RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560163.1

RABGGTA-214, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 877 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-214ENST00000560163 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.57■■■■■ 5.69
RABGGTA-214ENST00000560163 ABCC9O60706 1549 aa46.11■■■■■ 4.97
RABGGTA-214ENST00000560163 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.59■■■■■ 4.89
RABGGTA-214ENST00000560163 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.88■■■■■ 4.62
RABGGTA-214ENST00000560163 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.65■■■■■ 4.58
RABGGTA-214ENST00000560163 NACADO15069 1562 aa43.24■■■■■ 4.51
RABGGTA-214ENST00000560163 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.86■■■■■ 4.45
RABGGTA-214ENST00000560163 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.83■■■■■ 4.45
RABGGTA-214ENST00000560163 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.69■■■■■ 4.42
RABGGTA-214ENST00000560163 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.52■■■■■ 4.4
RABGGTA-214ENST00000560163 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.48■■■■■ 4.39
RABGGTA-214ENST00000560163 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.8■■■■■ 4.28
RABGGTA-214ENST00000560163 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.79■■■■■ 4.28
RABGGTA-214ENST00000560163 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.76■■■■■ 4.28
RABGGTA-214ENST00000560163 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.65■■■■■ 4.26
RABGGTA-214ENST00000560163 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.6■■■■■ 4.25
RABGGTA-214ENST00000560163 SCRIBQ14160 1630 aa41.45■■■■■ 4.23
RABGGTA-214ENST00000560163 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.43■■■■■ 4.22
RABGGTA-214ENST00000560163 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.66■■■■■ 4.1
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RABGGTA-214ENST00000560163 NCAPD3P42695 1498 aa39.99■■■■□ 3.99
RABGGTA-214ENST00000560163 ERCC6Q03468 1493 aa39.8■■■■□ 3.96
RABGGTA-214ENST00000560163 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.75■■■■□ 3.95
RABGGTA-214ENST00000560163 HMGXB3Q12766 1538 aa39.58■■■■□ 3.93
RABGGTA-214ENST00000560163 SMARCA2P51531 1590 aa39.57■■■■□ 3.92
RABGGTA-214ENST00000560163 SMARCA4P51532 1647 aa39.54■■■■□ 3.92
RABGGTA-214ENST00000560163 NESP48681 1621 aa39.49■■■■□ 3.91
RABGGTA-214ENST00000560163 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.28■■■■□ 3.88
RABGGTA-214ENST00000560163 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.25■■■■□ 3.87
RABGGTA-214ENST00000560163 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.21■■■■□ 3.87
RABGGTA-214ENST00000560163 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.19■■■■□ 3.86
RABGGTA-214ENST00000560163 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.11■■■■□ 3.85
RABGGTA-214ENST00000560163 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.96■■■■□ 3.83
RABGGTA-214ENST00000560163 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.93■■■■□ 3.82
RABGGTA-214ENST00000560163 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.89■■■■□ 3.82
RABGGTA-214ENST00000560163 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.71■■■■□ 3.79
RABGGTA-214ENST00000560163 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.58■■■■□ 3.77
RABGGTA-214ENST00000560163 WDR62O43379 1518 aa38.53■■■■□ 3.76
RABGGTA-214ENST00000560163 TRIM41Q8WV44 630 aa38.52■■■■□ 3.76
RABGGTA-214ENST00000560163 WIZO95785 1651 aa38.44■■■■□ 3.74
RABGGTA-214ENST00000560163 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.3■■■■□ 3.72
RABGGTA-214ENST00000560163 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.23■■■■□ 3.71
RABGGTA-214ENST00000560163 CFTRP13569 1480 aa38.16■■■■□ 3.7
RABGGTA-214ENST00000560163 OSCARQ8IYS5 282 aa38.08■■■■□ 3.69
RABGGTA-214ENST00000560163 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.99■■■■□ 3.67
RABGGTA-214ENST00000560163 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.96■■■■□ 3.67
RABGGTA-214ENST00000560163 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.91■■■■□ 3.66
RABGGTA-214ENST00000560163 PRDM2Q13029 1718 aa37.66■■■■□ 3.62
RABGGTA-214ENST00000560163 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.63■■■■□ 3.61
RABGGTA-214ENST00000560163 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.63■■■■□ 3.61
RABGGTA-214ENST00000560163 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.63■■■■□ 3.61
RABGGTA-214ENST00000560163 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.61■■■■□ 3.61
RABGGTA-214ENST00000560163 IFT140Q96RY7 1462 aa37.58■■■■□ 3.61
RABGGTA-214ENST00000560163 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.52■■■■□ 3.6
RABGGTA-214ENST00000560163 TOPBP1Q92547 1522 aa37.46■■■■□ 3.59
RABGGTA-214ENST00000560163 ARHGEF11O15085 1522 aa37.46■■■■□ 3.59
RABGGTA-214ENST00000560163 ABCC8Q09428 1581 aa37.34■■■■□ 3.57
RABGGTA-214ENST00000560163 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.33■■■■□ 3.57
RABGGTA-214ENST00000560163 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.25■■■■□ 3.55
RABGGTA-214ENST00000560163 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.21■■■■□ 3.55
RABGGTA-214ENST00000560163 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.21■■■■□ 3.55
RABGGTA-214ENST00000560163 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.2■■■■□ 3.544e-11■■■■■ 43.5
RABGGTA-214ENST00000560163 CHD1O14646 1710 aa37.14■■■■□ 3.54
RABGGTA-214ENST00000560163 ARAP1Q96P48 1450 aa37.06■■■■□ 3.52
RABGGTA-214ENST00000560163 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.05■■■■□ 3.52
RABGGTA-214ENST00000560163 FBLN2P98095 1184 aa36.98■■■■□ 3.51
RABGGTA-214ENST00000560163 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.93■■■■□ 3.5
RABGGTA-214ENST00000560163 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.91■■■■□ 3.5
RABGGTA-214ENST00000560163 SOGA1O94964 1423 aa36.87■■■■□ 3.49
RABGGTA-214ENST00000560163 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.87■■■■□ 3.49
RABGGTA-214ENST00000560163 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.76■■■■□ 3.48
RABGGTA-214ENST00000560163 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.75■■■■□ 3.47
RABGGTA-214ENST00000560163 WDR97A6NE52 1622 aa36.74■■■■□ 3.47
RABGGTA-214ENST00000560163 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.72■■■■□ 3.47
RABGGTA-214ENST00000560163 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.65■■■■□ 3.46
RABGGTA-214ENST00000560163 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.65■■■■□ 3.46
RABGGTA-214ENST00000560163 CUX1P39880 1505 aa36.63■■■■□ 3.45
RABGGTA-214ENST00000560163 SYNJ1O43426 1573 aa36.62■■■■□ 3.45
RABGGTA-214ENST00000560163 GRIN2BQ13224 1484 aa36.6■■■■□ 3.45
RABGGTA-214ENST00000560163 SYNJ2O15056 1496 aa36.55■■■■□ 3.44
RABGGTA-214ENST00000560163 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.4■■■■□ 3.42
RABGGTA-214ENST00000560163 PBRM1Q86U86 1689 aa36.38■■■■□ 3.41
RABGGTA-214ENST00000560163 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.3■■■■□ 3.4
RABGGTA-214ENST00000560163 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.29■■■■□ 3.4
RABGGTA-214ENST00000560163 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP36.22■■■■□ 3.39
RABGGTA-214ENST00000560163 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.15■■■■□ 3.38
RABGGTA-214ENST00000560163 GRIN2AQ12879 1464 aa36.13■■■■□ 3.37
RABGGTA-214ENST00000560163 NUP160Q12769 1436 aa36.07■■■■□ 3.36
RABGGTA-214ENST00000560163 CEP170Q5SW79 1584 aa36.03■■■■□ 3.36
RABGGTA-214ENST00000560163 ADAMTS12P58397 1594 aa36.02■■■■□ 3.36
RABGGTA-214ENST00000560163 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.01■■■■□ 3.36
RABGGTA-214ENST00000560163 SHROOM2Q13796 1616 aa35.97■■■■□ 3.35
RABGGTA-214ENST00000560163 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.91■■■■□ 3.34
RABGGTA-214ENST00000560163 TOP2BQ02880 1626 aa35.88■■■■□ 3.33
RABGGTA-214ENST00000560163 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.88■■■■□ 3.33
RABGGTA-214ENST00000560163 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.82■■■■□ 3.32
RABGGTA-214ENST00000560163 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.78■■■■□ 3.32
RABGGTA-214ENST00000560163 KIF13AQ9H1H9 1805 aa35.77■■■■□ 3.32
RABGGTA-214ENST00000560163 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.73■■■■□ 3.31
RABGGTA-214ENST00000560163 JPH4Q96JJ6 628 aa35.69■■■■□ 3.3
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