RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000422344.5

TRAF4-204, Transcript of TNF receptor associated factor 4, humanhuman

TSL 3

Gene TRAF4, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4-204ENST00000422344 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.56■■■■■ 6.16
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TRAF4-204ENST00000422344 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.76■■■■■ 4.92
TRAF4-204ENST00000422344 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.52■■■■■ 4.88
TRAF4-204ENST00000422344 NACADO15069 1562 aa45.37■■■■■ 4.85
TRAF4-204ENST00000422344 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.22■■■■■ 4.83
TRAF4-204ENST00000422344 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.91■■■■■ 4.78
TRAF4-204ENST00000422344 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.75■■■■■ 4.75
TRAF4-204ENST00000422344 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.62■■■■■ 4.73
TRAF4-204ENST00000422344 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.54■■■■■ 4.72
TRAF4-204ENST00000422344 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.44■■■■■ 4.71
TRAF4-204ENST00000422344 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.29■■■■■ 4.68
TRAF4-204ENST00000422344 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.76■■■■■ 4.6
TRAF4-204ENST00000422344 SCRIBQ14160 1630 aa43.7■■■■■ 4.59
TRAF4-204ENST00000422344 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.55■■■■■ 4.56
TRAF4-204ENST00000422344 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.47■■■■■ 4.55
TRAF4-204ENST00000422344 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.37■■■■■ 4.53
TRAF4-204ENST00000422344 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.96■■■■■ 4.31
TRAF4-204ENST00000422344 NCAPD3P42695 1498 aa41.9■■■■■ 4.3
TRAF4-204ENST00000422344 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.74■■■■■ 4.27
TRAF4-204ENST00000422344 ERCC6Q03468 1493 aa41.67■■■■■ 4.26
TRAF4-204ENST00000422344 SMARCA4P51532 1647 aa41.64■■■■■ 4.26
TRAF4-204ENST00000422344 CUX2O14529 1486 aa41.64■■■■■ 4.26
TRAF4-204ENST00000422344 SMARCA2P51531 1590 aa41.6■■■■■ 4.25
TRAF4-204ENST00000422344 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.57■■■■■ 4.25
TRAF4-204ENST00000422344 HMGXB3Q12766 1538 aa41.54■■■■■ 4.24
TRAF4-204ENST00000422344 NESP48681 1621 aa41.37■■■■■ 4.21
TRAF4-204ENST00000422344 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.34■■■■■ 4.21
TRAF4-204ENST00000422344 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.26■■■■■ 4.2
TRAF4-204ENST00000422344 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.2■■■■■ 4.19
TRAF4-204ENST00000422344 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.99■■■■■ 4.15
TRAF4-204ENST00000422344 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.95■■■■■ 4.15
TRAF4-204ENST00000422344 WIZO95785 1651 aa40.82■■■■■ 4.12
TRAF4-204ENST00000422344 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.82■■■■■ 4.12
TRAF4-204ENST00000422344 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.79■■■■■ 4.12
TRAF4-204ENST00000422344 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.67■■■■■ 4.1
TRAF4-204ENST00000422344 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.63■■■■■ 4.1
TRAF4-204ENST00000422344 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.45■■■■■ 4.07
TRAF4-204ENST00000422344 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.38■■■■■ 4.06
TRAF4-204ENST00000422344 WDR62O43379 1518 aa40.34■■■■■ 4.05
TRAF4-204ENST00000422344 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.24■■■■■ 4.03
TRAF4-204ENST00000422344 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.18■■■■■ 4.02
TRAF4-204ENST00000422344 CFTRP13569 1480 aa40.1■■■■■ 4.01
TRAF4-204ENST00000422344 TRIM41Q8WV44 630 aa40.07■■■■■ 4.01
TRAF4-204ENST00000422344 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.88■■■■□ 3.98
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TRAF4-204ENST00000422344 OSCARQ8IYS5 282 aa39.75■■■■□ 3.95
TRAF4-204ENST00000422344 PRDM2Q13029 1718 aa39.67■■■■□ 3.94
TRAF4-204ENST00000422344 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.49■■■■□ 3.91
TRAF4-204ENST00000422344 IFT140Q96RY7 1462 aa39.43■■■■□ 3.9
TRAF4-204ENST00000422344 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.43■■■■□ 3.9
TRAF4-204ENST00000422344 TOPBP1Q92547 1522 aa39.39■■■■□ 3.9
TRAF4-204ENST00000422344 ABCC8Q09428 1581 aa39.25■■■■□ 3.87
TRAF4-204ENST00000422344 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.25■■■■□ 3.87
TRAF4-204ENST00000422344 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.25■■■■□ 3.87
TRAF4-204ENST00000422344 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.25■■■■□ 3.87
TRAF4-204ENST00000422344 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.21■■■■□ 3.87
TRAF4-204ENST00000422344 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.17■■■■□ 3.86
TRAF4-204ENST00000422344 ARHGEF11O15085 1522 aa39.09■■■■□ 3.85
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TRAF4-204ENST00000422344 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.96■■■■□ 3.83
TRAF4-204ENST00000422344 CHD1O14646 1710 aa38.95■■■■□ 3.83
TRAF4-204ENST00000422344 FBLN2P98095 1184 aa38.9■■■■□ 3.82
TRAF4-204ENST00000422344 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.87■■■■□ 3.81
TRAF4-204ENST00000422344 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.86■■■■□ 3.81
TRAF4-204ENST00000422344 SOGA1O94964 1423 aa38.8■■■■□ 3.8
TRAF4-204ENST00000422344 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.78■■■■□ 3.8
TRAF4-204ENST00000422344 CUX1P39880 1505 aa38.73■■■■□ 3.79
TRAF4-204ENST00000422344 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.69■■■■□ 3.78
TRAF4-204ENST00000422344 ARAP1Q96P48 1450 aa38.69■■■■□ 3.78
TRAF4-204ENST00000422344 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.63■■■■□ 3.77
TRAF4-204ENST00000422344 WDR97A6NE52 1622 aa38.58■■■■□ 3.77
TRAF4-204ENST00000422344 TRHP20396 242 aaPredicted RBP38.55■■■■□ 3.76
TRAF4-204ENST00000422344 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.54■■■■□ 3.76
TRAF4-204ENST00000422344 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.49■■■■□ 3.75
TRAF4-204ENST00000422344 GRIN2BQ13224 1484 aa38.47■■■■□ 3.75
TRAF4-204ENST00000422344 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.47■■■■□ 3.75
TRAF4-204ENST00000422344 SYNJ1O43426 1573 aa38.44■■■■□ 3.74
TRAF4-204ENST00000422344 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.41■■■■□ 3.74
TRAF4-204ENST00000422344 SYNJ2O15056 1496 aa38.37■■■■□ 3.73
TRAF4-204ENST00000422344 TOP2BQ02880 1626 aa38.33■■■■□ 3.73
TRAF4-204ENST00000422344 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.33■■■■□ 3.73
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TRAF4-204ENST00000422344 GRIN2AQ12879 1464 aa37.98■■■■□ 3.67
TRAF4-204ENST00000422344 ADAMTS12P58397 1594 aa37.91■■■■□ 3.66
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TRAF4-204ENST00000422344 CEP170Q5SW79 1584 aa37.86■■■■□ 3.65
TRAF4-204ENST00000422344 NUP160Q12769 1436 aa37.85■■■■□ 3.65
TRAF4-204ENST00000422344 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.82■■■■□ 3.65
TRAF4-204ENST00000422344 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.81■■■■□ 3.64
TRAF4-204ENST00000422344 SHROOM2Q13796 1616 aa37.71■■■■□ 3.63
TRAF4-204ENST00000422344 KIF27Q86VH2 1401 aa37.65■■■■□ 3.62
TRAF4-204ENST00000422344 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP37.61■■■■□ 3.61
TRAF4-204ENST00000422344 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.54■■■■□ 3.6
TRAF4-204ENST00000422344 JPH4Q96JJ6 628 aa37.52■■■■□ 3.6
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