Protein–RNA interactions for Protein: Q12874

SF3A3, Splicing factor 3A subunit 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A3Q12874 SEPT2-230ENST00000467971 571 ntTSL 26.53□□□□□ -1.362e-8■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 SEPT2-220ENST00000443492 558 ntTSL 55.9□□□□□ -1.462e-8■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 SEPT2-222ENST00000449239 599 ntTSL 25.47□□□□□ -1.532e-8■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 SEPT2-236ENST00000476841 304 ntTSL 35.05□□□□□ -1.62e-8■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 SEPT2-225ENST00000457874 484 ntTSL 34.99□□□□□ -1.612e-8■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 TBCK-214ENST00000508666 897 ntTSL 54.88□□□□□ -1.639e-7■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 TBCK-209ENST00000505574 282 ntTSL 44.45□□□□□ -1.79e-7■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 SEPT2-232ENST00000469434 583 ntTSL 33.87□□□□□ -1.792e-8■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 KPNB1-201ENST00000290158 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.593e-7■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 KPNB1-202ENST00000535458 3163 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.843e-7■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 KPNB1-211ENST00000582097 2347 ntTSL 28.72□□□□□ -1.013e-7■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 KPNB1-203ENST00000540627 2989 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.173e-7■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 NAGPA-204ENST00000562037 615 ntTSL 217.32■□□□□ 0.364e-6■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 DDB2-209ENST00000614884 660 ntTSL 210.67□□□□□ -0.71e-6■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 RPS8-208ENST00000497035 694 ntTSL 313.95□□□□□ -0.186e-7■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 SNX17-205ENST00000464279 549 ntTSL 211.1□□□□□ -0.632e-6■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 MAP4K3-204ENST00000429397 689 ntTSL 321.38■■□□□ 1.011e-6■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.949e-11■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.797e-7■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.727e-7■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 RABGGTA-210ENST00000559586 889 ntTSL 518.07■□□□□ 0.487e-7■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 RABGGTA-208ENST00000558954 570 ntTSL 417.24■□□□□ 0.357e-7■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.137e-7■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 RABGGTA-214ENST00000560163 877 ntTSL 415.84■□□□□ 0.137e-7■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 DUS1L-214ENST00000582407 714 ntTSL 515.77■□□□□ 0.127e-7■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 PAICS-204ENST00000505164 1514 ntTSL 214.56□□□□□ -0.089e-11■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 RABGGTA-205ENST00000558534 753 ntTSL 314.16□□□□□ -0.147e-7■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.157e-7■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 TMEM259-206ENST00000589055 791 ntTSL 313.99□□□□□ -0.177e-7■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 PRPF39-202ENST00000424478 3174 ntTSL 213.15□□□□□ -0.39e-11■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 KPNB1-205ENST00000577918 859 ntTSL 312.62□□□□□ -0.397e-7■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 TMEM259-212ENST00000607316 477 ntTSL 212.38□□□□□ -0.437e-7■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 PRPF39-203ENST00000477626 3507 ntTSL 211.95□□□□□ -0.59e-11■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 RABGGTA-215ENST00000560207 678 ntTSL 311.01□□□□□ -0.657e-7■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 RABGGTA-213ENST00000560127 573 ntTSL 410.74□□□□□ -0.697e-7■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 NAPG-203ENST00000580483 1516 ntTSL 310.58□□□□□ -0.727e-7■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 ZRANB2-207ENST00000611683 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.747e-7■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 HMGCR-208ENST00000509431 421 ntTSL 210.2□□□□□ -0.787e-7■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 NAPG-205ENST00000582472 694 ntTSL 59.22□□□□□ -0.937e-7■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 PAICS-207ENST00000512576 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.949e-11■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 PAICS-202ENST00000399688 3297 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.959e-11■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 NAPG-207ENST00000583367 3860 ntTSL 28.22□□□□□ -1.097e-7■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 PAICS-208ENST00000514888 3340 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.189e-11■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.299e-11■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 NAPG-202ENST00000580224 1245 ntTSL 26.91□□□□□ -1.37e-7■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.347e-7■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 PRPF39-209ENST00000556353 687 ntTSL 25.56□□□□□ -1.529e-11■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 PRPF39-212ENST00000557477 724 ntTSL 55.28□□□□□ -1.569e-11■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 HMGCR-205ENST00000507942 527 ntTSL 44.89□□□□□ -1.637e-7■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 NAPG-206ENST00000582978 887 ntTSL 24.15□□□□□ -1.757e-7■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 PRPF39-207ENST00000554439 2982 ntTSL 52.82□□□□□ -1.969e-11■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 PRPF39-206ENST00000554429 2977 ntTSL 52.74□□□□□ -1.979e-11■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 PRPF39-205ENST00000554081 3223 ntTSL 52.49□□□□□ -2.019e-11■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 MTA1-220ENST00000552286 1943 ntTSL 220.09■□□□□ 0.811e-8■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 MTA1-211ENST00000481206 842 ntTSL 218.57■□□□□ 0.561e-8■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 MTA1-206ENST00000434050 2050 ntTSL 1 (best)18.03■□□□□ 0.481e-8■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 MTA1-215ENST00000494981 509 ntTSL 313.79□□□□□ -0.21e-8■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 MTA1-205ENST00000426567 568 ntTSL 312.44□□□□□ -0.421e-8■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.271e-323■□□□□ 9.7
SF3A3Q12874 KIAA0907-203ENST00000368321 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.451e-323■□□□□ 9.7
SF3A3Q12874 KIAA0907-202ENST00000368320 4499 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.551e-323■□□□□ 9.7
SF3A3Q12874 KIAA0907-208ENST00000482337 1135 ntTSL 1 (best)7.55□□□□□ -1.21e-323■□□□□ 9.7
SF3A3Q12874 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC3.18□□□□□ -1.91e-323■□□□□ 9.7
SF3A3Q12874 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC2.75□□□□□ -1.971e-323■□□□□ 9.7
SF3A3Q12874 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.732e-6■□□□□ 9.7
SF3A3Q12874 ANKRD10-209ENST00000489973 745 ntTSL 38.1□□□□□ -1.112e-6■□□□□ 9.7
SF3A3Q12874 PRKAB2-201ENST00000254101 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.274e-9■□□□□ 9.7
SF3A3Q12874 PIDD1-211ENST00000534649 754 ntTSL 216.45■□□□□ 0.221e-8■□□□□ 9.7
SF3A3Q12874 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.266e-8■□□□□ 9.7
SF3A3Q12874 TBC1D17-207ENST00000599049 1742 ntTSL 516.43■□□□□ 0.226e-8■□□□□ 9.7
SF3A3Q12874 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.096e-8■□□□□ 9.7
SF3A3Q12874 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.096e-8■□□□□ 9.7
SF3A3Q12874 TBC1D17-205ENST00000596243 2831 ntTSL 1 (best)13.9□□□□□ -0.186e-8■□□□□ 9.7
SF3A3Q12874 TBC1D17-204ENST00000594996 1161 ntTSL 1 (best)13.48□□□□□ -0.256e-8■□□□□ 9.7
SF3A3Q12874 TBC1D17-206ENST00000598789 556 ntTSL 411.75□□□□□ -0.536e-8■□□□□ 9.7
SF3A3Q12874 SRSF7-203ENST00000415527 1135 ntTSL 512.61□□□□□ -0.393e-7■□□□□ 9.7
SF3A3Q12874 SRSF7-201ENST00000313117 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.543e-7■□□□□ 9.7
SF3A3Q12874 SRSF7-209ENST00000446327 2453 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.643e-7■□□□□ 9.7
SF3A3Q12874 SRSF7-206ENST00000431066 1847 ntTSL 510.9□□□□□ -0.663e-7■□□□□ 9.7
SF3A3Q12874 SRSF7-208ENST00000443213 1903 ntTSL 510.15□□□□□ -0.783e-7■□□□□ 9.7
SF3A3Q12874 SRSF7-205ENST00000425941 1944 ntTSL 59.82□□□□□ -0.843e-7■□□□□ 9.7
SF3A3Q12874 SRSF7-204ENST00000425778 2857 ntTSL 29.7□□□□□ -0.863e-7■□□□□ 9.7
SF3A3Q12874 SRSF7-202ENST00000409276 1050 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.313e-7■□□□□ 9.7
SF3A3Q12874 SRSF7-210ENST00000452806 747 ntTSL 23.11□□□□□ -1.913e-7■□□□□ 9.7
SF3A3Q12874 DDX3X-210ENST00000615313 568 ntTSL 417.04■□□□□ 0.323e-6■□□□□ 9.7
SF3A3Q12874 DDX3X-206ENST00000542215 1592 ntTSL 215.44■□□□□ 0.063e-6■□□□□ 9.7
SF3A3Q12874 DDX3X-208ENST00000611546 442 ntTSL 515.43■□□□□ 0.063e-6■□□□□ 9.7
SF3A3Q12874 DDX3X-213ENST00000622198 409 ntTSL 415.43■□□□□ 0.063e-6■□□□□ 9.7
SF3A3Q12874 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.043e-6■□□□□ 9.7
SF3A3Q12874 DDX3X-203ENST00000457138 5346 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.513e-6■□□□□ 9.7
SF3A3Q12874 DDX3X-215ENST00000625837 3237 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.593e-6■□□□□ 9.7
SF3A3Q12874 DDX3X-218ENST00000629785 3457 ntTSL 510.96□□□□□ -0.653e-6■□□□□ 9.7
SF3A3Q12874 DDX3X-221ENST00000630858 3181 ntTSL 510.93□□□□□ -0.663e-6■□□□□ 9.7
SF3A3Q12874 DDX3X-216ENST00000626301 3013 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.673e-6■□□□□ 9.7
SF3A3Q12874 DDX3X-217ENST00000629496 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.673e-6■□□□□ 9.7
SF3A3Q12874 DDX3X-219ENST00000630255 3289 ntTSL 510.56□□□□□ -0.723e-6■□□□□ 9.7
SF3A3Q12874 DDX3X-220ENST00000630370 3120 ntTSL 510.41□□□□□ -0.743e-6■□□□□ 9.7
SF3A3Q12874 DDX3X-204ENST00000478993 3397 ntTSL 1 (best)9.99□□□□□ -0.813e-6■□□□□ 9.7
SF3A3Q12874 DDX3X-222ENST00000631641 583 ntTSL 37.82□□□□□ -1.163e-6■□□□□ 9.7
SF3A3Q12874 DDX3X-202ENST00000441189 1051 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.183e-6■□□□□ 9.7
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