RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272217.6

ARL8A-201, Transcript of ADP ribosylation factor like GTPase 8A, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ARL8A, Length 1,793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL8A-201ENST00000272217 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.18■■■■■ 7.06
ARL8A-201ENST00000272217 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.39■■■■■ 5.82
ARL8A-201ENST00000272217 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.8■■■■■ 5.56
ARL8A-201ENST00000272217 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.97■■■■■ 5.43
ARL8A-201ENST00000272217 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.64■■■■■ 5.38
ARL8A-201ENST00000272217 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.46■■■■■ 5.35
ARL8A-201ENST00000272217 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.25■■■■■ 5.31
ARL8A-201ENST00000272217 ABCC9O60706 1549 aa48.22■■■■■ 5.31
ARL8A-201ENST00000272217 NACADO15069 1562 aa47.79■■■■■ 5.24
ARL8A-201ENST00000272217 SCRIBQ14160 1630 aa47.28■■■■■ 5.16
ARL8A-201ENST00000272217 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.26■■■■■ 5.16
ARL8A-201ENST00000272217 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.83■■■■■ 5.09
ARL8A-201ENST00000272217 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.32■■■■■ 5.01
ARL8A-201ENST00000272217 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.07■■■■■ 4.97
ARL8A-201ENST00000272217 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.95■■■■■ 4.95
ARL8A-201ENST00000272217 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.88■■■■■ 4.94
ARL8A-201ENST00000272217 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.73■■■■■ 4.91
ARL8A-201ENST00000272217 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.64■■■■■ 4.9
ARL8A-201ENST00000272217 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.57■■■■■ 4.89
ARL8A-201ENST00000272217 SMARCA4P51532 1647 aa45.39■■■■■ 4.86
ARL8A-201ENST00000272217 WIZO95785 1651 aa45.34■■■■■ 4.85
ARL8A-201ENST00000272217 CHIC1Q5VXU3 224 aa45.11■■■■■ 4.81
ARL8A-201ENST00000272217 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.9■■■■■ 4.78
ARL8A-201ENST00000272217 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.86■■■■■ 4.77
ARL8A-201ENST00000272217 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.58■■■■■ 4.73
ARL8A-201ENST00000272217 SMARCA2P51531 1590 aa44.53■■■■■ 4.72
ARL8A-201ENST00000272217 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.47■■■■■ 4.71
ARL8A-201ENST00000272217 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.43■■■■■ 4.7
ARL8A-201ENST00000272217 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.3■■■■■ 4.68
ARL8A-201ENST00000272217 NCAPD3P42695 1498 aa44.14■■■■■ 4.66
ARL8A-201ENST00000272217 HMGXB3Q12766 1538 aa44.09■■■■■ 4.65
ARL8A-201ENST00000272217 TRIM41Q8WV44 630 aa44.03■■■■■ 4.64
ARL8A-201ENST00000272217 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.67■■■■■ 4.58
ARL8A-201ENST00000272217 ABCC8Q09428 1581 aa43.62■■■■■ 4.57
ARL8A-201ENST00000272217 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa43.36■■■■■ 4.53
ARL8A-201ENST00000272217 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.32■■■■■ 4.539e-6■■■■■ 50.1
ARL8A-201ENST00000272217 CFTRP13569 1480 aa43.26■■■■■ 4.52
ARL8A-201ENST00000272217 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP43.18■■■■■ 4.5
ARL8A-201ENST00000272217 SYNJ1O43426 1573 aa43.12■■■■■ 4.49
ARL8A-201ENST00000272217 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.02■■■■■ 4.48
ARL8A-201ENST00000272217 PRDM2Q13029 1718 aa42.99■■■■■ 4.47
ARL8A-201ENST00000272217 TOP2BQ02880 1626 aa42.93■■■■■ 4.46
ARL8A-201ENST00000272217 EEA1Q15075 1411 aa42.93■■■■■ 4.46
ARL8A-201ENST00000272217 SOGA1O94964 1423 aa42.91■■■■■ 4.46
ARL8A-201ENST00000272217 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.87■■■■■ 4.45
ARL8A-201ENST00000272217 CUX1P39880 1505 aa42.74■■■■■ 4.43
ARL8A-201ENST00000272217 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.73■■■■■ 4.43
ARL8A-201ENST00000272217 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.65■■■■■ 4.42
ARL8A-201ENST00000272217 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.53■■■■■ 4.4
ARL8A-201ENST00000272217 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.52■■■■■ 4.4
ARL8A-201ENST00000272217 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.52■■■■■ 4.4
ARL8A-201ENST00000272217 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.5■■■■■ 4.39
ARL8A-201ENST00000272217 NESP48681 1621 aa42.48■■■■■ 4.39
ARL8A-201ENST00000272217 KIF21BO75037 1637 aa42.33■■■■■ 4.37
ARL8A-201ENST00000272217 GOLGA3Q08378 1498 aa42.32■■■■■ 4.37
ARL8A-201ENST00000272217 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.3■■■■■ 4.36
ARL8A-201ENST00000272217 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.3■■■■■ 4.36
ARL8A-201ENST00000272217 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.21■■■■■ 4.35
ARL8A-201ENST00000272217 KIF27Q86VH2 1401 aa42.19■■■■■ 4.34
ARL8A-201ENST00000272217 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.19■■■■■ 4.34
ARL8A-201ENST00000272217 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.18■■■■■ 4.34
ARL8A-201ENST00000272217 TOPBP1Q92547 1522 aa42.12■■■■■ 4.33
ARL8A-201ENST00000272217 UBTFP17480 764 aaKnown RBP42.07■■■■■ 4.33
ARL8A-201ENST00000272217 CEP162Q5TB80 1403 aa42.07■■■■■ 4.33
ARL8A-201ENST00000272217 PRXQ9BXM0 1461 aa42.05■■■■■ 4.32
ARL8A-201ENST00000272217 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.02■■■■■ 4.32
ARL8A-201ENST00000272217 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.99■■■■■ 4.31
ARL8A-201ENST00000272217 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.98■■■■■ 4.31
ARL8A-201ENST00000272217 CUX2O14529 1486 aa41.98■■■■■ 4.31
ARL8A-201ENST00000272217 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.95■■■■■ 4.31
ARL8A-201ENST00000272217 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.94■■■■■ 4.3
ARL8A-201ENST00000272217 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.86■■■■■ 4.29
ARL8A-201ENST00000272217 IGF1RP08069 1367 aa41.82■■■■■ 4.28
ARL8A-201ENST00000272217 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.8■■■■■ 4.28
ARL8A-201ENST00000272217 PCGF6Q9BYE7 350 aa41.75■■■■■ 4.27
ARL8A-201ENST00000272217 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP41.7■■■■■ 4.27
ARL8A-201ENST00000272217 CLIP1P30622 1438 aa41.66■■■■■ 4.26
ARL8A-201ENST00000272217 WDR97A6NE52 1622 aa41.66■■■■■ 4.26
ARL8A-201ENST00000272217 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.63■■■■■ 4.25
ARL8A-201ENST00000272217 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.58■■■■■ 4.25
ARL8A-201ENST00000272217 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.46■■■■■ 4.23
ARL8A-201ENST00000272217 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.46■■■■■ 4.23
ARL8A-201ENST00000272217 WDR62O43379 1518 aa41.41■■■■■ 4.22
ARL8A-201ENST00000272217 CUL7Q14999 1698 aa41.41■■■■■ 4.22
ARL8A-201ENST00000272217 VPS8Q8N3P4 1428 aa41.36■■■■■ 4.21
ARL8A-201ENST00000272217 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.36■■■■■ 4.21
ARL8A-201ENST00000272217 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.35■■■■■ 4.21
ARL8A-201ENST00000272217 ERCC6Q03468 1493 aa41.28■■■■■ 4.2
ARL8A-201ENST00000272217 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP41.23■■■■■ 4.19
ARL8A-201ENST00000272217 ARAP1Q96P48 1450 aa41.22■■■■■ 4.19
ARL8A-201ENST00000272217 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.22■■■■■ 4.19
ARL8A-201ENST00000272217 IFT140Q96RY7 1462 aa41.19■■■■■ 4.18
ARL8A-201ENST00000272217 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.18■■■■■ 4.18
ARL8A-201ENST00000272217 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa41.15■■■■■ 4.18
ARL8A-201ENST00000272217 PBRM1Q86U86 1689 aa41.05■■■■■ 4.16
ARL8A-201ENST00000272217 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.03■■■■■ 4.168e-7■■■■□ 22.2
ARL8A-201ENST00000272217 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa40.98■■■■■ 4.15
ARL8A-201ENST00000272217 GRIN2BQ13224 1484 aa40.97■■■■■ 4.15
ARL8A-201ENST00000272217 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.95■■■■■ 4.15
ARL8A-201ENST00000272217 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.92■■■■■ 4.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms