RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435853.5

SPEG-211, Transcript of SPEG complex locus, humanhuman

TSL 4

Gene SPEG, Length 605 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEG-211ENST00000435853 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.28■■■■■ 5.64
SPEG-211ENST00000435853 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.88■■■■■ 4.78
SPEG-211ENST00000435853 ABCC9O60706 1549 aa44.29■■■■■ 4.68
SPEG-211ENST00000435853 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.5■■■■■ 4.39
SPEG-211ENST00000435853 NACADO15069 1562 aa42.36■■■■■ 4.37
SPEG-211ENST00000435853 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.08■■■■■ 4.33
SPEG-211ENST00000435853 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.05■■■■■ 4.32
SPEG-211ENST00000435853 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.93■■■■■ 4.3
SPEG-211ENST00000435853 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.67■■■■■ 4.26
SPEG-211ENST00000435853 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.38■■■■■ 4.21
SPEG-211ENST00000435853 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.3■■■■■ 4.2
SPEG-211ENST00000435853 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.16■■■■■ 4.18
SPEG-211ENST00000435853 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.14■■■■■ 4.18
SPEG-211ENST00000435853 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.9■■■■■ 4.14
SPEG-211ENST00000435853 SCRIBQ14160 1630 aa40.75■■■■■ 4.11
SPEG-211ENST00000435853 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.14■■■■■ 4.02
SPEG-211ENST00000435853 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.08■■■■■ 4.01
SPEG-211ENST00000435853 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.93■■■■□ 3.98
SPEG-211ENST00000435853 NCAPD3P42695 1498 aa39.11■■■■□ 3.85
SPEG-211ENST00000435853 SMARCA4P51532 1647 aa39.03■■■■□ 3.84
SPEG-211ENST00000435853 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.02■■■■□ 3.84
SPEG-211ENST00000435853 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.99■■■■□ 3.83
SPEG-211ENST00000435853 SMARCA2P51531 1590 aa38.95■■■■□ 3.83
SPEG-211ENST00000435853 HMGXB3Q12766 1538 aa38.84■■■■□ 3.81
SPEG-211ENST00000435853 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.74■■■■□ 3.79
SPEG-211ENST00000435853 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.71■■■■□ 3.79
SPEG-211ENST00000435853 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.62■■■■□ 3.77
SPEG-211ENST00000435853 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.3■■■■□ 3.72
SPEG-211ENST00000435853 WIZO95785 1651 aa38.29■■■■□ 3.72
SPEG-211ENST00000435853 ERCC6Q03468 1493 aa38.28■■■■□ 3.72
SPEG-211ENST00000435853 NESP48681 1621 aa38.16■■■■□ 3.7
SPEG-211ENST00000435853 CUX2O14529 1486 aa38.15■■■■□ 3.7
SPEG-211ENST00000435853 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.13■■■■□ 3.69
SPEG-211ENST00000435853 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.97■■■■□ 3.67
SPEG-211ENST00000435853 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.94■■■■□ 3.66
SPEG-211ENST00000435853 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.93■■■■□ 3.66
SPEG-211ENST00000435853 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.73■■■■□ 3.63
SPEG-211ENST00000435853 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.67■■■■□ 3.62
SPEG-211ENST00000435853 CFTRP13569 1480 aa37.59■■■■□ 3.61
SPEG-211ENST00000435853 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.58■■■■□ 3.61
SPEG-211ENST00000435853 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.5■■■■□ 3.59
SPEG-211ENST00000435853 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.45■■■■□ 3.59
SPEG-211ENST00000435853 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.45■■■■□ 3.59
SPEG-211ENST00000435853 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.43■■■■□ 3.58
SPEG-211ENST00000435853 WDR62O43379 1518 aa37.39■■■■□ 3.58
SPEG-211ENST00000435853 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.35■■■■□ 3.57
SPEG-211ENST00000435853 PRDM2Q13029 1718 aa37.16■■■■□ 3.54
SPEG-211ENST00000435853 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.05■■■■□ 3.52
SPEG-211ENST00000435853 ABCC8Q09428 1581 aa36.87■■■■□ 3.49
SPEG-211ENST00000435853 TOPBP1Q92547 1522 aa36.77■■■■□ 3.48
SPEG-211ENST00000435853 IFT140Q96RY7 1462 aa36.72■■■■□ 3.47
SPEG-211ENST00000435853 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.69■■■■□ 3.46
SPEG-211ENST00000435853 OSCARQ8IYS5 282 aa36.5■■■■□ 3.43
SPEG-211ENST00000435853 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.49■■■■□ 3.43
SPEG-211ENST00000435853 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.42■■■■□ 3.42
SPEG-211ENST00000435853 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.38■■■■□ 3.41
SPEG-211ENST00000435853 CUX1P39880 1505 aa36.33■■■■□ 3.41
SPEG-211ENST00000435853 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.32■■■■□ 3.4
SPEG-211ENST00000435853 SOGA1O94964 1423 aa36.3■■■■□ 3.4
SPEG-211ENST00000435853 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.24■■■■□ 3.392e-7■■■■■ 32.6
SPEG-211ENST00000435853 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.24■■■■□ 3.39
SPEG-211ENST00000435853 WDR97A6NE52 1622 aa36.21■■■■□ 3.39
SPEG-211ENST00000435853 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.21■■■■□ 3.39
SPEG-211ENST00000435853 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.17■■■■□ 3.38
SPEG-211ENST00000435853 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.11■■■■□ 3.37
SPEG-211ENST00000435853 TOP2BQ02880 1626 aa36.08■■■■□ 3.37
SPEG-211ENST00000435853 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.08■■■■□ 3.37
SPEG-211ENST00000435853 SYNJ1O43426 1573 aa36.03■■■■□ 3.36
SPEG-211ENST00000435853 TRIM41Q8WV44 630 aa35.96■■■■□ 3.35
SPEG-211ENST00000435853 GRIN2BQ13224 1484 aa35.95■■■■□ 3.35
SPEG-211ENST00000435853 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.93■■■■□ 3.34
SPEG-211ENST00000435853 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.92■■■■□ 3.34
SPEG-211ENST00000435853 CHD1O14646 1710 aa35.91■■■■□ 3.34
SPEG-211ENST00000435853 FBLN2P98095 1184 aa35.91■■■■□ 3.34
SPEG-211ENST00000435853 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.89■■■■□ 3.34
SPEG-211ENST00000435853 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.86■■■■□ 3.33
SPEG-211ENST00000435853 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.82■■■■□ 3.32
SPEG-211ENST00000435853 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.82■■■■□ 3.32
SPEG-211ENST00000435853 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.82■■■■□ 3.32
SPEG-211ENST00000435853 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.82■■■■□ 3.32
SPEG-211ENST00000435853 ARHGEF11O15085 1522 aa35.8■■■■□ 3.32
SPEG-211ENST00000435853 SYNJ2O15056 1496 aa35.77■■■■□ 3.32
SPEG-211ENST00000435853 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.76■■■■□ 3.32
SPEG-211ENST00000435853 PBRM1Q86U86 1689 aa35.72■■■■□ 3.31
SPEG-211ENST00000435853 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.61■■■■□ 3.29
SPEG-211ENST00000435853 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.51■■■■□ 3.28
SPEG-211ENST00000435853 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.51■■■■□ 3.27
SPEG-211ENST00000435853 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.47■■■■□ 3.27
SPEG-211ENST00000435853 ARAP1Q96P48 1450 aa35.46■■■■□ 3.27
SPEG-211ENST00000435853 GRIN2AQ12879 1464 aa35.45■■■■□ 3.27
SPEG-211ENST00000435853 ADAMTS12P58397 1594 aa35.45■■■■□ 3.27
SPEG-211ENST00000435853 KIF27Q86VH2 1401 aa35.41■■■■□ 3.26
SPEG-211ENST00000435853 NUP160Q12769 1436 aa35.35■■■■□ 3.25
SPEG-211ENST00000435853 CEP170Q5SW79 1584 aa35.23■■■■□ 3.23
SPEG-211ENST00000435853 CUL7Q14999 1698 aa35.2■■■■□ 3.23
SPEG-211ENST00000435853 IGF1RP08069 1367 aa35.19■■■■□ 3.22
SPEG-211ENST00000435853 SHROOM2Q13796 1616 aa35.1■■■■□ 3.21
SPEG-211ENST00000435853 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.01■■■■□ 3.2
SPEG-211ENST00000435853 JPH4Q96JJ6 628 aa35.01■■■■□ 3.2
SPEG-211ENST00000435853 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.99■■■■□ 3.19
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