Protein–RNA interactions for Protein: Q14527

HLTF, Helicase-like transcription factor, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLTFQ14527 HCG18-246ENST00000602591 1976 nt12.05□□□□□ -0.484e-7■■□□□ 13.7
HLTFQ14527 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.793e-10■■□□□ 13.7
HLTFQ14527 EPB41L2-205ENST00000445890 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.173e-10■■□□□ 13.7
HLTFQ14527 EPB41L2-204ENST00000392427 3369 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.173e-10■■□□□ 13.7
HLTFQ14527 EPB41L2-203ENST00000368128 4456 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.333e-10■■□□□ 13.7
HLTFQ14527 EPB41L2-232ENST00000628542 4247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.473e-10■■□□□ 13.7
HLTFQ14527 EPB41L2-224ENST00000530481 3914 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.533e-10■■□□□ 13.7
HLTFQ14527 EPB41L2-218ENST00000527659 2436 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.563e-10■■□□□ 13.7
HLTFQ14527 EPB41L2-216ENST00000527411 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.623e-10■■□□□ 13.7
HLTFQ14527 EPB41L2-201ENST00000337057 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.733e-10■■□□□ 13.7
HLTFQ14527 EPB41L2-221ENST00000529208 3023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.753e-10■■□□□ 13.7
HLTFQ14527 EPB41L2-223ENST00000530148 664 ntTSL 48.65□□□□□ -1.023e-10■■□□□ 13.7
HLTFQ14527 EPB41L2-209ENST00000525193 2121 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.233e-10■■□□□ 13.7
HLTFQ14527 EPB41L2-233ENST00000639623 3395 ntTSL 57.33□□□□□ -1.243e-10■■□□□ 13.7
HLTFQ14527 EPB41L2-212ENST00000526333 549 ntTSL 56.84□□□□□ -1.313e-10■■□□□ 13.7
HLTFQ14527 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.323e-10■■□□□ 13.7
HLTFQ14527 EPB41L2-219ENST00000528179 560 ntTSL 56.35□□□□□ -1.393e-10■■□□□ 13.7
HLTFQ14527 ALMS1-208ENST00000620466 6720 ntTSL 29.44□□□□□ -0.94e-8■■□□□ 13.7
HLTFQ14527 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.697e-7■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 RAB10-204ENST00000495146 1292 ntTSL 523.16■■□□□ 1.32e-7■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 RAB10-201ENST00000264710 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.182e-7■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 RAB10-202ENST00000462003 584 ntTSL 47.18□□□□□ -1.262e-7■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 RAB10-203ENST00000473035 571 ntTSL 46.92□□□□□ -1.32e-7■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 PHF3-211ENST00000514822 486 ntTSL 45.41□□□□□ -1.542e-15■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.756e-7■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.646e-7■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.596e-7■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.839e-13■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.899e-13■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.879e-13■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.519e-13■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 DDX42-215ENST00000582985 543 ntTSL 49.58□□□□□ -0.889e-13■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 DDX42-214ENST00000581767 2244 nt8.54□□□□□ -1.049e-13■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 DDX42-207ENST00000578593 2919 ntTSL 28.02□□□□□ -1.139e-13■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 DDX42-203ENST00000457800 3323 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.29e-13■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 DDX42-217ENST00000584010 3929 ntTSL 27.37□□□□□ -1.239e-13■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 DDX42-210ENST00000579539 571 ntTSL 26.63□□□□□ -1.359e-13■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 CCDC144NL-AS1-205ENST00000439794 481 ntTSL 314.44□□□□□ -0.13e-7■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.832e-6■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 REST-203ENST00000511065 513 ntTSL 1 (best)25.05■■□□□ 1.62e-6■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.482e-6■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.212e-6■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.212e-6■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.842e-6■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.462e-6■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 PALB2-205ENST00000567003 789 ntTSL 315.58■□□□□ 0.082e-6■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.052e-6■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 XPO1-206ENST00000428210 6776 ntTSL 215.14■□□□□ 0.012e-6■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 SLC30A9-205ENST00000513699 2217 ntTSL 214.73□□□□□ -0.052e-6■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.12e-6■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 CDC42BPA-203ENST00000366766 10610 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.222e-6■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 XPO1-214ENST00000461407 2676 ntTSL 213.53□□□□□ -0.242e-6■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 CDC42BPA-202ENST00000366764 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.272e-6■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 CDC42BPA-205ENST00000366769 10855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.372e-6■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 ZNF609-201ENST00000326648 8746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.412e-6■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 FAM69A-201ENST00000370310 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.452e-6■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 FAM69A-204ENST00000615519 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.452e-6■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 SLC30A9-201ENST00000264451 6218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.522e-6■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 MKLN1-209ENST00000494785 2386 ntTSL 1 (best)11.33□□□□□ -0.62e-6■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 FAM69A-205ENST00000616709 2426 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.682e-6■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 FNDC3A-201ENST00000378383 2037 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.722e-6■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 TTC28-207ENST00000490475 724 ntTSL 510.34□□□□□ -0.752e-6■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 REST-205ENST00000611211 1103 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.82e-6■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 AL121722.1-201ENST00000638550 4849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.822e-6■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 FNDC3A-204ENST00000492622 6286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.822e-6■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 CD46-202ENST00000322918 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.862e-6■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 REST-202ENST00000503522 457 ntTSL 1 (best)9.64□□□□□ -0.872e-6■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 CD46-206ENST00000360212 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.872e-6■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 LINC00261-203ENST00000609300 457 ntTSL 39.6□□□□□ -0.872e-6■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 CD46-214ENST00000480003 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.882e-6■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 FAM69A-203ENST00000613902 2468 ntTSL 4 BASIC9.44□□□□□ -0.92e-6■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 FNDC3A-206ENST00000541916 6328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.92e-6■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 CD46-209ENST00000367047 3089 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.922e-6■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 MKLN1-206ENST00000458153 2448 ntTSL 29.2□□□□□ -0.942e-6■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 XPO1-203ENST00000406957 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.942e-6■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 CD46-205ENST00000358170 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.952e-6■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 CD46-208ENST00000367042 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.952e-6■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 LINC00261-202ENST00000564492 4912 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -12e-6■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 CD46-203ENST00000354848 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.022e-6■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 HECTD4-201ENST00000311694 2734 ntTSL 28.54□□□□□ -1.042e-6■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 CD46-201ENST00000322875 3278 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.042e-6■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 CD46-207ENST00000367041 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.042e-6■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 CD46-204ENST00000357714 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.052e-6■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 CD46-212ENST00000469535 7826 ntTSL 1 (best)8.05□□□□□ -1.122e-6■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 XPO1-202ENST00000404992 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.192e-6■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.322e-6■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.452e-6■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC5.92□□□□□ -1.462e-6■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 MLH3-209ENST00000555671 931 ntTSL 55.78□□□□□ -1.482e-6■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 MKLN1-211ENST00000497746 645 ntTSL 35.61□□□□□ -1.512e-6■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 CD46-211ENST00000464082 567 ntTSL 25.27□□□□□ -1.572e-6■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 CDC42BPA-212ENST00000478573 599 ntTSL 55.25□□□□□ -1.572e-6■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 FNDC3A-203ENST00000484074 6082 ntTSL 1 (best)4.53□□□□□ -1.682e-6■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 XPO1-223ENST00000494468 562 ntTSL 34.09□□□□□ -1.752e-6■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 XPO1-219ENST00000481073 3706 ntTSL 24□□□□□ -1.772e-6■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.882e-6■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 MKLN1-212ENST00000498778 3380 ntTSL 1 (best)3.08□□□□□ -1.922e-6■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 ZNF146-202ENST00000456324 3780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.739e-7■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.399e-7■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.266e-7■■□□□ 13.6
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