RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617444.4

SLC35E2B-205, Transcript of solute carrier family 35 member E2B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC35E2B, Length 6,283 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35E2B-205ENST00000617444 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.69■■□□□ 1.38
SLC35E2B-205ENST00000617444 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
SLC35E2B-205ENST00000617444 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
SLC35E2B-205ENST00000617444 EHMT2Q96KQ7 1210 aa21.9■■□□□ 1.1
SLC35E2B-205ENST00000617444 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa21.43■■□□□ 1.02
SLC35E2B-205ENST00000617444 APLP2Q06481 763 aa21.4■■□□□ 1.02
SLC35E2B-205ENST00000617444 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
SLC35E2B-205ENST00000617444 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
SLC35E2B-205ENST00000617444 ERICH6Q7L0X2 663 aa21.11■□□□□ 0.97
SLC35E2B-205ENST00000617444 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
SLC35E2B-205ENST00000617444 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
SLC35E2B-205ENST00000617444 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
SLC35E2B-205ENST00000617444 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
SLC35E2B-205ENST00000617444 PCGF6Q9BYE7 350 aa20.76■□□□□ 0.91
SLC35E2B-205ENST00000617444 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
SLC35E2B-205ENST00000617444 NEFLP07196 543 aa20.54■□□□□ 0.88
SLC35E2B-205ENST00000617444 MYT1Q01538 1121 aa20.52■□□□□ 0.88
SLC35E2B-205ENST00000617444 NISCHQ9Y2I1 1504 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC35E2B-205ENST00000617444 MYT1LQ9UL68 1186 aa20.43■□□□□ 0.86
SLC35E2B-205ENST00000617444 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
SLC35E2B-205ENST00000617444 UBTFP17480 764 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
SLC35E2B-205ENST00000617444 TRIM41Q8WV44 630 aa20.2■□□□□ 0.83
SLC35E2B-205ENST00000617444 CHIC1Q5VXU3 224 aa20.17■□□□□ 0.82
SLC35E2B-205ENST00000617444 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
SLC35E2B-205ENST00000617444 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
SLC35E2B-205ENST00000617444 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
SLC35E2B-205ENST00000617444 POLR3GLQ9BT43 218 aa20.11■□□□□ 0.81
SLC35E2B-205ENST00000617444 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
SLC35E2B-205ENST00000617444 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
SLC35E2B-205ENST00000617444 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.78
SLC35E2B-205ENST00000617444 ITGAEP38570 1179 aa19.87■□□□□ 0.77
SLC35E2B-205ENST00000617444 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
SLC35E2B-205ENST00000617444 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP19.64■□□□□ 0.73
SLC35E2B-205ENST00000617444 HRCP23327 699 aa19.64■□□□□ 0.73
SLC35E2B-205ENST00000617444 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
SLC35E2B-205ENST00000617444 CLSPNQ9HAW4 1339 aa19.55■□□□□ 0.72
SLC35E2B-205ENST00000617444 SLC24A1O60721 1099 aa19.41■□□□□ 0.7
SLC35E2B-205ENST00000617444 BCANQ96GW7 911 aa19.3■□□□□ 0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 BCL11AQ9H165 835 aa19.28■□□□□ 0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 TRIM52Q96A61 297 aa19.27■□□□□ 0.67
SLC35E2B-205ENST00000617444 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
SLC35E2B-205ENST00000617444 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
SLC35E2B-205ENST00000617444 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP19.23■□□□□ 0.67
SLC35E2B-205ENST00000617444 FBLN2P98095 1184 aa19.17■□□□□ 0.66
SLC35E2B-205ENST00000617444 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa19.17■□□□□ 0.66
SLC35E2B-205ENST00000617444 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
SLC35E2B-205ENST00000617444 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
SLC35E2B-205ENST00000617444 NEUROD1Q13562 356 aa19.06■□□□□ 0.64
SLC35E2B-205ENST00000617444 PLPPR3Q6T4P5 718 aa19.05■□□□□ 0.64
SLC35E2B-205ENST00000617444 CANXP27824 592 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
SLC35E2B-205ENST00000617444 NEFMP07197 916 aa18.99■□□□□ 0.63
SLC35E2B-205ENST00000617444 ANP32CO43423 234 aa18.97■□□□□ 0.63
SLC35E2B-205ENST00000617444 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa18.96■□□□□ 0.63
SLC35E2B-205ENST00000617444 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP18.91■□□□□ 0.626e-6■■□□□ 12.8
SLC35E2B-205ENST00000617444 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
SLC35E2B-205ENST00000617444 ARID3CA6NKF2 412 aa18.88■□□□□ 0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
SLC35E2B-205ENST00000617444 STAG3Q9UJ98 1225 aa18.77■□□□□ 0.6
SLC35E2B-205ENST00000617444 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
SLC35E2B-205ENST00000617444 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
SLC35E2B-205ENST00000617444 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
SLC35E2B-205ENST00000617444 CHGAP10645 457 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
SLC35E2B-205ENST00000617444 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
SLC35E2B-205ENST00000617444 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
SLC35E2B-205ENST00000617444 A0A0G2JS52 829 aa18.67■□□□□ 0.58
SLC35E2B-205ENST00000617444 P3H3Q8IVL6 736 aa18.66■□□□□ 0.58
SLC35E2B-205ENST00000617444 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 ABCC9O60706 1549 aa18.6■□□□□ 0.57
SLC35E2B-205ENST00000617444 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
SLC35E2B-205ENST00000617444 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa18.56■□□□□ 0.56
SLC35E2B-205ENST00000617444 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP18.54■□□□□ 0.56
SLC35E2B-205ENST00000617444 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
SLC35E2B-205ENST00000617444 PLEKHG5O94827 1062 aa18.5■□□□□ 0.55
SLC35E2B-205ENST00000617444 ZBTB7CA1YPR0 619 aa18.46■□□□□ 0.55
SLC35E2B-205ENST00000617444 FKBP8Q14318 412 aa18.44■□□□□ 0.54
SLC35E2B-205ENST00000617444 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
SLC35E2B-205ENST00000617444 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
SLC35E2B-205ENST00000617444 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP18.35■□□□□ 0.533e-8■□□□□ 10.7
SLC35E2B-205ENST00000617444 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP18.34■□□□□ 0.53
SLC35E2B-205ENST00000617444 C14orf37Q86TY3 774 aa18.34■□□□□ 0.53
SLC35E2B-205ENST00000617444 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
SLC35E2B-205ENST00000617444 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
SLC35E2B-205ENST00000617444 FAM9BQ8IZU0 186 aa18.28■□□□□ 0.52
SLC35E2B-205ENST00000617444 ARXQ96QS3 562 aa18.27■□□□□ 0.52
SLC35E2B-205ENST00000617444 NBR1Q14596 966 aa18.27■□□□□ 0.52
SLC35E2B-205ENST00000617444 CCDC136Q96JN2 1154 aa18.27■□□□□ 0.52
SLC35E2B-205ENST00000617444 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
SLC35E2B-205ENST00000617444 TONSLQ96HA7 1378 aa18.24■□□□□ 0.51
SLC35E2B-205ENST00000617444 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
SLC35E2B-205ENST00000617444 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
SLC35E2B-205ENST00000617444 TMC1Q8TDI8 760 aa18.18■□□□□ 0.5
SLC35E2B-205ENST00000617444 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
SLC35E2B-205ENST00000617444 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP18.14■□□□□ 0.49
SLC35E2B-205ENST00000617444 CSRNP3Q8WYN3 585 aa18.14■□□□□ 0.49
SLC35E2B-205ENST00000617444 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa18.13■□□□□ 0.49
SLC35E2B-205ENST00000617444 CHIC2Q9UKJ5 165 aa18.12■□□□□ 0.49
SLC35E2B-205ENST00000617444 MYH16Q9H6N6 1097 aa18.11■□□□□ 0.49
SLC35E2B-205ENST00000617444 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
SLC35E2B-205ENST00000617444 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
SLC35E2B-205ENST00000617444 NPHP1O15259 732 aa18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms