RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255476.2

RFXAP-201, Transcript of regulatory factor X associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RFXAP, Length 2,304 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAP-201ENST00000255476 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.66■■■■■ 5.22
RFXAP-201ENST00000255476 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.41■■■■■ 4.22
RFXAP-201ENST00000255476 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.04■■■■■ 4
RFXAP-201ENST00000255476 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.6■■■■□ 3.93
RFXAP-201ENST00000255476 ABCC9O60706 1549 aa39.33■■■■□ 3.89
RFXAP-201ENST00000255476 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.26■■■■□ 3.88
RFXAP-201ENST00000255476 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.21■■■■□ 3.87
RFXAP-201ENST00000255476 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.73■■■■□ 3.79
RFXAP-201ENST00000255476 NACADO15069 1562 aa38.57■■■■□ 3.76
RFXAP-201ENST00000255476 SCRIBQ14160 1630 aa38.31■■■■□ 3.72
RFXAP-201ENST00000255476 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.25■■■■□ 3.71
RFXAP-201ENST00000255476 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.75■■■■□ 3.63
RFXAP-201ENST00000255476 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.63■■■■□ 3.61
RFXAP-201ENST00000255476 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.19■■■■□ 3.54
RFXAP-201ENST00000255476 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.18■■■■□ 3.54
RFXAP-201ENST00000255476 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.16■■■■□ 3.54
RFXAP-201ENST00000255476 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.06■■■■□ 3.52
RFXAP-201ENST00000255476 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.91■■■■□ 3.5
RFXAP-201ENST00000255476 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.76■■■■□ 3.48
RFXAP-201ENST00000255476 WIZO95785 1651 aa36.65■■■■□ 3.46
RFXAP-201ENST00000255476 SMARCA4P51532 1647 aa36.64■■■■□ 3.46
RFXAP-201ENST00000255476 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.14■■■■□ 3.38
RFXAP-201ENST00000255476 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.09■■■■□ 3.37
RFXAP-201ENST00000255476 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.08■■■■□ 3.37
RFXAP-201ENST00000255476 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.05■■■■□ 3.36
RFXAP-201ENST00000255476 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.02■■■■□ 3.36
RFXAP-201ENST00000255476 SMARCA2P51531 1590 aa35.92■■■■□ 3.34
RFXAP-201ENST00000255476 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.85■■■■□ 3.33
RFXAP-201ENST00000255476 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.82■■■■□ 3.33
RFXAP-201ENST00000255476 NCAPD3P42695 1498 aa35.63■■■■□ 3.29
RFXAP-201ENST00000255476 HMGXB3Q12766 1538 aa35.56■■■■□ 3.28
RFXAP-201ENST00000255476 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.53■■■■□ 3.28
RFXAP-201ENST00000255476 TRIM41Q8WV44 630 aa35.38■■■■□ 3.25
RFXAP-201ENST00000255476 ABCC8Q09428 1581 aa35.22■■■■□ 3.23
RFXAP-201ENST00000255476 CFTRP13569 1480 aa34.89■■■■□ 3.18
RFXAP-201ENST00000255476 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP34.89■■■■□ 3.18
RFXAP-201ENST00000255476 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.87■■■■□ 3.17
RFXAP-201ENST00000255476 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa34.83■■■■□ 3.17
RFXAP-201ENST00000255476 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.83■■■■□ 3.17
RFXAP-201ENST00000255476 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.77■■■■□ 3.16
RFXAP-201ENST00000255476 SYNJ1O43426 1573 aa34.77■■■■□ 3.16
RFXAP-201ENST00000255476 PRDM2Q13029 1718 aa34.7■■■■□ 3.14
RFXAP-201ENST00000255476 NESP48681 1621 aa34.59■■■■□ 3.13
RFXAP-201ENST00000255476 SOGA1O94964 1423 aa34.56■■■■□ 3.12
RFXAP-201ENST00000255476 TOP2BQ02880 1626 aa34.54■■■■□ 3.12
RFXAP-201ENST00000255476 EHMT2Q96KQ7 1210 aa34.52■■■■□ 3.12
RFXAP-201ENST00000255476 CUX1P39880 1505 aa34.48■■■■□ 3.11
RFXAP-201ENST00000255476 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.48■■■■□ 3.11
RFXAP-201ENST00000255476 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.46■■■■□ 3.11
RFXAP-201ENST00000255476 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.42■■■■□ 3.1
RFXAP-201ENST00000255476 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.4■■■■□ 3.1
RFXAP-201ENST00000255476 EEA1Q15075 1411 aa34.28■■■■□ 3.08
RFXAP-201ENST00000255476 CSRNP3Q8WYN3 585 aa34.24■■■■□ 3.07
RFXAP-201ENST00000255476 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.16■■■■□ 3.06
RFXAP-201ENST00000255476 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.15■■■■□ 3.06
RFXAP-201ENST00000255476 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.11■■■■□ 3.05
RFXAP-201ENST00000255476 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.09■■■■□ 3.05
RFXAP-201ENST00000255476 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.07■■■■□ 3.04
RFXAP-201ENST00000255476 TOPBP1Q92547 1522 aa34.06■■■■□ 3.04
RFXAP-201ENST00000255476 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.01■■■■□ 3.04
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RFXAP-201ENST00000255476 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.91■■■■□ 3.02
RFXAP-201ENST00000255476 GOLGA3Q08378 1498 aa33.91■■■■□ 3.02
RFXAP-201ENST00000255476 CUX2O14529 1486 aa33.9■■■■□ 3.02
RFXAP-201ENST00000255476 KIF21BO75037 1637 aa33.9■■■■□ 3.02
RFXAP-201ENST00000255476 UBTFP17480 764 aaKnown RBP33.89■■■■□ 3.02
RFXAP-201ENST00000255476 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.88■■■■□ 3.01
RFXAP-201ENST00000255476 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa33.82■■■■□ 3
RFXAP-201ENST00000255476 TNIKQ9UKE5 1360 aa33.82■■■■□ 3
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RFXAP-201ENST00000255476 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.72■■■□□ 2.99
RFXAP-201ENST00000255476 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.72■■■□□ 2.99
RFXAP-201ENST00000255476 CEP162Q5TB80 1403 aa33.71■■■□□ 2.99
RFXAP-201ENST00000255476 IGF1RP08069 1367 aa33.68■■■□□ 2.98
RFXAP-201ENST00000255476 ERCC6Q03468 1493 aa33.65■■■□□ 2.98
RFXAP-201ENST00000255476 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.63■■■□□ 2.97
RFXAP-201ENST00000255476 WDR97A6NE52 1622 aa33.62■■■□□ 2.97
RFXAP-201ENST00000255476 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.55■■■□□ 2.96
RFXAP-201ENST00000255476 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.53■■■□□ 2.96
RFXAP-201ENST00000255476 WDR62O43379 1518 aa33.53■■■□□ 2.96
RFXAP-201ENST00000255476 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.51■■■□□ 2.95
RFXAP-201ENST00000255476 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP33.48■■■□□ 2.95
RFXAP-201ENST00000255476 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.46■■■□□ 2.95
RFXAP-201ENST00000255476 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.45■■■□□ 2.95
RFXAP-201ENST00000255476 CLIP1P30622 1438 aa33.42■■■□□ 2.94
RFXAP-201ENST00000255476 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.41■■■□□ 2.94
RFXAP-201ENST00000255476 CUL7Q14999 1698 aa33.32■■■□□ 2.93
RFXAP-201ENST00000255476 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.31■■■□□ 2.92
RFXAP-201ENST00000255476 IFT140Q96RY7 1462 aa33.3■■■□□ 2.92
RFXAP-201ENST00000255476 PCGF6Q9BYE7 350 aa33.29■■■□□ 2.92
RFXAP-201ENST00000255476 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP33.29■■■□□ 2.92
RFXAP-201ENST00000255476 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.27■■■□□ 2.92
RFXAP-201ENST00000255476 PBRM1Q86U86 1689 aa33.23■■■□□ 2.91
RFXAP-201ENST00000255476 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP33.13■■■□□ 2.89
RFXAP-201ENST00000255476 VPS8Q8N3P4 1428 aa33.11■■■□□ 2.89
RFXAP-201ENST00000255476 GRIN2BQ13224 1484 aa33.1■■■□□ 2.89
RFXAP-201ENST00000255476 ARAP1Q96P48 1450 aa33.09■■■□□ 2.89
RFXAP-201ENST00000255476 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.09■■■□□ 2.89
RFXAP-201ENST00000255476 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa33.07■■■□□ 2.88
RFXAP-201ENST00000255476 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa33.03■■■□□ 2.88
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