Protein–RNA interactions for Protein: O43251

RBFOX2, RNA binding protein fox-1 homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX2O43251 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -02e-50■■■■■ 540.4
RBFOX2O43251 POTEF-202ENST00000409914 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.945e-55■■■■■ 462.5
RBFOX2O43251 HDAC4-216ENST00000544989 342 ntTSL 59.18□□□□□ -0.948e-8■■■■■ 403.8
RBFOX2O43251 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.386e-8■■■■■ 388.7
RBFOX2O43251 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.596e-8■■■■■ 388.7
RBFOX2O43251 FAM120B-201ENST00000476287 5155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.246e-8■■■■■ 388.7
RBFOX2O43251 FAM120B-203ENST00000537664 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.326e-8■■■■■ 388.7
RBFOX2O43251 HDAC4-210ENST00000493582 3188 ntTSL 1 (best)9.96□□□□□ -0.828e-8■■■■■ 378.8
RBFOX2O43251 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.338e-8■■■■■ 345.6
RBFOX2O43251 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.328e-8■■■■■ 345.6
RBFOX2O43251 MYO9B-210ENST00000597572 660 ntTSL 513.16□□□□□ -0.32e-57■■■■■ 282.9
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RBFOX2O43251 NEDD4L-215ENST00000586268 830 ntTSL 311.37□□□□□ -0.592e-25■■■■■ 235.9
RBFOX2O43251 NEDD4L-219ENST00000587634 628 ntTSL 48.45□□□□□ -1.062e-25■■■■■ 235.9
RBFOX2O43251 NEDD4L-221ENST00000588066 579 ntTSL 57.29□□□□□ -1.242e-25■■■■■ 235.9
RBFOX2O43251 NEDD4L-222ENST00000588494 505 ntTSL 41.8□□□□□ -2.122e-25■■■■■ 235.9
RBFOX2O43251 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.028e-8■■■■■ 223.3
RBFOX2O43251 CARS2-209ENST00000535398 1878 ntTSL 217.71■□□□□ 0.438e-8■■■■■ 223.3
RBFOX2O43251 CARS2-230ENST00000543487 870 ntTSL 515.05■□□□□ -08e-8■■■■■ 223.3
RBFOX2O43251 CARS2-212ENST00000537386 739 ntTSL 414.81□□□□□ -0.048e-8■■■■■ 223.3
RBFOX2O43251 CARS2-225ENST00000541362 1051 ntTSL 214.77□□□□□ -0.058e-8■■■■■ 223.3
RBFOX2O43251 CARS2-210ENST00000535516 2313 ntTSL 514.31□□□□□ -0.128e-8■■■■■ 223.3
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RBFOX2O43251 CARS2-211ENST00000535615 711 ntTSL 58.65□□□□□ -1.028e-8■■■■■ 223.3
RBFOX2O43251 COQ8A-204ENST00000476488 264 ntTSL 311.67□□□□□ -0.545e-13■■■■■ 220
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RBFOX2O43251 MMP25-AS1-207ENST00000573878 483 ntTSL 310□□□□□ -0.811e-40■■■■■ 207.1
RBFOX2O43251 MMP25-AS1-205ENST00000572930 420 ntTSL 37.06□□□□□ -1.281e-40■■■■■ 207.1
RBFOX2O43251 MMP25-AS1-206ENST00000573130 4434 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.41e-40■■■■■ 207.1
RBFOX2O43251 EPB41L2-208ENST00000524581 3090 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.91e-7■■■■■ 206.8
RBFOX2O43251 EPB41L2-207ENST00000456097 1138 ntTSL 59.2□□□□□ -0.941e-7■■■■■ 206.8
RBFOX2O43251 EPB41L2-210ENST00000525198 981 ntTSL 59.12□□□□□ -0.951e-7■■■■■ 206.8
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RBFOX2O43251 EPB41L2-217ENST00000527423 962 ntTSL 47.72□□□□□ -1.171e-7■■■■■ 206.8
RBFOX2O43251 EPB41L2-228ENST00000531410 2926 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.241e-7■■■■■ 206.8
RBFOX2O43251 EPB41L2-215ENST00000527017 727 ntTSL 57.28□□□□□ -1.241e-7■■■■■ 206.8
RBFOX2O43251 EPB41L2-209ENST00000525193 2121 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.491e-7■■■■■ 206.8
RBFOX2O43251 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.51e-7■■■■■ 206.8
RBFOX2O43251 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.691e-7■■■■■ 206.8
RBFOX2O43251 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.546e-12■■■■■ 196.8
RBFOX2O43251 NEDD4L-206ENST00000431212 3338 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.026e-12■■■■■ 196.8
RBFOX2O43251 NEDD4L-203ENST00000357895 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.136e-12■■■■■ 196.8
RBFOX2O43251 NEDD4L-214ENST00000586263 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.216e-12■■■■■ 196.8
RBFOX2O43251 NEDD4L-207ENST00000435432 3417 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.326e-12■■■■■ 196.8
RBFOX2O43251 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.031e-7■■■■■ 187.4
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RBFOX2O43251 EPB41L2-204ENST00000392427 3369 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.71e-7■■■■■ 187.4
RBFOX2O43251 EPB41L2-203ENST00000368128 4456 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.91e-7■■■■■ 187.4
RBFOX2O43251 EPB41L2-232ENST00000628542 4247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.921e-7■■■■■ 187.4
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RBFOX2O43251 EPB41L2-201ENST00000337057 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11e-7■■■■■ 187.4
RBFOX2O43251 NEDD4L-208ENST00000456173 4978 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.726e-12■■■■■ 187.4
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RBFOX2O43251 PFDN1-205ENST00000512925 900 ntTSL 27.68□□□□□ -1.181e-16■■■■■ 185.4
RBFOX2O43251 PFDN1-207ENST00000524074 395 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.51e-16■■■■■ 185.4
RBFOX2O43251 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.734e-49■■■■■ 183.9
RBFOX2O43251 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.224e-49■■■■■ 183.9
RBFOX2O43251 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.034e-49■■■■■ 183.9
RBFOX2O43251 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.434e-49■■■■■ 183.9
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RBFOX2O43251 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.146e-12■■■■■ 173.3
RBFOX2O43251 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.426e-12■■■■■ 173.3
RBFOX2O43251 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.456e-12■■■■■ 173.3
RBFOX2O43251 NEDD4L-201ENST00000256830 2920 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.16e-12■■■■■ 173.3
RBFOX2O43251 NR1H2-208ENST00000597157 856 ntTSL 1 (best)13.21□□□□□ -0.294e-15■■■■■ 173
RBFOX2O43251 NEDD4L-204ENST00000382850 8251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.226e-12■■■■■ 166.1
RBFOX2O43251 SMPD4-207ENST00000435455 842 ntTSL 512.65□□□□□ -0.387e-8■■■■■ 165.4
RBFOX2O43251 SMPD4-204ENST00000430682 820 ntTSL 39.52□□□□□ -0.897e-8■■■■■ 165.4
RBFOX2O43251 SMPD4-212ENST00000451542 796 ntTSL 59.46□□□□□ -0.97e-8■■■■■ 165.4
RBFOX2O43251 FOXK1-201ENST00000328914 11181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.652e-7■■■■■ 163.1
RBFOX2O43251 SMPD4-209ENST00000439886 3371 ntTSL 29.87□□□□□ -0.831e-7■■■■■ 161.6
RBFOX2O43251 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.087e-8■■■■■ 159.9
RBFOX2O43251 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.197e-8■■■■■ 159.9
RBFOX2O43251 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.417e-8■■■■■ 159.9
RBFOX2O43251 COQ8A-205ENST00000478406 3612 ntTSL 212.08□□□□□ -0.487e-8■■■■■ 159.9
RBFOX2O43251 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.021e-7■■■■■ 154.7
RBFOX2O43251 SMPD4-213ENST00000454468 3586 ntTSL 1 (best)9.75□□□□□ -0.851e-7■■■■■ 154.7
RBFOX2O43251 SMPD4-205ENST00000431183 3614 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.971e-7■■■■■ 154.7
RBFOX2O43251 SMPD4-217ENST00000473720 555 ntTSL 48.97□□□□□ -0.971e-7■■■■■ 154.7
RBFOX2O43251 SMPD4-206ENST00000433118 3335 ntTSL 58.71□□□□□ -1.021e-7■■■■■ 154.7
RBFOX2O43251 SMPD4-201ENST00000351288 3661 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.051e-7■■■■■ 154.7
RBFOX2O43251 SMPD4-203ENST00000412570 3601 ntTSL 27.72□□□□□ -1.171e-7■■■■■ 154.7
RBFOX2O43251 SMPD4-208ENST00000439029 566 ntTSL 46.7□□□□□ -1.341e-7■■■■■ 154.7
RBFOX2O43251 DIP2C-205ENST00000634311 4961 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.756e-7■■■■■ 153.7
RBFOX2O43251 DIP2C-201ENST00000280886 7888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.026e-7■■■■■ 153.7
RBFOX2O43251 WDR18-210ENST00000591997 577 ntTSL 315.18■□□□□ 0.025e-7■■■■■ 153.5
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