Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.648e-12■■■■■ 79
PCBP1Q15365 LYPLA2-210ENST00000495365 842 ntTSL 218.16■□□□□ 0.58e-12■■■■■ 79
PCBP1Q15365 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.378e-12■■■■■ 79
PCBP1Q15365 LYPLA2-208ENST00000472213 822 ntTSL 316.88■□□□□ 0.298e-12■■■■■ 79
PCBP1Q15365 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.18e-12■■■■■ 79
PCBP1Q15365 LYPLA2-203ENST00000374503 868 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.148e-12■■■■■ 79
PCBP1Q15365 DIAPH1-205ENST00000448451 2102 ntTSL 214□□□□□ -0.175e-19■■■■■ 77.8
PCBP1Q15365 DIAPH1-208ENST00000476339 2606 ntTSL 212.13□□□□□ -0.475e-19■■■■■ 77.8
PCBP1Q15365 DIAPH1-206ENST00000468119 619 ntTSL 412.02□□□□□ -0.495e-19■■■■■ 77.8
PCBP1Q15365 HBA2-203ENST00000482565 640 ntTSL 1 (best)19.68■□□□□ 0.741e-323■■■■■ 77.4
PCBP1Q15365 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.691e-323■■■■■ 77.4
PCBP1Q15365 HBA2-202ENST00000397806 513 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.381e-323■■■■■ 77.4
PCBP1Q15365 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.262e-13■■■■■ 76.4
PCBP1Q15365 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.042e-13■■■■■ 76.4
PCBP1Q15365 PXN-215ENST00000548912 655 ntTSL 521.37■■□□□ 1.012e-13■■■■■ 76.4
PCBP1Q15365 PXN-214ENST00000547983 1004 ntTSL 519.98■□□□□ 0.792e-13■■■■■ 76.4
PCBP1Q15365 PXN-212ENST00000547746 579 ntTSL 419.77■□□□□ 0.762e-13■■■■■ 76.4
PCBP1Q15365 PXN-211ENST00000546532 729 ntTSL 518.23■□□□□ 0.512e-13■■■■■ 76.4
PCBP1Q15365 PXN-205ENST00000440827 516 ntTSL 417.81■□□□□ 0.442e-13■■■■■ 76.4
PCBP1Q15365 PXN-219ENST00000552550 588 ntTSL 216.52■□□□□ 0.242e-13■■■■■ 76.4
PCBP1Q15365 PXN-210ENST00000543331 957 ntTSL 412.95□□□□□ -0.342e-13■■■■■ 76.4
PCBP1Q15365 PXN-209ENST00000540221 550 ntTSL 410.13□□□□□ -0.792e-13■■■■■ 76.4
PCBP1Q15365 PXN-218ENST00000551327 588 ntTSL 49.94□□□□□ -0.822e-13■■■■■ 76.4
PCBP1Q15365 CDC42BPA-203ENST00000366766 10610 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.43e-16■■■■■ 75.2
PCBP1Q15365 CDC42BPA-202ENST00000366764 10445 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.473e-16■■■■■ 75.2
PCBP1Q15365 CDC42BPA-205ENST00000366769 10855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.73e-16■■■■■ 75.2
PCBP1Q15365 CDC42BPA-209ENST00000448940 7355 ntTSL 1 (best)6.01□□□□□ -1.453e-16■■■■■ 75.2
PCBP1Q15365 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.523e-16■■■■■ 75.2
PCBP1Q15365 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.533e-16■■■■■ 75.2
PCBP1Q15365 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.332e-8■■■■■ 73.5
PCBP1Q15365 SNX6-210ENST00000557341 559 ntTSL 515.79■□□□□ 0.122e-8■■■■■ 73.5
PCBP1Q15365 SNX6-206ENST00000556162 1855 ntTSL 215.62■□□□□ 0.092e-8■■■■■ 73.5
PCBP1Q15365 SNX6-203ENST00000555416 1215 ntTSL 1 (best)15.1■□□□□ 0.012e-8■■■■■ 73.5
PCBP1Q15365 SNX6-207ENST00000556303 539 ntTSL 214.11□□□□□ -0.152e-8■■■■■ 73.5
PCBP1Q15365 SNX6-209ENST00000557265 725 ntTSL 313.7□□□□□ -0.222e-8■■■■■ 73.5
PCBP1Q15365 SNX6-201ENST00000362031 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.532e-8■■■■■ 73.5
PCBP1Q15365 SNX6-208ENST00000556712 851 ntTSL 511.45□□□□□ -0.582e-8■■■■■ 73.5
PCBP1Q15365 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.89e-12■■■■■ 73.1
PCBP1Q15365 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.299e-12■■■■■ 73.1
PCBP1Q15365 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.149e-12■■■■■ 73.1
PCBP1Q15365 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.139e-12■■■■■ 73.1
PCBP1Q15365 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.119e-12■■■■■ 73.1
PCBP1Q15365 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.872e-10■■■■■ 71.2
PCBP1Q15365 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.322e-10■■■■■ 71.2
PCBP1Q15365 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.952e-18■■■■■ 69.8
PCBP1Q15365 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.422e-18■■■■■ 69.8
PCBP1Q15365 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.212e-18■■■■■ 69.8
PCBP1Q15365 PPME1-208ENST00000543525 1928 ntTSL 1 (best)13.91□□□□□ -0.183e-13■■■■■ 69.4
PCBP1Q15365 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.333e-13■■■■■ 69.4
PCBP1Q15365 PPME1-202ENST00000398427 2496 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.413e-13■■■■■ 69.4
PCBP1Q15365 PPME1-205ENST00000539021 4055 ntTSL 28.64□□□□□ -1.033e-13■■■■■ 69.4
PCBP1Q15365 PPME1-206ENST00000541340 3618 ntTSL 1 (best)7.51□□□□□ -1.213e-13■■■■■ 69.4
PCBP1Q15365 EMP3-203ENST00000594198 263 ntTSL 210.07□□□□□ -0.83e-12■■■■■ 69.2
PCBP1Q15365 CMIP-211ENST00000621537 4000 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.471e-28■■■■■ 68.4
PCBP1Q15365 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.373e-13■■■■■ 68.3
PCBP1Q15365 PTBP2-209ENST00000482253 2029 ntTSL 219.35■□□□□ 0.693e-13■■■■■ 68.3
PCBP1Q15365 R3HDM2-215ENST00000634871 4092 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.142e-25■■■■■ 68.3
PCBP1Q15365 PTBP2-204ENST00000459735 791 ntTSL 59.9□□□□□ -0.823e-13■■■■■ 68.3
PCBP1Q15365 PTBP2-207ENST00000476419 1691 ntTSL 1 (best)9.29□□□□□ -0.923e-13■■■■■ 68.3
PCBP1Q15365 PTBP2-202ENST00000370198 3054 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.943e-13■■■■■ 68.3
PCBP1Q15365 PTBP2-201ENST00000370197 3057 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.943e-13■■■■■ 68.3
PCBP1Q15365 PTBP2-203ENST00000426398 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.113e-13■■■■■ 68.3
PCBP1Q15365 PTBP2-208ENST00000476783 779 ntTSL 1 (best)5.99□□□□□ -1.453e-13■■■■■ 68.3
PCBP1Q15365 PTBP2-210ENST00000492905 776 ntTSL 1 (best)5.99□□□□□ -1.453e-13■■■■■ 68.3
PCBP1Q15365 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.823e-13■■■■■ 68.3
PCBP1Q15365 SAR1A-203ENST00000373239 468 ntTSL 315.54■□□□□ 0.086e-13■■■■■ 67.5
PCBP1Q15365 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.096e-13■■■■■ 67.5
PCBP1Q15365 SAR1A-205ENST00000373242 5981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.816e-13■■■■■ 67.5
PCBP1Q15365 SAR1A-202ENST00000373238 3227 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.936e-13■■■■■ 67.5
PCBP1Q15365 GSK3A-203ENST00000453535 1897 ntTSL 530.03■■■□□ 2.46e-7■■■■■ 66.5
PCBP1Q15365 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.736e-7■■■■■ 66.5
PCBP1Q15365 GSK3A-202ENST00000398249 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.956e-7■■■■■ 66.5
PCBP1Q15365 CEP85-205ENST00000469609 2384 ntTSL 1 (best)12.06□□□□□ -0.484e-9■■■■■ 66.2
PCBP1Q15365 CEP85-202ENST00000451429 4061 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.494e-9■■■■■ 66.2
PCBP1Q15365 CEP85-203ENST00000453146 2821 ntTSL 1 (best)10.99□□□□□ -0.654e-9■■■■■ 66.2
PCBP1Q15365 CEP85-206ENST00000476272 3507 ntTSL 29.03□□□□□ -0.964e-9■■■■■ 66.2
PCBP1Q15365 CEP85-201ENST00000252992 3935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.214e-9■■■■■ 66.2
PCBP1Q15365 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.261e-7■■■■■ 66
PCBP1Q15365 ERGIC1-211ENST00000523215 3621 ntTSL 1 (best)10.7□□□□□ -0.71e-7■■■■■ 66
PCBP1Q15365 SNRPA-202ENST00000596860 336 ntTSL 29.71□□□□□ -0.864e-76■■■■■ 65.8
PCBP1Q15365 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.592e-11■■■■■ 65.5
PCBP1Q15365 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.562e-11■■■■■ 65.5
PCBP1Q15365 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.172e-11■■■■■ 65.5
PCBP1Q15365 NRBP1-206ENST00000460499 2561 ntTSL 215.06■□□□□ 02e-11■■■■■ 65.5
PCBP1Q15365 PMF1-201ENST00000368273 884 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.12e-11■■■■■ 65.5
PCBP1Q15365 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.86■□□□□ 0.771e-12■■■■■ 65.4
PCBP1Q15365 MBD6-204ENST00000547545 1884 ntTSL 1 (best)19.72■□□□□ 0.751e-12■■■■■ 65.4
PCBP1Q15365 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.571e-12■■■■■ 65.4
PCBP1Q15365 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.01■□□□□ 0.471e-12■■■■■ 65.4
PCBP1Q15365 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.351e-12■■■■■ 65.4
PCBP1Q15365 NPIPA1-203ENST00000472413 5345 ntTSL 216.55■□□□□ 0.241e-12■■■■■ 65.4
PCBP1Q15365 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.091e-12■■■■■ 65.4
PCBP1Q15365 NPIPA1-206ENST00000541836 2747 ntTSL 513.33□□□□□ -0.281e-12■■■■■ 65.4
PCBP1Q15365 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.45e-14■■■■■ 65.1
PCBP1Q15365 SUN1-222ENST00000457861 2975 ntTSL 215.63■□□□□ 0.095e-14■■■■■ 65.1
PCBP1Q15365 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.763e-7■■■■■ 64.9
PCBP1Q15365 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.183e-7■■■■■ 64.9
PCBP1Q15365 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.223e-7■■■■■ 64.9
PCBP1Q15365 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC6.15□□□□□ -1.424e-18■■■■■ 64.9
PCBP1Q15365 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.586e-8■■■■■ 64.6
Retrieved 100 of 13,035 protein–RNA pairs in 51.4 ms