Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.127e-8■■■■□ 19.7
PUM1Q14671 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.27e-8■■■■□ 19.7
PUM1Q14671 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.227e-8■■■■□ 19.7
PUM1Q14671 SMARCA2-215ENST00000452193 750 ntTSL 312.52□□□□□ -0.417e-8■■■■□ 19.7
PUM1Q14671 SMARCA2-209ENST00000382203 5867 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.477e-8■■■■□ 19.7
PUM1Q14671 SMARCA2-228ENST00000634772 810 ntTSL 510.2□□□□□ -0.787e-8■■■■□ 19.7
PUM1Q14671 SMARCA2-265ENST00000638139 2675 ntTSL 59.6□□□□□ -0.877e-8■■■■□ 19.7
PUM1Q14671 SMARCA2-202ENST00000324954 1781 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.087e-8■■■■□ 19.7
PUM1Q14671 SMARCA2-205ENST00000382183 1178 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.127e-8■■■■□ 19.7
PUM1Q14671 SMARCA2-243ENST00000635590 1843 ntTSL 38.08□□□□□ -1.127e-8■■■■□ 19.7
PUM1Q14671 SMARCA2-250ENST00000636367 1889 ntTSL 58□□□□□ -1.137e-8■■■■□ 19.7
PUM1Q14671 SMARCA2-246ENST00000635739 4272 ntTSL 57.89□□□□□ -1.157e-8■■■■□ 19.7
PUM1Q14671 SMARCA2-211ENST00000417599 980 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.27e-8■■■■□ 19.7
PUM1Q14671 SMARCA2-235ENST00000635133 758 ntTSL 57.48□□□□□ -1.217e-8■■■■□ 19.7
PUM1Q14671 SMARCA2-242ENST00000635530 712 ntTSL 57.48□□□□□ -1.217e-8■■■■□ 19.7
PUM1Q14671 SMARCA2-239ENST00000635388 711 ntTSL 57.48□□□□□ -1.217e-8■■■■□ 19.7
PUM1Q14671 SMARCA2-221ENST00000634343 792 ntTSL 37.42□□□□□ -1.227e-8■■■■□ 19.7
PUM1Q14671 SMARCA2-247ENST00000636157 3211 ntTSL 57.27□□□□□ -1.257e-8■■■■□ 19.7
PUM1Q14671 SMARCA2-212ENST00000423555 834 ntTSL 57.17□□□□□ -1.267e-8■■■■□ 19.7
PUM1Q14671 SMARCA2-223ENST00000634435 744 ntTSL 57.15□□□□□ -1.267e-8■■■■□ 19.7
PUM1Q14671 SMARCA2-220ENST00000634338 740 ntTSL 57.13□□□□□ -1.277e-8■■■■□ 19.7
PUM1Q14671 SMARCA2-244ENST00000635659 762 ntTSL 57.13□□□□□ -1.277e-8■■■■□ 19.7
PUM1Q14671 SMARCA2-225ENST00000634688 897 ntTSL 56.72□□□□□ -1.337e-8■■■■□ 19.7
PUM1Q14671 SMARCA2-226ENST00000634706 630 ntTSL 56.63□□□□□ -1.357e-8■■■■□ 19.7
PUM1Q14671 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.397e-8■■■■□ 19.7
PUM1Q14671 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.447e-8■■■■□ 19.7
PUM1Q14671 SMARCA2-232ENST00000634989 1118 ntTSL 26.04□□□□□ -1.447e-8■■■■□ 19.7
PUM1Q14671 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.457e-8■■■■□ 19.7
PUM1Q14671 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.487e-8■■■■□ 19.7
PUM1Q14671 SMARCA2-210ENST00000416751 633 ntTSL 35.51□□□□□ -1.537e-8■■■■□ 19.7
PUM1Q14671 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.537e-8■■■■□ 19.7
PUM1Q14671 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.155e-7■■■■□ 19.7
PUM1Q14671 RRP1B-202ENST00000470886 4634 ntTSL 29.99□□□□□ -0.815e-7■■■■□ 19.7
PUM1Q14671 GRSF1-207ENST00000514161 1765 ntTSL 211.48□□□□□ -0.571e-6■■■■□ 19.7
PUM1Q14671 GRSF1-203ENST00000502323 1794 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.781e-6■■■■□ 19.7
PUM1Q14671 GRSF1-205ENST00000506453 925 ntTSL 39.95□□□□□ -0.821e-6■■■■□ 19.7
PUM1Q14671 GRSF1-206ENST00000508091 419 ntTSL 39.29□□□□□ -0.921e-6■■■■□ 19.7
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PUM1Q14671 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.558e-7■■■■□ 19.7
PUM1Q14671 TMEM259-211ENST00000593068 1965 ntTSL 516.84■□□□□ 0.298e-7■■■■□ 19.7
PUM1Q14671 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.038e-9■■■■□ 19.7
PUM1Q14671 ACTB-211ENST00000480301 657 ntTSL 1 (best)21.28■■□□□ 16e-11■■■■□ 19.6
PUM1Q14671 ACTB-206ENST00000443528 569 ntTSL 415.87■□□□□ 0.136e-11■■■■□ 19.6
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PUM1Q14671 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.434e-7■■■■□ 19.6
PUM1Q14671 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.134e-7■■■■□ 19.6
PUM1Q14671 UBTF-206ENST00000527034 3010 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.444e-7■■■■□ 19.6
PUM1Q14671 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.549e-9■■■■□ 19.6
PUM1Q14671 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.182e-8■■■■□ 19.6
PUM1Q14671 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.162e-8■■■■□ 19.6
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PUM1Q14671 KIF2C-208ENST00000493027 1091 ntTSL 55.8□□□□□ -1.483e-6■■■■□ 19.5
PUM1Q14671 ANP32B-201ENST00000339399 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.325e-39■■■■□ 19.5
PUM1Q14671 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.384e-6■■■■□ 19.5
PUM1Q14671 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.693e-6■■■■□ 19.5
PUM1Q14671 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.573e-6■■■■□ 19.5
PUM1Q14671 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.761e-6■■■■□ 19.5
PUM1Q14671 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.491e-6■■■■□ 19.5
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PUM1Q14671 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.284e-8■■■■□ 19.5
PUM1Q14671 PDCL3-202ENST00000416255 657 ntTSL 213.24□□□□□ -0.294e-8■■■■□ 19.5
PUM1Q14671 PDCL3-203ENST00000450127 662 ntTSL 27.46□□□□□ -1.224e-8■■■■□ 19.5
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PUM1Q14671 CANX-212ENST00000506654 592 ntTSL 324.26■■□□□ 1.472e-8■■■■□ 19.4
PUM1Q14671 ABHD5-203ENST00000454293 464 ntTSL 321.71■■□□□ 1.072e-8■■■■□ 19.4
PUM1Q14671 CANX-204ENST00000502498 570 ntTSL 420.11■□□□□ 0.812e-8■■■■□ 19.4
PUM1Q14671 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.722e-8■■■■□ 19.4
PUM1Q14671 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.592e-8■■■■□ 19.4
PUM1Q14671 CANX-217ENST00000513246 727 ntTSL 518.73■□□□□ 0.592e-8■■■■□ 19.4
PUM1Q14671 ABHD5-201ENST00000013894 833 ntTSL 318.71■□□□□ 0.592e-8■■■■□ 19.4
PUM1Q14671 CANX-219ENST00000514383 585 ntTSL 318.56■□□□□ 0.562e-8■■■■□ 19.4
PUM1Q14671 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.482e-8■■■■□ 19.4
PUM1Q14671 CANX-216ENST00000510810 511 ntTSL 417.18■□□□□ 0.342e-8■■■■□ 19.4
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PUM1Q14671 CANX-203ENST00000502296 825 ntTSL 416.6■□□□□ 0.252e-8■■■■□ 19.4
PUM1Q14671 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.042e-8■■■■□ 19.4
PUM1Q14671 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.012e-8■■■■□ 19.4
PUM1Q14671 ABHD5-204ENST00000456453 876 ntTSL 414.44□□□□□ -0.12e-8■■■■□ 19.4
PUM1Q14671 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.132e-8■■■■□ 19.4
PUM1Q14671 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.142e-8■■■■□ 19.4
PUM1Q14671 SLC25A3-212ENST00000549338 1285 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.32e-8■■■■□ 19.4
PUM1Q14671 SLC25A3-202ENST00000228318 1678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.352e-8■■■■□ 19.4
PUM1Q14671 SCAF11-209ENST00000547018 3271 ntTSL 512.03□□□□□ -0.482e-8■■■■□ 19.4
PUM1Q14671 SLC25A3-214ENST00000551123 1417 ntTSL 1 (best)11.86□□□□□ -0.512e-8■■■■□ 19.4
PUM1Q14671 SLC25A3-203ENST00000401722 6087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.612e-8■■■■□ 19.4
PUM1Q14671 SCAF11-201ENST00000266589 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 510.83□□□□□ -0.682e-8■■■■□ 19.4
PUM1Q14671 SLC25A3-204ENST00000546766 3236 ntTSL 1 (best)9.78□□□□□ -0.842e-8■■■■□ 19.4
PUM1Q14671 SLC25A3-207ENST00000547869 1018 ntTSL 29.38□□□□□ -0.912e-8■■■■□ 19.4
PUM1Q14671 XRCC5-202ENST00000392133 3761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.076e-6■■■■□ 19.4
PUM1Q14671 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.396e-6■■■■□ 19.4
PUM1Q14671 CANX-206ENST00000503126 592 ntTSL 55.96□□□□□ -1.462e-8■■■■□ 19.4
PUM1Q14671 XRCC5-206ENST00000460284 2962 ntTSL 1 (best)5.81□□□□□ -1.486e-6■■■■□ 19.4
PUM1Q14671 PA2G4-203ENST00000551061 694 ntTSL 24.6□□□□□ -1.672e-8■■■■□ 19.4
PUM1Q14671 SLC25A3-210ENST00000548480 722 ntTSL 23.84□□□□□ -1.792e-8■■■■□ 19.4
PUM1Q14671 STRN4-222ENST00000601869 2240 nt18.51■□□□□ 0.557e-7■■■■□ 19.4
PUM1Q14671 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.875e-7■■■■□ 19.4
PUM1Q14671 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.55e-7■■■■□ 19.4
PUM1Q14671 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.335e-7■■■■□ 19.4
PUM1Q14671 VASP-211ENST00000592139 424 ntTSL 323.93■■□□□ 1.422e-12■■■■□ 19.4
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