RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321337.11

SENP3-201, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SENP3, Length 2,611 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-201ENST00000321337 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.49■■■■■ 5.67
SENP3-201ENST00000321337 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.06■■■■■ 4.64
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SENP3-201ENST00000321337 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.81■■■■■ 4.44
SENP3-201ENST00000321337 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.62■■■■■ 4.41
SENP3-201ENST00000321337 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.47■■■■■ 4.39
SENP3-201ENST00000321337 HRCP23327 699 aa42.33■■■■■ 4.37
SENP3-201ENST00000321337 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.31■■■■■ 4.36
SENP3-201ENST00000321337 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.14■■■■■ 4.34
SENP3-201ENST00000321337 PCGF6Q9BYE7 350 aa41.99■■■■■ 4.31
SENP3-201ENST00000321337 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP41.68■■■■■ 4.26
SENP3-201ENST00000321337 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.47■■■■■ 4.23
SENP3-201ENST00000321337 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.27■■■■■ 4.2
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SENP3-201ENST00000321337 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.35■■■■■ 4.05
SENP3-201ENST00000321337 TRIM41Q8WV44 630 aa40.25■■■■■ 4.03
SENP3-201ENST00000321337 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.24■■■■■ 4.03
SENP3-201ENST00000321337 SCRIBQ14160 1630 aa40.21■■■■■ 4.03
SENP3-201ENST00000321337 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.1■■■■■ 4.01
SENP3-201ENST00000321337 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.09■■■■■ 4.01
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SENP3-201ENST00000321337 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.45■■■■□ 3.91
SENP3-201ENST00000321337 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP39.28■■■■□ 3.88
SENP3-201ENST00000321337 WIZO95785 1651 aa39.28■■■■□ 3.88
SENP3-201ENST00000321337 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP39.11■■■■□ 3.85
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SENP3-201ENST00000321337 NACADO15069 1562 aa39.03■■■■□ 3.84
SENP3-201ENST00000321337 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP38.93■■■■□ 3.82
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SENP3-201ENST00000321337 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.88■■■■□ 3.81
SENP3-201ENST00000321337 NEUROD1Q13562 356 aa38.86■■■■□ 3.81
SENP3-201ENST00000321337 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP38.83■■■■□ 3.81
SENP3-201ENST00000321337 ABCC8Q09428 1581 aa38.75■■■■□ 3.79
SENP3-201ENST00000321337 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.71■■■■□ 3.79
SENP3-201ENST00000321337 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP38.68■■■■□ 3.78
SENP3-201ENST00000321337 CEP162Q5TB80 1403 aa38.57■■■■□ 3.76
SENP3-201ENST00000321337 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.55■■■■□ 3.76
SENP3-201ENST00000321337 SOGA1O94964 1423 aa38.54■■■■□ 3.76
SENP3-201ENST00000321337 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa38.5■■■■□ 3.75
SENP3-201ENST00000321337 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.46■■■■□ 3.75
SENP3-201ENST00000321337 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.38■■■■□ 3.73
SENP3-201ENST00000321337 SMARCA2P51531 1590 aa38.37■■■■□ 3.73
SENP3-201ENST00000321337 TNIKQ9UKE5 1360 aa38.35■■■■□ 3.73
SENP3-201ENST00000321337 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP38.32■■■■□ 3.73
SENP3-201ENST00000321337 SMARCA4P51532 1647 aa38.29■■■■□ 3.72
SENP3-201ENST00000321337 UBTFP17480 764 aaKnown RBP38.28■■■■□ 3.72
SENP3-201ENST00000321337 CSRNP3Q8WYN3 585 aa38.26■■■■□ 3.72
SENP3-201ENST00000321337 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP38.15■■■■□ 3.7
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SENP3-201ENST00000321337 EEA1Q15075 1411 aa38.03■■■■□ 3.68
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SENP3-201ENST00000321337 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.91■■■■□ 3.66
SENP3-201ENST00000321337 MIER1Q8N108 512 aa37.88■■■■□ 3.65
SENP3-201ENST00000321337 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.74■■■■□ 3.63
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SENP3-201ENST00000321337 CLIP1P30622 1438 aa37.68■■■■□ 3.62
SENP3-201ENST00000321337 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.66■■■■□ 3.62
SENP3-201ENST00000321337 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP37.64■■■■□ 3.62
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SENP3-201ENST00000321337 VPS8Q8N3P4 1428 aa37.54■■■■□ 3.6
SENP3-201ENST00000321337 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.5■■■■□ 3.59
SENP3-201ENST00000321337 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.44■■■■□ 3.58
SENP3-201ENST00000321337 APLP2Q06481 763 aa37.42■■■■□ 3.58
SENP3-201ENST00000321337 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.36■■■■□ 3.57
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SENP3-201ENST00000321337 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.19■■■■□ 3.54
SENP3-201ENST00000321337 MYT1Q01538 1121 aa37.17■■■■□ 3.54
SENP3-201ENST00000321337 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP37.16■■■■□ 3.54
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SENP3-201ENST00000321337 TOP2BQ02880 1626 aa37■■■■□ 3.51
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SENP3-201ENST00000321337 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.8■■■■□ 3.48
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SENP3-201ENST00000321337 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa36.57■■■■□ 3.45
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SENP3-201ENST00000321337 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP36.27■■■■□ 3.4
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SENP3-201ENST00000321337 WDR97A6NE52 1622 aa36.22■■■■□ 3.39
SENP3-201ENST00000321337 TIAM1Q13009 1591 aa36.21■■■■□ 3.39
SENP3-201ENST00000321337 SETD5Q9C0A6 1442 aa36.21■■■■□ 3.39
SENP3-201ENST00000321337 PHLDB1Q86UU1 1377 aa36.2■■■■□ 3.39
SENP3-201ENST00000321337 CFTRP13569 1480 aa36.2■■■■□ 3.39
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