RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614300.4

SLC35E2B-204, Transcript of solute carrier family 35 member E2B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC35E2B, Length 2,156 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35E2B-204ENST00000614300 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.52■■■■□ 3.6
SLC35E2B-204ENST00000614300 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.33■■■□□ 2.77
SLC35E2B-204ENST00000614300 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.53■■■□□ 2.64
SLC35E2B-204ENST00000614300 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.41■■■□□ 2.62
SLC35E2B-204ENST00000614300 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.26■■■□□ 2.6
SLC35E2B-204ENST00000614300 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.8■■■□□ 2.52
SLC35E2B-204ENST00000614300 ABCC9O60706 1549 aa30.79■■■□□ 2.52
SLC35E2B-204ENST00000614300 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.28■■■□□ 2.44
SLC35E2B-204ENST00000614300 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
SLC35E2B-204ENST00000614300 NACADO15069 1562 aa30.15■■■□□ 2.42
SLC35E2B-204ENST00000614300 SCRIBQ14160 1630 aa30.13■■■□□ 2.41
SLC35E2B-204ENST00000614300 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.86■■■□□ 2.37
SLC35E2B-204ENST00000614300 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.34■■■□□ 2.29
SLC35E2B-204ENST00000614300 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.34■■■□□ 2.29
SLC35E2B-204ENST00000614300 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
SLC35E2B-204ENST00000614300 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.28■■■□□ 2.286e-6■■□□□ 12.8
SLC35E2B-204ENST00000614300 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.12■■■□□ 2.25
SLC35E2B-204ENST00000614300 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.07■■■□□ 2.24
SLC35E2B-204ENST00000614300 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.93■■■□□ 2.22
SLC35E2B-204ENST00000614300 WIZO95785 1651 aa28.89■■■□□ 2.22
SLC35E2B-204ENST00000614300 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
SLC35E2B-204ENST00000614300 SMARCA4P51532 1647 aa28.75■■■□□ 2.19
SLC35E2B-204ENST00000614300 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
SLC35E2B-204ENST00000614300 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.32■■■□□ 2.12
SLC35E2B-204ENST00000614300 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.29■■■□□ 2.12
SLC35E2B-204ENST00000614300 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.26■■■□□ 2.12
SLC35E2B-204ENST00000614300 SMARCA2P51531 1590 aa28.25■■■□□ 2.11
SLC35E2B-204ENST00000614300 TRIM41Q8WV44 630 aa28.24■■■□□ 2.11
SLC35E2B-204ENST00000614300 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
SLC35E2B-204ENST00000614300 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
SLC35E2B-204ENST00000614300 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.05■■■□□ 2.08
SLC35E2B-204ENST00000614300 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
SLC35E2B-204ENST00000614300 NCAPD3P42695 1498 aa27.92■■■□□ 2.06
SLC35E2B-204ENST00000614300 ABCC8Q09428 1581 aa27.89■■■□□ 2.06
SLC35E2B-204ENST00000614300 HMGXB3Q12766 1538 aa27.79■■■□□ 2.04
SLC35E2B-204ENST00000614300 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.74■■■□□ 2.03
SLC35E2B-204ENST00000614300 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.72■■■□□ 2.03
SLC35E2B-204ENST00000614300 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.57■■■□□ 2
SLC35E2B-204ENST00000614300 SOGA1O94964 1423 aa27.47■■□□□ 1.99
SLC35E2B-204ENST00000614300 SYNJ1O43426 1573 aa27.45■■□□□ 1.98
SLC35E2B-204ENST00000614300 CFTRP13569 1480 aa27.41■■□□□ 1.98
SLC35E2B-204ENST00000614300 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.39■■□□□ 1.98
SLC35E2B-204ENST00000614300 HRCP23327 699 aa27.39■■□□□ 1.97
SLC35E2B-204ENST00000614300 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.37■■□□□ 1.97
SLC35E2B-204ENST00000614300 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.31■■□□□ 1.96
SLC35E2B-204ENST00000614300 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.25■■□□□ 1.95
SLC35E2B-204ENST00000614300 TOP2BQ02880 1626 aa27.19■■□□□ 1.94
SLC35E2B-204ENST00000614300 CUX1P39880 1505 aa27.17■■□□□ 1.94
SLC35E2B-204ENST00000614300 NESP48681 1621 aa27.15■■□□□ 1.94
SLC35E2B-204ENST00000614300 PCGF6Q9BYE7 350 aa27.14■■□□□ 1.94
SLC35E2B-204ENST00000614300 EEA1Q15075 1411 aa27.13■■□□□ 1.93
SLC35E2B-204ENST00000614300 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.1■■□□□ 1.93
SLC35E2B-204ENST00000614300 PRDM2Q13029 1718 aa27.06■■□□□ 1.92
SLC35E2B-204ENST00000614300 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
SLC35E2B-204ENST00000614300 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.02■■□□□ 1.92
SLC35E2B-204ENST00000614300 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.9■■□□□ 1.9
SLC35E2B-204ENST00000614300 GOLGA3Q08378 1498 aa26.9■■□□□ 1.9
SLC35E2B-204ENST00000614300 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.85■■□□□ 1.89
SLC35E2B-204ENST00000614300 CEP162Q5TB80 1403 aa26.85■■□□□ 1.89
SLC35E2B-204ENST00000614300 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.85■■□□□ 1.89
SLC35E2B-204ENST00000614300 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
SLC35E2B-204ENST00000614300 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.84■■□□□ 1.89
SLC35E2B-204ENST00000614300 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.84■■□□□ 1.89
SLC35E2B-204ENST00000614300 KIF27Q86VH2 1401 aa26.81■■□□□ 1.88
SLC35E2B-204ENST00000614300 KIF21BO75037 1637 aa26.79■■□□□ 1.88
SLC35E2B-204ENST00000614300 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
SLC35E2B-204ENST00000614300 CUX2O14529 1486 aa26.75■■□□□ 1.87
SLC35E2B-204ENST00000614300 TOPBP1Q92547 1522 aa26.74■■□□□ 1.87
SLC35E2B-204ENST00000614300 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.73■■□□□ 1.87
SLC35E2B-204ENST00000614300 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
SLC35E2B-204ENST00000614300 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.71■■□□□ 1.87
SLC35E2B-204ENST00000614300 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.7■■□□□ 1.87
SLC35E2B-204ENST00000614300 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
SLC35E2B-204ENST00000614300 PRXQ9BXM0 1461 aa26.69■■□□□ 1.86
SLC35E2B-204ENST00000614300 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
SLC35E2B-204ENST00000614300 IGF1RP08069 1367 aa26.65■■□□□ 1.86
SLC35E2B-204ENST00000614300 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.63■■□□□ 1.85
SLC35E2B-204ENST00000614300 CLIP1P30622 1438 aa26.57■■□□□ 1.84
SLC35E2B-204ENST00000614300 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
SLC35E2B-204ENST00000614300 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.54■■□□□ 1.84
SLC35E2B-204ENST00000614300 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.51■■□□□ 1.83
SLC35E2B-204ENST00000614300 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.5■■□□□ 1.83
SLC35E2B-204ENST00000614300 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
SLC35E2B-204ENST00000614300 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.36■■□□□ 1.81
SLC35E2B-204ENST00000614300 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.31■■□□□ 1.8
SLC35E2B-204ENST00000614300 WDR97A6NE52 1622 aa26.3■■□□□ 1.8
SLC35E2B-204ENST00000614300 ERCC6Q03468 1493 aa26.28■■□□□ 1.8
SLC35E2B-204ENST00000614300 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.28■■□□□ 1.8
SLC35E2B-204ENST00000614300 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
SLC35E2B-204ENST00000614300 ARAP1Q96P48 1450 aa26.26■■□□□ 1.79
SLC35E2B-204ENST00000614300 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.23■■□□□ 1.79
SLC35E2B-204ENST00000614300 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.22■■□□□ 1.791e-7■■■□□ 16.5
SLC35E2B-204ENST00000614300 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.21■■□□□ 1.79
SLC35E2B-204ENST00000614300 APLP2Q06481 763 aa26.19■■□□□ 1.78
SLC35E2B-204ENST00000614300 P3H3Q8IVL6 736 aa26.17■■□□□ 1.78
SLC35E2B-204ENST00000614300 WDR62O43379 1518 aa26.16■■□□□ 1.78
SLC35E2B-204ENST00000614300 CUL7Q14999 1698 aa26.14■■□□□ 1.78
SLC35E2B-204ENST00000614300 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
SLC35E2B-204ENST00000614300 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
SLC35E2B-204ENST00000614300 IFT140Q96RY7 1462 aa26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 894.2 ms