RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638187.1

REST-210, Transcript of RE1 silencing transcription factor, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene REST, Length 1,334 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REST-210ENST00000638187 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.53■■■■■ 7.12
REST-210ENST00000638187 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.02■■■■■ 6.08
REST-210ENST00000638187 ABCC9O60706 1549 aa51.75■■■■■ 5.88
REST-210ENST00000638187 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.91■■■■■ 5.58
REST-210ENST00000638187 NACADO15069 1562 aa49.84■■■■■ 5.57
REST-210ENST00000638187 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.75■■■■■ 5.55
REST-210ENST00000638187 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.59■■■■■ 5.53
REST-210ENST00000638187 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.55■■■■■ 5.52
REST-210ENST00000638187 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.32■■■■■ 5.49
REST-210ENST00000638187 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.68■■■■■ 5.38
REST-210ENST00000638187 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.32■■■■■ 5.33
REST-210ENST00000638187 SCRIBQ14160 1630 aa48.29■■■■■ 5.32
REST-210ENST00000638187 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.23■■■■■ 5.31
REST-210ENST00000638187 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.94■■■■■ 5.27
REST-210ENST00000638187 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.34■■■■■ 5.17
REST-210ENST00000638187 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.04■■■■■ 5.12
REST-210ENST00000638187 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.84■■■■■ 5.09
REST-210ENST00000638187 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.55■■■■■ 5.04
REST-210ENST00000638187 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.22■■■■■ 4.99
REST-210ENST00000638187 SMARCA4P51532 1647 aa46.21■■■■■ 4.99
REST-210ENST00000638187 SMARCA2P51531 1590 aa45.98■■■■■ 4.95
REST-210ENST00000638187 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.93■■■■■ 4.94
REST-210ENST00000638187 NCAPD3P42695 1498 aa45.92■■■■■ 4.94
REST-210ENST00000638187 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.82■■■■■ 4.93
REST-210ENST00000638187 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.76■■■■■ 4.92
REST-210ENST00000638187 HMGXB3Q12766 1538 aa45.75■■■■■ 4.91
REST-210ENST00000638187 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.62■■■■■ 4.89
REST-210ENST00000638187 WIZO95785 1651 aa45.35■■■■■ 4.85
REST-210ENST00000638187 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.31■■■■■ 4.84
REST-210ENST00000638187 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.93■■■■■ 4.78
REST-210ENST00000638187 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.78■■■■■ 4.76
REST-210ENST00000638187 NESP48681 1621 aa44.73■■■■■ 4.75
REST-210ENST00000638187 ERCC6Q03468 1493 aa44.73■■■■■ 4.75
REST-210ENST00000638187 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.6■■■■■ 4.73
REST-210ENST00000638187 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.5■■■■■ 4.71
REST-210ENST00000638187 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.34■■■■■ 4.69
REST-210ENST00000638187 CFTRP13569 1480 aa44.33■■■■■ 4.69
REST-210ENST00000638187 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.29■■■■■ 4.68
REST-210ENST00000638187 CUX2O14529 1486 aa44.24■■■■■ 4.67
REST-210ENST00000638187 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.2■■■■■ 4.67
REST-210ENST00000638187 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.13■■■■■ 4.65
REST-210ENST00000638187 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.09■■■■■ 4.65
REST-210ENST00000638187 PRDM2Q13029 1718 aa44.08■■■■■ 4.65
REST-210ENST00000638187 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.08■■■■■ 4.65
REST-210ENST00000638187 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.99■■■■■ 4.63
REST-210ENST00000638187 WDR62O43379 1518 aa43.83■■■■■ 4.61
REST-210ENST00000638187 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.59■■■■■ 4.57
REST-210ENST00000638187 ABCC8Q09428 1581 aa43.49■■■■■ 4.55
REST-210ENST00000638187 TOPBP1Q92547 1522 aa43.37■■■■■ 4.53
REST-210ENST00000638187 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.37■■■■■ 4.53
REST-210ENST00000638187 IFT140Q96RY7 1462 aa43.15■■■■■ 4.5
REST-210ENST00000638187 CUX1P39880 1505 aa43■■■■■ 4.47
REST-210ENST00000638187 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43■■■■■ 4.47
REST-210ENST00000638187 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.9■■■■■ 4.46
REST-210ENST00000638187 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.88■■■■■ 4.45
REST-210ENST00000638187 SOGA1O94964 1423 aa42.84■■■■■ 4.45
REST-210ENST00000638187 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.83■■■■■ 4.45
REST-210ENST00000638187 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.81■■■■■ 4.44
REST-210ENST00000638187 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.79■■■■■ 4.44
REST-210ENST00000638187 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.75■■■■■ 4.43
REST-210ENST00000638187 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.75■■■■■ 4.43
REST-210ENST00000638187 TOP2BQ02880 1626 aa42.7■■■■■ 4.43
REST-210ENST00000638187 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.7■■■■■ 4.43
REST-210ENST00000638187 WDR97A6NE52 1622 aa42.69■■■■■ 4.42
REST-210ENST00000638187 SYNJ1O43426 1573 aa42.63■■■■■ 4.41
REST-210ENST00000638187 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.61■■■■■ 4.41
REST-210ENST00000638187 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.55■■■■■ 4.4
REST-210ENST00000638187 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.51■■■■■ 4.4
REST-210ENST00000638187 OSCARQ8IYS5 282 aa42.4■■■■■ 4.38
REST-210ENST00000638187 GRIN2BQ13224 1484 aa42.38■■■■■ 4.37
REST-210ENST00000638187 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.36■■■■■ 4.37
REST-210ENST00000638187 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.32■■■■■ 4.36
REST-210ENST00000638187 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.29■■■■■ 4.36
REST-210ENST00000638187 PBRM1Q86U86 1689 aa42.29■■■■■ 4.36
REST-210ENST00000638187 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.27■■■■■ 4.36
REST-210ENST00000638187 CHD1O14646 1710 aa42.22■■■■■ 4.35
REST-210ENST00000638187 FBLN2P98095 1184 aa42.2■■■■■ 4.35
REST-210ENST00000638187 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.11■■■■■ 4.33
REST-210ENST00000638187 SYNJ2O15056 1496 aa42.1■■■■■ 4.33
REST-210ENST00000638187 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.04■■■■■ 4.32
REST-210ENST00000638187 KIF27Q86VH2 1401 aa41.95■■■■■ 4.31
REST-210ENST00000638187 ADAMTS12P58397 1594 aa41.93■■■■■ 4.3
REST-210ENST00000638187 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.9■■■■■ 4.3
REST-210ENST00000638187 TRIM41Q8WV44 630 aa41.81■■■■■ 4.28
REST-210ENST00000638187 GRIN2AQ12879 1464 aa41.81■■■■■ 4.28
REST-210ENST00000638187 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.73■■■■■ 4.27
REST-210ENST00000638187 CUL7Q14999 1698 aa41.7■■■■■ 4.27
REST-210ENST00000638187 IGF1RP08069 1367 aa41.67■■■■■ 4.26
REST-210ENST00000638187 ARHGEF11O15085 1522 aa41.67■■■■■ 4.26
REST-210ENST00000638187 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.66■■■■■ 4.26
REST-210ENST00000638187 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.66■■■■■ 4.26
REST-210ENST00000638187 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.66■■■■■ 4.26
REST-210ENST00000638187 NUP160Q12769 1436 aa41.6■■■■■ 4.25
REST-210ENST00000638187 CEP170Q5SW79 1584 aa41.55■■■■■ 4.24
REST-210ENST00000638187 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.48■■■■■ 4.23
REST-210ENST00000638187 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.38■■■■■ 4.21
REST-210ENST00000638187 SHROOM2Q13796 1616 aa41.29■■■■■ 4.2
REST-210ENST00000638187 ARAP1Q96P48 1450 aa41.29■■■■■ 4.2
REST-210ENST00000638187 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.26■■■■■ 4.2
REST-210ENST00000638187 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.26■■■■■ 4.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.5 ms