Protein–RNA interactions for Protein: O43251

RBFOX2, RNA binding protein fox-1 homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX2O43251 REPS1-207ENST00000445570 2690 ntTSL 215.95■□□□□ 0.144e-7■■■■□ 25.1
RBFOX2O43251 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.144e-7■■■■□ 25.1
RBFOX2O43251 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.084e-7■■■■□ 25.1
RBFOX2O43251 REPS1-210ENST00000483468 6069 ntTSL 214.91□□□□□ -0.024e-7■■■■□ 25.1
RBFOX2O43251 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.034e-7■■■■□ 25.1
RBFOX2O43251 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.034e-7■■■■□ 25.1
RBFOX2O43251 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.14e-7■■■■□ 25.1
RBFOX2O43251 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.24e-7■■■■□ 25.1
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RBFOX2O43251 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.244e-7■■■■□ 25.1
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RBFOX2O43251 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.524e-7■■■■□ 25.1
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RBFOX2O43251 HSH2D-208ENST00000616645 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.994e-7■■■■□ 25.1
RBFOX2O43251 HSH2D-205ENST00000613195 1508 ntTSL 58.65□□□□□ -1.024e-7■■■■□ 25.1
RBFOX2O43251 RANGAP1-207ENST00000455915 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.044e-7■■■■□ 25.1
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RBFOX2O43251 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.578e-7■■■■□ 25.1
RBFOX2O43251 AMT-245ENST00000637268 2855 ntTSL 511.3□□□□□ -0.68e-7■■■■□ 25.1
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RBFOX2O43251 AMT-228ENST00000636023 1780 ntTSL 510.5□□□□□ -0.738e-7■■■■□ 25.1
RBFOX2O43251 AMT-217ENST00000491800 3780 nt10.39□□□□□ -0.758e-7■■■■□ 25.1
RBFOX2O43251 AC104452.1-204ENST00000637442 4178 ntTSL 510.2□□□□□ -0.788e-7■■■■□ 25.1
RBFOX2O43251 AMT-210ENST00000473163 4544 ntTSL 210.07□□□□□ -0.88e-7■■■■□ 25.1
RBFOX2O43251 AMT-216ENST00000487589 811 ntTSL 59.94□□□□□ -0.828e-7■■■■□ 25.1
RBFOX2O43251 AMT-253ENST00000637914 3677 ntTSL 59.85□□□□□ -0.838e-7■■■■□ 25.1
RBFOX2O43251 AMT-219ENST00000495436 843 ntTSL 29.75□□□□□ -0.858e-7■■■■□ 25.1
RBFOX2O43251 AMT-230ENST00000636148 3865 ntTSL 59.19□□□□□ -0.948e-7■■■■□ 25.1
RBFOX2O43251 AMT-236ENST00000636597 1509 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.038e-7■■■■□ 25.1
RBFOX2O43251 AMT-209ENST00000465925 3976 ntTSL 57.42□□□□□ -1.228e-7■■■■□ 25.1
RBFOX2O43251 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.185e-6■■■■□ 25.1
RBFOX2O43251 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.141e-8■■■■□ 25.1
RBFOX2O43251 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.075e-6■■■■□ 25.1
RBFOX2O43251 GOLGA4-209ENST00000450863 1617 ntTSL 515.06■□□□□ 05e-6■■■■□ 25.1
RBFOX2O43251 GOLGA4-203ENST00000419177 760 ntTSL 313.12□□□□□ -0.315e-6■■■■□ 25.1
RBFOX2O43251 GOLGA4-204ENST00000429018 2036 ntTSL 1 (best)12.83□□□□□ -0.365e-6■■■■□ 25.1
RBFOX2O43251 GOLGA4-205ENST00000431105 568 ntTSL 311.51□□□□□ -0.575e-6■■■■□ 25.1
RBFOX2O43251 GOLGA4-202ENST00000361924 7772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.751e-8■■■■□ 25.1
RBFOX2O43251 GOLGA4-201ENST00000356847 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.841e-8■■■■□ 25.1
RBFOX2O43251 GOLGA4-206ENST00000435830 4152 ntTSL 1 (best)8.43□□□□□ -1.065e-6■■■■□ 25.1
RBFOX2O43251 SBF1-203ENST00000399627 811 ntTSL 514.3□□□□□ -0.122e-6■■■■□ 25.1
RBFOX2O43251 SLC39A14-205ENST00000517370 839 ntTSL 310.42□□□□□ -0.744e-8■■■■□ 25.1
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