RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481276.1

SLC35E2B-202, Transcript of solute carrier family 35 member E2B, humanhuman

TSL 2

Gene SLC35E2B, Length 2,199 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35E2B-202ENST00000481276 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.91■■■□□ 2.86
SLC35E2B-202ENST00000481276 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.34■■■□□ 2.13
SLC35E2B-202ENST00000481276 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
SLC35E2B-202ENST00000481276 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.54■■■□□ 2
SLC35E2B-202ENST00000481276 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.15■■□□□ 1.94
SLC35E2B-202ENST00000481276 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.07■■□□□ 1.92
SLC35E2B-202ENST00000481276 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
SLC35E2B-202ENST00000481276 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.46■■□□□ 1.83
SLC35E2B-202ENST00000481276 ABCC9O60706 1549 aa26.41■■□□□ 1.82
SLC35E2B-202ENST00000481276 SCRIBQ14160 1630 aa26.35■■□□□ 1.81
SLC35E2B-202ENST00000481276 NACADO15069 1562 aa26.21■■□□□ 1.79
SLC35E2B-202ENST00000481276 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.88■■□□□ 1.73
SLC35E2B-202ENST00000481276 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.86■■□□□ 1.73
SLC35E2B-202ENST00000481276 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
SLC35E2B-202ENST00000481276 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.64■■□□□ 1.7
SLC35E2B-202ENST00000481276 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.62■■□□□ 1.69
SLC35E2B-202ENST00000481276 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.54■■□□□ 1.68
SLC35E2B-202ENST00000481276 WIZO95785 1651 aa25.43■■□□□ 1.66
SLC35E2B-202ENST00000481276 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
SLC35E2B-202ENST00000481276 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.21■■□□□ 1.63
SLC35E2B-202ENST00000481276 SMARCA4P51532 1647 aa25.21■■□□□ 1.63
SLC35E2B-202ENST00000481276 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.07■■□□□ 1.6
SLC35E2B-202ENST00000481276 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
SLC35E2B-202ENST00000481276 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.02■■□□□ 1.6
SLC35E2B-202ENST00000481276 TRIM41Q8WV44 630 aa24.99■■□□□ 1.59
SLC35E2B-202ENST00000481276 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
SLC35E2B-202ENST00000481276 SMARCA2P51531 1590 aa24.88■■□□□ 1.57
SLC35E2B-202ENST00000481276 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.84■■□□□ 1.57
SLC35E2B-202ENST00000481276 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.77■■□□□ 1.56
SLC35E2B-202ENST00000481276 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
SLC35E2B-202ENST00000481276 ABCC8Q09428 1581 aa24.64■■□□□ 1.54
SLC35E2B-202ENST00000481276 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.59■■□□□ 1.53
SLC35E2B-202ENST00000481276 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.53■■□□□ 1.52
SLC35E2B-202ENST00000481276 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
SLC35E2B-202ENST00000481276 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.47■■□□□ 1.51
SLC35E2B-202ENST00000481276 SOGA1O94964 1423 aa24.26■■□□□ 1.47
SLC35E2B-202ENST00000481276 HRCP23327 699 aa24.26■■□□□ 1.47
SLC35E2B-202ENST00000481276 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.25■■□□□ 1.47
SLC35E2B-202ENST00000481276 HMGXB3Q12766 1538 aa24.24■■□□□ 1.47
SLC35E2B-202ENST00000481276 SYNJ1O43426 1573 aa24.23■■□□□ 1.47
SLC35E2B-202ENST00000481276 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
SLC35E2B-202ENST00000481276 NCAPD3P42695 1498 aa24.2■■□□□ 1.46
SLC35E2B-202ENST00000481276 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.18■■□□□ 1.46
SLC35E2B-202ENST00000481276 EEA1Q15075 1411 aa24.11■■□□□ 1.45
SLC35E2B-202ENST00000481276 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.03■■□□□ 1.44
SLC35E2B-202ENST00000481276 TOP2BQ02880 1626 aa23.99■■□□□ 1.43
SLC35E2B-202ENST00000481276 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.96■■□□□ 1.43
SLC35E2B-202ENST00000481276 CEP162Q5TB80 1403 aa23.95■■□□□ 1.42
SLC35E2B-202ENST00000481276 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.94■■□□□ 1.42
SLC35E2B-202ENST00000481276 GOLGA3Q08378 1498 aa23.92■■□□□ 1.42
SLC35E2B-202ENST00000481276 PRDM2Q13029 1718 aa23.89■■□□□ 1.41
SLC35E2B-202ENST00000481276 KIF21BO75037 1637 aa23.89■■□□□ 1.41
SLC35E2B-202ENST00000481276 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
SLC35E2B-202ENST00000481276 CFTRP13569 1480 aa23.88■■□□□ 1.41
SLC35E2B-202ENST00000481276 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.88■■□□□ 1.41
SLC35E2B-202ENST00000481276 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
SLC35E2B-202ENST00000481276 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.83■■□□□ 1.41
SLC35E2B-202ENST00000481276 CUX1P39880 1505 aa23.82■■□□□ 1.4
SLC35E2B-202ENST00000481276 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.72■■□□□ 1.39
SLC35E2B-202ENST00000481276 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.66■■□□□ 1.38
SLC35E2B-202ENST00000481276 CLIP1P30622 1438 aa23.59■■□□□ 1.37
SLC35E2B-202ENST00000481276 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
SLC35E2B-202ENST00000481276 PRXQ9BXM0 1461 aa23.57■■□□□ 1.36
SLC35E2B-202ENST00000481276 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.56■■□□□ 1.36
SLC35E2B-202ENST00000481276 KIF27Q86VH2 1401 aa23.53■■□□□ 1.36
SLC35E2B-202ENST00000481276 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
SLC35E2B-202ENST00000481276 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.46■■□□□ 1.35
SLC35E2B-202ENST00000481276 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.46■■□□□ 1.35
SLC35E2B-202ENST00000481276 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
SLC35E2B-202ENST00000481276 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.45■■□□□ 1.34
SLC35E2B-202ENST00000481276 NESP48681 1621 aa23.43■■□□□ 1.34
SLC35E2B-202ENST00000481276 CUX2O14529 1486 aa23.41■■□□□ 1.34
SLC35E2B-202ENST00000481276 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.34■■□□□ 1.33
SLC35E2B-202ENST00000481276 ARAP1Q96P48 1450 aa23.32■■□□□ 1.32
SLC35E2B-202ENST00000481276 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
SLC35E2B-202ENST00000481276 IGF1RP08069 1367 aa23.3■■□□□ 1.32
SLC35E2B-202ENST00000481276 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.3■■□□□ 1.32
SLC35E2B-202ENST00000481276 TOPBP1Q92547 1522 aa23.29■■□□□ 1.32
SLC35E2B-202ENST00000481276 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.25■■□□□ 1.31
SLC35E2B-202ENST00000481276 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
SLC35E2B-202ENST00000481276 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.23■■□□□ 1.31
SLC35E2B-202ENST00000481276 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
SLC35E2B-202ENST00000481276 APLP2Q06481 763 aa23.2■■□□□ 1.3
SLC35E2B-202ENST00000481276 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.19■■□□□ 1.3
SLC35E2B-202ENST00000481276 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.19■■□□□ 1.3
SLC35E2B-202ENST00000481276 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.18■■□□□ 1.3
SLC35E2B-202ENST00000481276 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
SLC35E2B-202ENST00000481276 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.16■■□□□ 1.3
SLC35E2B-202ENST00000481276 WDR97A6NE52 1622 aa23.14■■□□□ 1.29
SLC35E2B-202ENST00000481276 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.07■■□□□ 1.28
SLC35E2B-202ENST00000481276 CUL7Q14999 1698 aa23.05■■□□□ 1.28
SLC35E2B-202ENST00000481276 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
SLC35E2B-202ENST00000481276 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
SLC35E2B-202ENST00000481276 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23■■□□□ 1.27
SLC35E2B-202ENST00000481276 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.98■■□□□ 1.27
SLC35E2B-202ENST00000481276 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
SLC35E2B-202ENST00000481276 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
SLC35E2B-202ENST00000481276 TIAM1Q13009 1591 aa22.9■■□□□ 1.26
SLC35E2B-202ENST00000481276 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.89■■□□□ 1.25
SLC35E2B-202ENST00000481276 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms