BP4-201ENST00000344528 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
SH3BP4-201ENST00000344528 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP4-201ENST00000344528 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.01■■□□□ 1.11
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