RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295008.8

MRPL55-201, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L55, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene MRPL55, Length 632 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL55-201ENST00000295008 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.69■■■■□ 3.62
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MRPL55-201ENST00000295008 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.55■■■□□ 2.64
MRPL55-201ENST00000295008 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.2■■■□□ 2.59
MRPL55-201ENST00000295008 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.17■■■□□ 2.58
MRPL55-201ENST00000295008 NACADO15069 1562 aa31.12■■■□□ 2.57
MRPL55-201ENST00000295008 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.1■■■□□ 2.57
MRPL55-201ENST00000295008 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.03■■■□□ 2.56
MRPL55-201ENST00000295008 SCRIBQ14160 1630 aa30.45■■■□□ 2.47
MRPL55-201ENST00000295008 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.39■■■□□ 2.46
MRPL55-201ENST00000295008 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.13■■■□□ 2.41
MRPL55-201ENST00000295008 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.1■■■□□ 2.41
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MRPL55-201ENST00000295008 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
MRPL55-201ENST00000295008 SMARCA4P51532 1647 aa29.16■■■□□ 2.26
MRPL55-201ENST00000295008 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.12■■■□□ 2.25
MRPL55-201ENST00000295008 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.08■■■□□ 2.25
MRPL55-201ENST00000295008 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.98■■■□□ 2.23
MRPL55-201ENST00000295008 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
MRPL55-201ENST00000295008 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.84■■■□□ 2.21
MRPL55-201ENST00000295008 WIZO95785 1651 aa28.82■■■□□ 2.2
MRPL55-201ENST00000295008 SMARCA2P51531 1590 aa28.81■■■□□ 2.2
MRPL55-201ENST00000295008 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.8■■■□□ 2.2
MRPL55-201ENST00000295008 NCAPD3P42695 1498 aa28.68■■■□□ 2.18
MRPL55-201ENST00000295008 HMGXB3Q12766 1538 aa28.65■■■□□ 2.18
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MRPL55-201ENST00000295008 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
MRPL55-201ENST00000295008 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.15■■■□□ 2.1
MRPL55-201ENST00000295008 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.87■■■□□ 2.05
MRPL55-201ENST00000295008 NESP48681 1621 aa27.87■■■□□ 2.05
MRPL55-201ENST00000295008 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.86■■■□□ 2.05
MRPL55-201ENST00000295008 CFTRP13569 1480 aa27.85■■■□□ 2.05
MRPL55-201ENST00000295008 PRDM2Q13029 1718 aa27.77■■■□□ 2.04
MRPL55-201ENST00000295008 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.61■■■□□ 2.01
MRPL55-201ENST00000295008 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.6■■■□□ 2.01
MRPL55-201ENST00000295008 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.58■■■□□ 2.01
MRPL55-201ENST00000295008 ERCC6Q03468 1493 aa27.52■■■□□ 2
MRPL55-201ENST00000295008 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.51■■■□□ 2
MRPL55-201ENST00000295008 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
MRPL55-201ENST00000295008 ABCC8Q09428 1581 aa27.35■■□□□ 1.97
MRPL55-201ENST00000295008 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.35■■□□□ 1.97
MRPL55-201ENST00000295008 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
MRPL55-201ENST00000295008 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.26■■□□□ 1.95
MRPL55-201ENST00000295008 WDR62O43379 1518 aa27.26■■□□□ 1.95
MRPL55-201ENST00000295008 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.25■■□□□ 1.95
MRPL55-201ENST00000295008 CUX1P39880 1505 aa27.25■■□□□ 1.95
MRPL55-201ENST00000295008 TOPBP1Q92547 1522 aa27.22■■□□□ 1.95
MRPL55-201ENST00000295008 SYNJ1O43426 1573 aa27.22■■□□□ 1.95
MRPL55-201ENST00000295008 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.19■■□□□ 1.94
MRPL55-201ENST00000295008 TOP2BQ02880 1626 aa27.16■■□□□ 1.94
MRPL55-201ENST00000295008 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.06■■□□□ 1.92
MRPL55-201ENST00000295008 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
MRPL55-201ENST00000295008 CUX2O14529 1486 aa27.01■■□□□ 1.91
MRPL55-201ENST00000295008 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.01■■□□□ 1.91
MRPL55-201ENST00000295008 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.01■■□□□ 1.91
MRPL55-201ENST00000295008 TRIM41Q8WV44 630 aa26.94■■□□□ 1.9
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MRPL55-201ENST00000295008 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.9■■□□□ 1.9
MRPL55-201ENST00000295008 IFT140Q96RY7 1462 aa26.89■■□□□ 1.9
MRPL55-201ENST00000295008 SOGA1O94964 1423 aa26.89■■□□□ 1.89
MRPL55-201ENST00000295008 WDR97A6NE52 1622 aa26.87■■□□□ 1.89
MRPL55-201ENST00000295008 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.8■■□□□ 1.88
MRPL55-201ENST00000295008 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
MRPL55-201ENST00000295008 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
MRPL55-201ENST00000295008 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.7■■□□□ 1.86
MRPL55-201ENST00000295008 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
MRPL55-201ENST00000295008 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.63■■□□□ 1.858e-7■■■■■ 27.9
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MRPL55-201ENST00000295008 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.61■■□□□ 1.85
MRPL55-201ENST00000295008 PBRM1Q86U86 1689 aa26.6■■□□□ 1.85
MRPL55-201ENST00000295008 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.6■■□□□ 1.85
MRPL55-201ENST00000295008 GRIN2BQ13224 1484 aa26.53■■□□□ 1.84
MRPL55-201ENST00000295008 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.49■■□□□ 1.83
MRPL55-201ENST00000295008 EEA1Q15075 1411 aa26.49■■□□□ 1.83
MRPL55-201ENST00000295008 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.45■■□□□ 1.82
MRPL55-201ENST00000295008 IGF1RP08069 1367 aa26.42■■□□□ 1.82
MRPL55-201ENST00000295008 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
MRPL55-201ENST00000295008 ADAMTS12P58397 1594 aa26.41■■□□□ 1.82
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MRPL55-201ENST00000295008 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
MRPL55-201ENST00000295008 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.33■■□□□ 1.81
MRPL55-201ENST00000295008 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.31■■□□□ 1.8
MRPL55-201ENST00000295008 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.29■■□□□ 1.8
MRPL55-201ENST00000295008 SYNJ2O15056 1496 aa26.29■■□□□ 1.8
MRPL55-201ENST00000295008 PRXQ9BXM0 1461 aa26.27■■□□□ 1.8
MRPL55-201ENST00000295008 CHD1O14646 1710 aa26.27■■□□□ 1.8
MRPL55-201ENST00000295008 KIF21BO75037 1637 aa26.24■■□□□ 1.79
MRPL55-201ENST00000295008 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.22■■□□□ 1.79
MRPL55-201ENST00000295008 GRIN2AQ12879 1464 aa26.21■■□□□ 1.79
MRPL55-201ENST00000295008 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
MRPL55-201ENST00000295008 FBLN2P98095 1184 aa26.16■■□□□ 1.78
MRPL55-201ENST00000295008 GOLGA3Q08378 1498 aa26.11■■□□□ 1.77
MRPL55-201ENST00000295008 CEP170Q5SW79 1584 aa26.08■■□□□ 1.77
MRPL55-201ENST00000295008 NUP160Q12769 1436 aa26.05■■□□□ 1.76
MRPL55-201ENST00000295008 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.05■■□□□ 1.76
MRPL55-201ENST00000295008 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.02■■□□□ 1.76
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