Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 SREBF1-209ENST00000470247 374 ntTSL 510.99□□□□□ -0.652e-6■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 RPL12-205ENST00000536368 499 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.682e-6■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 CASC3-208ENST00000583649 577 ntTSL 310.64□□□□□ -0.712e-6■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 BMPR1A-201ENST00000372037 11255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.772e-6■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 CCNT1-201ENST00000261900 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.972e-6■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 SREK1-215ENST00000524111 4074 ntTSL 58.92□□□□□ -0.982e-6■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 AC106869.1-203ENST00000419035 1892 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.982e-6■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 USF2-212ENST00000599625 446 ntTSL 28.65□□□□□ -1.022e-6■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 EIF1-201ENST00000310837 1120 ntTSL 1 (best)8.31□□□□□ -1.081e-8■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 SSR1-203ENST00000462112 1094 ntTSL 4 BASIC7.89□□□□□ -1.153e-10■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 SSR1-201ENST00000244763 9669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.173e-10■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 RPL12-201ENST00000361436 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.182e-6■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 SSR1-210ENST00000489567 1893 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.223e-10■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 AC106869.1-202ENST00000441997 604 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.262e-6■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 EIF1-203ENST00000469257 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.271e-8■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 EIF1-207ENST00000591776 797 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.281e-8■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 SSR1-206ENST00000479365 1118 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.313e-10■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.422e-6■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 EIF1-205ENST00000482111 1428 ntTSL 26.16□□□□□ -1.421e-8■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 USF2-209ENST00000597671 464 ntTSL 55.99□□□□□ -1.452e-6■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 KSR1-208ENST00000579309 343 ntTSL 55.58□□□□□ -1.523e-10■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.532e-6■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 SREK1-204ENST00000518110 763 ntTSL 25.21□□□□□ -1.582e-6■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.583e-10■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 SSR1-209ENST00000488834 585 ntTSL 44.46□□□□□ -1.73e-10■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 SREK1-208ENST00000520580 2369 ntTSL 23.77□□□□□ -1.812e-6■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 SREK1-201ENST00000284041 3751 ntTSL 1 (best)3.65□□□□□ -1.822e-6■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 SREK1-210ENST00000521691 580 ntTSL 33.25□□□□□ -1.892e-6■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 ACAA1-215ENST00000469600 876 ntTSL 213.85□□□□□ -0.196e-7■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 ZNF692-210ENST00000476503 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 316.75■□□□□ 0.277e-9■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.131e-8■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.161e-8■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.161e-8■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 CNBP-210ENST00000512338 502 ntTSL 413.75□□□□□ -0.211e-8■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 CNBP-207ENST00000502976 1626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.231e-8■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.281e-8■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.311e-8■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 CNBP-209ENST00000507573 641 ntTSL 212.67□□□□□ -0.381e-8■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 CNBP-202ENST00000441626 1040 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.61e-8■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 CNBP-206ENST00000502372 1026 ntTSL 59.54□□□□□ -0.881e-8■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 DGKD-208ENST00000471764 270 ntTSL 213.7□□□□□ -0.227e-8■□□□□ 9.3
PRPF4O43172 POLRMT-201ENST00000587057 1229 ntTSL 517.79■□□□□ 0.446e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 POLRMT-203ENST00000589961 490 ntTSL 317.55■□□□□ 0.46e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 POLRMT-204ENST00000590336 380 ntTSL 38.37□□□□□ -1.076e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 AL591895.1-201ENST00000424332 348 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.775e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 TRAF4-207ENST00000461195 787 ntTSL 221.41■■□□□ 1.021e-6■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 TRAF4-204ENST00000422344 631 ntTSL 320.88■□□□□ 0.931e-6■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.921e-6■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.91e-6■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 TRAF4-203ENST00000394925 702 ntTSL 220.07■□□□□ 0.81e-6■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.621e-6■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 TRAF4-216ENST00000586813 789 ntTSL 318.42■□□□□ 0.541e-6■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 TRAF4-212ENST00000498540 748 ntTSL 313.94□□□□□ -0.181e-6■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 TRAF4-210ENST00000475329 544 ntTSL 313.81□□□□□ -0.21e-6■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 TRAF4-202ENST00000262396 683 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.531e-6■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 SLC26A6-206ENST00000414944 724 ntTSL 316.66■□□□□ 0.269e-8■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 SLC26A6-212ENST00000444531 806 ntTSL 315.17■□□□□ 0.029e-8■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 SLC26A6-208ENST00000421649 910 ntTSL 314.3□□□□□ -0.129e-8■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 CHRD-215ENST00000485883 568 ntTSL 419.27■□□□□ 0.681e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.012e-6■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.854e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.714e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.544e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.514e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.494e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.414e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.334e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 EWSR1-216ENST00000479135 7285 ntTSL 1 (best)11.9□□□□□ -0.54e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 PABPN1-204ENST00000554062 589 ntTSL 34.83□□□□□ -1.642e-9■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.768e-9■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 GGA2-214ENST00000569182 587 ntTSL 49.68□□□□□ -0.865e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 RASA1-206ENST00000515800 4979 ntTSL 1 (best)16.94■□□□□ 0.31e-8■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.181e-8■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 FLNB-214ENST00000493452 7402 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.732e-14■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 CA5A-201ENST00000309893 7567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.823e-6■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.233e-8■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 PROC-204ENST00000419985 500 ntTSL 420.97■□□□□ 0.959e-8■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 NELFCD-201ENST00000460601 2137 ntTSL 1 (best)16.79■□□□□ 0.283e-8■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 NELFCD-204ENST00000474543 2047 ntTSL 515.21■□□□□ 0.033e-8■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 NELFCD-205ENST00000477741 2070 ntTSL 1 (best)14.16□□□□□ -0.143e-8■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 NELFCD-207ENST00000479207 1112 ntTSL 310.92□□□□□ -0.663e-8■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 APOL1-203ENST00000397279 1564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.937e-25■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 NELFCD-206ENST00000478389 3581 ntTSL 28.86□□□□□ -0.993e-8■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 MTFR1L-206ENST00000464008 1201 ntTSL 521.26■□□□□ 0.991e-6■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 MTFR1L-217ENST00000526158 815 ntTSL 321.26■□□□□ 0.991e-6■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.831e-6■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.731e-6■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 AL020996.2-201ENST00000559265 568 ntTSL 419.08■□□□□ 0.641e-6■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 MTFR1L-209ENST00000472643 838 ntTSL 316.1■□□□□ 0.171e-6■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 MTFR1L-223ENST00000533762 722 ntTSL 515.34■□□□□ 0.051e-6■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 MTFR1L-212ENST00000488327 541 ntTSL 415.26■□□□□ 0.031e-6■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.031e-6■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 MTFR1L-220ENST00000529116 555 ntTSL 415.26■□□□□ 0.031e-6■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 MTFR1L-216ENST00000525713 575 ntTSL 414.13□□□□□ -0.151e-6■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 MTFR1L-219ENST00000528624 562 ntTSL 413.97□□□□□ -0.171e-6■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 MTFR1L-213ENST00000494293 804 ntTSL 213.07□□□□□ -0.321e-6■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 MTFR1L-208ENST00000469815 893 ntTSL 312.87□□□□□ -0.351e-6■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 MTFR1L-201ENST00000374300 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.421e-6■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 MTFR1L-211ENST00000478284 793 ntTSL 311.99□□□□□ -0.491e-6■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 MTFR1L-221ENST00000530599 763 ntTSL 411.95□□□□□ -0.51e-6■□□□□ 9.2
Retrieved 100 of 20,551 protein–RNA pairs in 93.8 ms