Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.365e-7■■□□□ 13.4
PUM1Q14671 CLK2-205ENST00000476983 1885 ntTSL 1 (best)18.33■□□□□ 0.535e-7■■□□□ 13.4
PUM1Q14671 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.355e-7■■□□□ 13.4
PUM1Q14671 RPL5-205ENST00000497519 1210 ntTSL 210.13□□□□□ -0.794e-32■■□□□ 13.4
PUM1Q14671 SUPT5H-201ENST00000359191 3770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.642e-6■■□□□ 13.4
PUM1Q14671 SUPT5H-203ENST00000402194 3698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.662e-6■■□□□ 13.4
PUM1Q14671 SUPT5H-215ENST00000599117 3902 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.742e-6■■□□□ 13.4
PUM1Q14671 SUPT5H-204ENST00000432763 3710 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.742e-6■■□□□ 13.4
PUM1Q14671 SUPT5H-213ENST00000598725 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.782e-6■■□□□ 13.4
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PUM1Q14671 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.028e-7■■□□□ 13.4
PUM1Q14671 TPX2-202ENST00000340513 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.542e-10■■□□□ 13.4
PUM1Q14671 TPX2-201ENST00000300403 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.542e-10■■□□□ 13.4
PUM1Q14671 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.959e-7■■□□□ 13.4
PUM1Q14671 DDX10-204ENST00000530116 435 ntTSL 35.63□□□□□ -1.511e-6■■□□□ 13.4
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PUM1Q14671 NCL-201ENST00000322723 4034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.599e-17■■□□□ 13.4
PUM1Q14671 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.352e-6■■□□□ 13.4
PUM1Q14671 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.252e-6■■□□□ 13.4
PUM1Q14671 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.052e-6■■□□□ 13.4
PUM1Q14671 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.442e-6■■□□□ 13.4
PUM1Q14671 SEC31A-202ENST00000311785 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.482e-6■■□□□ 13.4
PUM1Q14671 SEC31A-208ENST00000448323 4255 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.492e-6■■□□□ 13.4
PUM1Q14671 SEC31A-228ENST00000509142 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.752e-6■■□□□ 13.4
PUM1Q14671 SEC31A-227ENST00000508502 3801 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.922e-6■■□□□ 13.4
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PUM1Q14671 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.752e-6■■□□□ 13.4
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PUM1Q14671 SMARCC1-202ENST00000425518 3827 ntTSL 27.18□□□□□ -1.264e-8■■□□□ 13.4
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PUM1Q14671 PTPRA-204ENST00000380393 3636 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.951e-7■■□□□ 13.4
PUM1Q14671 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.382e-6■■□□□ 13.4
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PUM1Q14671 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.483e-7■■□□□ 13.4
PUM1Q14671 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.382e-6■■□□□ 13.4
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PUM1Q14671 ACIN1-213ENST00000555053 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.534e-7■■□□□ 13.4
PUM1Q14671 ACIN1-223ENST00000605057 4474 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.664e-7■■□□□ 13.4
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PUM1Q14671 ENSA-208ENST00000369014 2085 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.368e-8■■□□□ 13.4
PUM1Q14671 ENSA-202ENST00000339643 633 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.618e-8■■□□□ 13.4
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PUM1Q14671 ENSA-213ENST00000509582 716 ntTSL 39.4□□□□□ -0.98e-8■■□□□ 13.4
PUM1Q14671 ENSA-215ENST00000638926 360 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.998e-8■■□□□ 13.4
PUM1Q14671 ENSA-204ENST00000356527 2546 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.258e-8■■□□□ 13.4
PUM1Q14671 ENSA-212ENST00000505321 552 ntTSL 56.99□□□□□ -1.298e-8■■□□□ 13.4
PUM1Q14671 ENSA-201ENST00000271690 2818 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.318e-8■■□□□ 13.4
PUM1Q14671 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.48e-8■■□□□ 13.4
PUM1Q14671 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.568e-8■■□□□ 13.4
PUM1Q14671 ENSA-203ENST00000354702 569 ntTSL 54.3□□□□□ -1.728e-8■■□□□ 13.4
PUM1Q14671 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.818e-8■■□□□ 13.4
PUM1Q14671 RPS24-211ENST00000480662 711 ntTSL 210□□□□□ -0.811e-43■■□□□ 13.3
PUM1Q14671 SFPQ-201ENST00000357214 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.551e-16■■□□□ 13.3
PUM1Q14671 CLTC-215ENST00000621829 8587 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.581e-6■■□□□ 13.3
PUM1Q14671 CLTC-201ENST00000269122 7760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.161e-6■■□□□ 13.3
PUM1Q14671 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.351e-6■■□□□ 13.3
PUM1Q14671 CLK2-207ENST00000497188 2702 ntTSL 210.76□□□□□ -0.698e-7■■□□□ 13.3
PUM1Q14671 TPM4-208ENST00000588410 563 ntTSL 420.37■□□□□ 0.852e-10■■□□□ 13.3
PUM1Q14671 TPM4-204ENST00000586499 708 ntTSL 419.69■□□□□ 0.742e-10■■□□□ 13.3
PUM1Q14671 TPM4-206ENST00000587201 877 ntTSL 218.45■□□□□ 0.542e-10■■□□□ 13.3
PUM1Q14671 TPM4-205ENST00000586833 558 ntTSL 514.18□□□□□ -0.142e-10■■□□□ 13.3
PUM1Q14671 NFIC-207ENST00000589164 435 ntTSL 313.12□□□□□ -0.312e-10■■□□□ 13.3
PUM1Q14671 LAMA5-203ENST00000370691 3160 ntTSL 1 (best)12.89□□□□□ -0.352e-10■■□□□ 13.3
PUM1Q14671 TPM4-209ENST00000588483 801 ntTSL 510.82□□□□□ -0.682e-10■■□□□ 13.3
PUM1Q14671 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.325e-8■■□□□ 13.3
PUM1Q14671 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.085e-8■■□□□ 13.3
PUM1Q14671 CALM3-205ENST00000486500 2536 ntTSL 212.08□□□□□ -0.485e-8■■□□□ 13.3
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