RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619151.4

BRF1-221, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene BRF1, Length 1,530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-221ENST00000619151 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.6■■■■■ 7.77
BRF1-221ENST00000619151 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa56.08■■■■■ 6.57
BRF1-221ENST00000619151 ABCC9O60706 1549 aa53.97■■■■■ 6.23
BRF1-221ENST00000619151 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP53.18■■■■■ 6.1
BRF1-221ENST00000619151 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.71■■■■■ 6.03
BRF1-221ENST00000619151 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.71■■■■■ 6.03
BRF1-221ENST00000619151 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.61■■■■■ 6.01
BRF1-221ENST00000619151 NACADO15069 1562 aa52.55■■■■■ 6
BRF1-221ENST00000619151 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.34■■■■■ 5.97
BRF1-221ENST00000619151 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.32■■■■■ 5.81
BRF1-221ENST00000619151 SCRIBQ14160 1630 aa51.21■■■■■ 5.79
BRF1-221ENST00000619151 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.13■■■■■ 5.78
BRF1-221ENST00000619151 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.75■■■■■ 5.72
BRF1-221ENST00000619151 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP50.62■■■■■ 5.69
BRF1-221ENST00000619151 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.43■■■■■ 5.5
BRF1-221ENST00000619151 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP49.35■■■■■ 5.49
BRF1-221ENST00000619151 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.32■■■■■ 5.49
BRF1-221ENST00000619151 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.22■■■■■ 5.47
BRF1-221ENST00000619151 SMARCA4P51532 1647 aa49.11■■■■■ 5.45
BRF1-221ENST00000619151 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.01■■■■■ 5.44
BRF1-221ENST00000619151 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.94■■■■■ 5.42
BRF1-221ENST00000619151 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.87■■■■■ 5.41
BRF1-221ENST00000619151 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.77■■■■■ 5.4
BRF1-221ENST00000619151 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.68■■■■■ 5.38
BRF1-221ENST00000619151 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.66■■■■■ 5.38
BRF1-221ENST00000619151 SMARCA2P51531 1590 aa48.62■■■■■ 5.37
BRF1-221ENST00000619151 NCAPD3P42695 1498 aa48.53■■■■■ 5.36
BRF1-221ENST00000619151 WIZO95785 1651 aa48.5■■■■■ 5.35
BRF1-221ENST00000619151 HMGXB3Q12766 1538 aa48.32■■■■■ 5.33
BRF1-221ENST00000619151 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.27■■■■■ 5.32
BRF1-221ENST00000619151 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48.06■■■■■ 5.28
BRF1-221ENST00000619151 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.52■■■■■ 5.2
BRF1-221ENST00000619151 CHIC1Q5VXU3 224 aa47.21■■■■■ 5.15
BRF1-221ENST00000619151 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.15■■■■■ 5.14
BRF1-221ENST00000619151 CFTRP13569 1480 aa47.06■■■■■ 5.12
BRF1-221ENST00000619151 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.03■■■■■ 5.12
BRF1-221ENST00000619151 NESP48681 1621 aa47■■■■■ 5.11
BRF1-221ENST00000619151 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.72■■■■■ 5.07
BRF1-221ENST00000619151 PRDM2Q13029 1718 aa46.67■■■■■ 5.06
BRF1-221ENST00000619151 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.56■■■■■ 5.04
BRF1-221ENST00000619151 TRIM41Q8WV44 630 aa46.51■■■■■ 5.04
BRF1-221ENST00000619151 ERCC6Q03468 1493 aa46.43■■■■■ 5.02
BRF1-221ENST00000619151 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.41■■■■■ 5.02
BRF1-221ENST00000619151 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.4■■■■■ 5.02
BRF1-221ENST00000619151 ABCC8Q09428 1581 aa46.3■■■■■ 5
BRF1-221ENST00000619151 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.14■■■■■ 4.98
BRF1-221ENST00000619151 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.13■■■■■ 4.97
BRF1-221ENST00000619151 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.06■■■■■ 4.96
BRF1-221ENST00000619151 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP46.04■■■■■ 4.96
BRF1-221ENST00000619151 WDR62O43379 1518 aa45.97■■■■■ 4.95
BRF1-221ENST00000619151 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.94■■■■■ 4.94
BRF1-221ENST00000619151 CUX1P39880 1505 aa45.92■■■■■ 4.94
BRF1-221ENST00000619151 TOPBP1Q92547 1522 aa45.92■■■■■ 4.94
BRF1-221ENST00000619151 SYNJ1O43426 1573 aa45.87■■■■■ 4.93
BRF1-221ENST00000619151 TOP2BQ02880 1626 aa45.78■■■■■ 4.92
BRF1-221ENST00000619151 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.75■■■■■ 4.91
BRF1-221ENST00000619151 CUX2O14529 1486 aa45.66■■■■■ 4.9
BRF1-221ENST00000619151 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.61■■■■■ 4.89
BRF1-221ENST00000619151 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.6■■■■■ 4.89
BRF1-221ENST00000619151 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP45.53■■■■■ 4.88
BRF1-221ENST00000619151 EEA1Q15075 1411 aa45.53■■■■■ 4.88
BRF1-221ENST00000619151 SOGA1O94964 1423 aa45.45■■■■■ 4.87
BRF1-221ENST00000619151 IFT140Q96RY7 1462 aa45.41■■■■■ 4.86
BRF1-221ENST00000619151 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.38■■■■■ 4.85
BRF1-221ENST00000619151 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.35■■■■■ 4.85
BRF1-221ENST00000619151 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa45.3■■■■■ 4.84
BRF1-221ENST00000619151 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.25■■■■■ 4.83
BRF1-221ENST00000619151 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.19■■■■■ 4.82
BRF1-221ENST00000619151 WDR97A6NE52 1622 aa45.16■■■■■ 4.82
BRF1-221ENST00000619151 CSRNP3Q8WYN3 585 aa45.14■■■■■ 4.82
BRF1-221ENST00000619151 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.11■■■■■ 4.81
BRF1-221ENST00000619151 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.07■■■■■ 4.81
BRF1-221ENST00000619151 KIF27Q86VH2 1401 aa45.01■■■■■ 4.8
BRF1-221ENST00000619151 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.99■■■■■ 4.798e-7■■■■■ 27.9
BRF1-221ENST00000619151 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.94■■■■■ 4.78
BRF1-221ENST00000619151 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.93■■■■■ 4.78
BRF1-221ENST00000619151 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.93■■■■■ 4.78
BRF1-221ENST00000619151 KIF21BO75037 1637 aa44.87■■■■■ 4.77
BRF1-221ENST00000619151 GOLGA3Q08378 1498 aa44.83■■■■■ 4.77
BRF1-221ENST00000619151 EHMT2Q96KQ7 1210 aa44.81■■■■■ 4.76
BRF1-221ENST00000619151 GRIN2BQ13224 1484 aa44.79■■■■■ 4.76
BRF1-221ENST00000619151 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.72■■■■■ 4.75
BRF1-221ENST00000619151 IGF1RP08069 1367 aa44.72■■■■■ 4.75
BRF1-221ENST00000619151 PBRM1Q86U86 1689 aa44.69■■■■■ 4.74
BRF1-221ENST00000619151 TNIKQ9UKE5 1360 aa44.63■■■■■ 4.74
BRF1-221ENST00000619151 PRXQ9BXM0 1461 aa44.62■■■■■ 4.73
BRF1-221ENST00000619151 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.58■■■■■ 4.73
BRF1-221ENST00000619151 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.57■■■■■ 4.73
BRF1-221ENST00000619151 UBTFP17480 764 aaKnown RBP44.55■■■■■ 4.72
BRF1-221ENST00000619151 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa44.53■■■■■ 4.72
BRF1-221ENST00000619151 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.46■■■■■ 4.71
BRF1-221ENST00000619151 CUL7Q14999 1698 aa44.45■■■■■ 4.71
BRF1-221ENST00000619151 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa44.45■■■■■ 4.71
BRF1-221ENST00000619151 ADAMTS12P58397 1594 aa44.43■■■■■ 4.7
BRF1-221ENST00000619151 SYNJ2O15056 1496 aa44.4■■■■■ 4.7
BRF1-221ENST00000619151 CEP162Q5TB80 1403 aa44.35■■■■■ 4.69
BRF1-221ENST00000619151 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.31■■■■■ 4.68
BRF1-221ENST00000619151 FBLN2P98095 1184 aa44.24■■■■■ 4.67
BRF1-221ENST00000619151 GRIN2AQ12879 1464 aa44.21■■■■■ 4.67
BRF1-221ENST00000619151 CHD1O14646 1710 aa44.17■■■■■ 4.66
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