Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.648e-12■■■■■ 79
PCBP1Q15365 LYPLA2-210ENST00000495365 842 ntTSL 218.16■□□□□ 0.58e-12■■■■■ 79
PCBP1Q15365 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.378e-12■■■■■ 79
PCBP1Q15365 LYPLA2-208ENST00000472213 822 ntTSL 316.88■□□□□ 0.298e-12■■■■■ 79
PCBP1Q15365 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.18e-12■■■■■ 79
PCBP1Q15365 LYPLA2-203ENST00000374503 868 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.148e-12■■■■■ 79
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PCBP1Q15365 DIAPH1-206ENST00000468119 619 ntTSL 412.02□□□□□ -0.495e-19■■■■■ 77.8
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PCBP1Q15365 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.691e-323■■■■■ 77.4
PCBP1Q15365 HBA2-202ENST00000397806 513 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.381e-323■■■■■ 77.4
PCBP1Q15365 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.262e-13■■■■■ 76.4
PCBP1Q15365 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.042e-13■■■■■ 76.4
PCBP1Q15365 PXN-215ENST00000548912 655 ntTSL 521.37■■□□□ 1.012e-13■■■■■ 76.4
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PCBP1Q15365 PXN-212ENST00000547746 579 ntTSL 419.77■□□□□ 0.762e-13■■■■■ 76.4
PCBP1Q15365 PXN-211ENST00000546532 729 ntTSL 518.23■□□□□ 0.512e-13■■■■■ 76.4
PCBP1Q15365 PXN-205ENST00000440827 516 ntTSL 417.81■□□□□ 0.442e-13■■■■■ 76.4
PCBP1Q15365 PXN-219ENST00000552550 588 ntTSL 216.52■□□□□ 0.242e-13■■■■■ 76.4
PCBP1Q15365 PXN-210ENST00000543331 957 ntTSL 412.95□□□□□ -0.342e-13■■■■■ 76.4
PCBP1Q15365 PXN-209ENST00000540221 550 ntTSL 410.13□□□□□ -0.792e-13■■■■■ 76.4
PCBP1Q15365 PXN-218ENST00000551327 588 ntTSL 49.94□□□□□ -0.822e-13■■■■■ 76.4
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PCBP1Q15365 CDC42BPA-202ENST00000366764 10445 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.473e-16■■■■■ 75.2
PCBP1Q15365 CDC42BPA-205ENST00000366769 10855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.73e-16■■■■■ 75.2
PCBP1Q15365 CDC42BPA-209ENST00000448940 7355 ntTSL 1 (best)6.01□□□□□ -1.453e-16■■■■■ 75.2
PCBP1Q15365 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.523e-16■■■■■ 75.2
PCBP1Q15365 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.533e-16■■■■■ 75.2
PCBP1Q15365 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.332e-8■■■■■ 73.5
PCBP1Q15365 SNX6-210ENST00000557341 559 ntTSL 515.79■□□□□ 0.122e-8■■■■■ 73.5
PCBP1Q15365 SNX6-206ENST00000556162 1855 ntTSL 215.62■□□□□ 0.092e-8■■■■■ 73.5
PCBP1Q15365 SNX6-203ENST00000555416 1215 ntTSL 1 (best)15.1■□□□□ 0.012e-8■■■■■ 73.5
PCBP1Q15365 SNX6-207ENST00000556303 539 ntTSL 214.11□□□□□ -0.152e-8■■■■■ 73.5
PCBP1Q15365 SNX6-209ENST00000557265 725 ntTSL 313.7□□□□□ -0.222e-8■■■■■ 73.5
PCBP1Q15365 SNX6-201ENST00000362031 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.532e-8■■■■■ 73.5
PCBP1Q15365 SNX6-208ENST00000556712 851 ntTSL 511.45□□□□□ -0.582e-8■■■■■ 73.5
PCBP1Q15365 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.89e-12■■■■■ 73.1
PCBP1Q15365 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.299e-12■■■■■ 73.1
PCBP1Q15365 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.149e-12■■■■■ 73.1
PCBP1Q15365 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.139e-12■■■■■ 73.1
PCBP1Q15365 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.119e-12■■■■■ 73.1
PCBP1Q15365 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.872e-10■■■■■ 71.2
PCBP1Q15365 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.322e-10■■■■■ 71.2
PCBP1Q15365 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.952e-18■■■■■ 69.8
PCBP1Q15365 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.422e-18■■■■■ 69.8
PCBP1Q15365 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.212e-18■■■■■ 69.8
PCBP1Q15365 PPME1-208ENST00000543525 1928 ntTSL 1 (best)13.91□□□□□ -0.183e-13■■■■■ 69.4
PCBP1Q15365 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.333e-13■■■■■ 69.4
PCBP1Q15365 PPME1-202ENST00000398427 2496 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.413e-13■■■■■ 69.4
PCBP1Q15365 PPME1-205ENST00000539021 4055 ntTSL 28.64□□□□□ -1.033e-13■■■■■ 69.4
PCBP1Q15365 PPME1-206ENST00000541340 3618 ntTSL 1 (best)7.51□□□□□ -1.213e-13■■■■■ 69.4
PCBP1Q15365 EMP3-203ENST00000594198 263 ntTSL 210.07□□□□□ -0.83e-12■■■■■ 69.2
PCBP1Q15365 CMIP-211ENST00000621537 4000 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.471e-28■■■■■ 68.4
PCBP1Q15365 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.373e-13■■■■■ 68.3
PCBP1Q15365 PTBP2-209ENST00000482253 2029 ntTSL 219.35■□□□□ 0.693e-13■■■■■ 68.3
PCBP1Q15365 R3HDM2-215ENST00000634871 4092 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.142e-25■■■■■ 68.3
PCBP1Q15365 PTBP2-204ENST00000459735 791 ntTSL 59.9□□□□□ -0.823e-13■■■■■ 68.3
PCBP1Q15365 PTBP2-207ENST00000476419 1691 ntTSL 1 (best)9.29□□□□□ -0.923e-13■■■■■ 68.3
PCBP1Q15365 PTBP2-202ENST00000370198 3054 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.943e-13■■■■■ 68.3
PCBP1Q15365 PTBP2-201ENST00000370197 3057 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.943e-13■■■■■ 68.3
PCBP1Q15365 PTBP2-203ENST00000426398 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.113e-13■■■■■ 68.3
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PCBP1Q15365 PTBP2-210ENST00000492905 776 ntTSL 1 (best)5.99□□□□□ -1.453e-13■■■■■ 68.3
PCBP1Q15365 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.823e-13■■■■■ 68.3
PCBP1Q15365 SAR1A-203ENST00000373239 468 ntTSL 315.54■□□□□ 0.086e-13■■■■■ 67.5
PCBP1Q15365 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.096e-13■■■■■ 67.5
PCBP1Q15365 SAR1A-205ENST00000373242 5981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.816e-13■■■■■ 67.5
PCBP1Q15365 SAR1A-202ENST00000373238 3227 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.936e-13■■■■■ 67.5
PCBP1Q15365 GSK3A-203ENST00000453535 1897 ntTSL 530.03■■■□□ 2.46e-7■■■■■ 66.5
PCBP1Q15365 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.736e-7■■■■■ 66.5
PCBP1Q15365 GSK3A-202ENST00000398249 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.956e-7■■■■■ 66.5
PCBP1Q15365 CEP85-205ENST00000469609 2384 ntTSL 1 (best)12.06□□□□□ -0.484e-9■■■■■ 66.2
PCBP1Q15365 CEP85-202ENST00000451429 4061 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.494e-9■■■■■ 66.2
PCBP1Q15365 CEP85-203ENST00000453146 2821 ntTSL 1 (best)10.99□□□□□ -0.654e-9■■■■■ 66.2
PCBP1Q15365 CEP85-206ENST00000476272 3507 ntTSL 29.03□□□□□ -0.964e-9■■■■■ 66.2
PCBP1Q15365 CEP85-201ENST00000252992 3935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.214e-9■■■■■ 66.2
PCBP1Q15365 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.261e-7■■■■■ 66
PCBP1Q15365 ERGIC1-211ENST00000523215 3621 ntTSL 1 (best)10.7□□□□□ -0.71e-7■■■■■ 66
PCBP1Q15365 SNRPA-202ENST00000596860 336 ntTSL 29.71□□□□□ -0.864e-76■■■■■ 65.8
PCBP1Q15365 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.592e-11■■■■■ 65.5
PCBP1Q15365 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.562e-11■■■■■ 65.5
PCBP1Q15365 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.172e-11■■■■■ 65.5
PCBP1Q15365 NRBP1-206ENST00000460499 2561 ntTSL 215.06■□□□□ 02e-11■■■■■ 65.5
PCBP1Q15365 PMF1-201ENST00000368273 884 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.12e-11■■■■■ 65.5
PCBP1Q15365 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.86■□□□□ 0.771e-12■■■■■ 65.4
PCBP1Q15365 MBD6-204ENST00000547545 1884 ntTSL 1 (best)19.72■□□□□ 0.751e-12■■■■■ 65.4
PCBP1Q15365 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.571e-12■■■■■ 65.4
PCBP1Q15365 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.01■□□□□ 0.471e-12■■■■■ 65.4
PCBP1Q15365 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.351e-12■■■■■ 65.4
PCBP1Q15365 NPIPA1-203ENST00000472413 5345 ntTSL 216.55■□□□□ 0.241e-12■■■■■ 65.4
PCBP1Q15365 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.091e-12■■■■■ 65.4
PCBP1Q15365 NPIPA1-206ENST00000541836 2747 ntTSL 513.33□□□□□ -0.281e-12■■■■■ 65.4
PCBP1Q15365 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.45e-14■■■■■ 65.1
PCBP1Q15365 SUN1-222ENST00000457861 2975 ntTSL 215.63■□□□□ 0.095e-14■■■■■ 65.1
PCBP1Q15365 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.763e-7■■■■■ 64.9
PCBP1Q15365 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.183e-7■■■■■ 64.9
PCBP1Q15365 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.223e-7■■■■■ 64.9
PCBP1Q15365 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC6.15□□□□□ -1.424e-18■■■■■ 64.9
PCBP1Q15365 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.586e-8■■■■■ 64.6
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