RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291386.3

SSU72-201, Transcript of SSU72 homolog, RNA polymerase II CTD phosphatase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SSU72, Length 1,290 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72-201ENST00000291386 NISCHQ9Y2I1 1504 aa64.95■■■■■ 7.99
SSU72-201ENST00000291386 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa57.66■■■■■ 6.82
SSU72-201ENST00000291386 ABCC9O60706 1549 aa55.97■■■■■ 6.55
SSU72-201ENST00000291386 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP54.18■■■■■ 6.26
SSU72-201ENST00000291386 NACADO15069 1562 aa54.12■■■■■ 6.26
SSU72-201ENST00000291386 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.08■■■■■ 6.25
SSU72-201ENST00000291386 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.98■■■■■ 6.23
SSU72-201ENST00000291386 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.96■■■■■ 6.23
SSU72-201ENST00000291386 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa53.84■■■■■ 6.21
SSU72-201ENST00000291386 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.88■■■■■ 6.06
SSU72-201ENST00000291386 SCRIBQ14160 1630 aa52.51■■■■■ 6
SSU72-201ENST00000291386 BICRAQ9NZM4 1560 aa52.44■■■■■ 5.99
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SSU72-201ENST00000291386 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.99■■■■■ 5.91
SSU72-201ENST00000291386 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51.11■■■■■ 5.77
SSU72-201ENST00000291386 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP51.02■■■■■ 5.76
SSU72-201ENST00000291386 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.71■■■■■ 5.71
SSU72-201ENST00000291386 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.52■■■■■ 5.68
SSU72-201ENST00000291386 SMARCA4P51532 1647 aa50.33■■■■■ 5.65
SSU72-201ENST00000291386 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50.33■■■■■ 5.65
SSU72-201ENST00000291386 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.03■■■■■ 5.6
SSU72-201ENST00000291386 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.97■■■■■ 5.59
SSU72-201ENST00000291386 SMARCA2P51531 1590 aa49.95■■■■■ 5.59
SSU72-201ENST00000291386 NCAPD3P42695 1498 aa49.94■■■■■ 5.58
SSU72-201ENST00000291386 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.91■■■■■ 5.58
SSU72-201ENST00000291386 HMGXB3Q12766 1538 aa49.72■■■■■ 5.55
SSU72-201ENST00000291386 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP49.59■■■■■ 5.53
SSU72-201ENST00000291386 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.55■■■■■ 5.52
SSU72-201ENST00000291386 WIZO95785 1651 aa49.5■■■■■ 5.51
SSU72-201ENST00000291386 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.04■■■■■ 5.44
SSU72-201ENST00000291386 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.56■■■■■ 5.36
SSU72-201ENST00000291386 NESP48681 1621 aa48.54■■■■■ 5.36
SSU72-201ENST00000291386 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.47■■■■■ 5.35
SSU72-201ENST00000291386 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.43■■■■■ 5.34
SSU72-201ENST00000291386 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP48.43■■■■■ 5.34
SSU72-201ENST00000291386 CFTRP13569 1480 aa48.26■■■■■ 5.32
SSU72-201ENST00000291386 ERCC6Q03468 1493 aa48.23■■■■■ 5.31
SSU72-201ENST00000291386 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.19■■■■■ 5.31
SSU72-201ENST00000291386 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.02■■■■■ 5.28
SSU72-201ENST00000291386 PRDM2Q13029 1718 aa47.95■■■■■ 5.27
SSU72-201ENST00000291386 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.88■■■■■ 5.26
SSU72-201ENST00000291386 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.81■■■■■ 5.24
SSU72-201ENST00000291386 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.78■■■■■ 5.24
SSU72-201ENST00000291386 CUX2O14529 1486 aa47.7■■■■■ 5.23
SSU72-201ENST00000291386 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.67■■■■■ 5.22
SSU72-201ENST00000291386 WDR62O43379 1518 aa47.54■■■■■ 5.2
SSU72-201ENST00000291386 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.39■■■■■ 5.18
SSU72-201ENST00000291386 ABCC8Q09428 1581 aa47.24■■■■■ 5.15
SSU72-201ENST00000291386 TOPBP1Q92547 1522 aa47.17■■■■■ 5.14
SSU72-201ENST00000291386 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.15■■■■■ 5.14
SSU72-201ENST00000291386 CUX1P39880 1505 aa46.91■■■■■ 5.1
SSU72-201ENST00000291386 IFT140Q96RY7 1462 aa46.82■■■■■ 5.09
SSU72-201ENST00000291386 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.78■■■■■ 5.08
SSU72-201ENST00000291386 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.73■■■■■ 5.079e-6■■■■■ 50.1
SSU72-201ENST00000291386 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.7■■■■■ 5.07
SSU72-201ENST00000291386 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.65■■■■■ 5.06
SSU72-201ENST00000291386 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.65■■■■■ 5.06
SSU72-201ENST00000291386 TOP2BQ02880 1626 aa46.64■■■■■ 5.06
SSU72-201ENST00000291386 SYNJ1O43426 1573 aa46.6■■■■■ 5.05
SSU72-201ENST00000291386 SOGA1O94964 1423 aa46.58■■■■■ 5.05
SSU72-201ENST00000291386 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.54■■■■■ 5.04
SSU72-201ENST00000291386 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.52■■■■■ 5.04
SSU72-201ENST00000291386 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.38■■■■■ 5.01
SSU72-201ENST00000291386 WDR97A6NE52 1622 aa46.37■■■■■ 5.01
SSU72-201ENST00000291386 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.32■■■■■ 5.01
SSU72-201ENST00000291386 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.29■■■■■ 54e-6■■□□□ 13.1
SSU72-201ENST00000291386 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.24■■■■■ 4.99
SSU72-201ENST00000291386 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.1■■■■■ 4.97
SSU72-201ENST00000291386 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.06■■■■■ 4.96
SSU72-201ENST00000291386 GRIN2BQ13224 1484 aa46.02■■■■■ 4.96
SSU72-201ENST00000291386 PBRM1Q86U86 1689 aa45.96■■■■■ 4.95
SSU72-201ENST00000291386 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.89■■■■■ 4.94
SSU72-201ENST00000291386 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.88■■■■■ 4.94
SSU72-201ENST00000291386 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.83■■■■■ 4.93
SSU72-201ENST00000291386 TRIM41Q8WV44 630 aa45.78■■■■■ 4.92
SSU72-201ENST00000291386 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.77■■■■■ 4.92
SSU72-201ENST00000291386 KIF27Q86VH2 1401 aa45.74■■■■■ 4.91
SSU72-201ENST00000291386 CHD1O14646 1710 aa45.74■■■■■ 4.91
SSU72-201ENST00000291386 OSCARQ8IYS5 282 aa45.73■■■■■ 4.91
SSU72-201ENST00000291386 SYNJ2O15056 1496 aa45.69■■■■■ 4.91
SSU72-201ENST00000291386 ADAMTS12P58397 1594 aa45.62■■■■■ 4.89
SSU72-201ENST00000291386 FBLN2P98095 1184 aa45.6■■■■■ 4.89
SSU72-201ENST00000291386 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.59■■■■■ 4.89
SSU72-201ENST00000291386 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.56■■■■■ 4.88
SSU72-201ENST00000291386 IGF1RP08069 1367 aa45.52■■■■■ 4.88
SSU72-201ENST00000291386 CHIC1Q5VXU3 224 aa45.46■■■■■ 4.87
SSU72-201ENST00000291386 GRIN2AQ12879 1464 aa45.43■■■■■ 4.86
SSU72-201ENST00000291386 CUL7Q14999 1698 aa45.41■■■■■ 4.86
SSU72-201ENST00000291386 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.38■■■■■ 4.86
SSU72-201ENST00000291386 CLASP1Q7Z460 1538 aa45.28■■■■■ 4.84
SSU72-201ENST00000291386 NUP160Q12769 1436 aa45.25■■■■■ 4.83
SSU72-201ENST00000291386 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa45.24■■■■■ 4.83
SSU72-201ENST00000291386 CEP170Q5SW79 1584 aa45.19■■■■■ 4.82
SSU72-201ENST00000291386 EEA1Q15075 1411 aa45.11■■■■■ 4.81
SSU72-201ENST00000291386 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa45.03■■■■■ 4.8
SSU72-201ENST00000291386 ARHGEF11O15085 1522 aa45■■■■■ 4.79
SSU72-201ENST00000291386 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa44.97■■■■■ 4.79
SSU72-201ENST00000291386 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.97■■■■■ 4.79
SSU72-201ENST00000291386 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.97■■■■■ 4.79
SSU72-201ENST00000291386 PRXQ9BXM0 1461 aa44.97■■■■■ 4.79
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