RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429397.5

MAP4K3-204, Transcript of mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 3, humanhuman

TSL 3

Gene MAP4K3, Length 689 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP4K3-204ENST00000429397 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.13■■■■■ 7.06
MAP4K3-204ENST00000429397 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.82■■■■■ 6.05
MAP4K3-204ENST00000429397 ABCC9O60706 1549 aa51.94■■■■■ 5.91
MAP4K3-204ENST00000429397 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.86■■■■■ 5.57
MAP4K3-204ENST00000429397 NACADO15069 1562 aa49.69■■■■■ 5.54
MAP4K3-204ENST00000429397 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.56■■■■■ 5.52
MAP4K3-204ENST00000429397 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.24■■■■■ 5.47
MAP4K3-204ENST00000429397 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.19■■■■■ 5.47
MAP4K3-204ENST00000429397 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.91■■■■■ 5.42
MAP4K3-204ENST00000429397 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.76■■■■■ 5.4
MAP4K3-204ENST00000429397 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.42■■■■■ 5.34
MAP4K3-204ENST00000429397 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.3■■■■■ 5.32
MAP4K3-204ENST00000429397 SCRIBQ14160 1630 aa48.14■■■■■ 5.3
MAP4K3-204ENST00000429397 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.86■■■■■ 5.25
MAP4K3-204ENST00000429397 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.8■■■■■ 5.24
MAP4K3-204ENST00000429397 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.09■■■■■ 5.13
MAP4K3-204ENST00000429397 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.99■■■■■ 5.11
MAP4K3-204ENST00000429397 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.7■■■■■ 5.07
MAP4K3-204ENST00000429397 SMARCA4P51532 1647 aa46■■■■■ 4.95
MAP4K3-204ENST00000429397 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.9■■■■■ 4.94
MAP4K3-204ENST00000429397 NCAPD3P42695 1498 aa45.79■■■■■ 4.92
MAP4K3-204ENST00000429397 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.79■■■■■ 4.92
MAP4K3-204ENST00000429397 SMARCA2P51531 1590 aa45.78■■■■■ 4.92
MAP4K3-204ENST00000429397 HMGXB3Q12766 1538 aa45.6■■■■■ 4.89
MAP4K3-204ENST00000429397 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.56■■■■■ 4.88
MAP4K3-204ENST00000429397 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.52■■■■■ 4.88
MAP4K3-204ENST00000429397 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.44■■■■■ 4.87
MAP4K3-204ENST00000429397 WIZO95785 1651 aa45.1■■■■■ 4.81
MAP4K3-204ENST00000429397 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.88■■■■■ 4.78
MAP4K3-204ENST00000429397 ERCC6Q03468 1493 aa44.85■■■■■ 4.77
MAP4K3-204ENST00000429397 NESP48681 1621 aa44.82■■■■■ 4.77
MAP4K3-204ENST00000429397 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.73■■■■■ 4.75
MAP4K3-204ENST00000429397 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.6■■■■■ 4.73
MAP4K3-204ENST00000429397 CUX2O14529 1486 aa44.47■■■■■ 4.71
MAP4K3-204ENST00000429397 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.44■■■■■ 4.71
MAP4K3-204ENST00000429397 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.41■■■■■ 4.7
MAP4K3-204ENST00000429397 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.38■■■■■ 4.69
MAP4K3-204ENST00000429397 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.27■■■■■ 4.68
MAP4K3-204ENST00000429397 CFTRP13569 1480 aa44.12■■■■■ 4.65
MAP4K3-204ENST00000429397 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.02■■■■■ 4.64
MAP4K3-204ENST00000429397 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.99■■■■■ 4.63
MAP4K3-204ENST00000429397 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.98■■■■■ 4.63
MAP4K3-204ENST00000429397 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.98■■■■■ 4.63
MAP4K3-204ENST00000429397 PRDM2Q13029 1718 aa43.92■■■■■ 4.62
MAP4K3-204ENST00000429397 WDR62O43379 1518 aa43.84■■■■■ 4.61
MAP4K3-204ENST00000429397 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.54■■■■■ 4.56
MAP4K3-204ENST00000429397 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.53■■■■■ 4.56
MAP4K3-204ENST00000429397 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.42■■■■■ 4.54
MAP4K3-204ENST00000429397 ABCC8Q09428 1581 aa43.24■■■■■ 4.51
MAP4K3-204ENST00000429397 TOPBP1Q92547 1522 aa43.23■■■■■ 4.51
MAP4K3-204ENST00000429397 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.2■■■■■ 4.51
MAP4K3-204ENST00000429397 IFT140Q96RY7 1462 aa43.06■■■■■ 4.48
MAP4K3-204ENST00000429397 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.86■■■■■ 4.45
MAP4K3-204ENST00000429397 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.84■■■■■ 4.45
MAP4K3-204ENST00000429397 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.8■■■■■ 4.44
MAP4K3-204ENST00000429397 CUX1P39880 1505 aa42.77■■■■■ 4.44
MAP4K3-204ENST00000429397 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.75■■■■■ 4.43
MAP4K3-204ENST00000429397 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.7■■■■■ 4.43
MAP4K3-204ENST00000429397 SOGA1O94964 1423 aa42.65■■■■■ 4.42
MAP4K3-204ENST00000429397 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.64■■■■■ 4.42
MAP4K3-204ENST00000429397 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.57■■■■■ 4.411e-6■■□□□ 13.5
MAP4K3-204ENST00000429397 OSCARQ8IYS5 282 aa42.52■■■■■ 4.4
MAP4K3-204ENST00000429397 WDR97A6NE52 1622 aa42.49■■■■■ 4.39
MAP4K3-204ENST00000429397 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.43■■■■■ 4.38
MAP4K3-204ENST00000429397 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.38■■■■■ 4.38
MAP4K3-204ENST00000429397 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.37■■■■■ 4.37
MAP4K3-204ENST00000429397 TOP2BQ02880 1626 aa42.35■■■■■ 4.37
MAP4K3-204ENST00000429397 CHD1O14646 1710 aa42.32■■■■■ 4.36
MAP4K3-204ENST00000429397 SYNJ1O43426 1573 aa42.31■■■■■ 4.36
MAP4K3-204ENST00000429397 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.25■■■■■ 4.35
MAP4K3-204ENST00000429397 GRIN2BQ13224 1484 aa42.22■■■■■ 4.35
MAP4K3-204ENST00000429397 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.22■■■■■ 4.35
MAP4K3-204ENST00000429397 PBRM1Q86U86 1689 aa42.19■■■■■ 4.34
MAP4K3-204ENST00000429397 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.17■■■■■ 4.34
MAP4K3-204ENST00000429397 FBLN2P98095 1184 aa42.17■■■■■ 4.34
MAP4K3-204ENST00000429397 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.15■■■■■ 4.34
MAP4K3-204ENST00000429397 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.15■■■■■ 4.34
MAP4K3-204ENST00000429397 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.99■■■■■ 4.31
MAP4K3-204ENST00000429397 SYNJ2O15056 1496 aa41.98■■■■■ 4.31
MAP4K3-204ENST00000429397 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.94■■■■■ 4.3
MAP4K3-204ENST00000429397 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.94■■■■■ 4.3
MAP4K3-204ENST00000429397 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.94■■■■■ 4.3
MAP4K3-204ENST00000429397 TRIM41Q8WV44 630 aa41.93■■■■■ 4.3
MAP4K3-204ENST00000429397 ARHGEF11O15085 1522 aa41.87■■■■■ 4.29
MAP4K3-204ENST00000429397 ADAMTS12P58397 1594 aa41.79■■■■■ 4.28
MAP4K3-204ENST00000429397 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.78■■■■■ 4.28
MAP4K3-204ENST00000429397 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.77■■■■■ 4.28
MAP4K3-204ENST00000429397 GRIN2AQ12879 1464 aa41.67■■■■■ 4.26
MAP4K3-204ENST00000429397 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.67■■■■■ 4.26
MAP4K3-204ENST00000429397 KIF27Q86VH2 1401 aa41.53■■■■■ 4.24
MAP4K3-204ENST00000429397 ARAP1Q96P48 1450 aa41.49■■■■■ 4.23
MAP4K3-204ENST00000429397 CEP170Q5SW79 1584 aa41.49■■■■■ 4.23
MAP4K3-204ENST00000429397 NUP160Q12769 1436 aa41.47■■■■■ 4.23
MAP4K3-204ENST00000429397 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.46■■■■■ 4.23
MAP4K3-204ENST00000429397 CUL7Q14999 1698 aa41.38■■■■■ 4.21
MAP4K3-204ENST00000429397 IGF1RP08069 1367 aa41.33■■■■■ 4.21
MAP4K3-204ENST00000429397 SHROOM2Q13796 1616 aa41.24■■■■■ 4.19
MAP4K3-204ENST00000429397 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.18■■■■■ 4.18
MAP4K3-204ENST00000429397 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.15■■■■■ 4.18
MAP4K3-204ENST00000429397 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.12■■■■■ 4.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.6 ms