RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485883.5

CHRD-215, Transcript of chordin, humanhuman

TSL 4

Gene CHRD, Length 568 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRD-215ENST00000485883 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.03■■■■■ 5.76
CHRD-215ENST00000485883 ABCC9O60706 1549 aa45.88■■■■■ 4.94
CHRD-215ENST00000485883 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.68■■■■■ 4.9
CHRD-215ENST00000485883 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.54■■■■■ 4.56
CHRD-215ENST00000485883 NACADO15069 1562 aa43.25■■■■■ 4.51
CHRD-215ENST00000485883 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.19■■■■■ 4.5
CHRD-215ENST00000485883 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.16■■■■■ 4.5
CHRD-215ENST00000485883 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.79■■■■■ 4.442e-7■■■■□ 20.9
CHRD-215ENST00000485883 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.62■■■■■ 4.41
CHRD-215ENST00000485883 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.57■■■■■ 4.41
CHRD-215ENST00000485883 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.35■■■■■ 4.37
CHRD-215ENST00000485883 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.28■■■■■ 4.36
CHRD-215ENST00000485883 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.08■■■■■ 4.33
CHRD-215ENST00000485883 SCRIBQ14160 1630 aa41.75■■■■■ 4.27
CHRD-215ENST00000485883 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.65■■■■■ 4.26
CHRD-215ENST00000485883 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.4■■■■■ 4.22
CHRD-215ENST00000485883 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.3■■■■■ 4.2
CHRD-215ENST00000485883 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.29■■■■■ 4.2
CHRD-215ENST00000485883 NCAPD3P42695 1498 aa39.98■■■■□ 3.99
CHRD-215ENST00000485883 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.88■■■■□ 3.98
CHRD-215ENST00000485883 SMARCA4P51532 1647 aa39.79■■■■□ 3.96
CHRD-215ENST00000485883 SMARCA2P51531 1590 aa39.69■■■■□ 3.94
CHRD-215ENST00000485883 HMGXB3Q12766 1538 aa39.62■■■■□ 3.93
CHRD-215ENST00000485883 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.57■■■■□ 3.92
CHRD-215ENST00000485883 ERCC6Q03468 1493 aa39.56■■■■□ 3.92
CHRD-215ENST00000485883 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.56■■■■□ 3.92
CHRD-215ENST00000485883 CUX2O14529 1486 aa39.46■■■■□ 3.91
CHRD-215ENST00000485883 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.46■■■■□ 3.91
CHRD-215ENST00000485883 NESP48681 1621 aa39.43■■■■□ 3.9
CHRD-215ENST00000485883 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.38■■■■□ 3.89
CHRD-215ENST00000485883 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.36■■■■□ 3.89
CHRD-215ENST00000485883 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.03■■■■□ 3.84
CHRD-215ENST00000485883 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.95■■■■□ 3.83
CHRD-215ENST00000485883 WIZO95785 1651 aa38.87■■■■□ 3.81
CHRD-215ENST00000485883 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.84■■■■□ 3.81
CHRD-215ENST00000485883 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.82■■■■□ 3.81
CHRD-215ENST00000485883 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.79■■■■□ 3.8
CHRD-215ENST00000485883 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.55■■■■□ 3.76
CHRD-215ENST00000485883 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.52■■■■□ 3.76
CHRD-215ENST00000485883 WDR62O43379 1518 aa38.41■■■■□ 3.74
CHRD-215ENST00000485883 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.35■■■■□ 3.73
CHRD-215ENST00000485883 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.34■■■■□ 3.73
CHRD-215ENST00000485883 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.33■■■■□ 3.73
CHRD-215ENST00000485883 CFTRP13569 1480 aa38.33■■■■□ 3.73
CHRD-215ENST00000485883 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.04■■■■□ 3.68
CHRD-215ENST00000485883 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.96■■■■□ 3.67
CHRD-215ENST00000485883 TRIM41Q8WV44 630 aa37.86■■■■□ 3.65
CHRD-215ENST00000485883 PRDM2Q13029 1718 aa37.8■■■■□ 3.64
CHRD-215ENST00000485883 OSCARQ8IYS5 282 aa37.72■■■■□ 3.63
CHRD-215ENST00000485883 TOPBP1Q92547 1522 aa37.61■■■■□ 3.61
CHRD-215ENST00000485883 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.61■■■■□ 3.61
CHRD-215ENST00000485883 IFT140Q96RY7 1462 aa37.58■■■■□ 3.61
CHRD-215ENST00000485883 ABCC8Q09428 1581 aa37.45■■■■□ 3.59
CHRD-215ENST00000485883 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.42■■■■□ 3.58
CHRD-215ENST00000485883 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.31■■■■□ 3.56
CHRD-215ENST00000485883 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.27■■■■□ 3.563e-7■■□□□ 11.6
CHRD-215ENST00000485883 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.25■■■■□ 3.55
CHRD-215ENST00000485883 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.23■■■■□ 3.55
CHRD-215ENST00000485883 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.2■■■■□ 3.55
CHRD-215ENST00000485883 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.2■■■■□ 3.55
CHRD-215ENST00000485883 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.2■■■■□ 3.55
CHRD-215ENST00000485883 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.15■■■■□ 3.54
CHRD-215ENST00000485883 ARHGEF11O15085 1522 aa37.1■■■■□ 3.53
CHRD-215ENST00000485883 SOGA1O94964 1423 aa37.07■■■■□ 3.52
CHRD-215ENST00000485883 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.04■■■■□ 3.52
CHRD-215ENST00000485883 FBLN2P98095 1184 aa37.03■■■■□ 3.52
CHRD-215ENST00000485883 CHD1O14646 1710 aa37.02■■■■□ 3.52
CHRD-215ENST00000485883 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37■■■■□ 3.51
CHRD-215ENST00000485883 CUX1P39880 1505 aa36.97■■■■□ 3.51
CHRD-215ENST00000485883 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.9■■■■□ 3.5
CHRD-215ENST00000485883 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.89■■■■□ 3.5
CHRD-215ENST00000485883 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.85■■■■□ 3.49
CHRD-215ENST00000485883 WDR97A6NE52 1622 aa36.77■■■■□ 3.48
CHRD-215ENST00000485883 ARAP1Q96P48 1450 aa36.76■■■■□ 3.48
CHRD-215ENST00000485883 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.73■■■■□ 3.47
CHRD-215ENST00000485883 GRIN2BQ13224 1484 aa36.71■■■■□ 3.47
CHRD-215ENST00000485883 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.69■■■■□ 3.46
CHRD-215ENST00000485883 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.63■■■■□ 3.45
CHRD-215ENST00000485883 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.6■■■■□ 3.45
CHRD-215ENST00000485883 SYNJ2O15056 1496 aa36.59■■■■□ 3.45
CHRD-215ENST00000485883 SYNJ1O43426 1573 aa36.57■■■■□ 3.44
CHRD-215ENST00000485883 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.55■■■■□ 3.44
CHRD-215ENST00000485883 PBRM1Q86U86 1689 aa36.52■■■■□ 3.44
CHRD-215ENST00000485883 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.48■■■■□ 3.43
CHRD-215ENST00000485883 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.48■■■■□ 3.43
CHRD-215ENST00000485883 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.4■■■■□ 3.42
CHRD-215ENST00000485883 TOP2BQ02880 1626 aa36.31■■■■□ 3.4
CHRD-215ENST00000485883 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.3■■■■□ 3.4
CHRD-215ENST00000485883 GRIN2AQ12879 1464 aa36.25■■■■□ 3.39
CHRD-215ENST00000485883 ADAMTS12P58397 1594 aa36.21■■■■□ 3.39
CHRD-215ENST00000485883 NUP160Q12769 1436 aa36.15■■■■□ 3.38
CHRD-215ENST00000485883 CEP170Q5SW79 1584 aa36.15■■■■□ 3.38
CHRD-215ENST00000485883 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.14■■■■□ 3.38
CHRD-215ENST00000485883 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.13■■■■□ 3.37
CHRD-215ENST00000485883 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.06■■■■□ 3.36
CHRD-215ENST00000485883 SHROOM2Q13796 1616 aa35.94■■■■□ 3.34
CHRD-215ENST00000485883 JPH4Q96JJ6 628 aa35.82■■■■□ 3.32
CHRD-215ENST00000485883 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.82■■■■□ 3.32
CHRD-215ENST00000485883 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.69■■■■□ 3.3
CHRD-215ENST00000485883 IGF1RP08069 1367 aa35.69■■■■□ 3.3
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