RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481206.1

MTA1-211, Transcript of metastasis associated 1, humanhuman

TSL 2

Gene MTA1, Length 842 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA1-211ENST00000481206 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.13■■■■■ 5.62
MTA1-211ENST00000481206 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.71■■■■■ 4.75
MTA1-211ENST00000481206 ABCC9O60706 1549 aa43.78■■■■■ 4.6
MTA1-211ENST00000481206 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.11■■■■■ 4.33
MTA1-211ENST00000481206 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.02■■■■■ 4.32
MTA1-211ENST00000481206 NACADO15069 1562 aa42.01■■■■■ 4.32
MTA1-211ENST00000481206 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.72■■■■■ 4.27
MTA1-211ENST00000481206 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.65■■■■■ 4.26
MTA1-211ENST00000481206 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.45■■■■■ 4.23
MTA1-211ENST00000481206 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.25■■■■■ 4.19
MTA1-211ENST00000481206 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.86■■■■■ 4.131e-9■■□□□ 14.1
MTA1-211ENST00000481206 SCRIBQ14160 1630 aa40.78■■■■■ 4.12
MTA1-211ENST00000481206 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.76■■■■■ 4.12
MTA1-211ENST00000481206 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.33■■■■■ 4.05
MTA1-211ENST00000481206 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.14■■■■■ 4.02
MTA1-211ENST00000481206 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.73■■■■□ 3.95
MTA1-211ENST00000481206 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.62■■■■□ 3.93
MTA1-211ENST00000481206 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.33■■■■□ 3.89
MTA1-211ENST00000481206 SMARCA4P51532 1647 aa38.97■■■■□ 3.83
MTA1-211ENST00000481206 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.91■■■■□ 3.82
MTA1-211ENST00000481206 SMARCA2P51531 1590 aa38.74■■■■□ 3.79
MTA1-211ENST00000481206 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.71■■■■□ 3.79
MTA1-211ENST00000481206 NCAPD3P42695 1498 aa38.68■■■■□ 3.78
MTA1-211ENST00000481206 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.62■■■■□ 3.77
MTA1-211ENST00000481206 HMGXB3Q12766 1538 aa38.54■■■■□ 3.76
MTA1-211ENST00000481206 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.53■■■■□ 3.76
MTA1-211ENST00000481206 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.46■■■■□ 3.75
MTA1-211ENST00000481206 WIZO95785 1651 aa38.29■■■■□ 3.72
MTA1-211ENST00000481206 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.12■■■■□ 3.69
MTA1-211ENST00000481206 NESP48681 1621 aa37.83■■■■□ 3.65
MTA1-211ENST00000481206 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.83■■■■□ 3.65
MTA1-211ENST00000481206 ERCC6Q03468 1493 aa37.8■■■■□ 3.64
MTA1-211ENST00000481206 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.77■■■■□ 3.64
MTA1-211ENST00000481206 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.57■■■■□ 3.61
MTA1-211ENST00000481206 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.5■■■■□ 3.59
MTA1-211ENST00000481206 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.5■■■■□ 3.59
MTA1-211ENST00000481206 CUX2O14529 1486 aa37.36■■■■□ 3.57
MTA1-211ENST00000481206 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.35■■■■□ 3.57
MTA1-211ENST00000481206 CFTRP13569 1480 aa37.33■■■■□ 3.57
MTA1-211ENST00000481206 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.3■■■■□ 3.56
MTA1-211ENST00000481206 PRDM2Q13029 1718 aa37.26■■■■□ 3.56
MTA1-211ENST00000481206 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.19■■■■□ 3.54
MTA1-211ENST00000481206 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.19■■■■□ 3.54
MTA1-211ENST00000481206 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.17■■■■□ 3.54
MTA1-211ENST00000481206 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.11■■■■□ 3.53
MTA1-211ENST00000481206 WDR62O43379 1518 aa36.98■■■■□ 3.51
MTA1-211ENST00000481206 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.79■■■■□ 3.48
MTA1-211ENST00000481206 ABCC8Q09428 1581 aa36.6■■■■□ 3.45
MTA1-211ENST00000481206 TOPBP1Q92547 1522 aa36.57■■■■□ 3.44
MTA1-211ENST00000481206 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.56■■■■□ 3.44
MTA1-211ENST00000481206 IFT140Q96RY7 1462 aa36.37■■■■□ 3.41
MTA1-211ENST00000481206 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.28■■■■□ 3.4
MTA1-211ENST00000481206 CUX1P39880 1505 aa36.25■■■■□ 3.39
MTA1-211ENST00000481206 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.24■■■■□ 3.39
MTA1-211ENST00000481206 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.19■■■■□ 3.38
MTA1-211ENST00000481206 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.18■■■■□ 3.38
MTA1-211ENST00000481206 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.17■■■■□ 3.38
MTA1-211ENST00000481206 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.12■■■■□ 3.37
MTA1-211ENST00000481206 SOGA1O94964 1423 aa36.11■■■■□ 3.37
MTA1-211ENST00000481206 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.09■■■■□ 3.37
MTA1-211ENST00000481206 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36■■■■□ 3.35
MTA1-211ENST00000481206 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.98■■■■□ 3.35
MTA1-211ENST00000481206 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.98■■■■□ 3.352e-10■■■□□ 16
MTA1-211ENST00000481206 TOP2BQ02880 1626 aa35.96■■■■□ 3.35
MTA1-211ENST00000481206 WDR97A6NE52 1622 aa35.94■■■■□ 3.34
MTA1-211ENST00000481206 SYNJ1O43426 1573 aa35.93■■■■□ 3.34
MTA1-211ENST00000481206 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.9■■■■□ 3.34
MTA1-211ENST00000481206 OSCARQ8IYS5 282 aa35.81■■■■□ 3.32
MTA1-211ENST00000481206 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.78■■■■□ 3.32
MTA1-211ENST00000481206 CHD1O14646 1710 aa35.76■■■■□ 3.31
MTA1-211ENST00000481206 PBRM1Q86U86 1689 aa35.75■■■■□ 3.31
MTA1-211ENST00000481206 GRIN2BQ13224 1484 aa35.71■■■■□ 3.31
MTA1-211ENST00000481206 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.7■■■■□ 3.31
MTA1-211ENST00000481206 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.69■■■■□ 3.3
MTA1-211ENST00000481206 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.67■■■■□ 3.3
MTA1-211ENST00000481206 FBLN2P98095 1184 aa35.66■■■■□ 3.3
MTA1-211ENST00000481206 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.62■■■■□ 3.29
MTA1-211ENST00000481206 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.51■■■■□ 3.28
MTA1-211ENST00000481206 SYNJ2O15056 1496 aa35.48■■■■□ 3.27
MTA1-211ENST00000481206 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.39■■■■□ 3.26
MTA1-211ENST00000481206 ADAMTS12P58397 1594 aa35.36■■■■□ 3.25
MTA1-211ENST00000481206 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.29■■■■□ 3.24
MTA1-211ENST00000481206 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.29■■■■□ 3.24
MTA1-211ENST00000481206 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.29■■■■□ 3.24
MTA1-211ENST00000481206 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.27■■■■□ 3.24
MTA1-211ENST00000481206 KIF27Q86VH2 1401 aa35.27■■■■□ 3.24
MTA1-211ENST00000481206 GRIN2AQ12879 1464 aa35.24■■■■□ 3.23
MTA1-211ENST00000481206 ARHGEF11O15085 1522 aa35.23■■■■□ 3.23
MTA1-211ENST00000481206 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.23■■■■□ 3.23
MTA1-211ENST00000481206 TRIM41Q8WV44 630 aa35.16■■■■□ 3.22
MTA1-211ENST00000481206 CUL7Q14999 1698 aa35.12■■■■□ 3.21
MTA1-211ENST00000481206 CEP170Q5SW79 1584 aa35.08■■■■□ 3.21
MTA1-211ENST00000481206 IGF1RP08069 1367 aa35.07■■■■□ 3.2
MTA1-211ENST00000481206 NUP160Q12769 1436 aa35.04■■■■□ 3.2
MTA1-211ENST00000481206 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.92■■■■□ 3.18
MTA1-211ENST00000481206 ARAP1Q96P48 1450 aa34.91■■■■□ 3.18
MTA1-211ENST00000481206 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.91■■■■□ 3.18
MTA1-211ENST00000481206 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.88■■■■□ 3.17
MTA1-211ENST00000481206 SHROOM2Q13796 1616 aa34.85■■■■□ 3.17
MTA1-211ENST00000481206 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.74■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.2 ms