RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534649.1

PIDD1-211, Transcript of p53-induced death domain protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene PIDD1, Length 754 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIDD1-211ENST00000534649 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.33■■■■■ 5.17
PIDD1-211ENST00000534649 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.33■■■■■ 4.37
PIDD1-211ENST00000534649 ABCC9O60706 1549 aa42.12■■■■■ 4.33
PIDD1-211ENST00000534649 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.2■■■■■ 4.03
PIDD1-211ENST00000534649 NACADO15069 1562 aa39.98■■■■□ 3.99
PIDD1-211ENST00000534649 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.94■■■■□ 3.98
PIDD1-211ENST00000534649 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.5■■■■□ 3.91
PIDD1-211ENST00000534649 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.29■■■■□ 3.88
PIDD1-211ENST00000534649 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.28■■■■□ 3.88
PIDD1-211ENST00000534649 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.26■■■■□ 3.88
PIDD1-211ENST00000534649 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.26■■■■□ 3.88
PIDD1-211ENST00000534649 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.09■■■■□ 3.85
PIDD1-211ENST00000534649 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.99■■■■□ 3.83
PIDD1-211ENST00000534649 SCRIBQ14160 1630 aa38.63■■■■□ 3.77
PIDD1-211ENST00000534649 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.5■■■■□ 3.75
PIDD1-211ENST00000534649 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.05■■■■□ 3.68
PIDD1-211ENST00000534649 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.02■■■■□ 3.68
PIDD1-211ENST00000534649 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.91■■■■□ 3.66
PIDD1-211ENST00000534649 NCAPD3P42695 1498 aa36.91■■■■□ 3.5
PIDD1-211ENST00000534649 SMARCA4P51532 1647 aa36.86■■■■□ 3.49
PIDD1-211ENST00000534649 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.83■■■■□ 3.49
PIDD1-211ENST00000534649 SMARCA2P51531 1590 aa36.76■■■■□ 3.48
PIDD1-211ENST00000534649 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.73■■■■□ 3.47
PIDD1-211ENST00000534649 HMGXB3Q12766 1538 aa36.64■■■■□ 3.46
PIDD1-211ENST00000534649 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.51■■■■□ 3.44
PIDD1-211ENST00000534649 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.49■■■■□ 3.43
PIDD1-211ENST00000534649 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.47■■■■□ 3.43
PIDD1-211ENST00000534649 ERCC6Q03468 1493 aa36.37■■■■□ 3.41
PIDD1-211ENST00000534649 NESP48681 1621 aa36.25■■■■□ 3.39
PIDD1-211ENST00000534649 CUX2O14529 1486 aa36.18■■■■□ 3.38
PIDD1-211ENST00000534649 WIZO95785 1651 aa36.05■■■■□ 3.36
PIDD1-211ENST00000534649 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.03■■■■□ 3.36
PIDD1-211ENST00000534649 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.89■■■■□ 3.34
PIDD1-211ENST00000534649 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.85■■■■□ 3.33
PIDD1-211ENST00000534649 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.83■■■■□ 3.33
PIDD1-211ENST00000534649 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.82■■■■□ 3.32
PIDD1-211ENST00000534649 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.8■■■■□ 3.32
PIDD1-211ENST00000534649 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.78■■■■□ 3.32
PIDD1-211ENST00000534649 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.61■■■■□ 3.29
PIDD1-211ENST00000534649 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.5■■■■□ 3.27
PIDD1-211ENST00000534649 CFTRP13569 1480 aa35.45■■■■□ 3.27
PIDD1-211ENST00000534649 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.42■■■■□ 3.26
PIDD1-211ENST00000534649 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.41■■■■□ 3.26
PIDD1-211ENST00000534649 WDR62O43379 1518 aa35.38■■■■□ 3.25
PIDD1-211ENST00000534649 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.22■■■■□ 3.23
PIDD1-211ENST00000534649 PRDM2Q13029 1718 aa35.09■■■■□ 3.21
PIDD1-211ENST00000534649 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.09■■■■□ 3.21
PIDD1-211ENST00000534649 TOPBP1Q92547 1522 aa34.76■■■■□ 3.16
PIDD1-211ENST00000534649 ABCC8Q09428 1581 aa34.72■■■■□ 3.15
PIDD1-211ENST00000534649 IFT140Q96RY7 1462 aa34.71■■■■□ 3.15
PIDD1-211ENST00000534649 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.65■■■■□ 3.14
PIDD1-211ENST00000534649 OSCARQ8IYS5 282 aa34.64■■■■□ 3.14
PIDD1-211ENST00000534649 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.61■■■■□ 3.13
PIDD1-211ENST00000534649 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.51■■■■□ 3.12
PIDD1-211ENST00000534649 TRIM41Q8WV44 630 aa34.47■■■■□ 3.11
PIDD1-211ENST00000534649 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.42■■■■□ 3.1
PIDD1-211ENST00000534649 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.42■■■■□ 3.1
PIDD1-211ENST00000534649 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.41■■■■□ 3.1
PIDD1-211ENST00000534649 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.35■■■■□ 3.092e-8■■■■■ 31.9
PIDD1-211ENST00000534649 SOGA1O94964 1423 aa34.3■■■■□ 3.08
PIDD1-211ENST00000534649 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.3■■■■□ 3.08
PIDD1-211ENST00000534649 CUX1P39880 1505 aa34.25■■■■□ 3.07
PIDD1-211ENST00000534649 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.25■■■■□ 3.07
PIDD1-211ENST00000534649 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.2■■■■□ 3.07
PIDD1-211ENST00000534649 FBLN2P98095 1184 aa34.13■■■■□ 3.05
PIDD1-211ENST00000534649 CHD1O14646 1710 aa34.13■■■■□ 3.05
PIDD1-211ENST00000534649 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.09■■■■□ 3.05
PIDD1-211ENST00000534649 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.09■■■■□ 3.05
PIDD1-211ENST00000534649 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.09■■■■□ 3.05
PIDD1-211ENST00000534649 WDR97A6NE52 1622 aa34.08■■■■□ 3.05
PIDD1-211ENST00000534649 ARHGEF11O15085 1522 aa34.02■■■■□ 3.04
PIDD1-211ENST00000534649 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.01■■■■□ 3.03
PIDD1-211ENST00000534649 GRIN2BQ13224 1484 aa33.96■■■■□ 3.03
PIDD1-211ENST00000534649 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.93■■■■□ 3.02
PIDD1-211ENST00000534649 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.92■■■■□ 3.02
PIDD1-211ENST00000534649 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.88■■■■□ 3.01
PIDD1-211ENST00000534649 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.87■■■■□ 3.01
PIDD1-211ENST00000534649 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.82■■■■□ 3
PIDD1-211ENST00000534649 PBRM1Q86U86 1689 aa33.82■■■■□ 3
PIDD1-211ENST00000534649 CYB5RLQ6IPT4 315 aa33.81■■■■□ 3
PIDD1-211ENST00000534649 SYNJ2O15056 1496 aa33.81■■■■□ 3
PIDD1-211ENST00000534649 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.78■■■■□ 3
PIDD1-211ENST00000534649 TOP2BQ02880 1626 aa33.77■■■■□ 3
PIDD1-211ENST00000534649 SYNJ1O43426 1573 aa33.77■■■■□ 3
PIDD1-211ENST00000534649 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.76■■■■□ 3
PIDD1-211ENST00000534649 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.73■■■□□ 2.99
PIDD1-211ENST00000534649 ARAP1Q96P48 1450 aa33.69■■■□□ 2.98
PIDD1-211ENST00000534649 GRIN2AQ12879 1464 aa33.51■■■□□ 2.96
PIDD1-211ENST00000534649 ADAMTS12P58397 1594 aa33.51■■■□□ 2.95
PIDD1-211ENST00000534649 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.46■■■□□ 2.95
PIDD1-211ENST00000534649 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.45■■■□□ 2.95
PIDD1-211ENST00000534649 NUP160Q12769 1436 aa33.38■■■□□ 2.93
PIDD1-211ENST00000534649 TRHP20396 242 aaPredicted RBP33.37■■■□□ 2.93
PIDD1-211ENST00000534649 CEP170Q5SW79 1584 aa33.36■■■□□ 2.93
PIDD1-211ENST00000534649 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.23■■■□□ 2.91
PIDD1-211ENST00000534649 SHROOM2Q13796 1616 aa33.18■■■□□ 2.9
PIDD1-211ENST00000534649 KIF27Q86VH2 1401 aa33.16■■■□□ 2.9
PIDD1-211ENST00000534649 IGF1RP08069 1367 aa33.11■■■□□ 2.89
PIDD1-211ENST00000534649 JPH4Q96JJ6 628 aa33.09■■■□□ 2.89
PIDD1-211ENST00000534649 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP33.07■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 215.9 ms