Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.741e-23■■■■■ 34
TARDBPQ13148 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.291e-23■■■■■ 34
TARDBPQ13148 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.171e-23■■■■■ 34
TARDBPQ13148 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.341e-23■■■■■ 34
TARDBPQ13148 CMIP-203ENST00000539778 3937 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.578e-7■■■■■ 34
TARDBPQ13148 STXBP5-204ENST00000367481 9177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.991e-7■■■■■ 33.9
TARDBPQ13148 STXBP5-203ENST00000367480 3297 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.161e-7■■■■■ 33.9
TARDBPQ13148 STXBP5-201ENST00000321680 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.171e-7■■■■■ 33.9
TARDBPQ13148 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.061e-10■■■■■ 33.9
TARDBPQ13148 R3HDM2-208ENST00000448732 195 ntTSL 1 (best)23.7■■□□□ 1.386e-9■■■■■ 33.9
TARDBPQ13148 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.026e-9■■■■■ 33.9
TARDBPQ13148 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.266e-9■■■■■ 33.9
TARDBPQ13148 R3HDM2-215ENST00000634871 4092 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.436e-9■■■■■ 33.9
TARDBPQ13148 ARID4B-209ENST00000471257 4195 ntTSL 56.21□□□□□ -1.422e-10■■■■■ 33.9
TARDBPQ13148 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.144e-9■■■■■ 33.9
TARDBPQ13148 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.114e-9■■■■■ 33.9
TARDBPQ13148 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.294e-9■■■■■ 33.9
TARDBPQ13148 AC023509.3-202ENST00000591834 1609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.364e-9■■■■■ 33.9
TARDBPQ13148 ATF7-210ENST00000588232 531 ntTSL 411.16□□□□□ -0.624e-9■■■■■ 33.9
TARDBPQ13148 ATF7-202ENST00000456903 5218 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.874e-9■■■■■ 33.9
TARDBPQ13148 ATF7-201ENST00000420353 6680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.944e-9■■■■■ 33.9
TARDBPQ13148 ATF7-209ENST00000588078 531 ntTSL 57.09□□□□□ -1.274e-9■■■■■ 33.9
TARDBPQ13148 ATF7-208ENST00000551480 473 ntTSL 56.53□□□□□ -1.364e-9■■■■■ 33.9
TARDBPQ13148 ANKRD11-211ENST00000566973 442 ntTSL 221.15■□□□□ 0.984e-7■■■■■ 33.8
TARDBPQ13148 ANKRD11-215ENST00000568512 294 ntTSL 28.31□□□□□ -1.084e-7■■■■■ 33.8
TARDBPQ13148 TBL1X-207ENST00000441088 520 ntTSL 36.37□□□□□ -1.397e-7■■■■■ 33.8
TARDBPQ13148 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.444e-8■■■■■ 33.8
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TARDBPQ13148 TMEM116-203ENST00000546537 599 ntTSL 511.5□□□□□ -0.574e-9■■■■■ 33.8
TARDBPQ13148 TMEM116-215ENST00000552374 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.664e-9■■■■■ 33.8
TARDBPQ13148 TMEM116-217ENST00000552801 1397 ntTSL 58.94□□□□□ -0.984e-9■■■■■ 33.8
TARDBPQ13148 TMEM116-205ENST00000547878 1716 ntTSL 28.54□□□□□ -1.044e-9■■■■■ 33.8
TARDBPQ13148 TMEM116-213ENST00000550831 1446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.044e-9■■■■■ 33.8
TARDBPQ13148 TMEM116-209ENST00000550020 572 ntTSL 48.43□□□□□ -1.064e-9■■■■■ 33.8
TARDBPQ13148 TMEM116-201ENST00000355445 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.114e-9■■■■■ 33.8
TARDBPQ13148 TMEM116-214ENST00000551297 660 ntTSL 37.29□□□□□ -1.244e-9■■■■■ 33.8
TARDBPQ13148 TMEM116-208ENST00000549537 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.344e-9■■■■■ 33.8
TARDBPQ13148 TMEM116-206ENST00000548283 3640 ntTSL 56.62□□□□□ -1.354e-9■■■■■ 33.8
TARDBPQ13148 C1orf159-213ENST00000472741 661 ntTSL 418.64■□□□□ 0.571e-8■■■■■ 33.7
TARDBPQ13148 C1orf159-207ENST00000434641 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 517.79■□□□□ 0.441e-8■■■■■ 33.7
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TARDBPQ13148 C1orf159-218ENST00000482816 982 ntTSL 517.14■□□□□ 0.331e-8■■■■■ 33.7
TARDBPQ13148 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.281e-8■■■■■ 33.7
TARDBPQ13148 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.281e-8■■■■■ 33.7
TARDBPQ13148 C1orf159-215ENST00000475119 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 315.45■□□□□ 0.061e-8■■■■■ 33.7
TARDBPQ13148 C1orf159-203ENST00000379325 2010 ntTSL 215.41■□□□□ 0.061e-8■■■■■ 33.7
TARDBPQ13148 C1orf159-217ENST00000480643 579 ntTSL 415.28■□□□□ 0.041e-8■■■■■ 33.7
TARDBPQ13148 C1orf159-209ENST00000462097 836 ntAPPRIS ALT2 TSL 314.96□□□□□ -0.011e-8■■■■■ 33.7
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TARDBPQ13148 GLG1-209ENST00000565260 461 ntTSL 527.3■■□□□ 1.961e-8■■■■■ 33.6
TARDBPQ13148 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.591e-8■■■■■ 33.6
TARDBPQ13148 PDXK-218ENST00000498040 888 ntTSL 518.32■□□□□ 0.522e-7■■■■■ 33.6
TARDBPQ13148 PDXK-204ENST00000398078 1069 ntTSL 216.55■□□□□ 0.242e-7■■■■■ 33.6
TARDBPQ13148 PDXK-217ENST00000490666 577 ntTSL 515.05■□□□□ -02e-7■■■■■ 33.6
TARDBPQ13148 PDXK-203ENST00000343528 1101 ntTSL 1 (best)14.33□□□□□ -0.122e-7■■■■■ 33.6
TARDBPQ13148 PDXK-209ENST00000467908 7194 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.682e-7■■■■■ 33.6
TARDBPQ13148 PDXK-216ENST00000481512 583 ntTSL 59.5□□□□□ -0.892e-7■■■■■ 33.6
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TARDBPQ13148 SEC31A-208ENST00000448323 4255 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.452e-8■■■■■ 33.5
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TARDBPQ13148 SEC31A-227ENST00000508502 3801 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.932e-8■■■■■ 33.5
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TARDBPQ13148 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.62e-8■■■■■ 33.5
TARDBPQ13148 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.622e-8■■■■■ 33.5
TARDBPQ13148 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.742e-8■■■■■ 33.5
TARDBPQ13148 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.762e-8■■■■■ 33.5
TARDBPQ13148 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.82e-8■■■■■ 33.5
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TARDBPQ13148 PHF21A-215ENST00000531959 507 ntTSL 54.3□□□□□ -1.723e-7■■■■■ 33.5
TARDBPQ13148 DIRAS1-201ENST00000323469 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.64e-11■■■■■ 33.5
TARDBPQ13148 MYO18A-203ENST00000528322 549 ntTSL 416.44■□□□□ 0.221e-9■■■■■ 33.4
TARDBPQ13148 MYO18A-204ENST00000528564 589 ntTSL 414.97□□□□□ -0.011e-9■■■■■ 33.4
TARDBPQ13148 MYO18A-216ENST00000533420 1168 ntTSL 514□□□□□ -0.171e-9■■■■■ 33.4
TARDBPQ13148 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.251e-9■■■■■ 33.4
TARDBPQ13148 MYO18A-221ENST00000590242 637 ntTSL 212.11□□□□□ -0.471e-9■■■■■ 33.4
TARDBPQ13148 ATP13A3-206ENST00000461660 3517 ntTSL 1 (best)3.84□□□□□ -1.791e-9■■■■■ 33.4
TARDBPQ13148 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.71e-10■■■■■ 33.4
TARDBPQ13148 SPEG-211ENST00000435853 605 ntTSL 420.46■□□□□ 0.871e-10■■■■■ 33.4
TARDBPQ13148 SPEG-213ENST00000452101 583 ntTSL 419.59■□□□□ 0.731e-10■■■■■ 33.4
TARDBPQ13148 SPEG-210ENST00000431523 926 ntTSL 219.54■□□□□ 0.721e-10■■■■■ 33.4
TARDBPQ13148 SPEG-216ENST00000464989 5132 ntTSL 217.64■□□□□ 0.411e-10■■■■■ 33.4
TARDBPQ13148 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.261e-10■■■■■ 33.4
TARDBPQ13148 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.071e-10■■■■■ 33.4
TARDBPQ13148 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.061e-10■■■■■ 33.4
TARDBPQ13148 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -01e-10■■■■■ 33.4
TARDBPQ13148 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.031e-10■■■■■ 33.4
TARDBPQ13148 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.041e-10■■■■■ 33.4
TARDBPQ13148 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.071e-10■■■■■ 33.4
TARDBPQ13148 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.071e-10■■■■■ 33.4
TARDBPQ13148 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.081e-10■■■■■ 33.4
TARDBPQ13148 SPEG-224ENST00000498378 3874 ntTSL 213.87□□□□□ -0.191e-10■■■■■ 33.4
TARDBPQ13148 SPEG-209ENST00000420132 579 ntTSL 413.38□□□□□ -0.271e-10■■■■■ 33.4
TARDBPQ13148 BRF1-210ENST00000547374 3809 ntTSL 512.47□□□□□ -0.411e-10■■■■■ 33.4
TARDBPQ13148 BRF1-222ENST00000635152 2876 ntTSL 212.4□□□□□ -0.421e-10■■■■■ 33.4
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