Protein–RNA interactions for Protein: Q06787

FMR1, Synaptic functional regulator FMR1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMR1Q06787 ACTN4-204ENST00000440400 3180 ntTSL 514.84□□□□□ -0.034e-7■■■■■ 26.9
FMR1Q06787 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.292e-6■■■■■ 26.9
FMR1Q06787 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.092e-6■■■■■ 26.9
FMR1Q06787 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.971e-6■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.832e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.442e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.252e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.22e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 22e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.992e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.972e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 PFKFB4-207ENST00000445633 1733 ntTSL 1 (best)27.27■■□□□ 1.962e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 PFKFB4-205ENST00000417753 1744 ntTSL 1 (best)27.27■■□□□ 1.962e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.872e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.842e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.82e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.82e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 ABCF2-203ENST00000441774 941 ntTSL 325.55■■□□□ 1.682e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 VPS72-202ENST00000368892 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)24.25■■□□□ 1.472e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 PTCH1-227ENST00000553256 537 ntTSL 424.2■■□□□ 1.462e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.452e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 VPS72-201ENST00000354473 1347 ntTSL 323.35■■□□□ 1.332e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.32e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 OXR1-203ENST00000435082 2023 ntTSL 223.14■■□□□ 1.292e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.272e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.262e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.262e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 SSU72-203ENST00000378725 619 ntTSL 222.71■■□□□ 1.232e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 PFKFB4-208ENST00000452531 1011 ntTSL 522.33■■□□□ 1.172e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.132e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 FERMT3-208ENST00000545896 911 ntTSL 522.07■■□□□ 1.125e-14■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 PFKFB4-213ENST00000490115 1757 ntTSL 1 (best)21.46■■□□□ 1.032e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.92e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.792e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.742e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 PTCH1-217ENST00000548420 553 ntTSL 519.62■□□□□ 0.732e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 PHF19-213ENST00000487555 1092 ntTSL 1 (best)19.24■□□□□ 0.672e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 DHX29-203ENST00000508346 479 ntTSL 319.07■□□□□ 0.642e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 ZNF767P-204ENST00000486492 1616 ntTSL 218.88■□□□□ 0.612e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.542e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.512e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.392e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 PTCH1-226ENST00000553011 1037 ntTSL 1 (best)17.33■□□□□ 0.362e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.342e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.332e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.332e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.322e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 ATAT1-210ENST00000479562 691 ntTSL 516.79■□□□□ 0.282e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 CIDECP-201ENST00000335507 942 ntTSL 316.75■□□□□ 0.272e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 PTCH1-218ENST00000548945 243 ntTSL 1 (best)16.7■□□□□ 0.262e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 PTCH1-221ENST00000550914 630 ntTSL 216.7■□□□□ 0.262e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 PHF19-208ENST00000462229 550 ntTSL 216.69■□□□□ 0.262e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.252e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.242e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 PTCH1-213ENST00000546820 864 ntTSL 1 (best)16.53■□□□□ 0.242e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 CTSC-202ENST00000393301 598 ntTSL 215.9■□□□□ 0.142e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 POLR1B-209ENST00000448770 2494 ntTSL 1 (best)15.76■□□□□ 0.112e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.12e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.12e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 ATAT1-209ENST00000471782 1527 ntTSL 1 (best)15.48■□□□□ 0.072e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 ATAT1-204ENST00000330083 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.032e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 PTCH1-215ENST00000547672 881 ntTSL 1 (best)14.97□□□□□ -0.012e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 POLR1B-213ENST00000484574 551 ntTSL 214.9□□□□□ -0.022e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.042e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.062e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 KDM4C-206ENST00000438023 4022 ntTSL 514.63□□□□□ -0.072e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 ABCF2-201ENST00000222388 2185 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.072e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 PHF19-202ENST00000373896 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.092e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 AC010326.4-201ENST00000604665 891 ntBASIC14.39□□□□□ -0.112e-20■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 AC010326.4-202ENST00000603829 541 ntBASIC14.39□□□□□ -0.112e-20■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 CTSC-206ENST00000529974 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.132e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.152e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 SRP68-212ENST00000602720 2037 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.162e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 PTCH1-207ENST00000429896 6563 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.192e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 POLR1B-201ENST00000263331 4558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.192e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 ATAT1-207ENST00000462304 400 ntTSL 313.75□□□□□ -0.212e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 CIDECP-204ENST00000432401 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.232e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 SRP68-203ENST00000542536 1714 ntTSL 213.4□□□□□ -0.262e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 ZBTB8OS-208ENST00000468695 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.272e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 PTCH1-225ENST00000551845 809 ntTSL 513.12□□□□□ -0.312e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 ABCF2-204ENST00000468073 1031 ntTSL 212.87□□□□□ -0.352e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 KDM4C-213ENST00000496464 697 ntTSL 512.82□□□□□ -0.362e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 VPS72-205ENST00000491094 4267 ntTSL 512.78□□□□□ -0.362e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 SSU72-202ENST00000359060 4176 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.392e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 PTCH1-203ENST00000375274 4720 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.412e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 TIMM17A-201ENST00000367287 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.412e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 POLR1B-216ENST00000537335 4961 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.422e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 SRP68-207ENST00000588643 2040 ntTSL 212.39□□□□□ -0.432e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 PTCH1-208ENST00000430669 8232 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.432e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 LGALS8-208ENST00000416919 6097 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.452e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 POLR1B-202ENST00000333990 4376 ntTSL 1 (best)11.94□□□□□ -0.52e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 PTCH1-209ENST00000437951 8049 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.532e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 PTCH1-205ENST00000418258 7815 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.562e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 LGALS8-219ENST00000526589 6420 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.572e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 POLR1B-210ENST00000458012 923 ntTSL 511.51□□□□□ -0.572e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 KDM4C-201ENST00000381306 4601 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.582e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 PTCH1-206ENST00000421141 7659 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.622e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 LGALS8-212ENST00000450372 6281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.652e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 CTSC-203ENST00000524463 6125 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.662e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 PHF19-214ENST00000616568 4159 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.682e-7■■■■■ 26.8
Retrieved 100 of 13,491 protein–RNA pairs in 70.9 ms