Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 PPT2-250ENST00000424499 722 ntTSL 318.38■□□□□ 0.533e-9■■■■■ 43.5
EFTUD2Q15029 PPT2-249ENST00000414204 954 ntTSL 518.13■□□□□ 0.494e-9■■■■■ 43.5
EFTUD2Q15029 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.43e-9■■■■■ 43.5
EFTUD2Q15029 PPT2-251ENST00000436118 633 ntTSL 417.36■□□□□ 0.373e-9■■■■■ 43.5
EFTUD2Q15029 PPT2-253ENST00000478521 584 ntTSL 315.1■□□□□ 0.014e-9■■■■■ 43.5
EFTUD2Q15029 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.064e-9■■■■■ 43.5
EFTUD2Q15029 YIF1A-206ENST00000474986 860 ntTSL 1 (best)22.12■■□□□ 1.132e-8■■■■■ 43.5
EFTUD2Q15029 YIF1A-202ENST00000376899 1042 ntTSL 221.95■■□□□ 1.12e-8■■■■■ 43.5
EFTUD2Q15029 YIF1A-212ENST00000528575 532 ntTSL 317.84■□□□□ 0.452e-8■■■■■ 43.5
EFTUD2Q15029 YIF1A-204ENST00000431556 619 ntTSL 215.12■□□□□ 0.012e-8■■■■■ 43.5
EFTUD2Q15029 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.274e-11■■■■■ 43.4
EFTUD2Q15029 MRPL48-201ENST00000310614 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.374e-11■■■■■ 43.4
EFTUD2Q15029 MRPL48-214ENST00000544819 742 ntTSL 212.13□□□□□ -0.474e-11■■■■■ 43.4
EFTUD2Q15029 MRPL48-206ENST00000508278 1560 ntTSL 211.41□□□□□ -0.584e-11■■■■■ 43.4
EFTUD2Q15029 MRPL48-203ENST00000398483 1058 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.594e-11■■■■■ 43.4
EFTUD2Q15029 MRPL48-213ENST00000544140 996 ntTSL 211.16□□□□□ -0.624e-11■■■■■ 43.4
EFTUD2Q15029 MRPL48-209ENST00000540162 1004 ntTSL 510.66□□□□□ -0.74e-11■■■■■ 43.4
EFTUD2Q15029 MRPL48-205ENST00000497094 531 ntTSL 48.74□□□□□ -1.014e-11■■■■■ 43.4
EFTUD2Q15029 MRPL48-204ENST00000411840 1197 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.064e-11■■■■■ 43.4
EFTUD2Q15029 MRPL48-207ENST00000535277 598 ntTSL 36.51□□□□□ -1.374e-11■■■■■ 43.4
EFTUD2Q15029 MRPL48-211ENST00000543058 699 ntTSL 33□□□□□ -1.934e-11■■■■■ 43.4
EFTUD2Q15029 MRPL48-208ENST00000537007 287 ntTSL 32.03□□□□□ -2.084e-11■■■■■ 43.4
EFTUD2Q15029 MAP2K7-204ENST00000465324 399 ntTSL 59.89□□□□□ -0.833e-16■■■■■ 43.4
EFTUD2Q15029 TRIM11-206ENST00000602582 682 ntTSL 315.48■□□□□ 0.073e-7■■■■■ 43.4
EFTUD2Q15029 TRIM11-205ENST00000602308 586 ntTSL 312.87□□□□□ -0.353e-7■■■■■ 43.4
EFTUD2Q15029 KPNA4-202ENST00000469804 790 ntTSL 224.68■■□□□ 1.545e-6■■■■■ 43.4
EFTUD2Q15029 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.282e-7■■■■■ 43.4
EFTUD2Q15029 IRAK1-210ENST00000455690 784 ntTSL 319.32■□□□□ 0.681e-6■■■■■ 43.4
EFTUD2Q15029 IRAK1-206ENST00000437278 862 ntTSL 513.29□□□□□ -0.281e-6■■■■■ 43.4
EFTUD2Q15029 ATP6V0A1-220ENST00000588901 589 ntTSL 217.03■□□□□ 0.324e-13■■■■■ 43.4
EFTUD2Q15029 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.121e-12■■■■■ 43.4
EFTUD2Q15029 MRPL55-220ENST00000411464 767 ntTSL 315.49■□□□□ 0.071e-12■■■■■ 43.4
EFTUD2Q15029 MRPL55-222ENST00000457264 544 ntTSL 315.49■□□□□ 0.071e-12■■■■■ 43.4
EFTUD2Q15029 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.071e-12■■■■■ 43.4
EFTUD2Q15029 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.031e-12■■■■■ 43.4
EFTUD2Q15029 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.021e-12■■■■■ 43.4
EFTUD2Q15029 MRPL55-226ENST00000473066 820 ntTSL 314.76□□□□□ -0.051e-12■■■■■ 43.4
EFTUD2Q15029 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.181e-12■■■■■ 43.4
EFTUD2Q15029 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.181e-12■■■■■ 43.4
EFTUD2Q15029 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.331e-12■■■■■ 43.4
EFTUD2Q15029 MRPL55-219ENST00000391867 685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.391e-12■■■■■ 43.4
EFTUD2Q15029 MRPL55-227ENST00000475832 858 ntTSL 512.28□□□□□ -0.441e-12■■■■■ 43.4
EFTUD2Q15029 MRPL55-224ENST00000464148 636 ntTSL 512.25□□□□□ -0.451e-12■■■■■ 43.4
EFTUD2Q15029 MRPL55-210ENST00000366736 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.531e-12■■■■■ 43.4
EFTUD2Q15029 MRPL55-209ENST00000366735 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.531e-12■■■■■ 43.4
EFTUD2Q15029 MRPL55-213ENST00000366740 644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.651e-12■■■■■ 43.4
EFTUD2Q15029 MRPL55-221ENST00000430433 864 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.691e-12■■■■■ 43.4
EFTUD2Q15029 MRPL55-203ENST00000336520 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.691e-12■■■■■ 43.4
EFTUD2Q15029 MRPL55-212ENST00000366739 641 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.731e-12■■■■■ 43.4
EFTUD2Q15029 MRPL55-204ENST00000348259 661 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.881e-12■■■■■ 43.4
EFTUD2Q15029 MRPL55-216ENST00000366744 726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.991e-12■■■■■ 43.4
EFTUD2Q15029 MRPL55-211ENST00000366738 705 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.121e-12■■■■■ 43.4
EFTUD2Q15029 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.099e-8■■■■■ 43.4
EFTUD2Q15029 TMBIM6-227ENST00000552699 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.39e-8■■■■■ 43.4
EFTUD2Q15029 TMBIM6-201ENST00000267115 2836 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.99e-8■■■■■ 43.4
EFTUD2Q15029 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.491e-9■■■■■ 43.3
EFTUD2Q15029 RANBP1-210ENST00000435265 1879 ntTSL 219.73■□□□□ 0.751e-9■■■■■ 43.3
EFTUD2Q15029 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.091e-9■■■■■ 43.3
EFTUD2Q15029 RANBP1-203ENST00000411892 584 ntTSL 214.3□□□□□ -0.121e-9■■■■■ 43.3
EFTUD2Q15029 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.131e-9■■■■■ 43.3
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EFTUD2Q15029 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.754e-10■■■■■ 43.2
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EFTUD2Q15029 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.034e-10■■■■■ 43.2
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EFTUD2Q15029 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.334e-10■■■■■ 43.2
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EFTUD2Q15029 SLC25A3-202ENST00000228318 1678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.334e-10■■■■■ 43.2
EFTUD2Q15029 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.364e-10■■■■■ 43.2
EFTUD2Q15029 SLC25A3-214ENST00000551123 1417 ntTSL 1 (best)12.31□□□□□ -0.444e-10■■■■■ 43.2
EFTUD2Q15029 SLC25A3-203ENST00000401722 6087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.484e-10■■■■■ 43.2
EFTUD2Q15029 SLC25A3-212ENST00000549338 1285 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.554e-10■■■■■ 43.2
EFTUD2Q15029 SLC25A3-204ENST00000546766 3236 ntTSL 1 (best)10.76□□□□□ -0.694e-10■■■■■ 43.2
EFTUD2Q15029 SNRNP200-204ENST00000480615 1646 ntTSL 513.23□□□□□ -0.294e-8■■■■■ 43.2
EFTUD2Q15029 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.313e-11■■■■■ 43.2
EFTUD2Q15029 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.313e-11■■■■■ 43.2
EFTUD2Q15029 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.453e-11■■■■■ 43.2
EFTUD2Q15029 RPL37A-204ENST00000441179 529 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.163e-11■■■■■ 43.2
EFTUD2Q15029 PCGF1-202ENST00000463744 227 ntTSL 1 (best)6.03□□□□□ -1.441e-6■■■■■ 43.2
EFTUD2Q15029 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.856e-8■■■■■ 43.2
EFTUD2Q15029 FXR2-203ENST00000571597 565 ntTSL 419.54■□□□□ 0.726e-8■■■■■ 43.2
EFTUD2Q15029 TK1-206ENST00000592126 631 ntTSL 319.07■□□□□ 0.643e-6■■■■■ 43.2
EFTUD2Q15029 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.463e-6■■■■■ 43.2
EFTUD2Q15029 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.423e-6■■■■■ 43.2
EFTUD2Q15029 TK1-202ENST00000586613 631 ntTSL 316.34■□□□□ 0.213e-6■■■■■ 43.2
EFTUD2Q15029 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.083e-6■■■■■ 43.2
EFTUD2Q15029 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.063e-6■■■■■ 43.2
EFTUD2Q15029 ADCY6-203ENST00000547260 4758 ntTSL 214.36□□□□□ -0.116e-11■■■■■ 43.2
EFTUD2Q15029 SUGP1-205ENST00000586387 626 ntTSL 312.73□□□□□ -0.373e-7■■■■■ 43.2
EFTUD2Q15029 LIG1-213ENST00000596672 792 ntTSL 39.85□□□□□ -0.833e-9■■■■■ 43.2
EFTUD2Q15029 ADCY6-204ENST00000548351 576 ntTSL 39.35□□□□□ -0.916e-11■■■■■ 43.2
EFTUD2Q15029 RBM8A-209ENST00000634161 464 ntTSL 311.55□□□□□ -0.564e-8■■■■■ 43.2
EFTUD2Q15029 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.12■□□□□ 0.339e-7■■■■■ 43.2
EFTUD2Q15029 VARS-216ENST00000428445 863 ntTSL 515.27■□□□□ 0.043e-7■■■■■ 43.2
EFTUD2Q15029 CD46-217ENST00000493796 408 ntTSL 53.1□□□□□ -1.914e-7■■■■■ 43.2
EFTUD2Q15029 PLXND1-208ENST00000505237 507 ntTSL 518.44■□□□□ 0.547e-7■■■■■ 43.1
EFTUD2Q15029 SSBP4-213ENST00000602088 622 ntTSL 516.01■□□□□ 0.151e-6■■■■■ 43.1
EFTUD2Q15029 CUL7-202ENST00000478630 749 ntTSL 513.16□□□□□ -0.34e-7■■■■■ 43.1
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